Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0B1PDH1

Protein Details
Accession A0A0B1PDH1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
677-703LFVGSRRGTRPKTKERHEKATNKRKIEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
682-702RRGTRPKTKERHEKATNKRKI
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13, cyto 2.5, mito 2, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR019451  Rtp1_C1  
IPR019414  Rtp1_C2  
IPR039600  TANGO6/Rtp1  
Pfam View protein in Pfam  
PF10363  RTP1_C1  
PF10304  RTP1_C2  
Amino Acid Sequences MTSAGENKQSSLISKILQSAKQAFDTSTRADLQSQNLQNFNSLIEGIPTQALLPALNLLVQPGRIPERLRENLISTLAQVPLRANGVQDTIEFILSIHPSTNSINATSTGRTSFITHDALNAISRLLSSHPATISAEAWFNGIAPQLLYLLLGNEGQDLDKVVAYVIGFGILGRKQYGSPGSPGWRAIIEPIYKDISPSNAIVKARSQNFISPDGTEYVELRKVVSTPLNLKNSLKRITSLVTFHPHPFLAGRILSPILYSLWTLSCWPNGNELTENSYRKPAKKLLKMLLHLSSNNKDKTHKSLLNTILENIICERQNEILKRGWKFASVEDGGIQIEIISASNQIIDDIDLQSMNNAIDFFISLLRENTQMSSEVSVLFASLGSKWLAENSEESHILKTSSNQKSMEELDNERVHLIELNVLQKLITELPEKLIENSKQLLEFTYHILNCSNESNYSEANYDAIPIALSLLNVTITATSFRITTKNRPLIEMIEKALKTLDERDLGETSRTARNLLMLISLRDTVNSPEPDRSPKEILLMDQHLEDKKTYNLALSYITSPESPPPVRVQGLELLSSLLEVNSPIIDVPSFVTILTSILVDEEEYVHLRVIKLLVQLSHKHPKTTIRDIIDRYVDPNEECELDQRLRLGEALHQILQSNTSFFSDEIGKFLCEALLFVGSRRGTRPKTKERHEKATNKRKIEAEKAWGGPLPQLDQEIDFAYDEDFAINFQIVSGWESCRGTEDIRIRSSAITILGAALKANLQSIKSQLVSAALDLSIHILSLERDIEKSILRRAAVVLVMNFLQALDSAKADKQSLKFGLTDHGLADVRRIMKYAERTDNDNLVREHCKTVIESLESWSLANSLLPFQQQSASIQYIVGLPLLSNTTNTLKNSRPNIVEVE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.29
3 0.32
4 0.34
5 0.38
6 0.4
7 0.4
8 0.42
9 0.41
10 0.34
11 0.33
12 0.35
13 0.32
14 0.3
15 0.29
16 0.27
17 0.3
18 0.32
19 0.33
20 0.39
21 0.42
22 0.41
23 0.42
24 0.41
25 0.39
26 0.36
27 0.31
28 0.23
29 0.17
30 0.13
31 0.12
32 0.12
33 0.11
34 0.11
35 0.1
36 0.09
37 0.1
38 0.1
39 0.08
40 0.08
41 0.08
42 0.08
43 0.09
44 0.09
45 0.09
46 0.1
47 0.1
48 0.1
49 0.13
50 0.18
51 0.2
52 0.23
53 0.28
54 0.36
55 0.41
56 0.46
57 0.44
58 0.44
59 0.44
60 0.44
61 0.38
62 0.3
63 0.28
64 0.26
65 0.23
66 0.2
67 0.18
68 0.17
69 0.2
70 0.18
71 0.16
72 0.15
73 0.16
74 0.16
75 0.15
76 0.16
77 0.15
78 0.14
79 0.13
80 0.12
81 0.13
82 0.14
83 0.14
84 0.11
85 0.11
86 0.13
87 0.14
88 0.18
89 0.16
90 0.16
91 0.17
92 0.18
93 0.2
94 0.2
95 0.2
96 0.18
97 0.17
98 0.17
99 0.18
100 0.19
101 0.21
102 0.23
103 0.2
104 0.21
105 0.21
