Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q5KBL3

Protein Details
Accession Q5KBL3    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
229-251AEWSRETKTSKKHEPKLRISYNGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
285-298VKIGGVRARKPRRL
Subcellular Location(s) mito 14, nucl 7, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001971  Ribosomal_S11  
IPR036967  Ribosomal_S11_sf  
Gene Ontology GO:0005763  C:mitochondrial small ribosomal subunit  
GO:0048027  F:mRNA 5'-UTR binding  
GO:0070181  F:small ribosomal subunit rRNA binding  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0000462  P:maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000028  P:ribosomal small subunit assembly  
GO:0006412  P:translation  
Amino Acid Sequences MSYIFRPALVISRASRTASLPWAGAAGMVANFASSSRVRLDTTPSSFSRVNTTSASTTTFVGEEMPEPLPSLEAEGEAERSVSAHQSPSTSNPNPDPIPNHQIPPQKASPIPQPSPLGSLSSPSSSLPRPSHIPQFTTSRQVARSPYAGLRWTPETIDFSYPISNSDLTPTHTLHIRSTRNNVLLTLTDGLGPLFGTVTGGTDRTFKNAQRSTYEAAAQAAIKMFERVAEWSRETKTSKKHEPKLRISYNGLFGSAREAVTTTLAGPQGSDIRRLIVRVEDRTKVKIGGVRARKPRRL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.31
3 0.27
4 0.28
5 0.29
6 0.28
7 0.23
8 0.21
9 0.2
10 0.18
11 0.16
12 0.12
13 0.08
14 0.06
15 0.06
16 0.06
17 0.05
18 0.05
19 0.05
20 0.08
21 0.08
22 0.1
23 0.13
24 0.15
25 0.17
26 0.19
27 0.26
28 0.3
29 0.34
30 0.37
31 0.35
32 0.39
33 0.38
34 0.38
35 0.38
36 0.33
37 0.31
38 0.27
39 0.3
40 0.26
41 0.25
42 0.27
43 0.21
44 0.2
45 0.17
46 0.16
47 0.13
48 0.12
49 0.11
50 0.09
51 0.11
52 0.11
53 0.1
54 0.11
55 0.11
56 0.1
57 0.1
58 0.11
59 0.08
60 0.07
61 0.09
62 0.08
63 0.09
64 0.09
65 0.09
66 0.07
67 0.07
68 0.07
69 0.08
70 0.08
71 0.1
72 0.1
73 0.12
74 0.13
75 0.18
76 0.25
77 0.26
78 0.28
79 0.28
80 0.32
81 0.31
82 0.32
83 0.32
84 0.3
85 0.35
86 0.34
87 0.34
88 0.35
89 0.41
90 0.4
91 0.42
92 0.38
93 0.34
94 0.33
95 0.35
96 0.37
97 0.37
98 0.37
99 0.35
100 0.35
101 0.32
102 0.34
103 0.31
104 0.25
105 0.17
106 0.18
107 0.15
108 0.13
109 0.13
110 0.11
111 0.13
112 0.12
113 0.18
114 0.17
115 0.18
116 0.22
117 0.24
118 0.33
119 0.32
120 0.33
121 0.3
122 0.35
123 0.34
124 0.35
125 0.33
126 0.27
127 0.27
128 0.27
129 0.27
130 0.22
131 0.22
132 0.18
133 0.18
134 0.18
135 0.17
136 0.15
137 0.15
138 0.15
139 0.15
140 0.13
141 0.13
142 0.14
143 0.14
144 0.15
145 0.14
146 0.13
147 0.13
148 0.13
149 0.13
150 0.12
151 0.11
152 0.09
153 0.11
154 0.11
155 0.13
156 0.15
157 0.15
158 0.14
159 0.17
160 0.18
161 0.18
162 0.25
163 0.27
164 0.27
165 0.32
166 0.36
167 0.35
168 0.35
169 0.32
170 0.26
171 0.22
172 0.21
173 0.17
174 0.12
175 0.1
176 0.09
177 0.09
178 0.07
179 0.07
180 0.05
181 0.04
182 0.03
183 0.03
184 0.03
185 0.05
186 0.05
187 0.06
188 0.06
189 0.1
190 0.1
191 0.14
192 0.18
193 0.19
194 0.29
195 0.33
196 0.35
197 0.36
198 0.4
199 0.39
200 0.38
201 0.37
202 0.28
203 0.24
204 0.22
205 0.18
206 0.15
207 0.12
208 0.1
209 0.09
210 0.09
211 0.08
212 0.08
213 0.09
214 0.11
215 0.14
216 0.17
217 0.19
218 0.23
219 0.25
220 0.29
221 0.32
222 0.35
223 0.41
224 0.47
225 0.56
226 0.62
227 0.69
228 0.74
229 0.81
230 0.84
231 0.86
232 0.83
233 0.78
234 0.73
235 0.68
236 0.65
237 0.55
238 0.46
239 0.36
240 0.29
241 0.28
242 0.24
243 0.19
244 0.13
245 0.13
246 0.12
247 0.13
248 0.14
249 0.1
250 0.11
251 0.12
252 0.12
253 0.11
254 0.13
255 0.19
256 0.19
257 0.22
258 0.19
259 0.22
260 0.23
261 0.24
262 0.24
263 0.25
264 0.3
265 0.35
266 0.4
267 0.44
268 0.46
269 0.49
270 0.5
271 0.43
272 0.41
273 0.37
274 0.4
275 0.43
276 0.49
277 0.54
278 0.63