Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q5KHD2

Protein Details
Accession Q5KHD2    Localization Confidence High Confidence Score 15.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
50-70GIQRMKFKPKVPIRRVKTEAEHydrophilic
188-212KAKGEKNKKDVKRRAAKKDTGKHRDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
57-63KPKVPIR
87-101MNGRGRGGGTRGRGR
185-212TQGKAKGEKNKKDVKRRAAKKDTGKHRD
Subcellular Location(s) cyto 10.5, mito 10, cyto_nucl 8.5, nucl 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007811  RPC4  
Gene Ontology GO:0005666  C:RNA polymerase III complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006383  P:transcription by RNA polymerase III  
KEGG cne:CNE00450  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05132  RNA_pol_Rpc4  
Amino Acid Sequences MSDQHPPTLVSAAMQTNRSTTVSESSAPPSARSTPGPSAGPSGEGAPAGGIQRMKFKPKVPIRRVKTEAETRTEPAPVVQPPGRGGMNGRGRGGGTRGRGRGGAVVSTSIAAGVFGGPRPAASSSRRFTAAAPAPRTTDYASDAEIYSDHSEEDGFPSMRPIDIDMVSTMSESAPTSIYRDRKLTQGKAKGEKNKKDVKRRAAKKDTGKHRDDGRNGVKDEPMSPRQRERDDDAMMSGDEEQDRDERGRRVRNFMQTGGIDEPEVEEVNAAQAVDLSESESEDEEEDLKGDFISVDGNDPPENKLFIFQFPHLFPKFNPAGPVDLTNPDGDVKPDIKPTAAQLRAKKNVVEPTPEGRVGTMVVMKSGKVKIVMGKDIVMDVNPGVPATFVQQLVHLDAKQKSAIVLGDVHKNYVVTPDIDRLLQDLYSNGGQTPGDREVEARMKALRMRGLVKMEDH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.24
3 0.23
4 0.26
5 0.26
6 0.23
7 0.2
8 0.21
9 0.22
10 0.24
11 0.25
12 0.26
13 0.31
14 0.3
15 0.3
16 0.29
17 0.3
18 0.31
19 0.32
20 0.35
21 0.34
22 0.38
23 0.38
24 0.36
25 0.36
26 0.33
27 0.31
28 0.25
29 0.21
30 0.17
31 0.15
32 0.14
33 0.09
34 0.1
35 0.1
36 0.12
37 0.12
38 0.12
39 0.22
40 0.26
41 0.33
42 0.36
43 0.4
44 0.48
45 0.57
46 0.67
47 0.68
48 0.75
49 0.75
50 0.81
51 0.81
52 0.77
53 0.74
54 0.73
55 0.68
56 0.65
57 0.61
58 0.53
59 0.5
60 0.45
61 0.36
62 0.28
63 0.28
64 0.22
65 0.25
66 0.25
67 0.25
68 0.25
69 0.29
70 0.27
71 0.23
72 0.24
73 0.26
74 0.32
75 0.33
76 0.32
77 0.3
78 0.3
79 0.31
80 0.32
81 0.27
82 0.25
83 0.3
84 0.31
85 0.31
86 0.31
87 0.31
88 0.31
89 0.27
90 0.22
91 0.16
92 0.15
93 0.14
94 0.13
95 0.12
96 0.08
97 0.07
98 0.05
99 0.05
100 0.04
101 0.05
102 0.05
103 0.06
104 0.06
105 0.06
106 0.08
107 0.1
108 0.13
109 0.17
110 0.25
111 0.26
112 0.29
113 0.31
114 0.3
115 0.29
116 0.35
117 0.38
118 0.38
119 0.4
120 0.38
121 0.38
122 0.39
123 0.39
124 0.31
125 0.24
126 0.2
127 0.17
128 0.17
129 0.16
130 0.15
131 0.14
132 0.12
133 0.13
134 0.11
135 0.1
136 0.09
137 0.08
138 0.08
139 0.08
140 0.1
141 0.12
142 0.11
143 0.11
144 0.12
145 0.13
146 0.13
147 0.12
148 0.12
149 0.11
150 0.1
151 0.11
152 0.1