106 0.2
107 0.19
108 0.16
109 0.12
110 0.09
111 0.09
112 0.09
113 0.09
114 0.13
115 0.14
116 0.17
117 0.17
118 0.19
119 0.2
120 0.2
121 0.19
122 0.16
123 0.16
124 0.13
125 0.13
126 0.11
127 0.1
128 0.09
129 0.09
130 0.08
131 0.07
132 0.07
133 0.07
134 0.07
135 0.07
136 0.06
137 0.06
138 0.07
139 0.07
140 0.06
141 0.07
142 0.07
143 0.07
144 0.07
145 0.08
146 0.07
147 0.07
148 0.07
149 0.07
150 0.08
151 0.07
152 0.08
153 0.06
154 0.06
155 0.05
156 0.05
157 0.09
158 0.08
159 0.09
160 0.1
161 0.11
162 0.11
163 0.15
164 0.2
165 0.19
166 0.21
167 0.25
168 0.29
169 0.3
170 0.3
171 0.28
172 0.24
173 0.22
174 0.22
175 0.22
176 0.2
177 0.19
178 0.21
179 0.23
180 0.22
181 0.22
182 0.21
183 0.18
184 0.18
185 0.19
186 0.19
187 0.21
188 0.21
189 0.22
190 0.26
191 0.3
192 0.31
193 0.33
194 0.31
195 0.31
196 0.33
197 0.36
198 0.32
199 0.26
200 0.25
201 0.23
202 0.22
203 0.19
204 0.16
205 0.15
206 0.17
207 0.16
208 0.15
209 0.14
210 0.13
211 0.16
212 0.18
213 0.19
214 0.24
215 0.32
216 0.35
217 0.36
218 0.39
219 0.42
220 0.45
221 0.46
222 0.4
223 0.33
224 0.32
225 0.33
226 0.33
227 0.29
228 0.27
229 0.28
230 0.29
231 0.29
232 0.29
233 0.26
234 0.23
235 0.21
236 0.18
237 0.16
238 0.14
239 0.13
240 0.13
241 0.13
242 0.12
243 0.11
244 0.11
245 0.08
246 0.08
247 0.08
248 0.07
249 0.07
250 0.08
251 0.1
252 0.11
253 0.13
254 0.15
255 0.16
256 0.2
257 0.2
258 0.22
259 0.21
260 0.21
261 0.24
262 0.27
263 0.29
264 0.25
265 0.32
266 0.34
267 0.35
268 0.4
269 0.42
270 0.46
271 0.53
272 0.59
273 0.6
274 0.63
275 0.63
276 0.61
277 0.57
278 0.5
279 0.43
280 0.4
281 0.37
282 0.37
283 0.37
284 0.34
285 0.34
286 0.34
287 0.4
288 0.45
289 0.43
290 0.39
291 0.45
292 0.48
293 0.49
294 0.47
295 0.4
296 0.34
297 0.29
298 0.27
299 0.2
300 0.17
301 0.13
302 0.13
303 0.13
304 0.15
305 0.2
306 0.21
307 0.23
308 0.26
309 0.31
310 0.32
311 0.35
312 0.31
313 0.29
314 0.29
315 0.27
316 0.28
317 0.23
318 0.22
319 0.18
320 0.18
321 0.15
322 0.14
323 0.12
324 0.05
325 0.04
326 0.04
327 0.04
328 0.03
329 0.04
330 0.04
331 0.04
332 0.04
333 0.04
334 0.04
335 0.05
336 0.06
337 0.06
338 0.06
339 0.06
340 0.06
341 0.06
342 0.07
343 0.06
344 0.05
345 0.05
346 0.04
347 0.04
348 0.04
349 0.05
350 0.05
351 0.06
352 0.06
353 0.07
354 0.08
355 0.08
356 0.09
357 0.09
358 0.09
359 0.09
360 0.1
361 0.1
362 0.09
363 0.09
364 0.09
365 0.08
366 0.07
367 0.06
368 0.05
369 0.04
370 0.04
371 0.05
372 0.05
373 0.05
374 0.05
375 0.06
376 0.07
377 0.07
378 0.08
379 0.09
380 0.11
381 0.12
382 0.13
383 0.13
384 0.12
385 0.12
386 0.12
387 0.13
388 0.21
389 0.24
390 0.28
391 0.28
392 0.28
393 0.29
394 0.32
395 0.32
396 0.24
397 0.22
398 0.24
399 0.24
400 0.24
401 0.21
402 0.18
403 0.15
404 0.13
405 0.11
406 0.08
407 0.09
408 0.1
409 0.1
410 0.1
411 0.09
412 0.09
413 0.09
414 0.07
415 0.08
416 0.08
417 0.08
418 0.1
419 0.12
420 0.12
421 0.12
422 0.17
423 0.16
424 0.16
425 0.17
426 0.16
427 0.15
428 0.15
429 0.14
430 0.11
431 0.11
432 0.11
433 0.13
434 0.13
435 0.13
436 0.14
437 0.13
438 0.13
439 0.13
440 0.12
441 0.09
442 0.1
443 0.11
444 0.1
445 0.11
446 0.1
447 0.09
448 0.09
449 0.08
450 0.08
451 0.06
452 0.06
453 0.05
454 0.04
455 0.05
456 0.04
457 0.04
458 0.04
459 0.04
460 0.04
461 0.04
462 0.04
463 0.03
464 0.03
465 0.04
466 0.05
467 0.05
468 0.05
469 0.06
470 0.12
471 0.15
472 0.22
473 0.3
474 0.37
475 0.37
476 0.38
477 0.39
478 0.38
479 0.39
480 0.33
481 0.25
482 0.23
483 0.22
484 0.21
485 0.2
486 0.16
487 0.13
488 0.14
489 0.15
490 0.12
491 0.13
492 0.15
493 0.16
494 0.16
495 0.16
496 0.14
497 0.14
498 0.15
499 0.15
500 0.14
501 0.13
502 0.13
503 0.13
504 0.13
505 0.12
506 0.1
507 0.1
508 0.1
509 0.11
510 0.1
511 0.1
512 0.1
513 0.1
514 0.15
515 0.16
516 0.17
517 0.19
518 0.2
519 0.25
520 0.28
521 0.31
522 0.28
523 0.26
524 0.28
525 0.26
526 0.25
527 0.24
528 0.22
529 0.18
530 0.16
531 0.18
532 0.15
533 0.16
534 0.15
535 0.12
536 0.12
537 0.13
538 0.13
539 0.12
540 0.11
541 0.11
542 0.12
543 0.12
544 0.12
545 0.11
546 0.11
547 0.1
548 0.11
549 0.11
550 0.15
551 0.14
552 0.15
553 0.17
554 0.2
555 0.2
556 0.2
557 0.2
558 0.2
559 0.2
560 0.19
561 0.16
562 0.13
563 0.12
564 0.12
565 0.1
566 0.05
567 0.04
568 0.04
569 0.04
570 0.04
571 0.04
572 0.04
573 0.04
574 0.04
575 0.04
576 0.05
577 0.06
578 0.06
579 0.06
580 0.06
581 0.06
582 0.06
583 0.06
584 0.05
585 0.04
586 0.04
587 0.04
588 0.04
589 0.04
590 0.05
591 0.05
592 0.07
593 0.07
594 0.07
595 0.09
596 0.09
597 0.09
598 0.09
599 0.11
600 0.12
601 0.13
602 0.14
603 0.17
604 0.21
605 0.27
606 0.36
607 0.35
608 0.34
609 0.35
610 0.41
611 0.45
612 0.51
613 0.51
614 0.46
615 0.5
616 0.52
617 0.53
618 0.48
619 0.41
620 0.34
621 0.29
622 0.26
623 0.2
624 0.2
