Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0B2WQX0

Protein Details
Accession A0A0B2WQX0    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
484-503LVAVPRRRRNDTRPARPPSTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
477-500RPPRKLALVAVPRRRRNDTRPARP
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR024662  Trs65  
Gene Ontology GO:1990071  C:TRAPPII protein complex  
GO:0006891  P:intra-Golgi vesicle-mediated transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF12735  Trs65  
Amino Acid Sequences MADAGERPDGVTLDNDAPKASGNLLEQSYLAYVVPARTELDLESVFKDVDPGKPIFESIEQRELLLFDETVEVLLILKMPCSEEKDLHAQIKRLVISLECQIVNSTPADRSSQPVSETIFKGRAQDITDAFMLVDKLRMDSGHSSSQKVYAMWKLPVFLSRPRIRLQHPTVVFTASASVKPDARGDGAGTCGTGYLQSGMPSSFNLLESFSSDPALNGIKPRLSALRVSRVAPGSRQQDHVVHLRAQPRLRIPIHPVIHTRVRFSRPNTPQSTSSLVAMLEVDFTPHVDCEVVLQEIKLVTNDGTVQSLNDEEQMQLPMSCVSHDHITFLYHIKPHQVDQARRGFTGSLGVSITATAQVIPGVCTPKLTMSWNAALDFTVPVNPSFSNVPESSGIQRAHKPSQLSIGSSAAITPLKSPSITRPDALPGLDASARAEAAVPDLGITVSFTGPSEPVHPGDVFLWTVHVVNRSSEKTSRPPRKLALVAVPRRRRNDTRPARPPSTATRRQGEKEIADAVVDMNILHALQKNSAVDATDVICLSADTRVGPLAPGACHVAELQFLALREGIVGVEAVRVVDLGSQEHVDIRDLPTTVVEPAPA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.22
3 0.21
4 0.21
5 0.21
6 0.21
7 0.18
8 0.15
9 0.15
10 0.2
11 0.2
12 0.2
13 0.19
14 0.19
15 0.18
16 0.15
17 0.13
18 0.09
19 0.1
20 0.1
21 0.11
22 0.11
23 0.12
24 0.12
25 0.13
26 0.13
27 0.15
28 0.15
29 0.16
30 0.16
31 0.16
32 0.16
33 0.15
34 0.18
35 0.15
36 0.18
37 0.22
38 0.21
39 0.22
40 0.22
41 0.23
42 0.22
43 0.26
44 0.29
45 0.29
46 0.35
47 0.33
48 0.32
49 0.33
50 0.3
51 0.26
52 0.21
53 0.16
54 0.1
55 0.11
56 0.11
57 0.1
58 0.1
59 0.08
60 0.06
61 0.07
62 0.08
63 0.07
64 0.08
65 0.08
66 0.11
67 0.13
68 0.18
69 0.22
70 0.21
71 0.25
72 0.32
73 0.37
74 0.41
75 0.43
76 0.39
77 0.4
78 0.43
79 0.39
80 0.33
81 0.29
82 0.23
83 0.21
84 0.22
85 0.23
86 0.18
87 0.18
88 0.18
89 0.17
90 0.18
91 0.17
92 0.15
93 0.12
94 0.14
95 0.17
96 0.17
97 0.2
98 0.23
99 0.24
100 0.24
101 0.25
102 0.27
103 0.28
104 0.3
105 0.3
106 0.29
107 0.28
108 0.29
109 0.29
110 0.28
111 0.25
112 0.28
113 0.25
114 0.24
115 0.23
116 0.2
117 0.18
118 0.16
119 0.15
120 0.1
121 0.12
122 0.09
123 0.09
124 0.1
125 0.1
126 0.12
127 0.15
128 0.19
129 0.26
130 0.27
131 0.29
132 0.29
133 0.31
134 0.3
135 0.26
136 0.26
137 0.22
138 0.25
139 0.26
140 0.26
141 0.24
142 0.23
143 0.26
144 0.26
145 0.26
146 0.32
147 0.34
148 0.37
149 0.39
150 0.44
151 0.44
152 0.51
153 0.51
154 0.51
155 0.47
156 0.47
157 0.44
158 0.4
159 0.36
160 0.26
161 0.23
162 0.15
163 0.15
164 0.14
165 0.14
166 0.14
167 0.16
168 0.17
169 0.15
170 0.15
171 0.14
172 0.13
173 0.12
174 0.13
175 0.12
176 0.1
177 0.09
178 0.08
179 0.07
180 0.06
181 0.06
182 0.06
183 0.06
184 0.07
185 0.08
186 0.08
187 0.08
188 0.08
189 0.1
190 0.09
191 0.09
192 0.09
193 0.09
194 0.09
195 0.11
196 0.12
197 0.1
198 0.1
199 0.1
200 0.09
201 0.1
202 0.11
203 0.1
204 0.1
205 0.12
206 0.12
207 0.12
208 0.14
209 0.15
210 0.15
211 0.19
212 0.21
213 0.28
214 0.29
215 0.3
216 0.32
217 0.32
218 0.32
219 0.29
220 0.32
221 0.29
222 0.29
223 0.3
224 0.29
225 0.28
226 0.3
227 0.34
228 0.3
229 0.27
230 0.29
231 0.31
232 0.33
233 0.32
234 0.33
235 0.3
236 0.35
237 0.33
238 0.32
239 0.33
240 0.37
241 0.38
242 0.38
243 0.37
244 0.34
245 0.39
246 0.37
247 0.35
248 0.31
249 0.34
250 0.36
251 0.38
252 0.44
253 0.44
254 0.52
255 0.53
256 0.51
257 0.48
258 0.46
259 0.47
260 0.37
261 0.31
262 0.23
263 0.18
264 0.15
265 0.13
266 0.1
267 0.06
268 0.05
269 0.05
270 0.04
271 0.05
272 0.05
273 0.05
274 0.05
275 0.04
276 0.04
277 0.05
278 0.06
279 0.06
280 0.06
281 0.06
282 0.06
283 0.06
284 0.07
285 0.06
286 0.05
287 0.04
288 0.05
289 0.06
290 0.05
291 0.06
292 0.06
293 0.06
294 0.06
295 0.06
296 0.06
297 0.06
298 0.06
299 0.06
300 0.06
301 0.07
302 0.07
303 0.07
304 0.07
305 0.07
306 0.06
307 0.06
308 0.06
309 0.07
310 0.1
311 0.1
312 0.1
313 0.1
314 0.11
315 0.12
316 0.13
317 0.13
318 0.12
319 0.12
320 0.15
321 0.15
322 0.15
323 0.22
324 0.28
325 0.28
326 0.34
327 0.42
328 0.39
329 0.38
330 0.38
331 0.31
332 0.24
333 0.26
334 0.19
335 0.11
336 0.1
337 0.1
338 0.09
339 0.09
340 0.09
341 0.05
342 0.05
343 0.04
344 0.04
345 0.04
346 0.04
347 0.05
348 0.07
349 0.09
350 0.09
351 0.1
352 0.1
353 0.11
354 0.13
355 0.14
356 0.15
357 0.16
358 0.19
359 0.2
360 0.2
361 0.18
362 0.16
363 0.15
364 0.13
365 0.1
366 0.09
367 0.08
368 0.08
369 0.09
370 0.09
371 0.1
372 0.11
373 0.11
374 0.14
375 0.14
376 0.16
377 0.15
378 0.17
379 0.18
380 0.23
381 0.23
382 0.21
383 0.26
384 0.29
385 0.32
386 0.33
387 0.33
388 0.28
389 0.34
390 0.33
391 0.3
392 0.26
393 0.23
394 0.2
395 0.18
396 0.17
397 0.11
398 0.1
399 0.09
400 0.08
401 0.09
402 0.1
403 0.1
404 0.12
405 0.17
406 0.25
407 0.26
408 0.26
409 0.26
410 0.28
411 0.3
412 0.28
413 0.22
414 0.14
415 0.15
416 0.15
417 0.13
418 0.11
419 0.09
420 0.09
421 0.08
422 0.08
423 0.06
424 0.07
425 0.07
426 0.06
427 0.06
428 0.06
429 0.06
430 0.05
431 0.06
432 0.05
433 0.05
434 0.05
435 0.05
436 0.06
437 0.07
438 0.08
439 0.1
440 0.11
441 0.12
442 0.15
443 0.15
444 0.15
445 0.15
446 0.16
447 0.14
448 0.11
449 0.12
450 0.1
451 0.1
452 0.11
453 0.14
454 0.13
455 0.15
456 0.2
457 0.21
458 0.25
459 0.28
460 0.31
461 0.38
462 0.48
463 0.56
464 0.57
465 0.61
466 0.61
467 0.65
468 0.64
469 0.59
470 0.58
471 0.57
472 0.61
473 0.65
474 0.7
475 0.68
476 0.7
477 0.74
478 0.72
479 0.69
480 0.72
481 0.72
482 0.74
483 0.78
484 0.81
485 0.78
486 0.72
487 0.69
488 0.68
489 0.67
490 0.66
491 0.62
492 0.61
493 0.63
494 0.64
495 0.66
496 0.61
497 0.52
498 0.46
499 0.42
500 0.34
501 0.28
502 0.25
503 0.18
504 0.12
505 0.11
506 0.07
507 0.05
508 0.05
509 0.05
510 0.07
511 0.1
512 0.11
513 0.12
514 0.16
515 0.16
516 0.17
517 0.18
518 0.17
519 0.14
520 0.14
521 0.14
522 0.13
523 0.12
524 0.11
525 0.11
526 0.1
527 0.1
528 0.09
529 0.09
530 0.07
531 0.08
532 0.09
533 0.09
534 0.1
535 0.11
536 0.12
537 0.12
538 0.13
539 0.15
540 0.14
541 0.15
542 0.15
543 0.14
544 0.12
545 0.12
546 0.11
547 0.11
548 0.11
549 0.11
550 0.11
551 0.1
552 0.1
553 0.1
554 0.08
555 0.06
556 0.06
557 0.05
558 0.06
559 0.06
560 0.06
561 0.05
562 0.05
563 0.05
564 0.07
565 0.08
566 0.09
567 0.1
568 0.11
569 0.12
570 0.14
571 0.15
572 0.15
573 0.16
574 0.18
575 0.2
576 0.19
577 0.2
578 0.19
579 0.19
580 0.19