Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q5KA84

Protein Details
Accession Q5KA84    Localization Confidence High Confidence Score 17.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
273-292NYKKQRRRECHNLVEKRRREBasic
321-344EDGKTSAKKKKSKRGGNTSAKSQKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
327-336AKKKKSKRGG
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto 4.5, cyto_mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011598  bHLH_dom  
IPR036638  HLH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0000981  F:DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0046983  F:protein dimerization activity  
GO:0000978  F:RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF00010  HLH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50888  BHLH  
Amino Acid Sequences MSTAKVEGFSIPGNSHMSPRPIHRPFSDGSMTVDTDLLASLMSGGSHQSADRGQFNLPPSSFSFSQSLPVRHHSFDYSLPSPLSTSINIAGHMRNSISGGTGANSGGVFNSVKFGNEHPEPPVSLPPAMDGIEQGSHQRPRSQSSSHSVGKAPSSRSRQARKSMTDVRPPRSSLQRGRSQGPTRPMGLGVSLDTHVEGEMTDSISPPDFGANGAFGLAIASGRDSFNNDTSSWASGSVPSMVPGSLGSFDTDEVLVDSPITPVKPLMQLSDENYKKQRRRECHNLVEKRRREHINAKIEELGTLLPEKYNQIDEPAEEEDEDGKTSAKKKKSKRGGNTSAKSQKDAAHCKGRILSQSVNYIRDLKQVTETQASRISQLEQLLMNLGVNTADENANVNQGFPQQHSLFWLNNNGLNNFPDSGEHNLQAMRPSPEPERSFSFDVVNTQPWSESHDSGGSPNPVNGMHTQENKDMFIPFQPSPTSTNSSHPPNMSDFRRPSHSGSSDMEMDPLSPLGGAEEKGRDKLRQDSQIELQMGMSGLFNTKF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.24
3 0.27
4 0.29
5 0.3
6 0.37
7 0.45
8 0.46
9 0.51
10 0.49
11 0.48
12 0.46
13 0.49
14 0.46
15 0.37
16 0.36
17 0.34
18 0.32
19 0.28
20 0.27
21 0.2
22 0.16
23 0.14
24 0.1
25 0.06
26 0.05
27 0.05
28 0.04
29 0.04
30 0.04
31 0.05
32 0.07
33 0.08
34 0.08
35 0.1
36 0.12
37 0.16
38 0.19
39 0.2
40 0.2
41 0.24
42 0.27
43 0.32
44 0.3
45 0.29
46 0.29
47 0.34
48 0.33
49 0.32
50 0.32
51 0.25
52 0.33
53 0.35
54 0.37
55 0.34
56 0.41
57 0.42
58 0.41
59 0.43
60 0.37
61 0.34
62 0.34
63 0.37
64 0.32
65 0.3
66 0.28
67 0.26
68 0.25
69 0.24
70 0.22
71 0.15
72 0.16
73 0.17
74 0.18
75 0.18
76 0.19
77 0.19
78 0.18
79 0.18
80 0.16
81 0.13
82 0.13
83 0.12
84 0.11
85 0.11
86 0.1
87 0.1
88 0.1
89 0.1
90 0.09
91 0.09
92 0.08
93 0.07
94 0.08
95 0.08
96 0.07
97 0.09
98 0.09
99 0.1
100 0.11
101 0.13
102 0.18
103 0.2
104 0.21
105 0.22
106 0.23
107 0.24
108 0.24
109 0.27
110 0.23
111 0.21
112 0.2
113 0.18
114 0.18
115 0.17
116 0.15
117 0.11
118 0.1
119 0.1
120 0.11
121 0.13
122 0.16
123 0.2
124 0.22
125 0.27
126 0.27
127 0.32
128 0.37
129 0.37
130 0.37
131 0.4
132 0.46
133 0.44
134 0.44
135 0.4
136 0.36
137 0.38
138 0.37
139 0.35
140 0.36
141 0.4
142 0.45
143 0.52
144 0.59
145 0.61
146 0.66
147 0.69
148 0.65
149 0.67
150 0.69
151 0.67
152 0.68
153 0.68
154 0.65
155 0.61
156 0.59
157 0.55
158 0.54
159 0.55
160 0.54
161 0.55
162 0.58
163 0.58
164 0.59
165 0.63
166 0.59
167 0.57
168 0.55
169 0.49
170 0.42
171 0.39
172 0.35
173 0.27
174 0.23
175 0.17
176 0.11
177 0.1
178 0.08
179 0.08
180 0.07
181 0.07
182 0.06
183 0.06
184 0.05
185 0.05
186 0.05
187 0.06
188 0.06
189 0.06
