Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0B2WPK2

Protein Details
Accession A0A0B2WPK2    Localization Confidence High Confidence Score 17.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
347-366IKGGKKQNERFSRIPKNMKVHydrophilic
388-415LIVTKGKGFTKEKNKKKRGSFRGGLIDIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
210-211KR
394-407KGFTKEKNKKKRGS
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 13.5, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
Amino Acid Sequences MSQSSGPPSWLFSNNTSNTTKAAGTVDDTATGTHKKADKMAKKSSKAASSARAQAPSAPPAALLNLVGSFLNQHSFPKAHRAFQKEIDENGWVSEASKDGDNSLISIFQTWESGQNSKVESEAESDDESSDESSSSSSSSSGSGNVRQSGASLTTSSAVEKYTSATKNLKRKAPVDSSSSETSDSSSAYSDSGSGSGSSSDSDDEPRVKKRKTAKAVATKHEPASSDSDSDDGRMDVDGDSSDESSSHNDSSSDSESGSDSTSDSGSEVAAAAKVALPESDSSSSDSDSDSSSDSDADADSAKVKFKNYAQGAASKDSSDTSVTLDNQSPVPKPRVVEPPLPPNPVIKGGKKQNERFSRIPKNMKVDPRFASNEYVSMDYSRRAHEDLIVTKGKGFTKEKNKKKRGSFRGGLIDITERKAVYFD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.45
3 0.44
4 0.4
5 0.37
6 0.35
7 0.3
8 0.23
9 0.22
10 0.17
11 0.18
12 0.2
13 0.19
14 0.18
15 0.18
16 0.17
17 0.18
18 0.19
19 0.17
20 0.2
21 0.24
22 0.25
23 0.32
24 0.42
25 0.48
26 0.54
27 0.65
28 0.69
29 0.69
30 0.75
31 0.74
32 0.7
33 0.66
34 0.63
35 0.58
36 0.55
37 0.58
38 0.55
39 0.5
40 0.44
41 0.44
42 0.43
43 0.39
44 0.34
45 0.25
46 0.21
47 0.2
48 0.2
49 0.15
50 0.12
51 0.09
52 0.08
53 0.08
54 0.08
55 0.07
56 0.08
57 0.08
58 0.1
59 0.09
60 0.11
61 0.14
62 0.16
63 0.17
64 0.27
65 0.29
66 0.35
67 0.42
68 0.47
69 0.48
70 0.55
71 0.63
72 0.55
73 0.54
74 0.49
75 0.43
76 0.36
77 0.32
78 0.25
79 0.15
80 0.12
81 0.11
82 0.1
83 0.09
84 0.11
85 0.1
86 0.1
87 0.12
88 0.11
89 0.11
90 0.11
91 0.1
92 0.09
93 0.1
94 0.1
95 0.08
96 0.09
97 0.09
98 0.14
99 0.15
100 0.17
101 0.17
102 0.19
103 0.2
104 0.19
105 0.19
106 0.15
107 0.13
108 0.15
109 0.14
110 0.13
111 0.13
112 0.13
113 0.12
114 0.12
115 0.11
116 0.09
117 0.08
118 0.06
119 0.06
120 0.06
121 0.06
122 0.06
123 0.06
124 0.06
125 0.06
126 0.07
127 0.08
128 0.11
129 0.12
130 0.16
131 0.18
132 0.19
133 0.19
134 0.18
135 0.18
136 0.16
137 0.15
138 0.12
139 0.1
140 0.09
141 0.1
142 0.1
143 0.1
144 0.09
145 0.08
146 0.08
147 0.08
148 0.09
149 0.15
150 0.15
151 0.19
152 0.26
153 0.32
154 0.41
155 0.46
156 0.5
157 0.48
158 0.49
159 0.53
160 0.53
161 0.5
162 0.45
163 0.42
164 0.41
165 0.38
166 0.37
167 0.3
168 0.22
169 0.2
170 0.16
171 0.14
172 0.09
173 0.08
174 0.07
175 0.07
176 0.07
177 0.06
178 0.06
179 0.06
180 0.05
181 0.05
182 0.05
183 0.05
184 0.05
185 0.05
186 0.06
187 0.06
188 0.06
189 0.08
190 0.09
191 0.12
192 0.14
193 0.22
194 0.28
195 0.28
196 0.34
197 0.42
198 0.5
199 0.55
200 0.61
201 0.62
202 0.66
203 0.71
204 0.7
205 0.67
206 0.59
207 0.53
208 0.46
209 0.38
210 0.29
211 0.29
212 0.25
213 0.19
214 0.17
215 0.17
216 0.15
217 0.15
218 0.13
219 0.08
220 0.07
221 0.06
222 0.07
223 0.05
224 0.06
225 0.05
226 0.05
227 0.06
228 0.06
229 0.06
230 0.05
231 0.06
232 0.08
233 0.09
234 0.09
235 0.09
236 0.09
237 0.1
238 0.13
239 0.15
240 0.14
241 0.12
242 0.12
243 0.12
244 0.13
245 0.12
246 0.09
247 0.07
248 0.07
249 0.07
250 0.07
251 0.06
252 0.06
253 0.05
254 0.05
255 0.05
256 0.04
257 0.04
258 0.04
259 0.04
260 0.05
261 0.05
262 0.05
263 0.05
264 0.05
265 0.06
266 0.09
267 0.11
268 0.11
269 0.13
270 0.14
271 0.14
272 0.14
273 0.14
274 0.11
275 0.1
276 0.11
277 0.1
278 0.09
279 0.09
280 0.09
281 0.09
282 0.08
283 0.07
284 0.07
285 0.07
286 0.06
287 0.08
288 0.09
289 0.12
290 0.13
291 0.14
292 0.18
293 0.2
294 0.29
295 0.29
296 0.34
297 0.33
298 0.37
299 0.39
300 0.38
301 0.36
302 0.27
303 0.25
304 0.2
305 0.2
306 0.15
307 0.13
308 0.11
309 0.14
310 0.15
311 0.17
312 0.18
313 0.18
314 0.19
315 0.22
316 0.23
317 0.24
318 0.28
319 0.27
320 0.27
321 0.32
322 0.39
323 0.41
324 0.46
325 0.47
326 0.53
327 0.57
328 0.59
329 0.53
330 0.46
331 0.43
332 0.44
333 0.44
334 0.38
335 0.41
336 0.48
337 0.57
338 0.64
339 0.69
340 0.71
341 0.76
342 0.78
343 0.77
344 0.77
345 0.79
346 0.78
347 0.8
348 0.77
349 0.75
350 0.75
351 0.78
352 0.73
353 0.69
354 0.63
355 0.6
356 0.58
357 0.53
358 0.5
359 0.41
360 0.39
361 0.34
362 0.32
363 0.26
364 0.24
365 0.23
366 0.21
367 0.23
368 0.23
369 0.24
370 0.24
371 0.24
372 0.27
373 0.32
374 0.32
375 0.36
376 0.37
377 0.34
378 0.34
379 0.37
380 0.35
381 0.36
382 0.38
383 0.4
384 0.48
385 0.59
386 0.68
387 0.75
388 0.82
389 0.84
390 0.9
391 0.91
392 0.9
393 0.9
394 0.87
395 0.84
396 0.84
397 0.76
398 0.65
399 0.56
400 0.53
401 0.45
402 0.41
403 0.34
404 0.24