Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q5KFM4

Protein Details
Accession Q5KFM4    Localization Confidence High Confidence Score 22.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
22-62ADDTRSHRSHKDRDYEREDRDPERRHRRDDKDDRYRERDRDBasic
68-90RDLGRERDYRPRDRERERERGYEBasic
106-127AGGFEERPPRRRRRDEEELTLABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
46-49RHRR
71-88GRERDYRPRDRERERERG
103-119GRGAGGFEERPPRRRRR
156-187SPPRRRRDDGFRGGRGDRDGGRRGGGGGGGGG
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 14, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR003954  RRM_dom_euk  
Gene Ontology GO:0000243  C:commitment complex  
GO:0016607  C:nuclear speck  
GO:0071004  C:U2-type prespliceosome  
GO:0089701  C:U2AF complex  
GO:0008187  F:poly-pyrimidine tract binding  
GO:0030628  F:pre-mRNA 3'-splice site binding  
KEGG cne:CNF01250  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12230  RRM1_U2AF65  
cd12231  RRM2_U2AF65  
cd12232  RRM3_U2AF65  
Amino Acid Sequences MDAGYDALEEAASSYAKNRDRADDTRSHRSHKDRDYEREDRDPERRHRRDDKDDRYRERDRDAYRGERDLGRERDYRPRDRERERERGYEARDRYDRYERGDGRGAGGFEERPPRRRRRDEEELTLAAEPMHGHRDRRPRYDEPPEFAEPMRGNWSPPRRRRDDGFRGGRGDRDGGRRGGGGGGGGGGGGGRFYEDRRSPTPDGTMSLEERKEKLSRSLWDTAPVQFQGISALEAKTTGLFTYGPGRVPPPAHLGIPATFVAGAFPPSNPVRQNNRLYIGGIKEDMQEQQIQDFFNNLMKEKGMADGKEDPVKQCQINNDRNFAFIELHTPEQATAALELDGVVLDGASLRVRRPKDYAGIDPLLQTFNGVVAPSVADSPNKLFIGGIPTYLNDEQVMELLKSFGELKSFNLVKESAGVSKGFAFAEYLDPEVTDMAIQGLHNFSLGDRNLVVQRAAVGRNTGVNAPIPGSAAYLSQAIPHLMQNNADAPSSRVMLLLNMVTPEELYNDDDYNDIIEDINEECSKYGEIEGVRIPRPVPKSKKWESTEAAAATAERNKRTDDEAGVGRVYVMYKDVESTKKAMNAIGGRQFAGRTILVANVPEEEFLGPAPPPPPPEDAPAPAESDAPPPPPPADLDAAADAALKDIMSGI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.19
3 0.24
4 0.3
5 0.32
6 0.38
7 0.45
8 0.5
9 0.53
10 0.55
11 0.58
12 0.63
13 0.64
14 0.63
15 0.64
16 0.68
17 0.71
18 0.7
19 0.74
20 0.71
21 0.77
22 0.8
23 0.8
24 0.78
25 0.77
26 0.72
27 0.69
28 0.69
29 0.69
30 0.7
31 0.73
32 0.74
33 0.75
34 0.8
35 0.83
36 0.85
37 0.87
38 0.87
39 0.87
40 0.9
41 0.89
42 0.87
43 0.86
44 0.79
45 0.76
46 0.73
47 0.66
48 0.65
49 0.64
50 0.64
51 0.6
52 0.6
53 0.56
54 0.51
55 0.52
56 0.52
57 0.49
58 0.47
59 0.47
60 0.47
61 0.54
62 0.58
63 0.62
64 0.61
65 0.67
66 0.71
67 0.76
68 0.83
69 0.81
70 0.84
71 0.8
72 0.77
73 0.73
74 0.71
75 0.68
76 0.66
77 0.6
78 0.58
79 0.57
80 0.55
81 0.55
82 0.57
83 0.54
84 0.51
85 0.59
86 0.52
87 0.53
88 0.56
89 0.5
90 0.43
91 0.43
