FuNGI

A0A0B1PAD3

Protein Details

Accession

A0A0B1PAD3

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
104-129	GVAPRAKMNQQRSRRFRSAKEAKEKA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
405-433	RRRKQIEDRREANNKRRKLEKDRDGRGRP

Subcellular Location(s)

nucl 17, cyto 5, mito 3, cyto_pero 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027073 5_3_exoribonuclease IPR041412 Xrn1_helical IPR004859 Xrn1_N IPR017151 Xrn2/3/4
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0004534 F:5'-3' RNA exonuclease activity GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0006353 P:DNA-templated transcription termination GO:0006397 P:mRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF17846 XRN_M PF03159 XRN_N
CDD	cd18673 PIN_XRN1-2-like

Amino Acid Sequences

MGVPALFRWLSQKYPKIVSPVIEEQPRNINGQIIPVDSRGPNPNGEEFDNLYLDMNGIVHPCSHPEDGPVPKNEDEMMVAIFKYTDRVVKMVRPRKLLMIAIDGVAPRAKMNQQRSRRFRSAKEAKEKADDREQYLKLFKSEESNNKEPEKKIVWDSNEITPGTPFMDILAASLRYWIAFKLNTDLAWANMKVIISDSTVPGEGEHKIMEFIRSQRSSPDHNPNTRHVMYGLDADLIMLGLGTHEPNFRVLREDVFSQDSKPRVCKLCNQTGHEAGECTGRSKAKDGEFDEKESAPHLKPYIWLHVSILREYLAAELCIPNQPFKFDLERALDDWVFMCFFVGNDFLPHLPSLEIRENGIDTLIAIWRDNIPTMGGYLTKDGQVDLKRAQIILQGLAIQEDAIFRRRKQIEDRREANNKRRKLEKDRDGRGRPNERLNLQESPPKNKNTTNHRHSAPSGLPIFAPGELSKEAKALTYDMVVNRGAIYKANQANKSAAAALKSKMNANIDEKNSSAFETNIENTKTTPSTSKRKASTLEHEITSQPETPQTADDEPQIDTVRLWEEGYAERYYEQKFGADPKDLNFRHKVAKAYVEGLAWVLLYYFQGCPSWDWYYPYHYAPFAADFTEISDMEISFKKGRIFLPFEQLMGVLPAGSRQAIPKEFHHLMTSPESEIIDFYPEDFEIDLNGKKWAWQGVALLPFIDSKRLLDAMAKIYPRLPSDVAARNSVGKDVLLFAENNQLLYDEVAKNFYSKKQGSRNFKLNPKICQGLSGEIEKNDTYLPHSSLISPLTSGNLPNLDNDRSITVHYQMPKLTYTHKSMLLRGASIPPPVLTLAEVETTRDKALRSGQSYGGVPLHGDGSRRKQFNYGSSKNPQYSQSYNSYGQRSFSTNYSNNFGNNPLPGLLQSWQQPASGGYVNFGRGNFSYPPPPPPSYINRPNYNPPDFGRVSTGKFRRQNTGPRQYEPYR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.5
2	0.53
3	0.54
4	0.54
5	0.5
6	0.49
7	0.49
8	0.5
9	0.51
10	0.49
11	0.45
12	0.49
13	0.48
14	0.43
15	0.37
16	0.34
17	0.27
18	0.32
19	0.31
20	0.25
21	0.25
22	0.23
23	0.26
24	0.23
25	0.27
26	0.28
27	0.28
28	0.29
29	0.31
30	0.35
31	0.35
32	0.36
33	0.35
34	0.32
35	0.32
36	0.3
37	0.26
38	0.22
39	0.18
40	0.16
41	0.13
42	0.1
43	0.08
44	0.09
45	0.09
46	0.09
47	0.1
48	0.13
49	0.17
50	0.19
51	0.18
52	0.22
53	0.29
54	0.36
55	0.42
56	0.43
57	0.43
58	0.42
59	0.43
60	0.38
61	0.32
62	0.26
63	0.2
64	0.17
65	0.13
66	0.12
67	0.11
68	0.11
69	0.1
70	0.11
71	0.11
72	0.14
73	0.15
74	0.18
75	0.22
76	0.29
77	0.4
78	0.47
79	0.52
80	0.53
81	0.54
82	0.56
83	0.57
84	0.53
85	0.45
86	0.41
87	0.36
88	0.3
89	0.3
90	0.24
91	0.2
92	0.18
93	0.15
94	0.1
95	0.13
96	0.19
97	0.26
98	0.36
99	0.45
100	0.55
101	0.66
102	0.74
103	0.8
104	0.84
105	0.82
106	0.78
107	0.8
108	0.8
109	0.79
110	0.81
111	0.78
112	0.72
113	0.75
114	0.72
115	0.66
116	0.66
117	0.59
118	0.54
119	0.56
120	0.54
121	0.48
122	0.51
123	0.47
124	0.38
125	0.37
126	0.32
127	0.3
128	0.37
129	0.42
130	0.46
131	0.49
132	0.53
133	0.57
134	0.62
135	0.56
136	0.55
137	0.51
138	0.46
139	0.47
140	0.49
141	0.47
142	0.48
143	0.5
144	0.48
145	0.47
146	0.43
147	0.37
148	0.29
149	0.26
150	0.2
151	0.17
152	0.12
153	0.08
154	0.09
155	0.08
156	0.08
157	0.1
158	0.1
159	0.1
160	0.11
161	0.1
162	0.09
163	0.1
164	0.1
165	0.11
166	0.12
167	0.13
168	0.17
169	0.19
170	0.18
171	0.21
172	0.21
173	0.18
174	0.21
175	0.2
176	0.15
177	0.16
178	0.16
179	0.13
180	0.14
181	0.13
182	0.11
183	0.12
184	0.12
185	0.12
186	0.12
187	0.12
188	0.11
189	0.12
190	0.11
191	0.11
192	0.11
193	0.09
194	0.1
195	0.11
196	0.12
197	0.14
198	0.17
199	0.25
200	0.26
201	0.27
202	0.31
203	0.34
204	0.4
205	0.45
206	0.52
207	0.52
208	0.57
209	0.61
210	0.6
211	0.64
212	0.57
213	0.5
214	0.4
215	0.33
216	0.27
217	0.25
218	0.21
219	0.13
220	0.12
221	0.1
222	0.1
223	0.08
224	0.06
225	0.03
226	0.03
227	0.03
228	0.03
229	0.04
230	0.05
231	0.06
232	0.07
233	0.11
234	0.13
235	0.13
236	0.17
237	0.17
238	0.19
239	0.21
240	0.21
241	0.2
242	0.23
243	0.23
244	0.21
245	0.25
246	0.26
247	0.27
248	0.29
249	0.32
250	0.34
251	0.36
252	0.43
253	0.46
254	0.53
255	0.57
256	0.59
257	0.58
258	0.56
259	0.56
260	0.47
261	0.39
262	0.3
263	0.27
264	0.22
265	0.18
266	0.18
267	0.17
268	0.18
269	0.21
270	0.26
271	0.26
272	0.33
273	0.35
274	0.41
275	0.41
276	0.44
277	0.43
278	0.37
279	0.33
280	0.28
281	0.28
282	0.19
283	0.2
284	0.18
285	0.16
286	0.2
287	0.23
288	0.29
289	0.26
290	0.26
291	0.24
292	0.27
293	0.28
294	0.25
295	0.22
296	0.14
297	0.13
298	0.13
299	0.13
300	0.09
301	0.07
302	0.08
303	0.08
304	0.08
305	0.12
306	0.12
307	0.14
308	0.14
309	0.16
310	0.16
311	0.18
312	0.22
313	0.19
314	0.24
315	0.24
316	0.26
317	0.25
318	0.27
319	0.24
320	0.19
321	0.19
322	0.14
323	0.1
324	0.08
325	0.08
326	0.05
327	0.05
328	0.06
329	0.06
330	0.06
331	0.06
332	0.07
333	0.07
334	0.08
335	0.08
336	0.08
337	0.07
338	0.08
339	0.12
340	0.15
341	0.15
342	0.15
343	0.16
344	0.15
345	0.15
346	0.14
347	0.09
348	0.05
349	0.06
350	0.07
351	0.06
352	0.06
353	0.07
354	0.08
355	0.08
356	0.09
357	0.08
358	0.07
359	0.07
360	0.07
361	0.07
362	0.07
363	0.07
364	0.08
365	0.08
366	0.09
367	0.09
368	0.09
369	0.13
370	0.14
371	0.16
372	0.16
373	0.18
374	0.18
375	0.18
376	0.18
377	0.16
378	0.15
379	0.13
380	0.12
381	0.09
382	0.09
383	0.09
384	0.08
385	0.05
386	0.05
387	0.05
388	0.06
389	0.11
390	0.13
391	0.13
392	0.22
393	0.24
394	0.28
395	0.38
396	0.47
397	0.52
398	0.6
399	0.64
400	0.62
401	0.7
402	0.73
403	0.73
404	0.71
405	0.66
406	0.61
407	0.65
408	0.65
409	0.66
410	0.7
411	0.69
412	0.7
413	0.73
414	0.78
415	0.76
416	0.75
417	0.73
418	0.7
419	0.65
420	0.61
421	0.57
422	0.49
423	0.47
424	0.44
425	0.38
426	0.32
427	0.35
428	0.3
429	0.34
430	0.37
431	0.36
432	0.35
433	0.36
434	0.42
435	0.46
436	0.54
437	0.52
438	0.53
439	0.52
440	0.52
441	0.48
442	0.46
443	0.37
444	0.32
445	0.26
446	0.21
447	0.19
448	0.17
449	0.16
450	0.12
451	0.12
452	0.06
453	0.08
454	0.08
455	0.09
456	0.09
457	0.09
458	0.09
459	0.08
460	0.09
461	0.07
462	0.07
463	0.07
464	0.08
465	0.08
466	0.1
467	0.09
468	0.09
469	0.08
470	0.09
471	0.08
472	0.07
473	0.08
474	0.13
475	0.18
476	0.23
477	0.24
478	0.24
479	0.25
480	0.25
481	0.24
482	0.18
483	0.14
484	0.11
485	0.12
486	0.12
487	0.13
488	0.13
489	0.14
490	0.15
491	0.16
492	0.17
493	0.19
494	0.24
495	0.23
496	0.24
497	0.23
498	0.21
499	0.2
500	0.18
501	0.15
502	0.09
503	0.09
504	0.1
505	0.11
506	0.14
507	0.14
508	0.14
509	0.13
510	0.16
511	0.15
512	0.14
513	0.18
514	0.2
515	0.29
516	0.36
517	0.42
518	0.42
519	0.45
520	0.48
521	0.48
522	0.49
523	0.48
524	0.44
525	0.38
526	0.36
527	0.34
528	0.31
529	0.27
530	0.21
531	0.13
532	0.12
533	0.12
534	0.11
535	0.12
536	0.13
537	0.12
538	0.12
539	0.13
540	0.13
541	0.13
542	0.14
543	0.14
544	0.11
545	0.1
546	0.1
547	0.1
548	0.09
549	0.09
550	0.07
551	0.08
552	0.09
553	0.12
554	0.12
555	0.11
556	0.11
557	0.13
558	0.15
559	0.15
560	0.13
561	0.11
562	0.12
563	0.16
564	0.18
565	0.19
566	0.18
567	0.19
568	0.28
569	0.28
570	0.32
571	0.3
572	0.3
573	0.33
574	0.36
575	0.36
576	0.29
577	0.32
578	0.3
579	0.28
580	0.27
581	0.21
582	0.18
583	0.15
584	0.13
585	0.08
586	0.07
587	0.05
588	0.03
589	0.04
590	0.05
591	0.05
592	0.05
593	0.06
594	0.07
595	0.08
596	0.12
597	0.16
598	0.16
599	0.18
600	0.19
601	0.24
602	0.26
603	0.26
604	0.24
605	0.2
606	0.2
607	0.17
608	0.18
609	0.13
610	0.11
611	0.1
612	0.08
613	0.09
614	0.11
615	0.1
616	0.09
617	0.09
618	0.08
619	0.1
620	0.11
621	0.13
622	0.12
623	0.14
624	0.15
625	0.17
626	0.19
627	0.23
628	0.29
629	0.28
630	0.34
631	0.32
632	0.31
633	0.29
634	0.27
635	0.21
636	0.15
637	0.13
638	0.05
639	0.04
640	0.05
641	0.05
642	0.05
643	0.06
644	0.07
645	0.11
646	0.15
647	0.18
648	0.19
649	0.27
650	0.28
651	0.29
652	0.29
653	0.25
654	0.25
655	0.27
656	0.26
657	0.19
658	0.18
659	0.17
660	0.15
661	0.15
662	0.12
663	0.1
664	0.08
665	0.08
666	0.08
667	0.08
668	0.09
669	0.08
670	0.08
671	0.07
672	0.1
673	0.1
674	0.1
675	0.12
676	0.11
677	0.12
678	0.14
679	0.16
680	0.14
681	0.14
682	0.16
683	0.19
684	0.21
685	0.2
686	0.18
687	0.16
688	0.17
689	0.15
690	0.16
691	0.11
692	0.09
693	0.12
694	0.12
695	0.12
696	0.13
697	0.15
698	0.17
699	0.21
700	0.21
701	0.19
702	0.21
703	0.23
704	0.22
705	0.23
706	0.2
707	0.17
708	0.23
709	0.31
710	0.31
711	0.31
712	0.3
713	0.3
714	0.29
715	0.28
716	0.22
717	0.14
718	0.12
719	0.11
720	0.11
721	0.1
722	0.09
723	0.09
724	0.17
725	0.17
726	0.17
727	0.15
728	0.15
729	0.14
730	0.14
731	0.18
732	0.12
733	0.12
734	0.14
735	0.14
736	0.16
737	0.18
738	0.21
739	0.25
740	0.27
741	0.35
742	0.43
743	0.52
744	0.61
745	0.67
746	0.73
747	0.72
748	0.76
749	0.78
750	0.73
751	0.7
752	0.66
753	0.62
754	0.53
755	0.48
756	0.42
757	0.37
758	0.34
759	0.33
760	0.29
761	0.25
762	0.27
763	0.23
764	0.22
765	0.18
766	0.16
767	0.14
768	0.16
769	0.17
770	0.17
771	0.18
772	0.17
773	0.19
774	0.2
775	0.17
776	0.14
777	0.13
778	0.13
779	0.13
780	0.13
781	0.13
782	0.14
783	0.14
784	0.16
785	0.2
786	0.19
787	0.19
788	0.2
789	0.2
790	0.18
791	0.2
792	0.19
793	0.18
794	0.21
795	0.23
796	0.26
797	0.25
798	0.26
799	0.26
800	0.26
801	0.29
802	0.3
803	0.33
804	0.34
805	0.39
806	0.39
807	0.4
808	0.45
809	0.4
810	0.36
811	0.32
812	0.33
813	0.28
814	0.27
815	0.26
816	0.19
817	0.18
818	0.18
819	0.16
820	0.11
821	0.1
822	0.1
823	0.12
824	0.12
825	0.13
826	0.15
827	0.17
828	0.17
829	0.18
830	0.17
831	0.18
832	0.26
833	0.32
834	0.33
835	0.36
836	0.37
837	0.39
838	0.39
839	0.38
840	0.31
841	0.23
842	0.19
843	0.16
844	0.16
845	0.14
846	0.16
847	0.19
848	0.28
849	0.36
850	0.38
851	0.39
852	0.43
853	0.46
854	0.53
855	0.58
856	0.54
857	0.54
858	0.61
859	0.67
860	0.64
861	0.62
862	0.56
863	0.52
864	0.51
865	0.48
866	0.46
867	0.45
868	0.46
869	0.49
870	0.5
871	0.45
872	0.43
873	0.4
874	0.38
875	0.34
876	0.32
877	0.35
878	0.35
879	0.37
880	0.4
881	0.39
882	0.36
883	0.35
884	0.35
885	0.28
886	0.25
887	0.23
888	0.19
889	0.18
890	0.17
891	0.18
892	0.16
893	0.18
894	0.2
895	0.23
896	0.23
897	0.23
898	0.23
899	0.21
900	0.24
901	0.25
902	0.21
903	0.18
904	0.2
905	0.22
906	0.23
907	0.23
908	0.22
909	0.18
910	0.23
911	0.24
912	0.26
913	0.31
914	0.31
915	0.39
916	0.42
917	0.44
918	0.43
919	0.46
920	0.51
921	0.54
922	0.62
923	0.63
924	0.64
925	0.67
926	0.75
927	0.77
928	0.73
929	0.67
930	0.6
931	0.59
932	0.53
933	0.49
934	0.46
935	0.41
936	0.42
937	0.47
938	0.51
939	0.52
940	0.58
941	0.6
942	0.62
943	0.66
944	0.72
945	0.72
946	0.76
947	0.72
948	0.7

A0A0B1PAD3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer