Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q5KM41

Protein Details
Accession Q5KM41    Localization Confidence High Confidence Score 18.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
177-203REEAGEKKEEKKRKKKGDKGGTGSRANBasic
247-273TEPISSKTIKRLKKRLSKLEEKKEMSLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
182-210EKKEEKKRKKKGDKGGTGSRANSKNARSE
221-227EPKSKKR
256-263KRLKKRLS
Subcellular Location(s) nucl 19.5, mito_nucl 13.5, mito 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039999  LYAR  
IPR014898  Znf_C2H2_LYAR  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
IPR013087  Znf_C2H2_type  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0000122  P:negative regulation of transcription by RNA polymerase II  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG cne:CNB03080  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08790  zf-LYAR  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51804  ZF_C2HC_LYAR  
PS50157  ZINC_FINGER_C2H2_2  
Amino Acid Sequences MVSFQCDACADTVKKPKLDQHRSRCFASFTCLDCSKTFKNPSEYKGHTSCISEAEKYQGALYKGSKKEQSQSQPQSLTPVSEAEPAASAPGIHPSRLRQMTSSSSDSHQGGFQDRGTRGMRGGRGGRGGYQSRGGHNPNGGERSYASAMNKLESTVGMRSWGSPAITETASENVEVREEAGEKKEEKKRKKKGDKGGTGSRANSKNARSEEPSSAPPETSEPKSKKRKIDDVDIVADAEDPSSAVSTEPISSKTIKRLKKRLSKLEEKKEMSLGELVDSLQKDEKKAVEAAEIMKGIKISFRDGSWVLNV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.44
2 0.47
3 0.54
4 0.58
5 0.66
6 0.69
7 0.7
8 0.76
9 0.77
10 0.78
11 0.72
12 0.65
13 0.55
14 0.51
15 0.46
16 0.38
17 0.4
18 0.39
19 0.38
20 0.36
21 0.41
22 0.39
23 0.42
24 0.46
25 0.46
26 0.53
27 0.56
28 0.59
29 0.62
30 0.62
31 0.61
32 0.57
33 0.53
34 0.46
35 0.43
36 0.39
37 0.35
38 0.33
39 0.28
40 0.25
41 0.27
42 0.25
43 0.23
44 0.23
45 0.22
46 0.2
47 0.22
48 0.26
49 0.3
50 0.33
51 0.38
52 0.42
53 0.4
54 0.46
55 0.52
56 0.56
57 0.57
58 0.61
59 0.62
60 0.59
61 0.56
62 0.55
63 0.46
64 0.39
65 0.29
66 0.23
67 0.18
68 0.18
69 0.18
70 0.13
71 0.13
72 0.12
73 0.11
74 0.09
75 0.08
76 0.05
77 0.13
78 0.14
79 0.14
80 0.16
81 0.18
82 0.27
83 0.3
84 0.3
85 0.24
86 0.27
87 0.31
88 0.35
89 0.35
90 0.28
91 0.26
92 0.28
93 0.28
94 0.24
95 0.21
96 0.17
97 0.16
98 0.16
99 0.16
100 0.19
101 0.19
102 0.23
103 0.23
104 0.22
105 0.21
106 0.24
107 0.23
108 0.22
109 0.24
110 0.21
111 0.23
112 0.22
113 0.23
114 0.23
115 0.24
116 0.2
117 0.24
118 0.23
119 0.23
120 0.27
121 0.27
122 0.24
123 0.24
124 0.24
125 0.21
126 0.22
127 0.2
128 0.16
129 0.14
130 0.16
131 0.15
132 0.15
133 0.13
134 0.15
135 0.15
136 0.15
137 0.15
138 0.12
139 0.11
140 0.09
141 0.1
142 0.07
143 0.07
144 0.07
145 0.07
146 0.08
147 0.08
148 0.09
149 0.08
150 0.07
151 0.08
152 0.09
153 0.09
154 0.09
155 0.09
156 0.09
157 0.09
158 0.09
159 0.09
160 0.07
161 0.07
162 0.07
163 0.06
164 0.06
165 0.06
166 0.07
167 0.09
168 0.12
169 0.13
170 0.21
171 0.28
172 0.36
173 0.46
174 0.56
175 0.64
176 0.73
177 0.83
178 0.85
179 0.88
180 0.9
181 0.89
182 0.86
183 0.85
184 0.8
185 0.72
186 0.64
187 0.6
188 0.52
189 0.46
190 0.43
191 0.36
192 0.37
193 0.37
194 0.39
195 0.37
196 0.38
197 0.39
198 0.38
199 0.39
200 0.35
201 0.32
202 0.28
203 0.24
204 0.24
205 0.24
206 0.25
207 0.32
208 0.34
209 0.43
210 0.54
211 0.6
212 0.65
213 0.69
214 0.74
215 0.7
216 0.75
217 0.73
218 0.67
219 0.63
220 0.55
221 0.46
222 0.36
223 0.31
224 0.21
225 0.13
226 0.08
227 0.05
228 0.04
229 0.05
230 0.05
231 0.04
232 0.05
233 0.06
234 0.08
235 0.1
236 0.11
237 0.13
238 0.17
239 0.19
240 0.28
241 0.36
242 0.42
243 0.51
244 0.6
245 0.68
246 0.75
247 0.83
248 0.84
249 0.85
250 0.88
251 0.89
252 0.9
253 0.89
254 0.82
255 0.75
256 0.68
257 0.58
258 0.49
259 0.41
260 0.31
261 0.22
262 0.18
263 0.16
264 0.16
265 0.16
266 0.16
267 0.19
268 0.2
269 0.2
270 0.24
271 0.25
272 0.25
273 0.27
274 0.26
275 0.23
276 0.25
277 0.25
278 0.25
279 0.24
280 0.21
281 0.2
282 0.19
283 0.16
284 0.17
285 0.17
286 0.18
287 0.19
288 0.19
289 0.24
290 0.25