Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P0CN34

Protein Details
Accession P0CN34    Localization Confidence High Confidence Score 19.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-42MPADKKQRKGAHPYRKPRPNPSDPSSSDKPARPKPTHRIPATHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
5-38KKQRKGAHPYRKPRPNPSDPSSSDKPARPKPTHR
101-129RKNGAKYHKVKFFERQKLVRLIKRFKRKL
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019310  Efg1  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030688  C:preribosome, small subunit precursor  
GO:0000462  P:maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
Pfam View protein in Pfam  
PF10153  Efg1  
Amino Acid Sequences MPADKKQRKGAHPYRKPRPNPSDPSSSDKPARPKPTHRIPATEARDGAGIPGLSKLKSSIRQTKRLLAKENLEPGLRVSTQRRLTSLEADLAAAERREVERKNGAKYHKVKFFERQKLVRLIKRFKRKLLDSETSSKKRSKHEEELLDARIMLNYVLHYPNTQKYISLFPSNPNQTEDEDDDDDSSKPKLKLPPLLHPVPSTEECEKMDKPTKRRYDLLLETKRLMEESKLKSEPETDLKKGQVDGVVVGLGADVQIGLGDKKEAKQNAAQGTGEEEDDFFESGDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.88
2 0.89
3 0.9
4 0.89
5 0.89
6 0.88
7 0.86
8 0.82
9 0.81
10 0.74
11 0.75
12 0.69
13 0.66
14 0.62
15 0.59
16 0.62
17 0.61
18 0.67
19 0.67
20 0.71
21 0.74
22 0.79
23 0.83
24 0.77
25 0.74
26 0.69
27 0.72
28 0.69
29 0.63
30 0.52
31 0.43
32 0.4
33 0.33
34 0.28
35 0.2
36 0.14
37 0.09
38 0.13
39 0.14
40 0.13
41 0.14
42 0.16
43 0.19
44 0.26
45 0.34
46 0.41
47 0.47
48 0.56
49 0.59
50 0.65
51 0.69
52 0.68
53 0.67
54 0.61
55 0.59
56 0.56
57 0.58
58 0.51
59 0.43
60 0.36
61 0.31
62 0.3
63 0.25
64 0.22
65 0.2
66 0.26
67 0.32
68 0.33
69 0.33
70 0.33
71 0.35
72 0.35
73 0.33
74 0.27
75 0.21
76 0.19
77 0.18
78 0.14
79 0.13
80 0.09
81 0.07
82 0.07
83 0.08
84 0.12
85 0.13
86 0.17
87 0.25
88 0.29
89 0.34
90 0.39
91 0.41
92 0.47
93 0.53
94 0.56
95 0.54
96 0.54
97 0.52
98 0.56
99 0.62
100 0.63
101 0.63
102 0.59
103 0.56
104 0.62
105 0.64
106 0.6
107 0.58
108 0.57
109 0.58
110 0.66
111 0.66
112 0.62
113 0.64
114 0.62
115 0.62
116 0.61
117 0.59
118 0.52
119 0.56
120 0.58
121 0.54
122 0.54
123 0.49
124 0.45
125 0.46
126 0.5
127 0.5
128 0.51
129 0.55
130 0.55
131 0.55
132 0.54
133 0.49
134 0.4
135 0.32
136 0.23
137 0.15
138 0.12
139 0.08
140 0.05
141 0.04
142 0.06
143 0.07
144 0.07
145 0.08
146 0.1
147 0.13
148 0.16
149 0.15
150 0.14
151 0.15
152 0.19
153 0.21
154 0.23
155 0.21
156 0.21
157 0.29
158 0.31
159 0.31
160 0.28
161 0.27
162 0.24
163 0.26
164 0.25
165 0.21
166 0.2
167 0.19
168 0.17
169 0.17
170 0.16
171 0.14
172 0.13
173 0.15
174 0.14
175 0.19
176 0.24
177 0.28
178 0.37
179 0.4
180 0.49
181 0.5
182 0.53
183 0.5
184 0.44
185 0.42
186 0.38
187 0.35
188 0.3
189 0.25
190 0.24
191 0.25
192 0.28
193 0.27
194 0.29
195 0.36
196 0.39
197 0.44
198 0.52
199 0.59
200 0.6
201 0.62
202 0.6
203 0.6
204 0.62
205 0.66
206 0.64
207 0.58
208 0.54
209 0.52
210 0.47
211 0.39
212 0.31
213 0.25
214 0.26
215 0.28
216 0.35
217 0.35
218 0.36
219 0.36
220 0.37
221 0.37
222 0.38
223 0.39
224 0.35
225 0.37
226 0.39
227 0.4
228 0.38
229 0.35
230 0.28
231 0.22
232 0.19
233 0.15
234 0.13
235 0.11
236 0.1
237 0.08
238 0.05
239 0.04
240 0.03
241 0.02
242 0.02
243 0.03
244 0.04
245 0.04
246 0.05
247 0.08
248 0.1
249 0.13
250 0.21
251 0.24
252 0.27
253 0.32
254 0.38
255 0.42
256 0.44
257 0.41
258 0.34
259 0.36
260 0.33
261 0.28
262 0.22
263 0.16
264 0.13
265 0.15
266 0.14