153 0.11
154 0.1
155 0.1
156 0.09
157 0.06
158 0.06
159 0.05
160 0.06
161 0.06
162 0.06
163 0.09
164 0.15
165 0.18
166 0.2
167 0.24
168 0.24
169 0.31
170 0.38
171 0.42
172 0.45
173 0.5
174 0.54
175 0.59
176 0.64
177 0.66
178 0.69
179 0.69
180 0.69
181 0.7
182 0.72
183 0.75
184 0.77
185 0.77
186 0.78
187 0.8
188 0.83
189 0.82
190 0.82
191 0.8
192 0.81
193 0.81
194 0.79
195 0.73
196 0.67
197 0.66
198 0.65
199 0.58
200 0.58
201 0.54
202 0.51
203 0.49
204 0.46
205 0.38
206 0.32
207 0.31
208 0.28
209 0.28
210 0.27
211 0.28
212 0.33
213 0.37
214 0.39
215 0.4
216 0.39
217 0.38
218 0.35
219 0.33
220 0.28
221 0.23
222 0.2
223 0.17
224 0.12
225 0.07
226 0.06
227 0.06
228 0.06
229 0.06
230 0.07
231 0.08
232 0.12
233 0.15
234 0.21
235 0.3
236 0.31
237 0.38
238 0.43
239 0.5
240 0.49
241 0.46
242 0.43
243 0.35
244 0.36
245 0.29
246 0.23
247 0.15
248 0.12
249 0.12
250 0.09
251 0.08
252 0.06
253 0.04
254 0.04
255 0.05
256 0.05
257 0.04
258 0.03
259 0.03
260 0.04
261 0.04
262 0.04
263 0.05
264 0.04
265 0.05
266 0.05
267 0.05
268 0.06
269 0.06
270 0.06
271 0.06
272 0.06
273 0.06
274 0.06
275 0.06
276 0.05
277 0.05
278 0.05
279 0.04
280 0.05
281 0.05
282 0.06
283 0.07
284 0.08
285 0.09
286 0.1
287 0.12
288 0.12
289 0.13
290 0.11
291 0.14
292 0.14
293 0.16
294 0.18
295 0.18
296 0.21
297 0.21
298 0.28
299 0.27
300 0.27
301 0.24
302 0.29
303 0.3
304 0.27
305 0.28
306 0.22
307 0.24
308 0.23
309 0.26
310 0.2
311 0.19
312 0.19
313 0.16
314 0.16
315 0.14
316 0.13
317 0.12
318 0.13
319 0.13
320 0.14
321 0.17
322 0.17
323 0.17
324 0.17
325 0.21
326 0.27
327 0.32
328 0.35
329 0.4
330 0.48
331 0.54
332 0.56
333 0.53
334 0.49
335 0.51
336 0.48
337 0.47
338 0.41
339 0.4
340 0.42
341 0.41
342 0.35
343 0.27
344 0.25
345 0.19
346 0.17
347 0.15
348 0.11
349 0.12
350 0.13
351 0.13
352 0.16
353 0.17
354 0.17
355 0.15
356 0.17
357 0.21
358 0.25
359 0.28
360 0.25
361 0.25
362 0.23
363 0.23
364 0.22
365 0.16
366 0.12
367 0.09
368 0.09
369 0.08
370 0.08
371 0.07
372 0.07
373 0.07
374 0.09
375 0.12
376 0.11
377 0.12
378 0.14
379 0.15
380 0.19
381 0.21
382 0.19
383 0.22
384 0.23
385 0.26
386 0.24
387 0.23
388 0.2
389 0.2
390 0.19
391 0.15
392 0.18
393 0.18
394 0.26
395 0.26
396 0.27
397 0.25
398 0.25
399 0.23
400 0.22
401 0.21
402 0.15
403 0.17
404 0.2
405 0.21
406 0.21
407 0.21
408 0.19
409 0.18
410 0.17
411 0.15
412 0.11
413 0.13
414 0.14
415 0.15
416 0.13
417 0.14
418 0.13
419 0.14
420 0.19
421 0.19
422 0.19
423 0.18
424 0.19
425 0.25
426 0.31
427 0.31
428 0.29
429 0.27
430 0.3
431 0.33
432 0.38
433 0.36
434 0.34
435 0.36
436 0.39
437 0.42