FuNGI

A0A0B1P7B4

Protein Details

Accession

A0A0B1P7B4

Localization Confidence

High

Confidence Score

23.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
13-49	TPNSGKPLFVRRPRRTDPLRPRKKPLNRPPPPHIRSS	Hydrophilic
418-441	AEARKKFGKNVKKALKKRERNYIY	Hydrophilic
522-547	ESSGNESSRKKHKKRHFTPNIEIMNS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
22-44	VRRPRRTDPLRPRKKPLNRPPPP
420-436	ARKKFGKNVKKALKKRE
529-536	SRKKHKKR

Subcellular Location(s)

nucl 25, cyto_nucl 14.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0003743 F:translation initiation factor activity GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MSASPSGQSNGPTPNSGKPLFVRRPRRTDPLRPRKKPLNRPPPPHIRSSLVPPLPEASPLYPVNGLAPQIRSLNQQTDPQARDLKGGWTTNHEGEYSDYPLITTKRALREGLRYHIARFYSKKDIDPRNQYQFTRPVVLHRRDPQQPSGKGCKDGELEVDQLIDSKERERQEIARAEKEKQRVIDLAQIAPSGNNASSLATKKVVSGRIEKTTQVYHLDTSEEDKKASDLRYEEALPWHLEDADNKNTWIGNYEAALSDMNVALIMQDGVFKMIPIEKWYRFSSKGQFKAYTIDEAEAKMGKKVKESRWVMKEIEKKEADRANLEGRKAMVKLFTVKTESSTFKNSGKREIEDMDELDFNGEDLFQDDDELATVEPDKDEETKEAKNRIKKEQLGANVFDQADEAEVDRELLEEEKEAEARKKFGKNVKKALKKRERNYIYDSDSDHPYSEISEDDTSDEEKVKEIDKRLEEENKNKLKTDSKAIPSISMKGAINQASRSKDNDILKKTLSRKRLGSPSHSESSGNESSRKKHKKRHFTPNIEIMNSTSGPQSISPNSQHSSGTQNSHNLTVKNANSNGKSLDNYSTSGNLSPISDNEATRGDISDQAKKRHKSNVSVIKNSSRAGSRQGSPIPGKSIIGGGVNHGSGMSFLVFVTMFKSRRSWHMYAGASTNLRQKRY

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.35
2	0.41
3	0.39
4	0.39
5	0.38
6	0.46
7	0.52
8	0.59
9	0.64
10	0.67
11	0.76
12	0.79
13	0.83
14	0.82
15	0.83
16	0.85
17	0.85
18	0.87
19	0.85
20	0.87
21	0.88
22	0.9
23	0.9
24	0.9
25	0.9
26	0.89
27	0.9
28	0.9
29	0.91
30	0.84
31	0.8
32	0.73
33	0.67
34	0.6
35	0.6
36	0.6
37	0.52
38	0.48
39	0.42
40	0.4
41	0.35
42	0.34
43	0.28
44	0.2
45	0.22
46	0.22
47	0.23
48	0.21
49	0.2
50	0.2
51	0.19
52	0.19
53	0.17
54	0.18
55	0.18
56	0.2
57	0.21
58	0.24
59	0.27
60	0.31
61	0.31
62	0.35
63	0.39
64	0.45
65	0.46
66	0.45
67	0.48
68	0.42
69	0.42
70	0.38
71	0.37
72	0.34
73	0.36
74	0.32
75	0.32
76	0.36
77	0.36
78	0.36
79	0.31
80	0.26
81	0.26
82	0.28
83	0.24
84	0.2
85	0.17
86	0.16
87	0.2
88	0.21
89	0.19
90	0.2
91	0.23
92	0.29
93	0.32
94	0.35
95	0.35
96	0.43
97	0.47
98	0.49
99	0.5
100	0.44
101	0.43
102	0.45
103	0.43
104	0.4
105	0.38
106	0.38
107	0.4
108	0.42
109	0.46
110	0.51
111	0.59
112	0.62
113	0.68
114	0.7
115	0.7
116	0.73
117	0.68
118	0.65
119	0.63
120	0.57
121	0.52
122	0.44
123	0.44
124	0.49
125	0.52
126	0.54
127	0.53
128	0.57
129	0.59
130	0.64
131	0.63
132	0.63
133	0.63
134	0.62
135	0.66
136	0.62
137	0.6
138	0.55
139	0.51
140	0.43
141	0.39
142	0.35
143	0.28
144	0.26
145	0.2
146	0.2
147	0.15
148	0.13
149	0.13
150	0.11
151	0.09
152	0.1
153	0.16
154	0.17
155	0.2
156	0.22
157	0.25
158	0.31
159	0.39
160	0.42
161	0.45
162	0.46
163	0.48
164	0.51
165	0.53
166	0.49
167	0.42
168	0.4
169	0.33
170	0.32
171	0.35
172	0.31
173	0.27
174	0.23
175	0.22
176	0.19
177	0.17
178	0.16
179	0.1
180	0.08
181	0.08
182	0.07
183	0.08
184	0.11
185	0.13
186	0.15
187	0.15
188	0.15
189	0.17
190	0.21
191	0.25
192	0.26
193	0.31
194	0.33
195	0.37
196	0.38
197	0.37
198	0.35
199	0.31
200	0.3
201	0.27
202	0.24
203	0.19
204	0.18
205	0.19
206	0.16
207	0.19
208	0.22
209	0.19
210	0.18
211	0.17
212	0.18
213	0.2
214	0.21
215	0.2
216	0.16
217	0.17
218	0.2
219	0.21
220	0.21
221	0.19
222	0.2
223	0.17
224	0.16
225	0.14
226	0.12
227	0.11
228	0.13
229	0.16
230	0.19
231	0.19
232	0.18
233	0.19
234	0.19
235	0.18
236	0.17
237	0.13
238	0.09
239	0.09
240	0.1
241	0.09
242	0.1
243	0.1
244	0.07
245	0.07
246	0.06
247	0.06
248	0.05
249	0.04
250	0.03
251	0.04
252	0.04
253	0.03
254	0.03
255	0.04
256	0.05
257	0.05
258	0.05
259	0.05
260	0.07
261	0.07
262	0.11
263	0.16
264	0.17
265	0.21
266	0.24
267	0.27
268	0.28
269	0.32
270	0.38
271	0.41
272	0.46
273	0.47
274	0.46
275	0.43
276	0.44
277	0.41
278	0.34
279	0.25
280	0.2
281	0.16
282	0.15
283	0.15
284	0.13
285	0.12
286	0.12
287	0.15
288	0.15
289	0.2
290	0.27
291	0.31
292	0.39
293	0.44
294	0.49
295	0.49
296	0.53
297	0.48
298	0.48
299	0.51
300	0.43
301	0.46
302	0.39
303	0.36
304	0.38
305	0.4
306	0.33
307	0.27
308	0.28
309	0.28
310	0.29
311	0.29
312	0.24
313	0.21
314	0.21
315	0.2
316	0.19
317	0.12
318	0.1
319	0.15
320	0.14
321	0.15
322	0.16
323	0.16
324	0.18
325	0.2
326	0.21
327	0.19
328	0.21
329	0.22
330	0.25
331	0.31
332	0.29
333	0.34
334	0.34
335	0.33
336	0.32
337	0.31
338	0.28
339	0.24
340	0.23
341	0.17
342	0.14
343	0.13
344	0.1
345	0.09
346	0.06
347	0.05
348	0.04
349	0.03
350	0.04
351	0.04
352	0.04
353	0.04
354	0.04
355	0.04
356	0.05
357	0.05
358	0.04
359	0.04
360	0.04
361	0.04
362	0.04
363	0.05
364	0.06
365	0.06
366	0.07
367	0.1
368	0.13
369	0.17
370	0.21
371	0.28
372	0.32
373	0.38
374	0.42
375	0.47
376	0.52
377	0.52
378	0.52
379	0.5
380	0.52
381	0.49
382	0.46
383	0.38
384	0.33
385	0.3
386	0.25
387	0.19
388	0.13
389	0.1
390	0.08
391	0.08
392	0.05
393	0.05
394	0.05
395	0.05
396	0.05
397	0.05
398	0.05
399	0.05
400	0.05
401	0.06
402	0.07
403	0.08
404	0.09
405	0.13
406	0.14
407	0.17
408	0.22
409	0.25
410	0.31
411	0.39
412	0.48
413	0.52
414	0.61
415	0.68
416	0.73
417	0.76
418	0.82
419	0.83
420	0.83
421	0.81
422	0.81
423	0.77
424	0.71
425	0.71
426	0.67
427	0.59
428	0.52
429	0.5
430	0.42
431	0.39
432	0.35
433	0.28
434	0.21
435	0.17
436	0.15
437	0.12
438	0.1
439	0.09
440	0.09
441	0.09
442	0.1
443	0.11
444	0.11
445	0.11
446	0.12
447	0.1
448	0.1
449	0.11
450	0.13
451	0.16
452	0.19
453	0.25
454	0.26
455	0.29
456	0.33
457	0.41
458	0.44
459	0.47
460	0.53
461	0.55
462	0.54
463	0.52
464	0.51
465	0.48
466	0.45
467	0.47
468	0.45
469	0.41
470	0.45
471	0.44
472	0.45
473	0.4
474	0.4
475	0.33
476	0.28
477	0.24
478	0.2
479	0.24
480	0.23
481	0.22
482	0.22
483	0.26
484	0.27
485	0.29
486	0.3
487	0.3
488	0.33
489	0.39
490	0.44
491	0.44
492	0.43
493	0.44
494	0.48
495	0.53
496	0.53
497	0.53
498	0.51
499	0.5
500	0.55
501	0.62
502	0.59
503	0.59
504	0.6
505	0.6
506	0.57
507	0.54
508	0.47
509	0.38
510	0.41
511	0.39
512	0.32
513	0.31
514	0.31
515	0.37
516	0.47
517	0.57
518	0.58
519	0.63
520	0.72
521	0.77
522	0.85
523	0.9
524	0.9
525	0.88
526	0.88
527	0.87
528	0.82
529	0.71
530	0.62
531	0.51
532	0.44
533	0.35
534	0.27
535	0.18
536	0.13
537	0.13
538	0.14
539	0.17
540	0.16
541	0.21
542	0.23
543	0.28
544	0.29
545	0.3
546	0.29
547	0.27
548	0.3
549	0.29
550	0.3
551	0.29
552	0.32
553	0.32
554	0.37
555	0.39
556	0.33
557	0.33
558	0.36
559	0.35
560	0.37
561	0.4
562	0.41
563	0.39
564	0.4
565	0.39
566	0.35
567	0.33
568	0.29
569	0.29
570	0.25
571	0.25
572	0.24
573	0.23
574	0.22
575	0.21
576	0.2
577	0.16
578	0.15
579	0.15
580	0.14
581	0.18
582	0.19
583	0.18
584	0.2
585	0.21
586	0.2
587	0.2
588	0.21
589	0.16
590	0.2
591	0.24
592	0.31
593	0.35
594	0.43
595	0.52
596	0.55
597	0.59
598	0.62
599	0.66
600	0.65
601	0.7
602	0.72
603	0.72
604	0.74
605	0.74
606	0.71
607	0.67
608	0.59
609	0.53
610	0.45
611	0.39
612	0.39
613	0.4
614	0.36
615	0.4
616	0.42
617	0.46
618	0.46
619	0.47
620	0.45
621	0.4
622	0.37
623	0.31
624	0.29
625	0.23
626	0.22
627	0.18
628	0.17
629	0.17
630	0.17
631	0.16
632	0.14
633	0.13
634	0.1
635	0.11
636	0.08
637	0.06
638	0.06
639	0.07
640	0.07
641	0.08
642	0.11
643	0.16
644	0.18
645	0.19
646	0.25
647	0.27
648	0.36
649	0.44
650	0.44
651	0.44
652	0.52
653	0.53
654	0.52
655	0.52
656	0.49
657	0.42
658	0.42
659	0.44

A0A0B1P7B4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer