Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q5KBN3

Protein Details
Accession Q5KBN3    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
313-335EALREARRRFPRHRLFPNYTKEEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
214-239AKPSKGGKGKTKATPGTGKGKGKTKG
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 13, cyto 4.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
IPR013087  Znf_C2H2_type  
Gene Ontology GO:0000981  F:DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0000978  F:RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG cne:CNI01980  -  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00028  ZINC_FINGER_C2H2_1  
PS50157  ZINC_FINGER_C2H2_2  
Amino Acid Sequences MASATSSLPPTSPPASTHTMEPSQPQSSPLKAPSIIVSPSKNPVMERVASQQLNSSPGPQWATENNPHPKAGGSYTGVSPAPSVDGHVDVDEEIDELLGDDDVQEGAEEKNGEPEKQKCQWGECQGDFDSKQEFYGHVKDHINASKEYACEWRTCSRVGHKQGRSLLLTHIRGHTGERPYSCTIPGCNKAFARTDALNKHKRTVHADVTNPNGAKPSKGGKGKTKATPGTGKGKGKTKGVAPVPSDIPTPTPAITSKPKSKSLPPPLILSPSPPIPPVSAPDEDLILDPELAELIPRLRSRWPIIPEGNDEIEALREARRRFPRHRLFPNYTKEEDVEEKGSRVGLEELVADPLDDPVARPLRRNGEDEIEYRERVREYLTDTSRPPDADLPMEELDYTLPPLVPEIAHTTEDPEDPEGEVVDVLGRSRWQVRYIMAKARLLLLEEENMLRRRYLQELAETR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.31
3 0.32
4 0.34
5 0.35
6 0.36
7 0.36
8 0.39
9 0.39
10 0.36
11 0.35
12 0.36
13 0.34
14 0.34
15 0.38
16 0.36
17 0.36
18 0.33
19 0.34
20 0.33
21 0.32
22 0.32
23 0.3
24 0.31
25 0.29
26 0.34
27 0.36
28 0.34
29 0.3
30 0.32
31 0.34
32 0.32
33 0.32
34 0.33
35 0.37
36 0.36
37 0.36
38 0.35
39 0.31
40 0.34
41 0.31
42 0.28
43 0.22
44 0.25
45 0.27
46 0.23
47 0.25
48 0.24
49 0.31
50 0.35
51 0.42
52 0.47
53 0.47
54 0.47
55 0.44
56 0.41
57 0.37
58 0.32
59 0.28
60 0.23
61 0.23
62 0.23
63 0.26
64 0.24
65 0.21
66 0.19
67 0.14
68 0.13
69 0.1
70 0.12
71 0.1
72 0.11
73 0.12
74 0.11
75 0.11
76 0.09
77 0.1
78 0.08
79 0.07
80 0.06
81 0.05
82 0.04
83 0.04
84 0.05
85 0.04
86 0.04
87 0.03
88 0.04
89 0.04
90 0.04
91 0.04
92 0.05
93 0.05
94 0.07
95 0.08
96 0.08
97 0.16
98 0.18
99 0.19
100 0.23
101 0.28
102 0.33
103 0.38
104 0.43
105 0.37
106 0.4
107 0.47
108 0.5
109 0.53
110 0.46
111 0.45
112 0.4
113 0.42
114 0.38
115 0.32
116 0.27
117 0.19
118 0.2
119 0.16
120 0.16
121 0.16
122 0.21
123 0.21
124 0.23
125 0.25
126 0.25
127 0.3
128 0.33
129 0.32
130 0.27
131 0.28
132 0.26
133 0.25
134 0.26
135 0.25
136 0.21
137 0.2
138 0.24
139 0.25
140 0.24
141 0.26
142 0.28
143 0.32
144 0.4
145 0.47
146 0.54
147 0.52
148 0.56
149 0.58
150 0.59
151 0.51
152 0.43
153 0.39
154 0.36
155 0.36
156 0.31
157 0.28
158 0.25
