FuNGI

A0A0B1P538

Protein Details

Accession

A0A0B1P538

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
457-479	AEAEHRRKIKLKRQEKRGVKIGS	Basic
535-564	QTNPSEKDKKNNGEKNRSRGRNNRHRSSVN	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
462-476	RRKIKLKRQEKRGVK
543-578	KKNNGEKNRSRGRNNRHRSSVNSGRGRGFQNRRGNR

Subcellular Location(s)

nucl 21, cyto_nucl 15.5, cyto 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR038664 Gar1/Naf1_Cbf5-bd_sf IPR007504 H/ACA_rnp_Gar1/Naf1 IPR040309 Naf1 IPR009000 Transl_B-barrel_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0005732 C:sno(s)RNA-containing ribonucleoprotein complex GO:0003723 F:RNA binding GO:0000493 P:box H/ACA snoRNP assembly GO:0001522 P:pseudouridine synthesis GO:0042254 P:ribosome biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF04410 Gar1

Amino Acid Sequences

MENSVLEENQTNGLAEQSLTHALEALLGGLRPIPPLSTELSKNEDSDLSNLLENKSILSRDSSQLIEIQNENENLGPSAIPYDISKTTFSYIGAENSRNSPIYDEKQISNPDHTISDIGYVDNRTNSVLAQESQKDVTSSSICERKIDHHITEKSEQTTDAMTKLVAKNPVIPGLFLCDINNTNKKPTNLETIPPDFSTSQNFKSNSGISNDGIQEPATETTVITESPTDVEDSNVVVSEEANMEWEADSSPIEDSSDEQDSSENNTSSDDSEAGEDSFKFLSPEEQARILILGDGGSDDEGGDKSKGPEGQLRTKNEIVNEVILKPNVTITQDMPITELGAVEQVVDNILLIKAKISGEYKVLESGSVLCLSDRKVFGAVAETIGRVQQPYYSVLFTDATEIQAEGLSIGTIVYYSEIHSTFVFTKSLKAFKGSDASNINDEEVGEDEVEFSDDEAEAEHRRKIKLKRQEKRGVKIGSNGCLKRGRQSLQKLKEHPDDTSAINYDENDDEPYKTLTRPTGYVGSITRNEGSLEQTNPSEKDKKNNGEKNRSRGRNNRHRSSVNSGRGRGFQNRRGNRASAPRNLPHNPGNDSSIANTTHPNSVPGLYNNLLLPNTPINPYTSAQNSLNMQQFQEYDPRQVQAQQWPNPFLLFYGMNPFNG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.12
2	0.11
3	0.1
4	0.11
5	0.14
6	0.14
7	0.14
8	0.14
9	0.13
10	0.13
11	0.12
12	0.1
13	0.08
14	0.07
15	0.08
16	0.08
17	0.09
18	0.1
19	0.1
20	0.1
21	0.1
22	0.13
23	0.17
24	0.21
25	0.24
26	0.27
27	0.32
28	0.33
29	0.32
30	0.32
31	0.3
32	0.26
33	0.25
34	0.24
35	0.2
36	0.21
37	0.22
38	0.21
39	0.21
40	0.2
41	0.19
42	0.19
43	0.18
44	0.17
45	0.2
46	0.23
47	0.23
48	0.26
49	0.25
50	0.23
51	0.27
52	0.27
53	0.25
54	0.23
55	0.23
56	0.24
57	0.24
58	0.23
59	0.2
60	0.2
61	0.17
62	0.16
63	0.13
64	0.09
65	0.1
66	0.1
67	0.1
68	0.09
69	0.13
70	0.15
71	0.17
72	0.18
73	0.18
74	0.2
75	0.2
76	0.2
77	0.19
78	0.18
79	0.22
80	0.25
81	0.25
82	0.25
83	0.27
84	0.29
85	0.26
86	0.25
87	0.23
88	0.26
89	0.28
90	0.34
91	0.34
92	0.34
93	0.39
94	0.44
95	0.43
96	0.41
97	0.38
98	0.32
99	0.29
100	0.28
101	0.23
102	0.17
103	0.17
104	0.13
105	0.13
106	0.13
107	0.14
108	0.14
109	0.14
110	0.14
111	0.13
112	0.12
113	0.12
114	0.12
115	0.13
116	0.13
117	0.17
118	0.19
119	0.2
120	0.21
121	0.21
122	0.2
123	0.18
124	0.2
125	0.16
126	0.17
127	0.2
128	0.25
129	0.24
130	0.26
131	0.27
132	0.28
133	0.36
134	0.39
135	0.37
136	0.41
137	0.44
138	0.48
139	0.51
140	0.5
141	0.43
142	0.39
143	0.35
144	0.27
145	0.26
146	0.21
147	0.17
148	0.14
149	0.11
150	0.16
151	0.18
152	0.21
153	0.22
154	0.21
155	0.25
156	0.27
157	0.32
158	0.26
159	0.24
160	0.2
161	0.22
162	0.23
163	0.18
164	0.17
165	0.14
166	0.16
167	0.22
168	0.29
169	0.25
170	0.3
171	0.34
172	0.35
173	0.37
174	0.38
175	0.42
176	0.37
177	0.39
178	0.4
179	0.39
180	0.4
181	0.36
182	0.35
183	0.26
184	0.25
185	0.28
186	0.26
187	0.26
188	0.31
189	0.31
190	0.3
191	0.32
192	0.33
193	0.29
194	0.28
195	0.27
196	0.2
197	0.23
198	0.23
199	0.2
200	0.18
201	0.15
202	0.12
203	0.11
204	0.11
205	0.09
206	0.08
207	0.07
208	0.08
209	0.09
210	0.08
211	0.07
212	0.07
213	0.06
214	0.07
215	0.08
216	0.07
217	0.07
218	0.07
219	0.07
220	0.08
221	0.07
222	0.07
223	0.07
224	0.05
225	0.05
226	0.06
227	0.06
228	0.05
229	0.06
230	0.06
231	0.06
232	0.06
233	0.07
234	0.06
235	0.06
236	0.06
237	0.05
238	0.06
239	0.06
240	0.06
241	0.06
242	0.07
243	0.09
244	0.11
245	0.11
246	0.1
247	0.11
248	0.11
249	0.16
250	0.18
251	0.15
252	0.13
253	0.14
254	0.15
255	0.15
256	0.15
257	0.11
258	0.08
259	0.08
260	0.09
261	0.08
262	0.08
263	0.07
264	0.08
265	0.07
266	0.07
267	0.07
268	0.06
269	0.08
270	0.1
271	0.13
272	0.14
273	0.14
274	0.14
275	0.14
276	0.14
277	0.12
278	0.09
279	0.06
280	0.04
281	0.03
282	0.04
283	0.03
284	0.03
285	0.03
286	0.03
287	0.03
288	0.04
289	0.05
290	0.05
291	0.06
292	0.07
293	0.09
294	0.1
295	0.11
296	0.16
297	0.2
298	0.29
299	0.35
300	0.38
301	0.41
302	0.42
303	0.42
304	0.38
305	0.35
306	0.26
307	0.22
308	0.19
309	0.15
310	0.13
311	0.12
312	0.12
313	0.09
314	0.09
315	0.08
316	0.08
317	0.08
318	0.08
319	0.11
320	0.11
321	0.11
322	0.11
323	0.1
324	0.09
325	0.08
326	0.08
327	0.05
328	0.05
329	0.04
330	0.04
331	0.04
332	0.03
333	0.03
334	0.03
335	0.03
336	0.03
337	0.03
338	0.03
339	0.03
340	0.04
341	0.05
342	0.05
343	0.07
344	0.08
345	0.09
346	0.11
347	0.12
348	0.12
349	0.12
350	0.12
351	0.1
352	0.09
353	0.09
354	0.08
355	0.07
356	0.07
357	0.06
358	0.07
359	0.09
360	0.12
361	0.11
362	0.11
363	0.12
364	0.12
365	0.12
366	0.14
367	0.12
368	0.1
369	0.1
370	0.09
371	0.08
372	0.09
373	0.09
374	0.06
375	0.06
376	0.06
377	0.07
378	0.1
379	0.11
380	0.11
381	0.11
382	0.12
383	0.13
384	0.12
385	0.13
386	0.11
387	0.1
388	0.1
389	0.1
390	0.08
391	0.07
392	0.07
393	0.04
394	0.04
395	0.03
396	0.03
397	0.03
398	0.03
399	0.02
400	0.03
401	0.03
402	0.04
403	0.04
404	0.07
405	0.07
406	0.08
407	0.08
408	0.11
409	0.11
410	0.13
411	0.13
412	0.12
413	0.16
414	0.18
415	0.22
416	0.2
417	0.22
418	0.22
419	0.22
420	0.27
421	0.24
422	0.26
423	0.25
424	0.26
425	0.25
426	0.24
427	0.22
428	0.17
429	0.16
430	0.12
431	0.1
432	0.09
433	0.07
434	0.06
435	0.06
436	0.06
437	0.07
438	0.06
439	0.05
440	0.05
441	0.05
442	0.05
443	0.05
444	0.07
445	0.09
446	0.11
447	0.14
448	0.17
449	0.2
450	0.27
451	0.36
452	0.44
453	0.52
454	0.62
455	0.68
456	0.75
457	0.83
458	0.85
459	0.83
460	0.83
461	0.77
462	0.68
463	0.67
464	0.61
465	0.57
466	0.56
467	0.49
468	0.44
469	0.45
470	0.43
471	0.42
472	0.45
473	0.43
474	0.43
475	0.54
476	0.6
477	0.64
478	0.71
479	0.69
480	0.7
481	0.73
482	0.66
483	0.56
484	0.5
485	0.42
486	0.36
487	0.34
488	0.28
489	0.2
490	0.19
491	0.18
492	0.16
493	0.15
494	0.15
495	0.15
496	0.14
497	0.14
498	0.15
499	0.18
500	0.17
501	0.17
502	0.19
503	0.2
504	0.21
505	0.22
506	0.24
507	0.26
508	0.25
509	0.27
510	0.26
511	0.27
512	0.26
513	0.27
514	0.24
515	0.2
516	0.2
517	0.19
518	0.22
519	0.2
520	0.2
521	0.2
522	0.21
523	0.24
524	0.25
525	0.29
526	0.33
527	0.32
528	0.4
529	0.48
530	0.55
531	0.63
532	0.7
533	0.75
534	0.78
535	0.83
536	0.83
537	0.84
538	0.83
539	0.81
540	0.82
541	0.83
542	0.83
543	0.85
544	0.84
545	0.82
546	0.79
547	0.76
548	0.76
549	0.75
550	0.74
551	0.71
552	0.65
553	0.6
554	0.6
555	0.58
556	0.59
557	0.57
558	0.56
559	0.6
560	0.64
561	0.67
562	0.67
563	0.66
564	0.62
565	0.64
566	0.63
567	0.61
568	0.61
569	0.6
570	0.64
571	0.64
572	0.63
573	0.58
574	0.56
575	0.51
576	0.46
577	0.44
578	0.38
579	0.35
580	0.32
581	0.3
582	0.26
583	0.22
584	0.23
585	0.22
586	0.26
587	0.25
588	0.25
589	0.23
590	0.23
591	0.26
592	0.24
593	0.28
594	0.24
595	0.25
596	0.24
597	0.25
598	0.23
599	0.19
600	0.2
601	0.19
602	0.2
603	0.2
604	0.2
605	0.2
606	0.24
607	0.25
608	0.28
609	0.27
610	0.3
611	0.3
612	0.33
613	0.33
614	0.35
615	0.41
616	0.36
617	0.33
618	0.31
619	0.31
620	0.29
621	0.36
622	0.32
623	0.32
624	0.33
625	0.34
626	0.33
627	0.36
628	0.39
629	0.4
630	0.48
631	0.49
632	0.53
633	0.54
634	0.53
635	0.49
636	0.44
637	0.34
638	0.29
639	0.22
640	0.17
641	0.23

A0A0B1P538

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer