Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0B1PDD2

Protein Details
Accession A0A0B1PDD2    Localization Confidence High Confidence Score 17.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
81-105LVINKNAKKRAAKKKSKTREENLQDHydrophilic
133-161LEIEREKKTRSLKKKLKQARELEDKKKNGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
85-98KNAKKRAAKKKSKT
138-159EKKTRSLKKKLKQARELEDKKK
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 14, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039333  PYM1  
IPR015362  WIBG_mago-bd  
IPR036348  WIBG_N_sf  
Gene Ontology GO:1903259  P:exon-exon junction complex disassembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF09282  Mago-bind  
Amino Acid Sequences MSEVKVSSKAGIVESKTGERHIPSSIRADGTKRKEIKIRPGYKPIEDIEVYRNRYAQSYKSLDSKEVPGTQGLEETKSPSLVINKNAKKRAAKKKSKTREENLQDGPCIKEAGQMTQDSYEFGIATEKTHEALEIEREKKTRSLKKKLKQARELEDKKKNGSNLLPEQVTKILRINELIRELNVLELQSKVNETQDNEKVG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.29
3 0.28
4 0.29
5 0.29
6 0.26
7 0.26
8 0.27
9 0.27
10 0.26
11 0.3
12 0.31
13 0.31
14 0.31
15 0.34
16 0.38
17 0.43
18 0.49
19 0.48
20 0.49
21 0.54
22 0.59
23 0.64
24 0.66
25 0.68
26 0.65
27 0.71
28 0.71
29 0.65
30 0.63
31 0.53
32 0.47
33 0.39
34 0.34
35 0.32
36 0.34
37 0.36
38 0.32
39 0.32
40 0.27
41 0.3
42 0.3
43 0.26
44 0.27
45 0.28
46 0.3
47 0.34
48 0.34
49 0.33
50 0.33
51 0.33
52 0.29
53 0.26
54 0.25
55 0.2
56 0.2
57 0.18
58 0.19
59 0.16
60 0.14
61 0.12
62 0.14
63 0.14
64 0.12
65 0.13
66 0.11
67 0.16
68 0.17
69 0.24
70 0.31
71 0.36
72 0.43
73 0.47
74 0.5
75 0.52
76 0.59
77 0.64
78 0.65
79 0.7
80 0.73
81 0.8
82 0.87
83 0.89
84 0.87
85 0.81
86 0.81
87 0.75
88 0.71
89 0.65
90 0.55
91 0.46
92 0.39
93 0.34
94 0.24
95 0.2
96 0.13
97 0.12
98 0.12
99 0.13
100 0.14
101 0.14
102 0.14
103 0.15
104 0.15
105 0.11
106 0.11
107 0.09
108 0.07
109 0.06
110 0.08
111 0.07
112 0.07
113 0.09
114 0.09
115 0.1
116 0.1
117 0.1
118 0.08
119 0.09
120 0.15
121 0.19
122 0.21
123 0.23
124 0.24
125 0.26
126 0.31
127 0.39
128 0.43
129 0.46
130 0.56
131 0.64
132 0.72
133 0.81
134 0.85
135 0.86
136 0.85
137 0.84
138 0.82
139 0.83
140 0.83
141 0.82
142 0.81
143 0.74
144 0.69
145 0.65
146 0.57
147 0.51
148 0.47
149 0.46
150 0.44
151 0.46
152 0.42
153 0.38
154 0.39
155 0.38
156 0.34
157 0.27
158 0.25
159 0.22
160 0.22
161 0.25
162 0.25
163 0.25
164 0.29
165 0.29
166 0.25
167 0.24
168 0.23
169 0.21
170 0.2
171 0.16
172 0.12
173 0.12
174 0.13
175 0.13
176 0.15
177 0.14
178 0.17
179 0.2
180 0.23
181 0.3