Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0B1PAS3

Protein Details
Accession A0A0B1PAS3    Localization Confidence High Confidence Score 18
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
4-35MRNAVQRRSYRERDQPKERKKWGLLEKHKDYSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
18-50QPKERKKWGLLEKHKDYSARARDYNEKKAKLKA
224-236KHGIKFKVRERKR
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007144  SSU_processome_Utp11  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF03998  Utp11  
Amino Acid Sequences MSSMRNAVQRRSYRERDQPKERKKWGLLEKHKDYSARARDYNEKKAKLKALRQKVLEKNPDEFYFGMMSRIGPKTGKDSSGTIAGDRGNQILSQEAVRLLKTQDLAYIRNARNIVIKEVANLETAVKGIEGQGRKVIYLEDGSDQLTEIFNNGQIHQTNEDNNESLELLDTKNRRRLQQCQAEKLRAKLVVARERLKALADAEQALDLQRAKMAKSPTVGGINKHGIKFKVRERKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.74
2 0.79
3 0.79
4 0.83
5 0.85
6 0.86
7 0.89
8 0.87
9 0.86
10 0.81
11 0.81
12 0.8
13 0.8
14 0.8
15 0.8
16 0.8
17 0.76
18 0.73
19 0.65
20 0.59
21 0.58
22 0.56
23 0.53
24 0.48
25 0.48
26 0.55
27 0.6
28 0.67
29 0.66
30 0.63
31 0.6
32 0.63
33 0.67
34 0.66
35 0.68
36 0.68
37 0.69
38 0.7
39 0.72
40 0.75
41 0.75
42 0.76
43 0.74
44 0.67
45 0.61
46 0.58
47 0.53
48 0.46
49 0.37
50 0.3
51 0.24
52 0.21
53 0.17
54 0.13
55 0.13
56 0.15
57 0.16
58 0.15
59 0.14
60 0.15
61 0.19
62 0.21
63 0.22
64 0.2
65 0.2
66 0.2
67 0.24
68 0.23
69 0.18
70 0.17
71 0.16
72 0.15
73 0.14
74 0.13
75 0.09
76 0.08
77 0.08
78 0.08
79 0.08
80 0.07
81 0.07
82 0.08
83 0.08
84 0.08
85 0.09
86 0.09
87 0.1
88 0.11
89 0.1
90 0.12
91 0.14
92 0.15
93 0.17
94 0.26
95 0.24
96 0.27
97 0.27
98 0.24
99 0.26
100 0.26
101 0.24
102 0.18
103 0.18
104 0.15
105 0.16
106 0.16
107 0.12
108 0.11
109 0.1
110 0.07
111 0.07
112 0.07
113 0.05
114 0.04
115 0.05
116 0.09
117 0.09
118 0.09
119 0.12
120 0.12
121 0.12
122 0.13
123 0.12
124 0.09
125 0.09
126 0.1
127 0.08
128 0.08
129 0.09
130 0.08
131 0.08
132 0.08
133 0.07
134 0.06
135 0.06
136 0.05
137 0.08
138 0.09
139 0.1
140 0.12
141 0.13
142 0.15
143 0.17
144 0.18
145 0.17
146 0.19
147 0.2
148 0.17
149 0.17
150 0.15
151 0.13
152 0.11
153 0.1
154 0.08
155 0.08
156 0.13
157 0.17
158 0.21
159 0.29
160 0.33
161 0.39
162 0.44
163 0.52
164 0.57
165 0.64
166 0.67
167 0.69
168 0.72
169 0.74
170 0.71
171 0.66
172 0.6
173 0.51
174 0.43
175 0.38
176 0.4
177 0.39
178 0.42
179 0.43
180 0.4
181 0.41
182 0.41
183 0.37
184 0.3
185 0.24
186 0.23
187 0.21
188 0.2
189 0.18
190 0.18
191 0.17
192 0.16
193 0.16
194 0.11
195 0.1
196 0.12
197 0.12
198 0.13
199 0.18
200 0.21
201 0.23
202 0.25
203 0.27
204 0.29
205 0.37
206 0.38
207 0.35
208 0.38
209 0.43
210 0.45
211 0.45
212 0.46
213 0.4
214 0.45
215 0.5
216 0.53