FuNGI

A0A0B1PB80

Protein Details

Accession

A0A0B1PB80

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
250-292	LGKLKHQSSINKKRKKSKKNLEEAVKKVKKQERKKNATHSLNF	Hydrophilic
493-516	ELLEEWKREERKRKRNEKGLASDE	Basic
681-737	SAHKSTQALRRQKKESQGKSSTNKEKSRQKNFLMTIGKAKFKQKRSLVQTRKVLKNH	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
259-284	INKKRKKSKKNLEEAVKKVKKQERKK
499-508	KREERKRKRN
676-748	GKGERSAHKSTQALRRQKKESQGKSSTNKEKSRQKNFLMTIGKAKFKQKRSLVQTRKVLKNHVERSKRGGKRG

Subcellular Location(s)

nucl 20.5, cyto_nucl 12.5, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027312 Sda1 IPR007949 SDA1_C IPR012977 SDA1_N
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus GO:0015031 P:protein transport GO:0042273 P:ribosomal large subunit biogenesis GO:0000055 P:ribosomal large subunit export from nucleus
Pfam	View protein in Pfam PF08158 NUC130_3NT PF05285 SDA1

Amino Acid Sequences

MGKRKVGALEKIDADLSNLKNKIRRDPKSYIEDFLNQYEQYQSQRDIFLSTPTSAISNGIISFRDLIDFVAHVADCFPTETVNFPEDLKSILELHHTELESELREKIVGSLVLLKRKEIIKSENLLNTLFPILINSPSKTFRSFLYHKILSDLRNSNSKTTNHRLNRTMQNAFFNLLTSDRSSSKGIWAVKITRELWKRQIWTDAKAVEVMKEASLSENVKIIGGGVRFFLGGDNELEDESSEDEIAIDLGKLKHQSSINKKRKKSKKNLEEAVKKVKKQERKKNATHSLNFSAFHFLHDPQSFAETLFSKHLQNTKSKLNLENKLLVLRLVSRLVGLHKLTIISLYSYFTKYLTPRQPSVTSFLASLAQATHSLVPPDVLEPLIQKIANEFVSEASACEVASAGLNAIREICVRQPLAMNDTLLQDLIMYRKSKDKGTMMAAKGLLSLYREVGADLLRKRDRGKNATIGIKTGTIKERRFGEERIGEIEGLELLEEWKREERKRKRNEKGLASDEEDPDSDCTMEEAQGWENWESDSNDSDDSSGWKDLESDLEIQLSESEEEEPAVKKSKVENYTTRDKDSEEISNNDHKTSLNLATTQILTPADLAKLRELRLSASLNDKLHPNQKNTKLSATRLKSLSEKHEDDAVTVEAIEGLSRMRKATKDEIVALAKEGKGERSAHKSTQALRRQKKESQGKSSTNKEKSRQKNFLMTIGKAKFKQKRSLVQTRKVLKNHVERSKRGGKRGNIGM

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.3
2	0.29
3	0.27
4	0.29
5	0.31
6	0.33
7	0.38
8	0.42
9	0.5
10	0.54
11	0.59
12	0.6
13	0.65
14	0.69
15	0.74
16	0.73
17	0.66
18	0.6
19	0.58
20	0.52
21	0.49
22	0.44
23	0.34
24	0.32
25	0.31
26	0.29
27	0.27
28	0.28
29	0.27
30	0.26
31	0.28
32	0.28
33	0.28
34	0.26
35	0.27
36	0.26
37	0.23
38	0.21
39	0.19
40	0.2
41	0.17
42	0.17
43	0.13
44	0.11
45	0.11
46	0.12
47	0.12
48	0.12
49	0.13
50	0.13
51	0.13
52	0.11
53	0.11
54	0.11
55	0.11
56	0.1
57	0.11
58	0.11
59	0.1
60	0.1
61	0.1
62	0.09
63	0.1
64	0.1
65	0.08
66	0.09
67	0.12
68	0.15
69	0.16
70	0.16
71	0.16
72	0.17
73	0.17
74	0.18
75	0.16
76	0.14
77	0.14
78	0.14
79	0.18
80	0.17
81	0.2
82	0.23
83	0.22
84	0.21
85	0.21
86	0.22
87	0.2
88	0.21
89	0.18
90	0.13
91	0.13
92	0.13
93	0.13
94	0.14
95	0.12
96	0.11
97	0.2
98	0.23
99	0.3
100	0.3
101	0.29
102	0.3
103	0.33
104	0.36
105	0.33
106	0.35
107	0.35
108	0.4
109	0.46
110	0.45
111	0.43
112	0.4
113	0.35
114	0.3
115	0.24
116	0.18
117	0.12
118	0.1
119	0.1
120	0.15
121	0.17
122	0.17
123	0.2
124	0.23
125	0.26
126	0.26
127	0.26
128	0.24
129	0.3
130	0.33
131	0.36
132	0.42
133	0.42
134	0.4
135	0.44
136	0.44
137	0.37
138	0.41
139	0.4
140	0.33
141	0.39
142	0.4
143	0.4
144	0.43
145	0.45
146	0.46
147	0.48
148	0.56
149	0.56
150	0.61
151	0.61
152	0.62
153	0.68
154	0.66
155	0.64
156	0.56
157	0.53
158	0.47
159	0.45
160	0.36
161	0.28
162	0.22
163	0.17
164	0.16
165	0.13
166	0.14
167	0.14
168	0.17
169	0.18
170	0.18
171	0.21
172	0.25
173	0.25
174	0.25
175	0.28
176	0.29
177	0.3
178	0.35
179	0.32
180	0.35
181	0.38
182	0.4
183	0.43
184	0.46
185	0.46
186	0.43
187	0.51
188	0.45
189	0.45
190	0.45
191	0.39
192	0.33
193	0.33
194	0.31
195	0.22
196	0.2
197	0.17
198	0.12
199	0.11
200	0.11
201	0.09
202	0.12
203	0.12
204	0.11
205	0.12
206	0.12
207	0.12
208	0.11
209	0.1
210	0.11
211	0.1
212	0.1
213	0.08
214	0.08
215	0.08
216	0.08
217	0.09
218	0.06
219	0.07
220	0.07
221	0.07
222	0.08
223	0.08
224	0.08
225	0.07
226	0.07
227	0.07
228	0.07
229	0.06
230	0.05
231	0.05
232	0.05
233	0.05
234	0.05
235	0.04
236	0.06
237	0.06
238	0.09
239	0.1
240	0.11
241	0.16
242	0.19
243	0.28
244	0.36
245	0.48
246	0.56
247	0.63
248	0.7
249	0.75
250	0.83
251	0.85
252	0.86
253	0.85
254	0.86
255	0.87
256	0.9
257	0.89
258	0.87
259	0.81
260	0.81
261	0.75
262	0.65
263	0.64
264	0.62
265	0.62
266	0.64
267	0.7
268	0.7
269	0.74
270	0.81
271	0.83
272	0.86
273	0.85
274	0.78
275	0.73
276	0.67
277	0.6
278	0.52
279	0.43
280	0.37
281	0.28
282	0.26
283	0.22
284	0.17
285	0.21
286	0.21
287	0.21
288	0.16
289	0.17
290	0.16
291	0.14
292	0.15
293	0.1
294	0.11
295	0.13
296	0.14
297	0.14
298	0.16
299	0.21
300	0.21
301	0.26
302	0.29
303	0.32
304	0.36
305	0.37
306	0.42
307	0.44
308	0.47
309	0.44
310	0.44
311	0.38
312	0.34
313	0.32
314	0.25
315	0.18
316	0.14
317	0.12
318	0.09
319	0.08
320	0.07
321	0.08
322	0.09
323	0.12
324	0.11
325	0.1
326	0.1
327	0.1
328	0.09
329	0.09
330	0.08
331	0.06
332	0.06
333	0.07
334	0.08
335	0.09
336	0.09
337	0.09
338	0.11
339	0.12
340	0.2
341	0.26
342	0.29
343	0.3
344	0.34
345	0.36
346	0.34
347	0.38
348	0.31
349	0.24
350	0.2
351	0.19
352	0.16
353	0.13
354	0.12
355	0.07
356	0.06
357	0.06
358	0.06
359	0.07
360	0.06
361	0.07
362	0.06
363	0.06
364	0.06
365	0.06
366	0.06
367	0.05
368	0.05
369	0.05
370	0.07
371	0.08
372	0.08
373	0.07
374	0.07
375	0.09
376	0.09
377	0.09
378	0.08
379	0.07
380	0.08
381	0.08
382	0.07
383	0.06
384	0.06
385	0.05
386	0.05
387	0.05
388	0.04
389	0.04
390	0.04
391	0.03
392	0.04
393	0.05
394	0.05
395	0.05
396	0.05
397	0.05
398	0.06
399	0.07
400	0.1
401	0.1
402	0.11
403	0.13
404	0.13
405	0.16
406	0.16
407	0.15
408	0.13
409	0.14
410	0.13
411	0.11
412	0.09
413	0.06
414	0.06
415	0.07
416	0.09
417	0.09
418	0.1
419	0.16
420	0.18
421	0.2
422	0.24
423	0.26
424	0.27
425	0.32
426	0.38
427	0.33
428	0.34
429	0.32
430	0.28
431	0.25
432	0.21
433	0.16
434	0.1
435	0.09
436	0.07
437	0.07
438	0.07
439	0.07
440	0.07
441	0.08
442	0.12
443	0.13
444	0.2
445	0.2
446	0.22
447	0.26
448	0.32
449	0.39
450	0.4
451	0.44
452	0.44
453	0.48
454	0.53
455	0.49
456	0.43
457	0.36
458	0.33
459	0.29
460	0.24
461	0.26
462	0.26
463	0.26
464	0.3
465	0.32
466	0.34
467	0.37
468	0.35
469	0.37
470	0.33
471	0.33
472	0.32
473	0.29
474	0.24
475	0.2
476	0.19
477	0.11
478	0.08
479	0.07
480	0.04
481	0.04
482	0.05
483	0.06
484	0.07
485	0.12
486	0.18
487	0.24
488	0.35
489	0.46
490	0.55
491	0.66
492	0.76
493	0.8
494	0.85
495	0.88
496	0.86
497	0.84
498	0.79
499	0.71
500	0.64
501	0.57
502	0.48
503	0.4
504	0.31
505	0.23
506	0.19
507	0.15
508	0.12
509	0.08
510	0.09
511	0.08
512	0.09
513	0.08
514	0.09
515	0.09
516	0.1
517	0.12
518	0.12
519	0.11
520	0.11
521	0.13
522	0.13
523	0.14
524	0.14
525	0.13
526	0.13
527	0.13
528	0.13
529	0.11
530	0.12
531	0.13
532	0.13
533	0.11
534	0.11
535	0.11
536	0.11
537	0.13
538	0.13
539	0.12
540	0.11
541	0.12
542	0.12
543	0.11
544	0.11
545	0.1
546	0.08
547	0.07
548	0.08
549	0.07
550	0.08
551	0.09
552	0.1
553	0.11
554	0.16
555	0.15
556	0.17
557	0.23
558	0.31
559	0.35
560	0.41
561	0.47
562	0.48
563	0.58
564	0.59
565	0.57
566	0.49
567	0.45
568	0.41
569	0.36
570	0.37
571	0.3
572	0.3
573	0.31
574	0.38
575	0.37
576	0.35
577	0.32
578	0.26
579	0.24
580	0.25
581	0.24
582	0.18
583	0.18
584	0.19
585	0.2
586	0.21
587	0.19
588	0.17
589	0.13
590	0.11
591	0.11
592	0.11
593	0.11
594	0.12
595	0.13
596	0.17
597	0.2
598	0.21
599	0.23
600	0.22
601	0.22
602	0.25
603	0.27
604	0.23
605	0.26
606	0.31
607	0.3
608	0.31
609	0.32
610	0.32
611	0.38
612	0.43
613	0.43
614	0.47
615	0.56
616	0.62
617	0.62
618	0.66
619	0.62
620	0.63
621	0.66
622	0.61
623	0.59
624	0.53
625	0.52
626	0.48
627	0.49
628	0.51
629	0.49
630	0.47
631	0.42
632	0.45
633	0.43
634	0.38
635	0.35
636	0.27
637	0.19
638	0.16
639	0.14
640	0.09
641	0.09
642	0.08
643	0.05
644	0.06
645	0.09
646	0.1
647	0.11
648	0.15
649	0.17
650	0.24
651	0.32
652	0.38
653	0.39
654	0.41
655	0.45
656	0.45
657	0.43
658	0.38
659	0.34
660	0.27
661	0.25
662	0.24
663	0.2
664	0.21
665	0.24
666	0.28
667	0.33
668	0.38
669	0.39
670	0.44
671	0.47
672	0.51
673	0.57
674	0.61
675	0.64
676	0.68
677	0.74
678	0.74
679	0.76
680	0.79
681	0.8
682	0.8
683	0.79
684	0.79
685	0.8
686	0.8
687	0.84
688	0.84
689	0.82
690	0.81
691	0.8
692	0.81
693	0.82
694	0.85
695	0.84
696	0.8
697	0.8
698	0.75
699	0.75
700	0.7
701	0.62
702	0.61
703	0.57
704	0.57
705	0.51
706	0.58
707	0.58
708	0.59
709	0.67
710	0.66
711	0.71
712	0.75
713	0.82
714	0.82
715	0.83
716	0.86
717	0.85
718	0.86
719	0.8
720	0.78
721	0.76
722	0.77
723	0.77
724	0.78
725	0.76
726	0.71
727	0.76
728	0.78
729	0.76
730	0.74
731	0.74
732	0.7

A0A0B1PB80

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer