FuNGI

P0CO38

Protein Details

Accession

P0CO38

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
158-186	DEDDGGERRRKKKKRAERRRQRQEEEDED	Basic
206-227	DAIGKKPKAIRRKKKGDDDVDI	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
164-178	ERRRKKKKRAERRRQ
209-220	GKKPKAIRRKKK

Subcellular Location(s)

nucl 18.5, cyto_nucl 13.5, cyto 7.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR035441 TFIIS/LEDGF_dom_sf IPR017923 TFIIS_N
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0016973 P:poly(A)+ mRNA export from nucleus
KEGG	cne:CNC05650 -
Pfam	View protein in Pfam PF08711 Med26
PROSITE	View protein in PROSITE PS51319 TFIIS_N

Amino Acid Sequences

MSSPALDTIHDQTGEQDLHQEVQAQEHLPVEPTPEVQEEPESDHQDDDEQPEAQVLEQEQEQVAEQERLQDQEDQDQGAELVSQQPTAEEQEETRDELYNEVFGNQGSEASDLSDDEDVRMDEGEKYVPATATSAAKIPKFKKSKRDDEDEDEDEDEDEDDGGERRRKKKKRAERRRQRQEEEDEDEAPVLDEATQRRLALEERIDAIGKKPKAIRRKKKGDDDVDIVDSYHDDICARLRDRMIAAADKDEAANRIKMPGTAKLAMLDEVMGVLRNTTLWQSIVDNGVLEAVKRWLEPLPDKSLPSVGIQKAIFEVLPKMDLDTTTLKECRLGPIVLFYTKTKRVTPAINRQADALVQAWSRPIIKRPANYRSRYIESQNEVEQSQGGGGTGGGYSQSQRGPGERKFKRFDVKKALEENAHRKGARLQIVQDVQYTVAPEPKTHHHAEEMQHVSRIQQDNKKFNRFARQVKTKKH

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.25
2	0.22
3	0.21
4	0.18
5	0.19
6	0.2
7	0.23
8	0.17
9	0.2
10	0.23
11	0.21
12	0.2
13	0.2
14	0.2
15	0.18
16	0.18
17	0.18
18	0.16
19	0.17
20	0.18
21	0.19
22	0.19
23	0.19
24	0.21
25	0.19
26	0.24
27	0.29
28	0.31
29	0.3
30	0.29
31	0.28
32	0.28
33	0.29
34	0.26
35	0.22
36	0.18
37	0.17
38	0.18
39	0.17
40	0.15
41	0.15
42	0.12
43	0.11
44	0.11
45	0.13
46	0.12
47	0.12
48	0.12
49	0.12
50	0.13
51	0.13
52	0.13
53	0.17
54	0.19
55	0.2
56	0.21
57	0.24
58	0.23
59	0.28
60	0.29
61	0.24
62	0.23
63	0.21
64	0.19
65	0.15
66	0.13
67	0.07
68	0.1
69	0.1
70	0.1
71	0.1
72	0.1
73	0.11
74	0.14
75	0.15
76	0.12
77	0.12
78	0.18
79	0.19
80	0.2
81	0.2
82	0.19
83	0.17
84	0.18
85	0.18
86	0.14
87	0.13
88	0.12
89	0.11
90	0.09
91	0.1
92	0.09
93	0.09
94	0.07
95	0.08
96	0.07
97	0.08
98	0.08
99	0.07
100	0.08
101	0.09
102	0.09
103	0.09
104	0.1
105	0.09
106	0.09
107	0.09
108	0.09
109	0.08
110	0.09
111	0.09
112	0.08
113	0.09
114	0.1
115	0.1
116	0.09
117	0.09
118	0.1
119	0.11
120	0.12
121	0.14
122	0.16
123	0.18
124	0.25
125	0.27
126	0.35
127	0.43
128	0.48
129	0.55
130	0.62
131	0.71
132	0.7
133	0.76
134	0.73
135	0.71
136	0.72
137	0.64
138	0.56
139	0.46
140	0.39
141	0.3
142	0.24
143	0.17
144	0.1
145	0.07
146	0.05
147	0.05
148	0.06
149	0.1
150	0.15
151	0.21
152	0.3
153	0.4
154	0.49
155	0.59
156	0.69
157	0.77
158	0.83
159	0.89
160	0.91
161	0.93
162	0.96
163	0.96
164	0.95
165	0.9
166	0.87
167	0.83
168	0.78
169	0.72
170	0.63
171	0.52
172	0.42
173	0.36
174	0.27
175	0.19
176	0.12
177	0.06
178	0.05
179	0.06
180	0.07
181	0.1
182	0.11
183	0.11
184	0.11
185	0.12
186	0.13
187	0.15
188	0.15
189	0.13
190	0.14
191	0.15
192	0.15
193	0.14
194	0.16
195	0.19
196	0.18
197	0.2
198	0.23
199	0.29
200	0.39
201	0.5
202	0.58
203	0.62
204	0.73
205	0.78
206	0.83
207	0.86
208	0.82
209	0.75
210	0.68
211	0.59
212	0.49
213	0.41
214	0.31
215	0.22
216	0.16
217	0.12
218	0.08
219	0.06
220	0.04
221	0.05
222	0.07
223	0.11
224	0.12
225	0.13
226	0.13
227	0.14
228	0.15
229	0.17
230	0.16
231	0.14
232	0.13
233	0.13
234	0.13
235	0.12
236	0.11
237	0.09
238	0.1
239	0.09
240	0.1
241	0.09
242	0.11
243	0.11
244	0.13
245	0.14
246	0.17
247	0.19
248	0.19
249	0.19
250	0.18
251	0.19
252	0.17
253	0.15
254	0.11
255	0.06
256	0.05
257	0.05
258	0.04
259	0.04
260	0.03
261	0.03
262	0.03
263	0.04
264	0.05
265	0.05
266	0.05
267	0.06
268	0.07
269	0.09
270	0.1
271	0.09
272	0.08
273	0.08
274	0.08
275	0.07
276	0.07
277	0.06
278	0.06
279	0.07
280	0.07
281	0.08
282	0.09
283	0.13
284	0.17
285	0.21
286	0.27
287	0.28
288	0.29
289	0.29
290	0.28
291	0.26
292	0.24
293	0.26
294	0.19
295	0.21
296	0.21
297	0.2
298	0.19
299	0.19
300	0.17
301	0.11
302	0.12
303	0.08
304	0.09
305	0.08
306	0.09
307	0.09
308	0.09
309	0.11
310	0.13
311	0.14
312	0.17
313	0.18
314	0.17
315	0.19
316	0.2
317	0.2
318	0.21
319	0.19
320	0.16
321	0.2
322	0.22
323	0.21
324	0.22
325	0.2
326	0.23
327	0.28
328	0.31
329	0.28
330	0.3
331	0.33
332	0.4
333	0.48
334	0.53
335	0.57
336	0.58
337	0.56
338	0.53
339	0.5
340	0.41
341	0.33
342	0.22
343	0.15
344	0.11
345	0.11
346	0.11
347	0.12
348	0.14
349	0.14
350	0.19
351	0.25
352	0.31
353	0.38
354	0.45
355	0.54
356	0.61
357	0.63
358	0.65
359	0.63
360	0.64
361	0.62
362	0.59
363	0.56
364	0.52
365	0.51
366	0.47
367	0.42
368	0.36
369	0.32
370	0.27
371	0.19
372	0.14
373	0.11
374	0.08
375	0.06
376	0.05
377	0.05
378	0.05
379	0.04
380	0.05
381	0.05
382	0.06
383	0.09
384	0.1
385	0.12
386	0.14
387	0.2
388	0.26
389	0.33
390	0.43
391	0.48
392	0.55
393	0.59
394	0.65
395	0.7
396	0.71
397	0.74
398	0.74
399	0.74
400	0.73
401	0.72
402	0.7
403	0.66
404	0.66
405	0.65
406	0.61
407	0.6
408	0.52
409	0.48
410	0.5
411	0.52
412	0.52
413	0.47
414	0.42
415	0.45
416	0.48
417	0.48
418	0.43
419	0.35
420	0.28
421	0.25
422	0.24
423	0.17
424	0.19
425	0.18
426	0.18
427	0.22
428	0.28
429	0.34
430	0.35
431	0.37
432	0.36
433	0.42
434	0.45
435	0.5
436	0.49
437	0.44
438	0.43
439	0.41
440	0.37
441	0.39
442	0.43
443	0.41
444	0.44
445	0.51
446	0.59
447	0.68
448	0.77
449	0.74
450	0.73
451	0.76
452	0.76
453	0.77
454	0.77
455	0.79

P0CO38

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer