FuNGI

A0A0B2WLQ9

Protein Details

Accession

A0A0B2WLQ9

Localization Confidence

High

Confidence Score

20.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
4-38	AASPEAAKPKHDKKTHKERSSKSEKKRAREEDPAP	Basic
60-121	DHVPGPQDVKKEKKKREKKKKHGQKTAEATVEESEPVHEPKTEKKKKKKKHHKEGMEIPAQM	Basic
127-154	VSDDESKSKKKDRKKKKKHGHAADDVVD	Basic
427-448	TAQMRRDKKGGRGAQRQRAPDF	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
10-49	AKPKHDKKTHKERSSKSEKKRAREEDPAPGDGERKHKRSK
69-84	KKEKKKREKKKKHGQK
99-112	PKTEKKKKKKKHHK
133-146	KSKKKDRKKKKKHG
431-439	RRDKKGGRG

Subcellular Location(s)

nucl 17.5, cyto_nucl 13.333, mito_nucl 10.166, cyto 7

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR036898 RNA_pol_Rpb7-like_N_sf IPR041901 RNAP_I_Rpa43_N IPR041178 RPA43_OB IPR045113 Rpb7-like
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005730 C:nucleolus GO:0003677 F:DNA binding GO:0006352 P:DNA-templated transcription initiation
Pfam	View protein in Pfam PF17875 RPA43_OB
CDD	cd04328 RNAP_I_Rpa43_N

Amino Acid Sequences

MSAAASPEAAKPKHDKKTHKERSSKSEKKRAREEDPAPGDGERKHKRSKSVAADAIVQTDHVPGPQDVKKEKKKREKKKKHGQKTAEATVEESEPVHEPKTEKKKKKKKHHKEGMEIPAQMDVKAEVSDDESKSKKKDRKKKKKHGHAADDVVDTVTSDKPKSNGQLTTLDDAGADAMDIDKPSGSTSKSSKVYQPPDIPANPQFPFFEQTVSLYEPLYPNGWAQPITSCQYQHLQHLQNKYVPSLRGVLLNYKNVTLGSKPGRDGAATDDETPTTVVSQNEYAVGFGWITADVELFVPSRGAWMEGSVNLQTEGHIGVVCFGKFNASVEARRLPPAWKWVSNESPEAHGFEETASVMTADDHGVVRQIHSTGFWVDGSGDRVKGKIRFRIRNFDAGTSGETSYLSLEGTMLDKDSEKKLVKEEARTAQMRRDKKGGRGAQRQRAPDFSMTRFADVEGENDGQQADAGG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.61
2	0.67
3	0.69
4	0.8
5	0.87
6	0.88
7	0.88
8	0.86
9	0.88
10	0.9
11	0.89
12	0.88
13	0.88
14	0.86
15	0.85
16	0.88
17	0.86
18	0.82
19	0.82
20	0.77
21	0.77
22	0.74
23	0.66
24	0.57
25	0.49
26	0.45
27	0.39
28	0.44
29	0.42
30	0.43
31	0.51
32	0.55
33	0.62
34	0.67
35	0.73
36	0.73
37	0.74
38	0.72
39	0.64
40	0.65
41	0.57
42	0.49
43	0.39
44	0.3
45	0.2
46	0.17
47	0.15
48	0.1
49	0.12
50	0.11
51	0.18
52	0.21
53	0.27
54	0.32
55	0.42
56	0.53
57	0.6
58	0.7
59	0.75
60	0.83
61	0.88
62	0.92
63	0.94
64	0.94
65	0.96
66	0.97
67	0.96
68	0.96
69	0.93
70	0.92
71	0.89
72	0.85
73	0.78
74	0.67
75	0.57
76	0.47
77	0.4
78	0.3
79	0.21
80	0.14
81	0.13
82	0.14
83	0.14
84	0.15
85	0.16
86	0.25
87	0.37
88	0.46
89	0.54
90	0.64
91	0.74
92	0.82
93	0.92
94	0.94
95	0.94
96	0.95
97	0.96
98	0.95
99	0.94
100	0.93
101	0.9
102	0.84
103	0.73
104	0.62
105	0.55
106	0.45
107	0.34
108	0.25
109	0.16
110	0.11
111	0.11
112	0.11
113	0.07
114	0.1
115	0.14
116	0.15
117	0.19
118	0.21
119	0.24
120	0.29
121	0.38
122	0.41
123	0.48
124	0.58
125	0.65
126	0.74
127	0.82
128	0.89
129	0.91
130	0.95
131	0.96
132	0.96
133	0.93
134	0.9
135	0.83
136	0.75
137	0.64
138	0.53
139	0.42
140	0.31
141	0.22
142	0.15
143	0.12
144	0.1
145	0.1
146	0.11
147	0.13
148	0.16
149	0.2
150	0.23
151	0.23
152	0.25
153	0.29
154	0.3
155	0.31
156	0.28
157	0.23
158	0.19
159	0.17
160	0.14
161	0.08
162	0.05
163	0.03
164	0.03
165	0.04
166	0.04
167	0.04
168	0.04
169	0.04
170	0.05
171	0.07
172	0.08
173	0.11
174	0.14
175	0.21
176	0.24
177	0.26
178	0.31
179	0.38
180	0.42
181	0.45
182	0.46
183	0.42
184	0.44
185	0.43
186	0.4
187	0.35
188	0.35
189	0.29
190	0.26
191	0.24
192	0.2
193	0.22
194	0.19
195	0.16
196	0.12
197	0.12
198	0.13
199	0.14
200	0.13
201	0.1
202	0.11
203	0.1
204	0.11
205	0.1
206	0.09
207	0.08
208	0.09
209	0.09
210	0.08
211	0.08
212	0.09
213	0.11
214	0.13
215	0.14
216	0.13
217	0.14
218	0.19
219	0.19
220	0.22
221	0.26
222	0.29
223	0.32
224	0.36
225	0.36
226	0.35
227	0.34
228	0.32
229	0.28
230	0.22
231	0.2
232	0.18
233	0.17
234	0.16
235	0.16
236	0.21
237	0.2
238	0.23
239	0.22
240	0.2
241	0.2
242	0.17
243	0.17
244	0.11
245	0.15
246	0.16
247	0.18
248	0.18
249	0.19
250	0.2
251	0.19
252	0.19
253	0.17
254	0.18
255	0.17
256	0.17
257	0.16
258	0.16
259	0.16
260	0.16
261	0.12
262	0.07
263	0.08
264	0.08
265	0.09
266	0.09
267	0.09
268	0.1
269	0.1
270	0.09
271	0.07
272	0.08
273	0.06
274	0.05
275	0.05
276	0.04
277	0.05
278	0.05
279	0.04
280	0.04
281	0.05
282	0.05
283	0.05
284	0.05
285	0.05
286	0.05
287	0.06
288	0.06
289	0.06
290	0.06
291	0.07
292	0.08
293	0.08
294	0.1
295	0.1
296	0.1
297	0.09
298	0.09
299	0.08
300	0.08
301	0.07
302	0.06
303	0.06
304	0.05
305	0.07
306	0.09
307	0.09
308	0.08
309	0.08
310	0.09
311	0.09
312	0.1
313	0.14
314	0.15
315	0.16
316	0.2
317	0.24
318	0.24
319	0.26
320	0.26
321	0.23
322	0.24
323	0.32
324	0.34
325	0.33
326	0.36
327	0.4
328	0.45
329	0.45
330	0.46
331	0.38
332	0.36
333	0.33
334	0.31
335	0.25
336	0.19
337	0.16
338	0.13
339	0.13
340	0.09
341	0.08
342	0.07
343	0.06
344	0.06
345	0.06
346	0.06
347	0.06
348	0.07
349	0.07
350	0.07
351	0.09
352	0.1
353	0.1
354	0.11
355	0.12
356	0.11
357	0.11
358	0.13
359	0.11
360	0.12
361	0.11
362	0.1
363	0.1
364	0.12
365	0.15
366	0.15
367	0.16
368	0.15
369	0.16
370	0.21
371	0.27
372	0.31
373	0.37
374	0.45
375	0.54
376	0.59
377	0.69
378	0.68
379	0.71
380	0.68
381	0.61
382	0.53
383	0.44
384	0.4
385	0.32
386	0.28
387	0.19
388	0.16
389	0.14
390	0.13
391	0.11
392	0.09
393	0.06
394	0.06
395	0.06
396	0.08
397	0.08
398	0.08
399	0.08
400	0.1
401	0.13
402	0.16
403	0.24
404	0.25
405	0.27
406	0.31
407	0.4
408	0.44
409	0.48
410	0.53
411	0.53
412	0.57
413	0.59
414	0.56
415	0.56
416	0.59
417	0.58
418	0.56
419	0.58
420	0.55
421	0.6
422	0.68
423	0.68
424	0.7
425	0.75
426	0.8
427	0.8
428	0.82
429	0.81
430	0.75
431	0.7
432	0.65
433	0.62
434	0.57
435	0.5
436	0.53
437	0.47
438	0.45
439	0.4
440	0.36
441	0.32
442	0.27
443	0.25
444	0.2
445	0.2
446	0.18
447	0.18
448	0.17
449	0.13

A0A0B2WLQ9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer