Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0B2WP36

Protein Details
Accession A0A0B2WP36    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
338-362LGSYAKPGKRTSKKSKAQTGLEQLEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
261-267GRKKKRK
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 11.5, cyto 4.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007307  Ltv1  
Gene Ontology GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF04180  LTV  
Amino Acid Sequences MVLNPTQPKPGSSKVKHLDDLASEFGSDASGIRANEGEAASYGVYFDDTEYDYMQHLRDLGSAPGGQVVFVEASTKSRGKQKESLQDALKKMDLEQKSGDLFDEEMLPSKNLTKATYQAQQDIPDSIRGFQPDMDPRLREVLEALDDEAYVDDEDDDIFKSLTKDGREIGHSEFREADLFDDDDDEEGWESDDTAKPAKEHKEEIPALVAAPEQPQPEVGPPQDWMEGFQQFKREQKAGKPRVAPSHSELRSAWTTTTNGGRKKKRKGALTDASSYSMTSSSLVRTDQMTLLDARFDRIEEAYLEDPEDDMASVSHASTSSVVGPTRRDFDGILDDFLGSYAKPGKRTSKKSKAQTGLEQLEEIRRELGPPRIRGRNVGA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.6
2 0.66
3 0.66
4 0.62
5 0.56
6 0.49
7 0.49
8 0.41
9 0.32
10 0.25
11 0.22
12 0.2
13 0.16
14 0.12
15 0.08
16 0.08
17 0.11
18 0.11
19 0.12
20 0.12
21 0.12
22 0.15
23 0.15
24 0.13
25 0.1
26 0.12
27 0.1
28 0.1
29 0.1
30 0.07
31 0.07
32 0.07
33 0.07
34 0.07
35 0.09
36 0.1
37 0.11
38 0.11
39 0.12
40 0.14
41 0.14
42 0.12
43 0.12
44 0.11
45 0.12
46 0.13
47 0.13
48 0.14
49 0.14
50 0.13
51 0.15
52 0.14
53 0.12
54 0.1
55 0.11
56 0.08
57 0.08
58 0.09
59 0.07
60 0.09
61 0.14
62 0.15
63 0.17
64 0.25
65 0.3
66 0.36
67 0.43
68 0.5
69 0.56
70 0.61
71 0.65
72 0.63
73 0.65
74 0.6
75 0.55
76 0.48
77 0.38
78 0.34
79 0.35
80 0.3
81 0.26
82 0.26
83 0.25
84 0.24
85 0.24
86 0.22
87 0.15
88 0.14
89 0.11
90 0.12
91 0.09
92 0.1
93 0.11
94 0.11
95 0.11
96 0.12
97 0.15
98 0.15
99 0.16
100 0.16
101 0.19
102 0.23
103 0.29
104 0.29
105 0.3
106 0.31
107 0.31
108 0.3
109 0.28
110 0.24
111 0.22
112 0.21
113 0.18
114 0.17
115 0.17
116 0.16
117 0.15
118 0.19
119 0.21
120 0.25
121 0.26
122 0.25
123 0.25
124 0.28
125 0.27
126 0.22
127 0.17
128 0.14
129 0.13
130 0.12
131 0.12
132 0.08
133 0.08
134 0.08
135 0.07
136 0.06
137 0.05
138 0.04
139 0.04
140 0.04
141 0.04
142 0.04
143 0.05
144 0.05
145 0.05
146 0.05
147 0.06
148 0.08
149 0.12
150 0.12
151 0.13
152 0.14
153 0.16
154 0.17
155 0.18
156 0.2
157 0.23
158 0.22
159 0.22
160 0.21
161 0.19
162 0.19
163 0.16
164 0.14
165 0.09
166 0.09
167 0.08
168 0.08
169 0.07
170 0.07
171 0.07
172 0.06
173 0.05
174 0.04
175 0.05
176 0.04
177 0.04
178 0.05
179 0.06
180 0.07
181 0.09
182 0.09
183 0.1
184 0.15
185 0.2
186 0.21
187 0.23
188 0.25
189 0.32
190 0.31
191 0.31
192 0.28
193 0.22
194 0.2
195 0.17
196 0.14
197 0.06
198 0.08
199 0.09
200 0.08
201 0.08
202 0.09
203 0.09
204 0.11
205 0.13
206 0.12
207 0.11
208 0.11
209 0.13
210 0.14
211 0.13
212 0.14
213 0.14
214 0.17
215 0.17
216 0.18
217 0.21
218 0.21
219 0.26
220 0.28
221 0.28
222 0.28
223 0.36
224 0.46
225 0.48
226 0.53
227 0.54
228 0.54
229 0.6
230 0.6
231 0.54
232 0.47
233 0.5
234 0.44
235 0.41
236 0.37
237 0.33
238 0.32
239 0.3
240 0.27
241 0.19
242 0.19
243 0.19
244 0.26
245 0.27
246 0.33
247 0.41
248 0.5
249 0.57
250 0.66
251 0.73
252 0.72
253 0.75
254 0.76
255 0.77
256 0.76
257 0.73
258 0.67
259 0.6
260 0.55
261 0.46
262 0.38
263 0.28
264 0.19
265 0.14
266 0.1
267 0.09
268 0.09
269 0.1
270 0.1
271 0.11
272 0.12
273 0.13
274 0.14
275 0.14
276 0.14
277 0.14
278 0.14
279 0.16
280 0.15
281 0.15
282 0.13
283 0.13
284 0.13
285 0.12
286 0.13
287 0.11
288 0.15
289 0.15
290 0.15
291 0.15
292 0.13
293 0.13
294 0.12
295 0.11
296 0.07
297 0.06
298 0.05
299 0.06
300 0.06
301 0.06
302 0.07
303 0.06
304 0.07
305 0.08
306 0.09
307 0.1
308 0.12
309 0.14
310 0.15
311 0.19
312 0.22
313 0.25
314 0.24
315 0.24
316 0.21
317 0.23
318 0.3
319 0.27
320 0.25
321 0.22
322 0.21
323 0.2
324 0.19
325 0.17
326 0.08
327 0.09
328 0.16
329 0.18
330 0.22
331 0.28
332 0.38
333 0.48
334 0.59
335 0.68
336 0.71
337 0.78
338 0.84
339 0.89
340 0.87
341 0.84
342 0.83
343 0.82
344 0.76
345 0.67
346 0.59
347 0.49
348 0.47
349 0.41
350 0.32
351 0.24
352 0.19
353 0.2
354 0.24
355 0.32
356 0.34
357 0.4
358 0.48
359 0.55
360 0.57