Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q5KHG3

Protein Details
Accession Q5KHG3    Localization Confidence Low Confidence Score 5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
557-577QLYKGKRSSDVRKFKKWQDAEHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 19.5, cyto_mito 12.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012310  DNA_ligase_ATP-dep_cent  
IPR029319  DNA_ligase_OB  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0003910  F:DNA ligase (ATP) activity  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
KEGG cne:CNE00160  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01068  DNA_ligase_A_M  
PF14743  DNA_ligase_OB_2  
CDD cd08041  OBF_kDNA_ligase_like  
Amino Acid Sequences MFGGLLQLLPTRQSLSSIKAILRWRSKPLHVALNPLDRNLYLSPASASSAVYQHQSSCLLRTCSRVTYEPAQLFATIGLGSRYIHSSGGTGNSVVKILKDIGELNNRVSAENSKTEKQNIIAGYPWLRELLEYVYHPDHRTYMTFSSLKSFIDNSPKSFKSIDLPSVATSDLSLIELFDLLSQKAVTGHDAKRTVVAFLKANGVIGNDELLKTFGRLLDRNLVAGFGAKTLVNVPWVEGESELSNTVSPPSLSKKYPSTQITSSSKPSQLASSPRPISPSVSGVTPILPTFRPLDKFEVALGKSLEPPFSSLFKSEPVWYASRKLDGVRCLSFIDVLVPSSSSKPLEFVHGHFVSRSGKPFHSLTKLSEQLRLLVKDHPDNPLREWLKNDPEVVEIRETGVVKRLVLDGEICLMRPKTEEELKVVQPRDDGSAADKMWIASDPFIEDFPSTVSAIRKSGTIQHLSYFVFDVLSWAEVYAKQGLLRPGLGKKFSERIADVERLGNWLNKSLALEGIDEQERIMRALVQCKVERPEDVEDMVKRAANEGWEGLILRADQLYKGKRSSDVRKFKKWQDAEYVVKSADTNIMRLAINGVFDEHEALASVWIEHKGHPVSVGSGFSAEERLRYAEKPEEIVGKTITVEYFSESEAIGREGAKSLRFPRVKAIWGGERDL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.24
3 0.29
4 0.32
5 0.32
6 0.35
7 0.42
8 0.46
9 0.53
10 0.52
11 0.54
12 0.57
13 0.61
14 0.62
15 0.61
16 0.62
17 0.55
18 0.59
19 0.58
20 0.61
21 0.57
22 0.5
23 0.46
24 0.35
25 0.38
26 0.3
27 0.27
28 0.17
29 0.17
30 0.18
31 0.17
32 0.19
33 0.15
34 0.15
35 0.14
36 0.15
37 0.16
38 0.17
39 0.17
40 0.16
41 0.18
42 0.22
43 0.21
44 0.23
45 0.28
46 0.3
47 0.32
48 0.36
49 0.38
50 0.38
51 0.41
52 0.4
53 0.4
54 0.41
55 0.47
56 0.43
57 0.41
58 0.38
59 0.34
60 0.31
61 0.25
62 0.19
63 0.11
64 0.1
65 0.08
66 0.08
67 0.08
68 0.09
69 0.11
70 0.11
71 0.12
72 0.12
73 0.12
74 0.13
75 0.16
76 0.15
77 0.14
78 0.14
79 0.14
80 0.15
81 0.14
82 0.13
83 0.12
84 0.12
85 0.13
86 0.13
87 0.15
88 0.2
89 0.28
90 0.29
91 0.28
92 0.31
93 0.3
94 0.28
95 0.28
96 0.27
97 0.23
98 0.29
99 0.33
100 0.33
101 0.36
102 0.39
103 0.4
104 0.37
105 0.38
106 0.31
107 0.28
108 0.25
109 0.25
110 0.25
111 0.23
112 0.22
113 0.17
114 0.16
115 0.14
116 0.14
117 0.13
118 0.14
119 0.14
120 0.18
121 0.21
122 0.23
123 0.25
124 0.24
125 0.23
126 0.22
127 0.23
128 0.23
129 0.21
130 0.25
131 0.25
132 0.24
133 0.28
134 0.27
135 0.25
136 0.22
137 0.22
138 0.2
139 0.3
140 0.31
141 0.31
142 0.37
143 0.37
144 0.38
145 0.37
146 0.34
147 0.3
148 0.33
149 0.32
150 0.27
151 0.28
152 0.26
153 0.26
154 0.25
155 0.19
156 0.14
157 0.11
158 0.08
159 0.07
160 0.07
161 0.05
162 0.05
163 0.05
164 0.05
165 0.06
166 0.07
167 0.06
168 0.07
169 0.07
170 0.07
171 0.09
172 0.09
173 0.11
174 0.16
175 0.19
176 0.24
177 0.26
178 0.26
179 0.28
180 0.28
181 0.26
182 0.23
183 0.24
184 0.19
185 0.18
186 0.21
187 0.18
188 0.18
189 0.16
190 0.14
191 0.11
192 0.1
193 0.1
194 0.07
195 0.07
196 0.07
197 0.08
198 0.07
199 0.07
200 0.08
201 0.09
202 0.12
203 0.14
204 0.16
205 0.22
206 0.23
207 0.23
208 0.22
209 0.2
210 0.16
211 0.17
212 0.14
213 0.07
214 0.07
215 0.06
216 0.07
217 0.08
218 0.08
219 0.08
220 0.08
221 0.08
222 0.09
223 0.09
224 0.1
225 0.08
226 0.09
227 0.08
228 0.09
229 0.09
230 0.08
231 0.07
232 0.07
233 0.08
234 0.07
235 0.07
236 0.08
237 0.14
238 0.17
239 0.18
240 0.22
241 0.27
242 0.29
243 0.37
244 0.37
245 0.36
246 0.35
247 0.41
248 0.43
249 0.4
250 0.42
251 0.38
252 0.37
253 0.33
254 0.32
255 0.26
256 0.25
257 0.29
258 0.28
259 0.32
260 0.32
261 0.32
262 0.34
263 0.32
264 0.31
265 0.26
266 0.24
267 0.17
268 0.15
269 0.16
270 0.13
271 0.13
272 0.11
273 0.09
274 0.09
275 0.08
276 0.09
277 0.11
278 0.14
279 0.16
280 0.18
281 0.23
282 0.22
283 0.22
284 0.22
285 0.24
286 0.21
287 0.2
288 0.19
289 0.15
290 0.17
291 0.17
292 0.16
293 0.11
294 0.13
295 0.13
296 0.14
297 0.14
298 0.12
299 0.12
300 0.14
301 0.15
302 0.14
303 0.14
304 0.15
305 0.17
306 0.17
307 0.2
308 0.19
309 0.2
310 0.19
311 0.19
312 0.19
313 0.21
314 0.23
315 0.2
316 0.2
317 0.19
318 0.18
319 0.16
320 0.13
321 0.11
322 0.07
323 0.07
324 0.06
325 0.06
326 0.06
327 0.07
328 0.08
329 0.08
330 0.07
331 0.09
332 0.09
333 0.14
334 0.15
335 0.15
336 0.21
337 0.22
338 0.22
339 0.2
340 0.21
341 0.2
342 0.2
343 0.21
344 0.17
345 0.17
346 0.2
347 0.21
348 0.23
349 0.25
350 0.25
351 0.25
352 0.28
353 0.33
354 0.31
355 0.34
356 0.3
357 0.29
358 0.31
359 0.29
360 0.24
361 0.22
362 0.24
363 0.24
364 0.25
365 0.26
366 0.27
367 0.27
368 0.27
369 0.33
370 0.33
371 0.3
372 0.32
373 0.32
374 0.34
375 0.34
376 0.33
377 0.24
378 0.24
379 0.24
380 0.22
381 0.18
382 0.12
383 0.12
384 0.13
385 0.13
386 0.11
387 0.15
388 0.14
389 0.13
390 0.14
391 0.14
392 0.11
393 0.11
394 0.12
395 0.07
396 0.09
397 0.09
398 0.08
399 0.09
400 0.09
401 0.09
402 0.1
403 0.12
404 0.14
405 0.19
406 0.2
407 0.23
408 0.28
409 0.31
410 0.37
411 0.35
412 0.31
413 0.27
414 0.27
415 0.25
416 0.21
417 0.17
418 0.13
419 0.16
420 0.16
421 0.16
422 0.15
423 0.12
424 0.12
425 0.13
426 0.1
427 0.07
428 0.08
429 0.08
430 0.08
431 0.09
432 0.09
433 0.08
434 0.08
435 0.08
436 0.1
437 0.08
438 0.1
439 0.12
440 0.13
441 0.14
442 0.14
443 0.13
444 0.13
445 0.19
446 0.22
447 0.24
448 0.23
449 0.24
450 0.26
451 0.26
452 0.25
453 0.19
454 0.15
455 0.11
456 0.1
457 0.09
458 0.07
459 0.08
460 0.07
461 0.06
462 0.07
463 0.07
464 0.09
465 0.09
466 0.09
467 0.1
468 0.13
469 0.15
470 0.15
471 0.16
472 0.18
473 0.22
474 0.26
475 0.27
476 0.25
477 0.27
478 0.3
479 0.32
480 0.33
481 0.28
482 0.29
483 0.32
484 0.33
485 0.31
486 0.28
487 0.25
488 0.24
489 0.24
490 0.23
491 0.18
492 0.18
493 0.18
494 0.16
495 0.17
496 0.15
497 0.15
498 0.13
499 0.13
500 0.12
501 0.15
502 0.15
503 0.14
504 0.13
505 0.13
506 0.13
507 0.12
508 0.12
509 0.12
510 0.13
511 0.2
512 0.24
513 0.27
514 0.28
515 0.31
516 0.35
517 0.33
518 0.32
519 0.3
520 0.31
521 0.28
522 0.29
523 0.29
524 0.26
525 0.27
526 0.27
527 0.24
528 0.19
529 0.18
530 0.18
531 0.15
532 0.15
533 0.13
534 0.12
535 0.12
536 0.12
537 0.11
538 0.11
539 0.09
540 0.08
541 0.09
542 0.09
543 0.1
544 0.17
545 0.22
546 0.25
547 0.28
548 0.29
549 0.35
550 0.43
551 0.51
552 0.55
553 0.61
554 0.65
555 0.73
556 0.79
557 0.8
558 0.83
559 0.77
560 0.72
561 0.71
562 0.7
563 0.67
564 0.63
565 0.57
566 0.47
567 0.42
568 0.37
569 0.28
570 0.27
571 0.21
572 0.18
573 0.16
574 0.18
575 0.18
576 0.18
577 0.19
578 0.13
579 0.13
580 0.12
581 0.12
582 0.11
583 0.11
584 0.13
585 0.1
586 0.09
587 0.09
588 0.09
589 0.09
590 0.09
591 0.09
592 0.09
593 0.11
594 0.12
595 0.13
596 0.19
597 0.19
598 0.2
599 0.21
600 0.2
601 0.2
602 0.22
603 0.22
604 0.16
605 0.15
606 0.15
607 0.14
608 0.17
609 0.14
610 0.13
611 0.14
612 0.17
613 0.19
614 0.2
615 0.25
616 0.28
617 0.3
618 0.32
619 0.33
620 0.36
621 0.35
622 0.36
623 0.32
624 0.25
625 0.24
626 0.22
627 0.2
628 0.15
629 0.14
630 0.15
631 0.15
632 0.15
633 0.15
634 0.13
635 0.14
636 0.13
637 0.14
638 0.12
639 0.11
640 0.11
641 0.14
642 0.17
643 0.19
644 0.24
645 0.28
646 0.37
647 0.4
648 0.4
649 0.46
650 0.5
651 0.52
652 0.51
653 0.53
654 0.51