159 0.24
160 0.26
161 0.26
162 0.23
163 0.25
164 0.24
165 0.27
166 0.29
167 0.3
168 0.28
169 0.24
170 0.22
171 0.25
172 0.3
173 0.27
174 0.28
175 0.28
176 0.3
177 0.3
178 0.29
179 0.28
180 0.23
181 0.27
182 0.3
183 0.38
184 0.44
185 0.42
186 0.46
187 0.44
188 0.45
189 0.46
190 0.45
191 0.45
192 0.42
193 0.44
194 0.42
195 0.42
196 0.43
197 0.36
198 0.3
199 0.26
200 0.21
201 0.18
202 0.18
203 0.18
204 0.21
205 0.26
206 0.3
207 0.35
208 0.43
209 0.48
210 0.5
211 0.52
212 0.47
213 0.46
214 0.47
215 0.43
216 0.43
217 0.44
218 0.42
219 0.39
220 0.44
221 0.43
222 0.4
223 0.38
224 0.32
225 0.33
226 0.34
227 0.35
228 0.29
229 0.29
230 0.28
231 0.27
232 0.25
233 0.19
234 0.16
235 0.13
236 0.13
237 0.11
238 0.1
239 0.1
240 0.14
241 0.2
242 0.25
243 0.31
244 0.35
245 0.4
246 0.42
247 0.49
248 0.55
249 0.58
250 0.61
251 0.55
252 0.54
253 0.5
254 0.51
255 0.43
256 0.35
257 0.27
258 0.2
259 0.19
260 0.16
261 0.16
262 0.13
263 0.14
264 0.14
265 0.17
266 0.16
267 0.16
268 0.16
269 0.15
270 0.15
271 0.14
272 0.13
273 0.09
274 0.08
275 0.06
276 0.06
277 0.05
278 0.05
279 0.05
280 0.04
281 0.05
282 0.09
283 0.09
284 0.11
285 0.14
286 0.18
287 0.22
288 0.29
289 0.32
290 0.35
291 0.37
292 0.39
293 0.4
294 0.39
295 0.36
296 0.29
297 0.25
298 0.18
299 0.16
300 0.13
301 0.1
302 0.1
303 0.14
304 0.15
305 0.24
306 0.34
307 0.41
308 0.47
309 0.58
310 0.65
311 0.71
312 0.79
313 0.8
314 0.79
315 0.8
316 0.82
317 0.77
318 0.69
319 0.6
320 0.51
321 0.45
322 0.4
323 0.34
324 0.3
325 0.24
326 0.23
327 0.21
328 0.21
329 0.17
330 0.15
331 0.13
332 0.09
333 0.09
334 0.09
335 0.09
336 0.1
337 0.1
338 0.08
339 0.07
340 0.07
341 0.07
342 0.06
343 0.06
344 0.12
345 0.2
346 0.2
347 0.23
348 0.29
349 0.38
350 0.41
351 0.44
352 0.4
353 0.4
354 0.42
355 0.41
356 0.43
357 0.37
358 0.35
359 0.33
360 0.32
361 0.26
362 0.23
363 0.24
364 0.19
365 0.21
366 0.3
367 0.33
368 0.35
369 0.35
370 0.38
371 0.38
372 0.36
373 0.32
374 0.27
375 0.25
376 0.24
377 0.24
378 0.26
379 0.24
380 0.24
381 0.21
382 0.17
383 0.16
384 0.13
385 0.13
386 0.09
387 0.08
388 0.08
389 0.09
390 0.1
391 0.09
392 0.11
393 0.15
394 0.17
395 0.18
396 0.18
397 0.21
398 0.22
399 0.23
400 0.22
401 0.18
402 0.17
403 0.16
404 0.16
405 0.13
406 0.11
407 0.1
408 0.09
409 0.08
410 0.08
411 0.08
412 0.09
413 0.09
414 0.11
415 0.18
416 0.2
417 0.22
418 0.25
419 0.29
420 0.37
421 0.42
422 0.49
423 0.48
424 0.47
425 0.45
426 0.46
427 0.42
428 0.34
429 0.31
430 0.24
431 0.22
432 0.21
433 0.22
434 0.24
435 0.27
436 0.26
437 0.23
438 0.25
439 0.26
440 0.29
441 0.33
442 0.31