190 0.07
191 0.07
192 0.07
193 0.06
194 0.06
195 0.05
196 0.06
197 0.06
198 0.06
199 0.05
200 0.05
201 0.05
202 0.04
203 0.04
204 0.04
205 0.03
206 0.03
207 0.03
208 0.04
209 0.05
210 0.05
211 0.07
212 0.09
213 0.12
214 0.14
215 0.13
216 0.15
217 0.16
218 0.17
219 0.14
220 0.13
221 0.11
222 0.1
223 0.1
224 0.1
225 0.08
226 0.08
227 0.08
228 0.07
229 0.07
230 0.07
231 0.06
232 0.06
233 0.06
234 0.06
235 0.06
236 0.06
237 0.06
238 0.06
239 0.06
240 0.05
241 0.05
242 0.05
243 0.05
244 0.05
245 0.05
246 0.06
247 0.06
248 0.05
249 0.05
250 0.07
251 0.09
252 0.09
253 0.1
254 0.12
255 0.13
256 0.15
257 0.25
258 0.24
259 0.24
260 0.3
261 0.36
262 0.39
263 0.45
264 0.51
265 0.48
266 0.57
267 0.65
268 0.68
269 0.7
270 0.76
271 0.78
272 0.8
273 0.83
274 0.78
275 0.72
276 0.7
277 0.63
278 0.58
279 0.58
280 0.57
281 0.57
282 0.53
283 0.51
284 0.46
285 0.43
286 0.37
287 0.29
288 0.19
289 0.1
290 0.09
291 0.07
292 0.05
293 0.06
294 0.07
295 0.07
296 0.09
297 0.08
298 0.1
299 0.1
300 0.11
301 0.13
302 0.13
303 0.12
304 0.11
305 0.11
306 0.1
307 0.09
308 0.1
309 0.07
310 0.07
311 0.09
312 0.15
313 0.22
314 0.29
315 0.37
316 0.46
317 0.57
318 0.67
319 0.75
320 0.78
321 0.82
322 0.85
323 0.88
324 0.82
325 0.81
326 0.79
327 0.7
328 0.61
329 0.53
330 0.47
331 0.45
332 0.49
333 0.45
334 0.46
335 0.46
336 0.46
337 0.46
338 0.43
339 0.38
340 0.35
341 0.32
342 0.25
343 0.33
344 0.34
345 0.33
346 0.31
347 0.32
348 0.28
349 0.3
350 0.28
351 0.21
352 0.23
353 0.24
354 0.26
355 0.29
356 0.29
357 0.26
358 0.3
359 0.29
360 0.26
361 0.24
362 0.23
363 0.19
364 0.19
365 0.19
366 0.14
367 0.14
368 0.13
369 0.12
370 0.1
371 0.08
372 0.07
373 0.05
374 0.05
375 0.05
376 0.05
377 0.05
378 0.06
379 0.08
380 0.08
381 0.12
382 0.12
383 0.11
384 0.11
385 0.15
386 0.16
387 0.15
388 0.21
389 0.18
390 0.19
391 0.23
392 0.25
393 0.23
394 0.24
395 0.27
396 0.22
397 0.25
398 0.26
399 0.23
400 0.22
401 0.21
402 0.21
403 0.17
404 0.15
405 0.14
406 0.14
407 0.2
408 0.21
409 0.21
410 0.2
411 0.2
412 0.21
413 0.22
414 0.23
415 0.2
416 0.19
417 0.22
418 0.25
419 0.32
420 0.34
421 0.35
422 0.38
423 0.4
424 0.41
425 0.39
426 0.37
427 0.3
428 0.32
429 0.31
430 0.29
431 0.24
432 0.22
433 0.21
434 0.19
435 0.25
436 0.24
437 0.22
438 0.21
439 0.22
440 0.22
441 0.23
442 0.28
443 0.25
444 0.22
445 0.21
446 0.2
447 0.18
448 0.2
449 0.2
450 0.22
451 0.25
452 0.3
453 0.33
454 0.37
455 0.38
456 0.37
457 0.37
458 0.3
459 0.25
460 0.23
461 0.25
462 0.2
463 0.22
464 0.22
465 0.23
466 0.26
467 0.3
468 0.32
469 0.28
470 0.34
471 0.36
472 0.42
473 0.45
474 0.43
475 0.41
476 0.41
477 0.47
478 0.46
479 0.5
480 0.47
481 0.47
482 0.53
483 0.53
484 0.52
485 0.54
486 0.52
487 0.48
488 0.46
489 0.46
490 0.42
491 0.39
492 0.35
493 0.25
494 0.23
495 0.19
496 0.16
497 0.11
498 0.07
499 0.07
500 0.08
501 0.1
502 0.1
503 0.12
504 0.19
505 0.21
506 0.27
507 0.3
508 0.32
509 0.34
510 0.43
511 0.48
512 0.52
513 0.52
514 0.53
515 0.55
516 0.6
517 0.57
518 0.47
519 0.38
520 0.3
521 0.28
522 0.22
523 0.17
524 0.09