625 0.17
626 0.15
627 0.15
628 0.15
629 0.17
630 0.16
631 0.16
632 0.15
633 0.15
634 0.14
635 0.14
636 0.13
637 0.12
638 0.16
639 0.18
640 0.18
641 0.17
642 0.18
643 0.17
644 0.18
645 0.15
646 0.11
647 0.1
648 0.1
649 0.1
650 0.1
651 0.12
652 0.14
653 0.14
654 0.15
655 0.16
656 0.15
657 0.14
658 0.14
659 0.13
660 0.08
661 0.08
662 0.07
663 0.09
664 0.09
665 0.09
666 0.14
667 0.14
668 0.16
669 0.19
670 0.26
671 0.3
672 0.4
673 0.49
674 0.55
675 0.64
676 0.73
677 0.81
678 0.81
679 0.86
680 0.86
681 0.86
682 0.87
683 0.88
684 0.86
685 0.79
686 0.76
687 0.71
688 0.68
689 0.66
690 0.61
691 0.57
692 0.55
693 0.52
694 0.48
695 0.43
696 0.37
697 0.3
698 0.26
699 0.21
700 0.15
701 0.15
702 0.14
703 0.14
704 0.15
705 0.14
706 0.13
707 0.11
708 0.1
709 0.09
710 0.09
711 0.08
712 0.08
713 0.06
714 0.06
715 0.06
716 0.06
717 0.05
718 0.05
719 0.06
720 0.06
721 0.08
722 0.09
723 0.1
724 0.13
725 0.14
726 0.14
727 0.17
728 0.18
729 0.17
730 0.23
731 0.29
732 0.31
733 0.33
734 0.34
735 0.32
736 0.3
737 0.3
738 0.24
739 0.18
740 0.13
741 0.11
742 0.11
743 0.1
744 0.1
745 0.09
746 0.08
747 0.07
748 0.07
749 0.09
750 0.1
751 0.1
752 0.12
753 0.14
754 0.18
755 0.18
756 0.18
757 0.16
758 0.17
759 0.17
760 0.15
761 0.14
762 0.1
763 0.09
764 0.09
765 0.1
766 0.07
767 0.07
768 0.06
769 0.06
770 0.06
771 0.08
772 0.11
773 0.1
774 0.11
775 0.12
776 0.14
777 0.17
778 0.2
779 0.24
780 0.26
781 0.25
782 0.26
783 0.26
784 0.27
785 0.25
786 0.24
787 0.18
788 0.16
789 0.16
790 0.15
791 0.14
792 0.1
793 0.09
794 0.07
795 0.09
796 0.08
797 0.09
798 0.12
799 0.13
800 0.16
801 0.18
802 0.23
803 0.22
804 0.29
805 0.31
806 0.31
807 0.3
808 0.29
809 0.33
810 0.29
811 0.28
812 0.2
813 0.22
814 0.21
815 0.2
816 0.21
817 0.2
818 0.21
819 0.2
820 0.21
821 0.18
822 0.24
823 0.33
824 0.39
825 0.44
826 0.44
827 0.49
828 0.53
829 0.59
830 0.55
831 0.51
832 0.44
833 0.39
834 0.41
835 0.39
836 0.37
837 0.31
838 0.31
839 0.27
840 0.3
841 0.3
842 0.29
843 0.27
844 0.28
845 0.3
846 0.28
847 0.26
848 0.22
849 0.17
850 0.14
851 0.15
852 0.12
853 0.11
854 0.13
855 0.15
856 0.15
857 0.16
858 0.18
859 0.18
860 0.2
861 0.23
862 0.23
863 0.21
864 0.2
865 0.2
866 0.19
867 0.18
868 0.16
869 0.1
870 0.08
871 0.09
872 0.12
873 0.11
874 0.11
875 0.14
876 0.18
877 0.22
878 0.25
879 0.3
880 0.33
881 0.41
882 0.47
883 0.51
884 0.49