Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P0CM98

Protein Details
Accession P0CM98    Localization Confidence High Confidence Score 17.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
180-213GESKEERKARKRAEKEERRKSKHRYHDSRSPPSDBasic
248-269RSESPKREKKEKDYSNRDRDYRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
163-203RKQLRAAKKAKETKGREGESKEERKARKRAEKEERRKSKHR
244-259RSRTRSESPKREKKEK
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019339  CIR_N_dom  
IPR022209  CWC25  
Gene Ontology GO:0005684  C:U2-type spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG cne:CND02200  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10197  Cir_N  
PF12542  CWC25  
Amino Acid Sequences MGGGDLNMKKSWHPVLLVNQERVWKAEKVANEEKKMLAQLRKEREEERQLEELHRLQEASTGKKRVEKLDWMYAAPSTEGGALGGARIGERDMEEYLLGKKRVDEVLGQGDKNIGAASREFIALQNANTARDTAAKIREDPLLAIKKQEQAALAALMNRPDIRKQLRAAKKAKETKGREGESKEERKARKRAEKEERRKSKHRYHDSRSPPSDYYDDRDHRRHRDSYDSQDRENRRTYRDRSDRSRTRSESPKREKKEKDYSNRDRDYRRRNDTTRGSFDESPRKGGGNRWGSHGPDGYRRSDHRDDGFRERQRGDRIPPPRHLSYNHSTPDVRPSSPPSSSAAPVNRNTSTLEDQRAARLAAMSASADELYSSRSKSLAARAEEERREQEKDEKMRQKYGKEQASANFFSQQSQLGLGEALQRRGGKGLLKDI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.39
3 0.49
4 0.54
5 0.52
6 0.5
7 0.51
8 0.49
9 0.46
10 0.4
11 0.32
12 0.29
13 0.3
14 0.32
15 0.36
16 0.46
17 0.51
18 0.51
19 0.51
20 0.49
21 0.47
22 0.48
23 0.46
24 0.42
25 0.43
26 0.48
27 0.55
28 0.6
29 0.61
30 0.59
31 0.61
32 0.65
33 0.61
34 0.57
35 0.54
36 0.5
37 0.49
38 0.5
39 0.45
40 0.37
41 0.34
42 0.27
43 0.21
44 0.25
45 0.27
46 0.3
47 0.33
48 0.35
49 0.36
50 0.42
51 0.46
52 0.47
53 0.49
54 0.5
55 0.49
56 0.55
57 0.55
58 0.49
59 0.46
60 0.4
61 0.35
62 0.26
63 0.2
64 0.11
65 0.09
66 0.08
67 0.07
68 0.07
69 0.06
70 0.05
71 0.06
72 0.05
73 0.05
74 0.05
75 0.05
76 0.06
77 0.06
78 0.08
79 0.08
80 0.09
81 0.09
82 0.1
83 0.15
84 0.2
85 0.2
86 0.19
87 0.19
88 0.22
89 0.24
90 0.24
91 0.21
92 0.19
93 0.28
94 0.31
95 0.29
96 0.26
97 0.25
98 0.23
99 0.22
100 0.18
101 0.08
102 0.06
103 0.07
104 0.08
105 0.08
106 0.09
107 0.09
108 0.09
109 0.13
110 0.13
111 0.13
112 0.18
113 0.17
114 0.18
115 0.18
116 0.18
117 0.15
118 0.16
119 0.18
120 0.16
121 0.22
122 0.22
123 0.23
124 0.25
125 0.26
126 0.24
127 0.23
128 0.26
129 0.26
130 0.25
131 0.26
132 0.26
133 0.29
134 0.29
135 0.3
136 0.23
137 0.18
138 0.19
139 0.17
140 0.15
141 0.13
142 0.12
143 0.12
144 0.12
145 0.11
146 0.11
147 0.12
148 0.18
149 0.2
150 0.24
151 0.28
152 0.38
153 0.45
154 0.53
155 0.58
156 0.59
157 0.65
158 0.69
159 0.72
160 0.71
161 0.68
162 0.69
163 0.72
164 0.67
165 0.62
166 0.56
167 0.56
168 0.55
169 0.55
170 0.5
171 0.48
172 0.51
173 0.54
174 0.6
175 0.62
176 0.63
177 0.65
178 0.71
179 0.75
180 0.81
181 0.84
182 0.86
183 0.88
184 0.85
185 0.86
186 0.84
187 0.83
188 0.82
189 0.83
190 0.81
191 0.78
192 0.8
193 0.81
194 0.81
195 0.75
196 0.68
197 0.58
198 0.51
199 0.47
200 0.38
201 0.33
202 0.32
203 0.33
204 0.33
205 0.4
206 0.43
207 0.46
208 0.5
209 0.49
210 0.44
211 0.49
212 0.49
213 0.51
214 0.57
215 0.53
216 0.49
217 0.52
218 0.53
219 0.47
220 0.5
221 0.43
222 0.39
223 0.45
224 0.48
225 0.51
226 0.58
227 0.61
228 0.61
229 0.69
230 0.71
231 0.7
232 0.74
233 0.67
234 0.64
235 0.68
236 0.69
237 0.69
238 0.72
239 0.75
240 0.74
241 0.79
242 0.79
243 0.78
244 0.8
245 0.78
246 0.78
247 0.79
248 0.83
249 0.83
250 0.82
251 0.78
252 0.75
253 0.75
254 0.74
255 0.73
256 0.71
257 0.7
258 0.67
259 0.72
260 0.73
261 0.71
262 0.67
263 0.62
264 0.59
265 0.53
266 0.55
267 0.56
268 0.48
269 0.44
270 0.39
271 0.35
272 0.31
273 0.32
274 0.37
275 0.36
276 0.36
277 0.37
278 0.39
279 0.39
280 0.4
281 0.39
282 0.31
283 0.3
284 0.33
285 0.3
286 0.32
287 0.33
288 0.39
289 0.41
290 0.43
291 0.41
292 0.46
293 0.48
294 0.53
295 0.6
296 0.57
297 0.58
298 0.55
299 0.55
300 0.55
301 0.55
302 0.51
303 0.5
304 0.55
305 0.56
306 0.61
307 0.62
308 0.59
309 0.57
310 0.55
311 0.54
312 0.51
313 0.53
314 0.48
315 0.44
316 0.41
317 0.39
318 0.45
319 0.41
320 0.35
321 0.3
322 0.34
323 0.36
324 0.37
325 0.37
326 0.31
327 0.31
328 0.31
329 0.34
330 0.34
331 0.34
332 0.36
333 0.4
334 0.37
335 0.35
336 0.35
337 0.33
338 0.34
339 0.33
340 0.33
341 0.31
342 0.31
343 0.33
344 0.33
345 0.28
346 0.23
347 0.19
348 0.15
349 0.12
350 0.12
351 0.1
352 0.08
353 0.09
354 0.08
355 0.07
356 0.07
357 0.07
358 0.1
359 0.12
360 0.13
361 0.12
362 0.13
363 0.15
364 0.18
365 0.26
366 0.3
367 0.31
368 0.35
369 0.41
370 0.49
371 0.51
372 0.52
373 0.52
374 0.48
375 0.48
376 0.46
377 0.48
378 0.5
379 0.55
380 0.61
381 0.63
382 0.64
383 0.71
384 0.73
385 0.72
386 0.72
387 0.73
388 0.71
389 0.65
390 0.65
391 0.61
392 0.63
393 0.59
394 0.51
395 0.47
396 0.38
397 0.37
398 0.33
399 0.3
400 0.23
401 0.22
402 0.2
403 0.14
404 0.14
405 0.13
406 0.2
407 0.21
408 0.22
409 0.24
410 0.25
411 0.25
412 0.27
413 0.29
414 0.27