Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P0CN28

Protein Details
Accession P0CN28    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
62-100SRDSRDGRDRPDNKRRKPNKQDKKDKKGQNKGRHFPVIRBasic
277-302PFTLQNKKPTKQQPHKRKNNVLDEEEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
69-94RDRPDNKRRKPNKQDKKDKKGQNKGR
Subcellular Location(s) cyto 13.5, cyto_nucl 10.5, nucl 6.5, pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013785  Aldolase_TIM  
IPR035587  DUS-like_FMN-bd  
IPR018517  tRNA_hU_synthase_CS  
IPR000571  Znf_CCCH  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0034399  C:nuclear periphery  
GO:0050660  F:flavin adenine dinucleotide binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0017150  F:tRNA dihydrouridine synthase activity  
GO:0102265  F:tRNA-dihydrouridine47 synthase activity  
GO:0006397  P:mRNA processing  
KEGG cne:CNI00050  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01207  Dus  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS01136  UPF0034  
PS50103  ZF_C3H1  
CDD cd02801  DUS_like_FMN  
Amino Acid Sequences MTDDPAATPRPETSVNARPAFSGQAPIKAEYLINTTPIVESASASELNNIHPDDAAEGRTDSRDSRDGRDRPDNKRRKPNKQDKKDKKGQNKGRHFPVIREASVRICRAWETTGICDRADKGDCRYAHSWEGYFEVKPNDISYRPDWSLVGEAPFVVEGERVVGGEDVVGKTLDLDTVCPVLKDLGYCPFGWRCRFLGAHVKRVAAAVDGEKEKEAGPEKRMGEWQVENWVQSEVENGWKQKETNWPEHEVLNALRRSTASFPFSEAYLKKVDPDKPFTLQNKKPTKQQPHKRKNNVLDEEEAANGPTGIPSAGDDEENAMNATENERNEEKGKVYGEPEAIDVPLRPEEKRRLNWEGGRYLAPLTTVGNLPFRRLCVDYGATITVSEMALAQPLVYGAKEEWALVRRHESEKMFGVQVAGGFPNRMVPAAEVIANTIGKGGGVDFVDVNMGCPIDLVFNQGAGSALMDSPGRLGKLLVGMNRALGDIPLTVKFRTGVAHGKPNAHKLIPRFVTEWGAGALTIHGRSRQQRYSKPADWEYIKTCVTALRESVADANLPPVPIFGNGDCFSAASYYEEMDRSGVDGVMVARGALIKPWIFTEIKERREWDISAVERLEGIKKFAEFGLSHWGSDTQGVNTTRRFLCEALSFQHRYIPIGLLERLPAKLNERPPAYRGRNELETLLASPFAGDWVKISEMFLGKVDEGFSFVPKHKSNAYGGEEAQG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.44
3 0.45
4 0.45
5 0.41
6 0.41
7 0.42
8 0.35
9 0.34
10 0.28
11 0.32
12 0.34
13 0.35
14 0.33
15 0.3
16 0.29
17 0.22
18 0.27
19 0.2
20 0.19
21 0.18
22 0.18
23 0.17
24 0.17
25 0.17
26 0.11
27 0.11
28 0.11
29 0.13
30 0.14
31 0.14
32 0.17
33 0.16
34 0.18
35 0.22
36 0.2
37 0.18
38 0.17
39 0.17
40 0.17
41 0.17
42 0.16
43 0.13
44 0.14
45 0.15
46 0.16
47 0.18
48 0.17
49 0.2
50 0.26
51 0.28
52 0.35
53 0.43
54 0.47
55 0.53
56 0.62
57 0.65
58 0.68
59 0.77
60 0.8
61 0.8
62 0.86
63 0.88
64 0.89
65 0.92
66 0.93
67 0.93
68 0.94
69 0.96
70 0.96
71 0.96
72 0.95
73 0.94
74 0.93
75 0.93
76 0.92
77 0.92
78 0.92
79 0.9
80 0.88
81 0.88
82 0.78
83 0.71
84 0.7
85 0.66
86 0.56
87 0.5
88 0.43
89 0.4
90 0.45
91 0.42
92 0.33
93 0.28
94 0.28
95 0.27
96 0.27
97 0.25
98 0.22
99 0.27
100 0.33
101 0.33
102 0.32
103 0.31
104 0.3
105 0.31
106 0.32
107 0.28
108 0.27
109 0.33
110 0.33
111 0.39
112 0.4
113 0.38
114 0.39
115 0.39
116 0.34
117 0.28
118 0.31
119 0.26
120 0.24
121 0.23
122 0.21
123 0.19
124 0.19
125 0.2
126 0.21
127 0.2
128 0.25
129 0.24
130 0.29
131 0.29
132 0.29
133 0.27
134 0.25
135 0.26
136 0.23
137 0.21
138 0.14
139 0.13
140 0.12
141 0.12
142 0.1
143 0.07
144 0.06
145 0.04
146 0.06
147 0.06
148 0.06
149 0.06
150 0.06
151 0.06
152 0.06
153 0.08
154 0.07
155 0.07
156 0.07
157 0.06
158 0.07
159 0.07
160 0.08
161 0.07
162 0.07
163 0.08
164 0.1
165 0.11
166 0.1
167 0.1
168 0.1
169 0.11
170 0.11
171 0.11
172 0.15
173 0.17
174 0.17
175 0.2
176 0.24
177 0.29
178 0.3
179 0.32
180 0.28
181 0.31
182 0.31
183 0.31
184 0.37
185 0.36
186 0.43
187 0.42
188 0.4
189 0.36
190 0.36
191 0.32
192 0.22
193 0.19
194 0.12
195 0.13
196 0.14
197 0.14
198 0.14
199 0.14
200 0.14
201 0.16
202 0.2
203 0.2
204 0.22
205 0.28
206 0.29
207 0.31
208 0.33
209 0.31
210 0.3
211 0.27
212 0.26
213 0.26
214 0.26
215 0.23
216 0.22
217 0.21
218 0.16
219 0.15
220 0.15
221 0.09
222 0.14
223 0.17
224 0.17
225 0.18
226 0.2
227 0.2
228 0.23
229 0.32
230 0.32
231 0.39
232 0.42
233 0.44
234 0.44
235 0.44
236 0.41
237 0.33
238 0.29
239 0.26
240 0.23
241 0.18
242 0.18
243 0.17
244 0.19
245 0.21
246 0.22
247 0.18
248 0.18
249 0.2
250 0.2
251 0.2
252 0.22
253 0.19
254 0.17
255 0.18
256 0.17
257 0.18
258 0.23
259 0.29
260 0.3
261 0.36
262 0.37
263 0.37
264 0.44
265 0.47
266 0.51
267 0.5
268 0.56
269 0.59
270 0.58
271 0.64
272 0.67
273 0.72
274 0.73
275 0.78
276 0.8
277 0.81
278 0.89
279 0.9
280 0.9
281 0.88
282 0.87
283 0.82
284 0.73
285 0.64
286 0.55
287 0.46
288 0.37
289 0.28
290 0.18
291 0.12
292 0.09
293 0.07
294 0.05
295 0.04
296 0.03
297 0.03
298 0.04
299 0.06
300 0.06
301 0.06
302 0.06
303 0.08
304 0.08
305 0.09
306 0.08
307 0.06
308 0.06
309 0.06
310 0.08
311 0.09
312 0.09
313 0.12
314 0.13
315 0.15
316 0.16
317 0.17
318 0.16
319 0.16
320 0.17
321 0.15
322 0.15
323 0.16
324 0.15
325 0.14
326 0.14
327 0.11
328 0.1
329 0.09
330 0.08
331 0.07
332 0.1
333 0.11
334 0.11
335 0.15
336 0.23
337 0.29
338 0.34
339 0.39
340 0.41
341 0.45
342 0.48
343 0.48
344 0.42
345 0.37
346 0.33
347 0.27
348 0.22
349 0.17
350 0.13
351 0.09
352 0.08
353 0.07
354 0.07
355 0.07
356 0.12
357 0.12
358 0.14
359 0.14
360 0.14
361 0.15
362 0.16
363 0.16
364 0.14
365 0.15
366 0.13
367 0.14
368 0.14
369 0.11
370 0.1
371 0.09
372 0.07
373 0.06
374 0.05
375 0.04
376 0.04
377 0.04
378 0.04
379 0.04
380 0.03
381 0.03
382 0.04
383 0.03
384 0.04
385 0.04
386 0.05
387 0.05
388 0.06
389 0.07
390 0.11
391 0.12
392 0.12
393 0.17
394 0.18
395 0.21
396 0.25
397 0.24
398 0.23
399 0.25
400 0.26
401 0.22
402 0.19
403 0.17
404 0.13
405 0.12
406 0.1
407 0.08
408 0.06
409 0.06
410 0.06
411 0.07
412 0.07
413 0.07
414 0.07
415 0.07
416 0.08
417 0.09
418 0.09
419 0.07
420 0.08
421 0.08
422 0.08
423 0.07
424 0.06
425 0.05
426 0.04
427 0.04
428 0.04
429 0.05
430 0.05
431 0.06
432 0.05
433 0.05
434 0.07
435 0.06
436 0.07
437 0.06
438 0.05
439 0.05
440 0.05
441 0.05
442 0.05
443 0.05
444 0.08
445 0.07
446 0.08
447 0.08
448 0.08
449 0.08
450 0.07
451 0.07
452 0.04
453 0.04
454 0.05
455 0.05
456 0.05
457 0.06
458 0.07
459 0.07
460 0.06
461 0.06
462 0.07
463 0.11
464 0.13
465 0.13
466 0.14
467 0.14
468 0.15
469 0.15
470 0.14
471 0.1
472 0.08
473 0.07
474 0.06
475 0.07
476 0.09
477 0.11
478 0.11
479 0.11
480 0.12
481 0.12
482 0.12
483 0.14
484 0.19
485 0.21
486 0.29
487 0.31
488 0.37
489 0.39
490 0.43
491 0.43
492 0.38
493 0.37
494 0.32
495 0.39
496 0.35
497 0.35
498 0.32
499 0.3
500 0.31
501 0.28
502 0.26
503 0.17
504 0.14
505 0.11
506 0.1
507 0.09
508 0.07
509 0.08
510 0.08
511 0.09
512 0.13
513 0.2
514 0.27
515 0.35
516 0.41
517 0.48
518 0.55
519 0.63
520 0.64
521 0.65
522 0.62
523 0.6
524 0.56
525 0.53
526 0.48
527 0.43
528 0.38
529 0.31
530 0.27
531 0.24
532 0.23
533 0.21
534 0.18
535 0.15
536 0.15
537 0.15
538 0.17
539 0.14
540 0.12
541 0.1
542 0.12
543 0.11
544 0.11
545 0.1
546 0.09
547 0.09
548 0.1
549 0.12
550 0.1
551 0.15
552 0.16
553 0.17
554 0.16
555 0.15
556 0.15
557 0.13
558 0.13
559 0.09
560 0.09
561 0.09
562 0.1
563 0.11
564 0.11
565 0.11
566 0.1
567 0.09
568 0.09
569 0.09
570 0.07
571 0.07
572 0.07
573 0.08
574 0.07
575 0.06
576 0.05
577 0.06
578 0.07
579 0.06
580 0.09
581 0.09
582 0.09
583 0.11
584 0.15
585 0.14
586 0.15
587 0.25
588 0.31
589 0.35
590 0.39
591 0.4
592 0.41
593 0.45
594 0.44
595 0.38
596 0.37
597 0.34
598 0.35
599 0.33
600 0.28
601 0.25
602 0.25
603 0.26
604 0.19
605 0.2
606 0.17
607 0.17
608 0.19
609 0.18
610 0.22
611 0.17
612 0.18
613 0.27
614 0.25
615 0.24
616 0.24
617 0.24
618 0.2
619 0.23
620 0.23
621 0.13
622 0.2
623 0.22
624 0.25
625 0.25
626 0.31
627 0.29
628 0.3
629 0.31
630 0.25
631 0.27
632 0.29
633 0.3
634 0.29
635 0.36
636 0.35
637 0.33
638 0.37
639 0.33
640 0.3
641 0.29
642 0.27
643 0.22
644 0.24
645 0.26
646 0.22
647 0.24
648 0.23
649 0.23
650 0.23
651 0.22
652 0.23
653 0.29
654 0.34
655 0.4
656 0.44
657 0.45
658 0.47
659 0.55
660 0.57
661 0.56
662 0.56
663 0.54
664 0.54
665 0.53
666 0.5
667 0.42
668 0.36
669 0.32
670 0.26
671 0.19
672 0.14
673 0.12
674 0.11
675 0.11
676 0.1
677 0.08
678 0.09
679 0.12
680 0.14
681 0.14
682 0.14
683 0.17
684 0.18
685 0.19
686 0.19
687 0.18
688 0.17
689 0.18
690 0.18
691 0.13
692 0.15
693 0.15
694 0.16
695 0.17
696 0.21
697 0.29
698 0.3
699 0.34
700 0.35
701 0.39
702 0.42
703 0.46
704 0.48
705 0.45