Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0B1PAX1

Protein Details
Accession A0A0B1PAX1    Localization Confidence High Confidence Score 21.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
9-38GSSCQPKQFAQKSRKGKRAWRKNIDSTDVQHydrophilic
170-193PFSFLEKKKKKIPPKTLKKTPVSLHydrophilic
287-320NLTLKRPERKTQAQRNKIKRRKEEERKLKIERDIBasic
410-438IVESRKPIAFAKKPKRKITEKWTHKDFVLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
20-29KSRKGKRAWR
176-189KKKKKIPPKTLKKT
291-323KRPERKTQAQRNKIKRRKEEERKLKIERDIKRK
414-427RKPIAFAKKPKRKI
Subcellular Location(s) nucl 14.5, mito 12, cyto_nucl 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011687  Nop53/GLTSCR2  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0005654  C:nucleoplasm  
GO:0000027  P:ribosomal large subunit assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF07767  Nop53  
Amino Acid Sequences MPLLKRPVGSSCQPKQFAQKSRKGKRAWRKNIDSTDVQNGLEELREELIQGGVITEKRSNELFIIDKRGDTSITKRMSNRRSKILKATEIITQRSSIPAVSTGKRPNQTNINGIIEPKRQRTSYVSHRELTRLKSIAAGQQTRNISGLKEATYNIWNTDIDEDTDSLDHPFSFLEKKKKKIPPKTLKKTPVSLSASGKKFPAVEKPTGAYSYNPSANEYVERLQELGNKEISAEKNRIRAAEAEKIILEAAAKSAVEAEIAEARADLSEWEEDSAWEGFESGIEDGNLTLKRPERKTQAQRNKIKRRKEEERKLKIERDIKRKNAQVSQAIELARELDKKKKDQQLETIGSEDSHIDSYEIRRRKFGNTKLPEKNLELVLPEELQDSLRLLKPEGNLLKERYRSLLERGIVESRKPIAFAKKPKRKITEKWTHKDFVLH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.61
2 0.65
3 0.69
4 0.7
5 0.7
6 0.72
7 0.73
8 0.8
9 0.86
10 0.84
11 0.85
12 0.86
13 0.87
14 0.89
15 0.89
16 0.88
17 0.89
18 0.88
19 0.84
20 0.78
21 0.71
22 0.68
23 0.59
24 0.49
25 0.4
26 0.32
27 0.26
28 0.22
29 0.18
30 0.11
31 0.1
32 0.1
33 0.1
34 0.1
35 0.1
36 0.09
37 0.08
38 0.07
39 0.09
40 0.1
41 0.12
42 0.14
43 0.15
44 0.17
45 0.18
46 0.19
47 0.17
48 0.2
49 0.23
50 0.23
51 0.3
52 0.28
53 0.27
54 0.27
55 0.27
56 0.26
57 0.24
58 0.26
59 0.27
60 0.3
61 0.34
62 0.39
63 0.48
64 0.56
65 0.64
66 0.64
67 0.66
68 0.69
69 0.7
70 0.74
71 0.72
72 0.68
73 0.59
74 0.55
75 0.51
76 0.49
77 0.46
78 0.38
79 0.31
80 0.25
81 0.24
82 0.23
83 0.17
84 0.13
85 0.16
86 0.19
87 0.21
88 0.27
89 0.32
90 0.38
91 0.43
92 0.45
93 0.45
94 0.49
95 0.5
96 0.49
97 0.46
98 0.44
99 0.39
100 0.39
101 0.39
102 0.37
103 0.38
104 0.38
105 0.38
106 0.33
107 0.36
108 0.38
109 0.42
110 0.46
111 0.51
112 0.5
113 0.5
114 0.51
115 0.53
116 0.53
117 0.49
118 0.45
119 0.35
120 0.31
121 0.3
122 0.3
123 0.3
124 0.32
125 0.32
126 0.26
127 0.31
128 0.32
129 0.3
130 0.3
131 0.26
132 0.19
133 0.18
134 0.19
135 0.14
136 0.14
137 0.14
138 0.14
139 0.16
140 0.17
141 0.14
142 0.14
143 0.13
144 0.13
145 0.14
146 0.12
147 0.11
148 0.12
149 0.11
150 0.1
151 0.1
152 0.1
153 0.08
154 0.08
155 0.07
156 0.06
157 0.06
158 0.07
159 0.12
160 0.17
161 0.28
162 0.33
163 0.38
164 0.48
165 0.57
166 0.66
167 0.71
168 0.77
169 0.77
170 0.83
171 0.89
172 0.89
173 0.89
174 0.83
175 0.77
176 0.68
177 0.66
178 0.59
179 0.52
180 0.48
181 0.47
182 0.44
183 0.4
184 0.37
185 0.29
186 0.25
187 0.23
188 0.27
189 0.23
190 0.24
191 0.24
192 0.25
193 0.25
194 0.26
195 0.25
196 0.17
197 0.15
198 0.17
199 0.18
200 0.17
201 0.17
202 0.16
203 0.16
204 0.16
205 0.15
206 0.13
207 0.11
208 0.11
209 0.1
210 0.1
211 0.13
212 0.14
213 0.14
214 0.13
215 0.13
216 0.13
217 0.16
218 0.17
219 0.17
220 0.2
221 0.2
222 0.25
223 0.26
224 0.26
225 0.23
226 0.25
227 0.26
228 0.29
229 0.27
230 0.23
231 0.22
232 0.21
233 0.2
234 0.16
235 0.12
236 0.05
237 0.05
238 0.04
239 0.04
240 0.04
241 0.04
242 0.04
243 0.04
244 0.04
245 0.05
246 0.06
247 0.06
248 0.06
249 0.06
250 0.06
251 0.06
252 0.06
253 0.05
254 0.05
255 0.05
256 0.06
257 0.07
258 0.07
259 0.07
260 0.09
261 0.09
262 0.07
263 0.06
264 0.07
265 0.06
266 0.06
267 0.07
268 0.05
269 0.05
270 0.05
271 0.05
272 0.05
273 0.09
274 0.09
275 0.08
276 0.11
277 0.16
278 0.23
279 0.27
280 0.34
281 0.39
282 0.5
283 0.6
284 0.68
285 0.75
286 0.78
287 0.84
288 0.88
289 0.91
290 0.89
291 0.88
292 0.87
293 0.85
294 0.86
295 0.88
296 0.88
297 0.88
298 0.9
299 0.88
300 0.85
301 0.81
302 0.78
303 0.75
304 0.72
305 0.72
306 0.71
307 0.71
308 0.72
309 0.72
310 0.7
311 0.68
312 0.65
313 0.61
314 0.55
315 0.5
316 0.46
317 0.4
318 0.34
319 0.28
320 0.24
321 0.19
322 0.19
323 0.19
324 0.24
325 0.3
326 0.36
327 0.45
328 0.52
329 0.58
330 0.59
331 0.66
332 0.68
333 0.67
334 0.62
335 0.55
336 0.46
337 0.38
338 0.33
339 0.25
340 0.16
341 0.11
342 0.1
343 0.08
344 0.1
345 0.16
346 0.24
347 0.31
348 0.3
349 0.35
350 0.37
351 0.46
352 0.54
353 0.58
354 0.6
355 0.62
356 0.71
357 0.76
358 0.79
359 0.74
360 0.67
361 0.62
362 0.52
363 0.44
364 0.36
365 0.28
366 0.25
367 0.2
368 0.17
369 0.14
370 0.12
371 0.12
372 0.11
373 0.11
374 0.13
375 0.16
376 0.16
377 0.17
378 0.21
379 0.21
380 0.3
381 0.34
382 0.35
383 0.37
384 0.41
385 0.47
386 0.47
387 0.47
388 0.42
389 0.42
390 0.4
391 0.42
392 0.44
393 0.39
394 0.38
395 0.39
396 0.43
397 0.4
398 0.39
399 0.37
400 0.34
401 0.32
402 0.31
403 0.33
404 0.36
405 0.43
406 0.53
407 0.59
408 0.66
409 0.75
410 0.83
411 0.87
412 0.86
413 0.87
414 0.87
415 0.87
416 0.88
417 0.88
418 0.86
419 0.8