Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0B1P5M4

Protein Details
Accession A0A0B1P5M4    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
253-278NTQSRDHRGKKAKDSRKSVRCWKCKEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
260-265RGKKAK
Subcellular Location(s) nucl 14, cyto_nucl 12, cyto 8, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00098  zf-CCHC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MNVKSHCQKLSKADCSDEGDEEESEAENDNEPMTGWDMPFNFRPLQLRTKTKLIWGSFRWELHRSMYFKGTSNWIAYKEALLTQIEGIGYLPGMRLTPLYEVKLVGVVQSTSTSTPEAQIFIRGLKQGTKITRTFEATFQQVGHVQQETTWDDLTSLKYKGGCPLKFVMKFRTTVNNFFSVGGKLSKSQMKTIFKTSVKDKASSLYGMASNIPQSQDWTAEQLYQNFISQLYQRVDKEPKADDKQVTPKSLHNTQSRDHRGKKAKDSRKSVRCWKCKEEGHYSNKCPKKKANAQGADVDATNDKKNLTPESVIEFKPKQFSVLTGIGVTYADCMGEVLLPLKGPQGTHTVLRLKYVVCLRELPSGIISGERFYRCGGYLDHNRFINPEGVTITH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.57
2 0.59
3 0.56
4 0.48
5 0.4
6 0.33
7 0.29
8 0.26
9 0.22
10 0.16
11 0.14
12 0.13
13 0.12
14 0.1
15 0.11
16 0.1
17 0.1
18 0.09
19 0.1
20 0.11
21 0.12
22 0.12
23 0.15
24 0.16
25 0.2
26 0.23
27 0.25
28 0.24
29 0.25
30 0.3
31 0.31
32 0.39
33 0.44
34 0.5
35 0.51
36 0.57
37 0.56
38 0.57
39 0.6
40 0.54
41 0.54
42 0.48
43 0.5
44 0.48
45 0.49
46 0.47
47 0.42
48 0.41
49 0.38
50 0.42
51 0.37
52 0.36
53 0.38
54 0.35
55 0.35
56 0.35
57 0.35
58 0.31
59 0.32
60 0.31
61 0.28
62 0.28
63 0.26
64 0.25
65 0.21
66 0.19
67 0.17
68 0.15
69 0.14
70 0.12
71 0.13
72 0.11
73 0.1
74 0.09
75 0.07
76 0.06
77 0.06
78 0.06
79 0.05
80 0.05
81 0.05
82 0.05
83 0.07
84 0.11
85 0.13
86 0.15
87 0.16
88 0.16
89 0.16
90 0.17
91 0.16
92 0.11
93 0.1
94 0.08
95 0.08
96 0.09
97 0.09
98 0.08
99 0.09
100 0.1
101 0.09
102 0.12
103 0.12
104 0.12
105 0.12
106 0.13
107 0.13
108 0.13
109 0.15
110 0.14
111 0.14
112 0.16
113 0.19
114 0.22
115 0.26
116 0.3
117 0.3
118 0.31
119 0.34
120 0.36
121 0.34
122 0.32
123 0.31
124 0.27
125 0.27
126 0.23
127 0.21
128 0.18
129 0.17
130 0.16
131 0.14
132 0.11
133 0.11
134 0.14
135 0.15
136 0.14
137 0.13
138 0.12
139 0.12
140 0.13
141 0.15
142 0.14
143 0.13
144 0.13
145 0.14
146 0.15
147 0.22
148 0.29
149 0.26
150 0.27
151 0.3
152 0.36
153 0.39
154 0.41
155 0.4
156 0.34
157 0.36
158 0.35
159 0.41
160 0.36
161 0.36
162 0.37
163 0.32
164 0.31
165 0.3
166 0.29
167 0.2
168 0.18
169 0.15
170 0.12
171 0.11
172 0.13
173 0.16
174 0.16
175 0.2
176 0.26
177 0.3
178 0.32
179 0.35
180 0.39
181 0.37
182 0.39
183 0.38
184 0.39
185 0.35
186 0.34
187 0.3
188 0.25
189 0.25
190 0.23
191 0.2
192 0.13
193 0.12
194 0.11
195 0.11
196 0.09
197 0.08
198 0.09
199 0.09
200 0.08
201 0.09
202 0.09
203 0.1
204 0.1
205 0.12
206 0.11
207 0.13
208 0.14
209 0.14
210 0.15
211 0.14
212 0.14
213 0.12
214 0.12
215 0.1
216 0.1
217 0.14
218 0.14
219 0.17
220 0.18
221 0.23
222 0.27
223 0.28
224 0.3
225 0.29
226 0.35
227 0.37
228 0.41
229 0.38
230 0.39
231 0.47
232 0.48
233 0.46
234 0.4
235 0.39
236 0.4
237 0.45
238 0.47
239 0.44
240 0.43
241 0.44
242 0.53
243 0.58
244 0.6
245 0.58
246 0.61
247 0.64
248 0.67
249 0.75
250 0.75
251 0.76
252 0.77
253 0.81
254 0.82
255 0.81
256 0.82
257 0.82
258 0.82
259 0.82
260 0.8
261 0.77
262 0.76
263 0.73
264 0.72
265 0.72
266 0.7
267 0.7
268 0.71
269 0.7
270 0.71
271 0.72
272 0.7
273 0.65
274 0.63
275 0.64
276 0.66
277 0.7
278 0.71
279 0.7
280 0.69
281 0.68
282 0.62
283 0.53
284 0.43
285 0.34
286 0.26
287 0.21
288 0.19
289 0.15
290 0.14
291 0.16
292 0.19
293 0.21
294 0.22
295 0.22
296 0.22
297 0.27
298 0.31
299 0.3
300 0.33
301 0.32
302 0.31
303 0.35
304 0.33
305 0.29
306 0.25
307 0.26
308 0.27
309 0.27
310 0.25
311 0.19
312 0.19
313 0.17
314 0.16
315 0.15
316 0.09
317 0.06
318 0.05
319 0.05
320 0.05
321 0.05
322 0.05
323 0.06
324 0.06
325 0.07
326 0.07
327 0.07
328 0.1
329 0.11
330 0.11
331 0.12
332 0.17
333 0.19
334 0.21
335 0.27
336 0.31
337 0.31
338 0.33
339 0.33
340 0.28
341 0.32
342 0.35
343 0.32
344 0.28
345 0.31
346 0.31
347 0.36
348 0.37
349 0.32
350 0.27
351 0.27
352 0.24
353 0.23
354 0.21
355 0.16
356 0.21
357 0.2
358 0.2
359 0.2
360 0.23
361 0.21
362 0.23
363 0.24
364 0.27
365 0.37
366 0.43
367 0.48
368 0.46
369 0.46
370 0.44
371 0.44
372 0.4
373 0.3
374 0.25