92 0.36
93 0.27
94 0.27
95 0.22
96 0.19
97 0.28
98 0.29
99 0.35
100 0.43
101 0.52
102 0.61
103 0.71
104 0.75
105 0.75
106 0.82
107 0.82
108 0.82
109 0.78
110 0.68
111 0.59
112 0.51
113 0.42
114 0.3
115 0.23
116 0.15
117 0.1
118 0.16
119 0.16
120 0.18
121 0.26
122 0.37
123 0.43
124 0.51
125 0.57
126 0.56
127 0.62
128 0.71
129 0.7
130 0.64
131 0.63
132 0.58
133 0.53
134 0.47
135 0.44
136 0.33
137 0.3
138 0.31
139 0.25
140 0.24
141 0.3
142 0.41
143 0.45
144 0.53
145 0.6
146 0.61
147 0.66
148 0.71
149 0.74
150 0.74
151 0.74
152 0.74
153 0.69
154 0.67
155 0.62
156 0.57
157 0.48
158 0.41
159 0.35
160 0.32
161 0.32
162 0.28
163 0.28
164 0.26
165 0.25
166 0.22
167 0.18
168 0.11
169 0.07
170 0.06
171 0.05
172 0.04
173 0.04
174 0.03
175 0.03
176 0.02
177 0.02
178 0.03
179 0.04
180 0.05
181 0.12
182 0.15
183 0.21
184 0.24
185 0.32
186 0.33
187 0.34
188 0.37
189 0.31
190 0.31
191 0.29
192 0.28
193 0.23
194 0.25
195 0.26
196 0.24
197 0.24
198 0.25
199 0.24
200 0.23
201 0.28
202 0.29
203 0.31
204 0.35
205 0.4
206 0.37
207 0.39
208 0.39
209 0.34
210 0.32
211 0.27
212 0.21
213 0.16
214 0.15
215 0.12
216 0.11
217 0.1
218 0.09
219 0.08
220 0.08
221 0.08
222 0.08
223 0.07
224 0.07
225 0.05
226 0.05
227 0.05
228 0.06
229 0.12
230 0.13
231 0.13
232 0.13
233 0.14
234 0.16
235 0.17
236 0.18
237 0.18
238 0.18
239 0.18
240 0.18
241 0.19
242 0.17
243 0.18
244 0.16
245 0.11
246 0.09
247 0.09
248 0.08
249 0.07
250 0.08
251 0.06
252 0.06
253 0.1
254 0.11
255 0.14
256 0.15
257 0.21
258 0.28
259 0.35
260 0.4
261 0.39
262 0.42
263 0.4
264 0.38
265 0.35
266 0.28
267 0.21
268 0.17
269 0.14
270 0.12
271 0.12
272 0.12
273 0.1
274 0.1
275 0.09
276 0.1
277 0.11
278 0.11
279 0.1
280 0.1
281 0.1
282 0.12
283 0.12
284 0.11
285 0.1
286 0.1
287 0.11
288 0.1
289 0.13
290 0.11
291 0.11
292 0.13
293 0.16
294 0.18
295 0.21
296 0.21
297 0.19
298 0.2
299 0.23
300 0.21
301 0.19
302 0.25
303 0.3
304 0.38
305 0.39
306 0.41
307 0.38
308 0.38
309 0.37
310 0.3
311 0.22
312 0.13
313 0.14
314 0.12
315 0.12
316 0.11
317 0.11
318 0.1
319 0.09
320 0.09
321 0.06
322 0.05
323 0.05
324 0.05
325 0.04
326 0.04
327 0.04
328 0.04
329 0.03
330 0.03
331 0.02
332 0.02
333 0.02
334 0.02
335 0.03
336 0.04
337 0.05
338 0.11
339 0.12
340 0.15
341 0.18
342 0.21
343 0.26
344 0.29
345 0.31
346 0.31
347 0.31
348 0.29
349 0.26
350 0.24
351 0.18
352 0.15
353 0.12
354 0.06
355 0.06
356 0.06
357 0.05
358 0.04
359 0.04
360 0.04
361 0.04
362 0.05
363 0.05
364 0.05
365 0.06
366 0.08
367 0.11
368 0.11
369 0.11
370 0.1
371 0.1
372 0.15
373 0.14
374 0.14
375 0.11
376 0.11
377 0.14
378 0.14
379 0.14
380 0.09
381 0.09
382 0.08
383 0.09
384 0.09
385 0.06
386 0.06
387 0.06
388 0.05
389 0.06
390 0.07
391 0.06
392 0.07
393 0.08
394 0.09
395 0.16
396 0.17
397 0.17
398 0.18
399 0.18
400 0.16
401 0.18
402 0.18
403 0.12
404 0.12
405 0.12
406 0.11
407 0.11
408 0.12
409 0.1
410 0.09
411 0.08
412 0.07
413 0.1
414 0.1
415 0.1
416 0.09
417 0.09
418 0.09
419 0.09
420 0.08
421 0.05
422 0.04
423 0.04
424 0.04
425 0.04
426 0.05
427 0.06
428 0.06
429 0.06
430 0.06
431 0.06
432 0.11
433 0.11
434 0.11
435 0.11
436 0.13
437 0.14
438 0.15
439 0.15
440 0.1
441 0.12
442 0.13
443 0.14
444 0.13
445 0.13
446 0.12
447 0.14
448 0.15
449 0.13
450 0.11
451 0.11
452 0.11
453 0.11
454 0.11
455 0.1
456 0.09
457 0.09
458 0.08
459 0.08
460 0.08
461 0.08
462 0.08
463 0.08
464 0.09
465 0.09
466 0.09
467 0.11
468 0.12
469 0.12
470 0.13
471 0.13
472 0.15
473 0.16
474 0.15
475 0.14
476 0.14
477 0.15
478 0.15
479 0.14
480 0.11
481 0.1
482 0.1
483 0.11
484 0.1
485 0.09
486 0.08
487 0.08
488 0.07
489 0.08
490 0.07
491 0.07
492 0.08
493 0.09
494 0.11
495 0.11
496 0.12
497 0.12
498 0.11
499 0.11
500 0.1
501 0.08
502 0.06
503 0.06
504 0.07
505 0.07
506 0.11
507 0.1
508 0.1
509 0.1
510 0.11
511 0.11
512 0.11
513 0.11
514 0.11
515 0.12
516 0.14
517 0.18
518 0.21
519 0.22
520 0.22
521 0.23
522 0.25
523 0.31
524 0.39
525 0.43
526 0.48
527 0.57
528 0.65
529 0.74
530 0.72
531 0.75
532 0.68
533 0.65
534 0.62
535 0.53
536 0.45
537 0.35
538 0.31
539 0.25
540 0.27
541 0.26
542 0.22
543 0.23
544 0.24
545 0.27
546 0.3
547 0.32
548 0.29
549 0.3
550 0.31
551 0.31
552 0.29
553 0.26
554 0.22
555 0.19
556 0.17
557 0.12
558 0.1
559 0.09
560 0.09
561 0.12
562 0.16
563 0.19
564 0.21
565 0.24
566 0.27
567 0.29
568 0.3
569 0.29
570 0.31
571 0.31
572 0.35
573 0.38
574 0.36
575 0.33
576 0.33
577 0.32
578 0.26
579 0.25
580 0.19
581 0.13
582 0.13
583 0.15
584 0.15
585 0.16
586 0.15
587 0.14
588 0.14
589 0.13
590 0.13
591 0.11
592 0.1
593 0.09
594 0.11
595 0.08
596 0.11
597 0.12
598 0.13
599 0.16
600 0.19
601 0.25
602 0.26
603 0.32
604 0.34
605 0.37
606 0.39
607 0.38
608 0.37
609 0.32
610 0.31
611 0.26
612 0.25
613 0.24
614 0.23
615 0.23
616 0.23
617 0.23
618 0.23
619 0.24
620 0.25
621 0.26
622 0.24
623 0.25
624 0.23
625 0.23
626 0.21
627 0.2
628 0.15
629 0.12
630 0.11
631 0.07