FuNGI

A0A0B2WTB5

Protein Details

Accession

A0A0B2WTB5

Localization Confidence

High

Confidence Score

17.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
125-153	KIAPVAKDNNPKRPKKQKEEKTMFNRAPK	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
134-153	NPKRPKKQKEEKTMFNRAPK
423-458	KDKAKGTGSKRSMTPQGKQKQGELTKKTKSLKRAGS
471-476	RKKMKK
615-621	KRLRRRR

Subcellular Location(s)

nucl 22.5, cyto_nucl 13, cyto 2.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0003743 F:translation initiation factor activity GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MSLNGSKTSCDDQRKQYGGWSEPPPQYQYNDIPIMTTKKSLMEGMRYHLMRFSQARASDSPVDPTDQDDFARPVTLHRRDARQPPPGRATKVEEPEPPQVEEKEAERLAQAKAEREAQRAIDLAKIAPVAKDNNPKRPKKQKEEKTMFNRAPKSEAAKKESDLRYEEALPWHLEDADGKNVWVGSYVAALSEANVAFMIDKAVFRMVPLEKWYRFGAKPPFQPFTIDQAEAFMNRKVDVGRWIMKDEEKRAGQSDLEATRKLLSGRGQMIKTESDTFKAASRSEKLDHDELDVSGDEFQDDDETPYFERMEDDDTKESKDRIRREQLGANLFGDGDEQEVDKELQEQLREELERQKYGKSTKKALIKRDREDIYESDDSEENPWSSSSDEESSGDYEQDEGEGEKKKDDKKDADNKETQGDGKDKAKGTGSKRSMTPQGKQKQGELTKKTKSLKRAGSPALSESSGNESSRKKMKKSSLLGSGSRAGTPVSQPNAVRRGKVGHGSGSDAEATTTEMSDGAVAPRKGTKMVGNSGRGTPVASRAGSPNPATAATLATTQTAGIEPWEILDKIPADGIAITDLIKHFHGRVGDRSGQMPRGEWIKLVKQLCDYGPDKRLRRRR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.63
2	0.6
3	0.6
4	0.6
5	0.56
6	0.56
7	0.53
8	0.51
9	0.52
10	0.55
11	0.53
12	0.48
13	0.46
14	0.45
15	0.44
16	0.42
17	0.41
18	0.37
19	0.34
20	0.35
21	0.37
22	0.33
23	0.3
24	0.25
25	0.24
26	0.25
27	0.29
28	0.28
29	0.31
30	0.32
31	0.35
32	0.42
33	0.4
34	0.39
35	0.38
36	0.35
37	0.33
38	0.33
39	0.32
40	0.31
41	0.32
42	0.36
43	0.35
44	0.4
45	0.4
46	0.38
47	0.39
48	0.33
49	0.33
50	0.29
51	0.31
52	0.28
53	0.23
54	0.22
55	0.21
56	0.21
57	0.19
58	0.22
59	0.18
60	0.22
61	0.3
62	0.36
63	0.41
64	0.45
65	0.51
66	0.56
67	0.66
68	0.68
69	0.68
70	0.68
71	0.68
72	0.72
73	0.71
74	0.68
75	0.63
76	0.63
77	0.61
78	0.61
79	0.58
80	0.54
81	0.52
82	0.56
83	0.54
84	0.48
85	0.43
86	0.37
87	0.35
88	0.32
89	0.29
90	0.28
91	0.25
92	0.23
93	0.21
94	0.23
95	0.21
96	0.23
97	0.23
98	0.19
99	0.22
100	0.3
101	0.31
102	0.32
103	0.34
104	0.3
105	0.3
106	0.28
107	0.26
108	0.2
109	0.18
110	0.15
111	0.14
112	0.14
113	0.13
114	0.12
115	0.14
116	0.16
117	0.21
118	0.32
119	0.36
120	0.45
121	0.55
122	0.62
123	0.7
124	0.77
125	0.81
126	0.82
127	0.87
128	0.87
129	0.89
130	0.9
131	0.9
132	0.88
133	0.87
134	0.82
135	0.79
136	0.74
137	0.64
138	0.59
139	0.51
140	0.5
141	0.48
142	0.5
143	0.47
144	0.44
145	0.44
146	0.5
147	0.5
148	0.46
149	0.41
150	0.37
151	0.35
152	0.33
153	0.34
154	0.27
155	0.26
156	0.22
157	0.2
158	0.18
159	0.14
160	0.13
161	0.13
162	0.13
163	0.15
164	0.15
165	0.14
166	0.14
167	0.14
168	0.14
169	0.12
170	0.1
171	0.06
172	0.07
173	0.07
174	0.06
175	0.06
176	0.06
177	0.06
178	0.08
179	0.07
180	0.07
181	0.07
182	0.07
183	0.06
184	0.07
185	0.07
186	0.05
187	0.05
188	0.06
189	0.07
190	0.07
191	0.07
192	0.12
193	0.11
194	0.13
195	0.17
196	0.23
197	0.23
198	0.26
199	0.28
200	0.28
201	0.27
202	0.33
203	0.39
204	0.39
205	0.46
206	0.49
207	0.5
208	0.45
209	0.48
210	0.43
211	0.4
212	0.36
213	0.29
214	0.23
215	0.22
216	0.22
217	0.19
218	0.19
219	0.14
220	0.11
221	0.11
222	0.12
223	0.11
224	0.12
225	0.15
226	0.18
227	0.22
228	0.22
229	0.23
230	0.24
231	0.28
232	0.3
233	0.29
234	0.31
235	0.26
236	0.26
237	0.27
238	0.26
239	0.22
240	0.2
241	0.21
242	0.19
243	0.2
244	0.19
245	0.17
246	0.17
247	0.18
248	0.17
249	0.15
250	0.14
251	0.17
252	0.21
253	0.26
254	0.25
255	0.25
256	0.26
257	0.24
258	0.23
259	0.23
260	0.18
261	0.15
262	0.16
263	0.16
264	0.17
265	0.18
266	0.17
267	0.16
268	0.18
269	0.2
270	0.21
271	0.23
272	0.24
273	0.24
274	0.24
275	0.22
276	0.2
277	0.17
278	0.16
279	0.13
280	0.1
281	0.08
282	0.08
283	0.06
284	0.05
285	0.05
286	0.05
287	0.05
288	0.06
289	0.06
290	0.07
291	0.07
292	0.08
293	0.08
294	0.07
295	0.08
296	0.07
297	0.11
298	0.13
299	0.15
300	0.17
301	0.18
302	0.19
303	0.2
304	0.2
305	0.2
306	0.25
307	0.28
308	0.33
309	0.4
310	0.43
311	0.45
312	0.49
313	0.49
314	0.46
315	0.42
316	0.33
317	0.25
318	0.21
319	0.17
320	0.13
321	0.08
322	0.05
323	0.04
324	0.04
325	0.04
326	0.05
327	0.05
328	0.05
329	0.06
330	0.07
331	0.08
332	0.09
333	0.1
334	0.1
335	0.12
336	0.13
337	0.13
338	0.19
339	0.21
340	0.23
341	0.24
342	0.24
343	0.26
344	0.33
345	0.4
346	0.37
347	0.41
348	0.44
349	0.52
350	0.55
351	0.62
352	0.65
353	0.65
354	0.64
355	0.66
356	0.62
357	0.55
358	0.53
359	0.44
360	0.4
361	0.33
362	0.29
363	0.23
364	0.22
365	0.2
366	0.18
367	0.18
368	0.11
369	0.11
370	0.1
371	0.09
372	0.09
373	0.09
374	0.11
375	0.11
376	0.11
377	0.12
378	0.12
379	0.13
380	0.13
381	0.12
382	0.1
383	0.09
384	0.07
385	0.07
386	0.06
387	0.05
388	0.08
389	0.13
390	0.14
391	0.16
392	0.21
393	0.26
394	0.32
395	0.39
396	0.42
397	0.47
398	0.58
399	0.63
400	0.66
401	0.66
402	0.61
403	0.57
404	0.51
405	0.42
406	0.35
407	0.3
408	0.25
409	0.24
410	0.27
411	0.26
412	0.26
413	0.3
414	0.33
415	0.35
416	0.42
417	0.43
418	0.41
419	0.42
420	0.45
421	0.5
422	0.48
423	0.5
424	0.5
425	0.54
426	0.58
427	0.58
428	0.56
429	0.56
430	0.6
431	0.63
432	0.6
433	0.59
434	0.57
435	0.63
436	0.67
437	0.63
438	0.62
439	0.62
440	0.63
441	0.63
442	0.65
443	0.63
444	0.59
445	0.56
446	0.5
447	0.43
448	0.35
449	0.28
450	0.22
451	0.23
452	0.21
453	0.2
454	0.22
455	0.21
456	0.26
457	0.36
458	0.4
459	0.38
460	0.45
461	0.53
462	0.59
463	0.64
464	0.66
465	0.66
466	0.66
467	0.63
468	0.58
469	0.53
470	0.44
471	0.37
472	0.3
473	0.21
474	0.17
475	0.19
476	0.22
477	0.2
478	0.23
479	0.24
480	0.3
481	0.38
482	0.38
483	0.36
484	0.32
485	0.34
486	0.34
487	0.39
488	0.35
489	0.31
490	0.3
491	0.33
492	0.31
493	0.27
494	0.24
495	0.18
496	0.16
497	0.11
498	0.12
499	0.09
500	0.08
501	0.07
502	0.07
503	0.06
504	0.07
505	0.07
506	0.09
507	0.15
508	0.15
509	0.17
510	0.2
511	0.21
512	0.22
513	0.24
514	0.26
515	0.26
516	0.35
517	0.41
518	0.42
519	0.44
520	0.44
521	0.43
522	0.38
523	0.33
524	0.25
525	0.23
526	0.23
527	0.21
528	0.21
529	0.23
530	0.27
531	0.3
532	0.3
533	0.26
534	0.24
535	0.24
536	0.23
537	0.2
538	0.17
539	0.14
540	0.14
541	0.13
542	0.12
543	0.11
544	0.1
545	0.1
546	0.1
547	0.09
548	0.08
549	0.08
550	0.08
551	0.09
552	0.12
553	0.12
554	0.11
555	0.15
556	0.15
557	0.14
558	0.15
559	0.14
560	0.11
561	0.11
562	0.11
563	0.09
564	0.08
565	0.08
566	0.1
567	0.1
568	0.11
569	0.12
570	0.14
571	0.13
572	0.17
573	0.22
574	0.24
575	0.29
576	0.35
577	0.4
578	0.4
579	0.44
580	0.45
581	0.45
582	0.42
583	0.38
584	0.33
585	0.32
586	0.3
587	0.29
588	0.3
589	0.32
590	0.38
591	0.39
592	0.39
593	0.38
594	0.42
595	0.4
596	0.42
597	0.38
598	0.38
599	0.44
600	0.5
601	0.55

A0A0B2WTB5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer