Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0B1PCT6

Protein Details
Accession A0A0B1PCT6    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
107-129EVDEKMDKRRKARREARLKTELEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
114-123KRRKARREAR
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto 7.5, cyto_mito 6, mito 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR010491  PRP1_N  
IPR045075  Syf1-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF06424  PRP1_N  
PF13432  TPR_16  
PF14559  TPR_19  
Amino Acid Sequences MSGRRDFLNQPAPENYVAGLGRGATGFTTRSDLGPAREGPSEDQIKEALAKRAAQLGAAAPTAYGVPEKKDDDDDDERFQDPENEVGLFAGGAYDKDDDEADRIYQEVDEKMDKRRKARREARLKTELEEYERNNPKIQQQFADLKRALGTVSDEDWANLPEVGDLTGKNRRNKQALRQRFYAIPDSVIASARDSGELGTTVTDEPDVGDVSDGTMTNFADIGAARDKVLQVKLDQASLGTDSVVAGNATNIDPKGYLTSLAKSQINEGEAQVGDVKRVRVLLESVIRTNPKHAPGWIAAARLEELAGKIVAARNVIARGCEFCPKNEDVWLENIRLNNNYNAKIIAANAIKNNDHSVRLWIEAMNLESESRAKKKVIRHALDHIPQSVMLWKEAVNLEENPDDARLLLAKATEIIPLSVELWLALAHLETSENAQKVLNKARKAIPTSHEIWIAAARLQEQMGNANKVNVMKRAVLALAKESAMLKREEWITEAEKCEKEGAILTCANIIRETLGWGLDEDDDRKEIWMEDAKASIHRGQYGTARAIYAYALQVFVNSRKLWLAAADLEKNHGQKEALWKLLEKSVEACPQSEVLWMMLAKEKWQAGEIDNARRVLGRAFNQNPNNEDIWLAAVKLEAENQQSEQARELLKTARQEAPTDRVWMKSVAFERQLGNTEGALDLVNQALQLFPNVPKLWMIKGQIYEGEGNLPRAREAYSMGTKACPESVPLWLLYSRLEERAGNLVKARGVLDRARLAIVNSPELWTESIRVERRANNIGQAKNLMAQALQQVTNSGLLYSEAIWYLENRTHRKPRALEAIKKVDNDPILFVTIARIFWGERKLEKAQNWFEKAIILDSDLGDTWAWYYKFLLQHGTEEKRADVLSKFILNEPRHGEVWQSVAKDPKNARLSLEEILHLVIGKLE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.29
3 0.24
4 0.22
5 0.18
6 0.16
7 0.13
8 0.13
9 0.12
10 0.12
11 0.08
12 0.09
13 0.1
14 0.11
15 0.15
16 0.15
17 0.16
18 0.2
19 0.23
20 0.25
21 0.29
22 0.3
23 0.29
24 0.31
25 0.32
26 0.31
27 0.36
28 0.38
29 0.33
30 0.32
31 0.29
32 0.28
33 0.32
34 0.33
35 0.31
36 0.28
37 0.3
38 0.3
39 0.36
40 0.35
41 0.29
42 0.26
43 0.22
44 0.21
45 0.2
46 0.18
47 0.11
48 0.12
49 0.12
50 0.11
51 0.11
52 0.1
53 0.13
54 0.19
55 0.21
56 0.23
57 0.27
58 0.29
59 0.34
60 0.4
61 0.4
62 0.4
63 0.4
64 0.38
65 0.35
66 0.33
67 0.3
68 0.24
69 0.23
70 0.2
71 0.18
72 0.17
73 0.16
74 0.15
75 0.1
76 0.09
77 0.07
78 0.05
79 0.05
80 0.07
81 0.07
82 0.07
83 0.09
84 0.09
85 0.1
86 0.11
87 0.13
88 0.12
89 0.11
90 0.12
91 0.11
92 0.12
93 0.13
94 0.13
95 0.14
96 0.2
97 0.22
98 0.31
99 0.39
100 0.43
101 0.5
102 0.58
103 0.64
104 0.69
105 0.78
106 0.79
107 0.82
108 0.86
109 0.87
110 0.86
111 0.79
112 0.7
113 0.67
114 0.59
115 0.54
116 0.5
117 0.44
118 0.45
119 0.52
120 0.51
121 0.47
122 0.46
123 0.48
124 0.5
125 0.51
126 0.43
127 0.41
128 0.49
129 0.49
130 0.55
131 0.47
132 0.4
133 0.38
134 0.35
135 0.29
136 0.2
137 0.2
138 0.14
139 0.15
140 0.15
141 0.14
142 0.14
143 0.15
144 0.15
145 0.13
146 0.1
147 0.09
148 0.08
149 0.09
150 0.09
151 0.09
152 0.09
153 0.12
154 0.2
155 0.27
156 0.34
157 0.42
158 0.48
159 0.57
160 0.63
161 0.7
162 0.73
163 0.78
164 0.77
165 0.73
166 0.69
167 0.63
168 0.6
169 0.56
170 0.46
171 0.36
172 0.3
173 0.28
174 0.25
175 0.23
176 0.19
177 0.13
178 0.14
179 0.13
180 0.13
181 0.11
182 0.1
183 0.09
184 0.09
185 0.08
186 0.07
187 0.08
188 0.08
189 0.08
190 0.07
191 0.06
192 0.06
193 0.07
194 0.07
195 0.06
196 0.06
197 0.06
198 0.06
199 0.08
200 0.07
201 0.07
202 0.08
203 0.07
204 0.07
205 0.07
206 0.07
207 0.06
208 0.06
209 0.09
210 0.1
211 0.11
212 0.11
213 0.12
214 0.13
215 0.16
216 0.18
217 0.17
218 0.15
219 0.22
220 0.22
221 0.22
222 0.21
223 0.17
224 0.16
225 0.16
226 0.15
227 0.08
228 0.07
229 0.06
230 0.07
231 0.07
232 0.06
233 0.04
234 0.04
235 0.06
236 0.06
237 0.08
238 0.07
239 0.08
240 0.08
241 0.09
242 0.11
243 0.1
244 0.12
245 0.11
246 0.14
247 0.16
248 0.19
249 0.21
250 0.19
251 0.21
252 0.21
253 0.21
254 0.2
255 0.17
256 0.16
257 0.14
258 0.14
259 0.15
260 0.12
261 0.13
262 0.14
263 0.14
264 0.12
265 0.13
266 0.13
267 0.11
268 0.13
269 0.16
270 0.19
271 0.21
272 0.22
273 0.24
274 0.26
275 0.25
276 0.28
277 0.27
278 0.25
279 0.25
280 0.24
281 0.25
282 0.24
283 0.3
284 0.28
285 0.24
286 0.21
287 0.2
288 0.2
289 0.16
290 0.14
291 0.08
292 0.07
293 0.07
294 0.06
295 0.05
296 0.06
297 0.08
298 0.08
299 0.08
300 0.09
301 0.09
302 0.11
303 0.11
304 0.11
305 0.1
306 0.12
307 0.13
308 0.2
309 0.19
310 0.18
311 0.23
312 0.25
313 0.25
314 0.26
315 0.26
316 0.2
317 0.26
318 0.27
319 0.23
320 0.23
321 0.24
322 0.22
323 0.22
324 0.22
325 0.21
326 0.23
327 0.23
328 0.22
329 0.2
330 0.2
331 0.18
332 0.17
333 0.17
334 0.14
335 0.15
336 0.16
337 0.18
338 0.17
339 0.18
340 0.21
341 0.16
342 0.17
343 0.15
344 0.17
345 0.16
346 0.17
347 0.17
348 0.14
349 0.13
350 0.12
351 0.12
352 0.09
353 0.08
354 0.07
355 0.07
356 0.09
357 0.11
358 0.12
359 0.14
360 0.15
361 0.2
362 0.27
363 0.37
364 0.45
365 0.46
366 0.48
367 0.52
368 0.58
369 0.57
370 0.52
371 0.43
372 0.32
373 0.28
374 0.25
375 0.22
376 0.15
377 0.11
378 0.1
379 0.09
380 0.11
381 0.12
382 0.12
383 0.11
384 0.1
385 0.12
386 0.12
387 0.12
388 0.1
389 0.1
390 0.09
391 0.07
392 0.07
393 0.05
394 0.05
395 0.05
396 0.05
397 0.04
398 0.05
399 0.06
400 0.06
401 0.06
402 0.06
403 0.06
404 0.06
405 0.06
406 0.06
407 0.05
408 0.04
409 0.04
410 0.04
411 0.04
412 0.03
413 0.03
414 0.03
415 0.03
416 0.03
417 0.03
418 0.05
419 0.08
420 0.08
421 0.09
422 0.1
423 0.11
424 0.14
425 0.23
426 0.26
427 0.25
428 0.28
429 0.33
430 0.36
431 0.38
432 0.39
433 0.33
434 0.32
435 0.35
436 0.33
437 0.29
438 0.24
439 0.21
440 0.18
441 0.16
442 0.12
443 0.09
444 0.08
445 0.08
446 0.08
447 0.08
448 0.07
449 0.11
450 0.12
451 0.14
452 0.13
453 0.13
454 0.14
455 0.16
456 0.17
457 0.15
458 0.15
459 0.13
460 0.14
461 0.14
462 0.13
463 0.12
464 0.11
465 0.1
466 0.09
467 0.08
468 0.08
469 0.08
470 0.09
471 0.1
472 0.1
473 0.09
474 0.11
475 0.12
476 0.12
477 0.12
478 0.14
479 0.15
480 0.16
481 0.18
482 0.2
483 0.19
484 0.19
485 0.19
486 0.16
487 0.14
488 0.15
489 0.14
490 0.13
491 0.13
492 0.12
493 0.14
494 0.14
495 0.14
496 0.11
497 0.1
498 0.07
499 0.07
500 0.08
501 0.06
502 0.06
503 0.06
504 0.06
505 0.07
506 0.07
507 0.08
508 0.07
509 0.08
510 0.08
511 0.08
512 0.08
513 0.08
514 0.07
515 0.09
516 0.12
517 0.13
518 0.13
519 0.14
520 0.14
521 0.15
522 0.17
523 0.17
524 0.14
525 0.14
526 0.14
527 0.14
528 0.17
529 0.19
530 0.19
531 0.16
532 0.16
533 0.14
534 0.13
535 0.12
536 0.1
537 0.08
538 0.06
539 0.07
540 0.06
541 0.07
542 0.08
543 0.1
544 0.12
545 0.11
546 0.12
547 0.11
548 0.12
549 0.12
550 0.11
551 0.11
552 0.1
553 0.13
554 0.14
555 0.14
556 0.16
557 0.18
558 0.18
559 0.17
560 0.15
561 0.12
562 0.13
563 0.23
564 0.24
565 0.25
566 0.25
567 0.26
568 0.26
569 0.29
570 0.27
571 0.18
572 0.16
573 0.17
574 0.22
575 0.21
576 0.2
577 0.18
578 0.18
579 0.18
580 0.17
581 0.13
582 0.08
583 0.09
584 0.09
585 0.09
586 0.12
587 0.11
588 0.11
589 0.14
590 0.14
591 0.13
592 0.14
593 0.15
594 0.12
595 0.21
596 0.23
597 0.26
598 0.29
599 0.29
600 0.28
601 0.27
602 0.26
603 0.2
604 0.22
605 0.19
606 0.26
607 0.3
608 0.38
609 0.42
610 0.44
611 0.43
612 0.42
613 0.39
614 0.3
615 0.26
616 0.18
617 0.16
618 0.13
619 0.11
620 0.07
621 0.07
622 0.07
623 0.07
624 0.08
625 0.09
626 0.1
627 0.11
628 0.12
629 0.17
630 0.18
631 0.18
632 0.18
633 0.19
634 0.18
635 0.17
636 0.19
637 0.17
638 0.19
639 0.21
640 0.24
641 0.27
642 0.27
643 0.3
644 0.31
645 0.33
646 0.31
647 0.34
648 0.3
649 0.26
650 0.27
651 0.26
652 0.22
653 0.23
654 0.24
655 0.24
656 0.25
657 0.25
658 0.25
659 0.25
660 0.28
661 0.24
662 0.22
663 0.17
664 0.16
665 0.14
666 0.13
667 0.11
668 0.08
669 0.06
670 0.06
671 0.06
672 0.05
673 0.05
674 0.05
675 0.05
676 0.05
677 0.07
678 0.08
679 0.14
680 0.15
681 0.15
682 0.17
683 0.19
684 0.21
685 0.24
686 0.25
687 0.24
688 0.25
689 0.25
690 0.24
691 0.24
692 0.22
693 0.18
694 0.2
695 0.17
696 0.19
697 0.19
698 0.18
699 0.16
700 0.16
701 0.17
702 0.13
703 0.15
704 0.19
705 0.22
706 0.23
707 0.24
708 0.24
709 0.24
710 0.24
711 0.23
712 0.16
713 0.14
714 0.14
715 0.16
716 0.16
717 0.16
718 0.17
719 0.16
720 0.16
721 0.15
722 0.18
723 0.16
724 0.16
725 0.18
726 0.16
727 0.18
728 0.26
729 0.27
730 0.23
731 0.24
732 0.24
733 0.23
734 0.24
735 0.23
736 0.16
737 0.18
738 0.19
739 0.22
740 0.23
741 0.24
742 0.23
743 0.23
744 0.22
745 0.23
746 0.23
747 0.21
748 0.19
749 0.19
750 0.18
751 0.19
752 0.2
753 0.15
754 0.15
755 0.15
756 0.22
757 0.24
758 0.28
759 0.32
760 0.35
761 0.4
762 0.44
763 0.43
764 0.43
765 0.48
766 0.45
767 0.43
768 0.4
769 0.35
770 0.32
771 0.31
772 0.23
773 0.15
774 0.15
775 0.17
776 0.18
777 0.17
778 0.14
779 0.15
780 0.15
781 0.17
782 0.16
783 0.11
784 0.08
785 0.08
786 0.09
787 0.09
788 0.09
789 0.08
790 0.08
791 0.09
792 0.09
793 0.12
794 0.15
795 0.22
796 0.27
797 0.36
798 0.46
799 0.52
800 0.6
801 0.61
802 0.65
803 0.69
804 0.72
805 0.72
806 0.71
807 0.75
808 0.7
809 0.68
810 0.61
811 0.55
812 0.49
813 0.41
814 0.34
815 0.26
816 0.24
817 0.21
818 0.2
819 0.19
820 0.17
821 0.16
822 0.14
823 0.13
824 0.12
825 0.17
826 0.22
827 0.22
828 0.23
829 0.3
830 0.36
831 0.42
832 0.46
833 0.52
834 0.56
835 0.61
836 0.64
837 0.58
838 0.52
839 0.47
840 0.43
841 0.36
842 0.26
843 0.19
844 0.15
845 0.15
846 0.16
847 0.13
848 0.13
849 0.11
850 0.1
851 0.1
852 0.15
853 0.14
854 0.14
855 0.16
856 0.2
857 0.25
858 0.26
859 0.32
860 0.27
861 0.34
862 0.42
863 0.45
864 0.44
865 0.41
866 0.4
867 0.36
868 0.35
869 0.31
870 0.24
871 0.22
872 0.23
873 0.24
874 0.25
875 0.28
876 0.36
877 0.35
878 0.4
879 0.41
880 0.41
881 0.39
882 0.38
883 0.36
884 0.29
885 0.34
886 0.31
887 0.29
888 0.28
889 0.34
890 0.36
891 0.41
892 0.43
893 0.46
894 0.49
895 0.47
896 0.47
897 0.44
898 0.46
899 0.42
900 0.41
901 0.32
902 0.27
903 0.26
904 0.23
905 0.18