Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q5KCM6

Protein Details
Accession Q5KCM6    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
265-289LLEKETQGQKTREKRQRRKEREARTBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
275-288TREKRQRRKEREAR
Subcellular Location(s) mito 19, nucl 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021036  Ribosomal_S35_mit  
Gene Ontology GO:0005763  C:mitochondrial small ribosomal subunit  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0032543  P:mitochondrial translation  
KEGG cne:CNH01595  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF12298  Bot1p  
Amino Acid Sequences MSLLSFSNIAGPSRLPLQVTVTACRRAVAARFYATEAQEPQEPLAAEQSEQSAPVDELSALTLDPSTPATRSGLEKREGRIFYRDWLRYEGEQFRVPQKGQKAKWLGGNVPYPSNPSFRPPPPLSNHIQDQVFADLQRGQSVAELSVKYNISKARVEAIQKLKEIETEYKRRSLPLQTAFLEGMEPLLGVRTPISPRTRQHDPALARELDLAHEAHPSTAAERLEEQRFDAGIGEEGAFGQRTRESTKPSIERTVWEFMDEESALLEKETQGQKTREKRQRRKEREART
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.16
3 0.16
4 0.2
5 0.25
6 0.28
7 0.32
8 0.33
9 0.36
10 0.35
11 0.34
12 0.3
13 0.27
14 0.29
15 0.28
16 0.27
17 0.26
18 0.28
19 0.3
20 0.34
21 0.31
22 0.3
23 0.27
24 0.25
25 0.26
26 0.25
27 0.23
28 0.22
29 0.21
30 0.18
31 0.21
32 0.19
33 0.15
34 0.15
35 0.17
36 0.14
37 0.14
38 0.14
39 0.11
40 0.11
41 0.11
42 0.11
43 0.08
44 0.08
45 0.08
46 0.08
47 0.06
48 0.06
49 0.06
50 0.05
51 0.06
52 0.08
53 0.08
54 0.08
55 0.1
56 0.11
57 0.13
58 0.18
59 0.25
60 0.28
61 0.33
62 0.36
63 0.38
64 0.44
65 0.44
66 0.42
67 0.4
68 0.36
69 0.37
70 0.42
71 0.42
72 0.36
73 0.38
74 0.38
75 0.35
76 0.39
77 0.37
78 0.31
79 0.31
80 0.31
81 0.31
82 0.32
83 0.31
84 0.3
85 0.34
86 0.4
87 0.38
88 0.45
89 0.46
90 0.45
91 0.49
92 0.47
93 0.41
94 0.36
95 0.4
96 0.32
97 0.29
98 0.26
99 0.25
100 0.23
101 0.24
102 0.2
103 0.2
104 0.25
105 0.25
106 0.33
107 0.32
108 0.37
109 0.4
110 0.44
111 0.43
112 0.41
113 0.42
114 0.37
115 0.34
116 0.28
117 0.24
118 0.21
119 0.17
120 0.13
121 0.12
122 0.1
123 0.1
124 0.1
125 0.09
126 0.07
127 0.08
128 0.08
129 0.08
130 0.08
131 0.08
132 0.08
133 0.11
134 0.11
135 0.11
136 0.13
137 0.13
138 0.14
139 0.14
140 0.15
141 0.14
142 0.17
143 0.19
144 0.24
145 0.29
146 0.29
147 0.29
148 0.3
149 0.27
150 0.26
151 0.27
152 0.27
153 0.27
154 0.32
155 0.33
156 0.37
157 0.37
158 0.37
159 0.37
160 0.35
161 0.36
162 0.34
163 0.36
164 0.33
165 0.34
166 0.33
167 0.3
168 0.25
169 0.17
170 0.11
171 0.06
172 0.05
173 0.03
174 0.04
175 0.03
176 0.04
177 0.04
178 0.07
179 0.09
180 0.15
181 0.2
182 0.25
183 0.29
184 0.35
185 0.42
186 0.43
187 0.46
188 0.48
189 0.46
190 0.47
191 0.49
192 0.42
193 0.36
194 0.32
195 0.28
196 0.21
197 0.2
198 0.14
199 0.09
200 0.11
201 0.1
202 0.09
203 0.1
204 0.09
205 0.09
206 0.13
207 0.12
208 0.12
209 0.15
210 0.2
211 0.23
212 0.23
213 0.23
214 0.2
215 0.2
216 0.2
217 0.17
218 0.13
219 0.1
220 0.11
221 0.1
222 0.08
223 0.08
224 0.09
225 0.08
226 0.08
227 0.08
228 0.09
229 0.12
230 0.17
231 0.21
232 0.28
233 0.33
234 0.42
235 0.47
236 0.5
237 0.55
238 0.51
239 0.51
240 0.49
241 0.5
242 0.41
243 0.35
244 0.31
245 0.24
246 0.27
247 0.23
248 0.18
249 0.12
250 0.12
251 0.11
252 0.11
253 0.11
254 0.07
255 0.15
256 0.19
257 0.23
258 0.3
259 0.35
260 0.44
261 0.53
262 0.64
263 0.66
264 0.74
265 0.8
266 0.85
267 0.91
268 0.92
269 0.94