Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q5KD78

Protein Details
Accession Q5KD78    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
254-283APKATANAASKKKKKRTRALKITNTHMKEQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
261-272AASKKKKKRTRA
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 12.333, cyto 7, cyto_mito 5.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040501  TFA2_Winged_2  
IPR016656  TFIIE-bsu  
IPR003166  TFIIE_bsu_DNA-bd  
Gene Ontology GO:0005673  C:transcription factor TFIIE complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
KEGG cne:CNH03590  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF18121  TFA2_Winged_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51351  TFIIE_BETA_C  
Amino Acid Sequences MLKRNTPAWAVPKSPSVKHELKDEPGEEPDTKRIKTGNVKPILTATHGMFKENRTAAYALLNQLKKSMTIGWEDAFFWIQDTSPGSDPTEALEIFKALERVEFNKINRVFTYIPELTLTTTNEIRNHIRIHSTPTSGIPIKTLREAMPNGIEPLKDLEARGDILIMRGLTGAWKDIPLPRLGRKNVNGQELMEGGSGRWKTVFWDHLREAGRAGKRVDDEFIYSWADVPIAETDDVAKLLADQELSASSAIPAAPKATANAASKKKKKRTRALKITNTHMKEQGIDFSKDYVKPA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.47
2 0.44
3 0.45
4 0.46
5 0.45
6 0.51
7 0.48
8 0.49
9 0.52
10 0.5
11 0.45
12 0.42
13 0.44
14 0.37
15 0.34
16 0.37
17 0.37
18 0.35
19 0.35
20 0.34
21 0.38
22 0.46
23 0.52
24 0.54
25 0.56
26 0.56
27 0.54
28 0.54
29 0.48
30 0.41
31 0.34
32 0.25
33 0.26
34 0.25
35 0.27
36 0.26
37 0.26
38 0.31
39 0.3
40 0.29
41 0.24
42 0.24
43 0.22
44 0.25
45 0.26
46 0.22
47 0.28
48 0.29
49 0.26
50 0.27
51 0.27
52 0.22
53 0.22
54 0.2
55 0.15
56 0.17
57 0.19
58 0.18
59 0.18
60 0.18
61 0.18
62 0.15
63 0.13
64 0.1
65 0.09
66 0.08
67 0.08
68 0.1
69 0.12
70 0.13
71 0.14
72 0.14
73 0.15
74 0.15
75 0.14
76 0.15
77 0.12
78 0.11
79 0.1
80 0.09
81 0.09
82 0.1
83 0.1
84 0.07
85 0.09
86 0.1
87 0.12
88 0.18
89 0.22
90 0.21
91 0.3
92 0.31
93 0.31
94 0.3
95 0.32
96 0.27
97 0.23
98 0.31
99 0.22
100 0.21
101 0.2
102 0.2
103 0.16
104 0.18
105 0.17
106 0.12
107 0.14
108 0.15
109 0.16
110 0.18
111 0.19
112 0.2
113 0.21
114 0.2
115 0.21
116 0.2
117 0.26
118 0.25
119 0.25
120 0.22
121 0.21
122 0.24
123 0.23
124 0.22
125 0.17
126 0.16
127 0.15
128 0.16
129 0.17
130 0.13
131 0.15
132 0.16
133 0.15
134 0.15
135 0.14
136 0.14
137 0.13
138 0.13
139 0.1
140 0.11
141 0.11
142 0.1
143 0.09
144 0.09
145 0.09
146 0.1
147 0.09
148 0.07
149 0.06
150 0.06
151 0.07
152 0.06
153 0.05
154 0.05
155 0.05
156 0.05
157 0.05
158 0.06
159 0.05
160 0.05
161 0.07
162 0.09
163 0.11
164 0.14
165 0.17
166 0.21
167 0.29
168 0.31
169 0.37
170 0.37
171 0.45
172 0.47
173 0.48
174 0.44
175 0.37
176 0.35
177 0.29
178 0.27
179 0.17
180 0.12
181 0.08
182 0.12
183 0.12
184 0.1
185 0.1
186 0.09
187 0.11
188 0.16
189 0.24
190 0.22
191 0.29
192 0.3
193 0.37
194 0.39
195 0.37
196 0.34
197 0.34
198 0.33
199 0.3
200 0.3
201 0.27
202 0.27
203 0.28
204 0.28
205 0.22
206 0.22
207 0.19
208 0.21
209 0.18
210 0.16
211 0.16
212 0.14
213 0.12
214 0.09
215 0.09
216 0.08
217 0.09
218 0.09
219 0.08
220 0.09
221 0.1
222 0.1
223 0.09
224 0.07
225 0.06
226 0.06
227 0.07
228 0.06
229 0.06
230 0.06
231 0.07
232 0.08
233 0.08
234 0.07
235 0.06
236 0.07
237 0.08
238 0.08
239 0.07
240 0.08
241 0.09
242 0.09
243 0.1
244 0.13
245 0.19
246 0.23
247 0.31
248 0.4
249 0.49
250 0.58
251 0.68
252 0.75
253 0.79
254 0.85
255 0.87
256 0.89
257 0.9
258 0.92
259 0.93
260 0.93
261 0.9
262 0.89
263 0.88
264 0.81
265 0.74
266 0.66
267 0.56
268 0.49
269 0.44
270 0.42
271 0.37
272 0.36
273 0.33
274 0.32
275 0.37