Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0B2WJP9

Protein Details
Accession A0A0B2WJP9    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
55-74GSVKYVPRPRLRPRLRRGLAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
64-70RLRPRLR
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 11, cyto 8.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR014381  Arch_Rpo5/euc_Rpb5  
IPR005571  RNA_pol_Rpb5_N  
IPR036710  RNA_pol_Rpb5_N_sf  
IPR000783  RNA_pol_subH/Rpb5_C  
IPR035913  RPB5-like_sf  
Gene Ontology GO:0055029  C:nuclear DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003899  F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF01191  RNA_pol_Rpb5_C  
PF03871  RNA_pol_Rpb5_N  
Amino Acid Sequences MDDVPNDAKSKEVVRLWRAWRTVHEMVADREYELAEEEVNISLDRFRDEYCNPDGSVKYVPRPRLRPRLRRGLALLSHPRGHPLSGLFAAAKRPSYIQKLTARAPSSRAKLQFSARPSDAMLKKNTPPATESNPDPAPDCGPVWVEFLTDKQFGVGQIRQFAKYTISNNYKTGIMVTHVPLSPAARKSLASVENLAKIECFLEGDLLVNITHHELVPRHVLLSRDEKTALLKRYRLKETQLPRILQKDPVARYLGLKRGQVVKIIRVSETAGRYASYRLCV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.46
3 0.5
4 0.55
5 0.55
6 0.51
7 0.5
8 0.52
9 0.49
10 0.44
11 0.42
12 0.38
13 0.39
14 0.39
15 0.35
16 0.26
17 0.23
18 0.21
19 0.16
20 0.14
21 0.11
22 0.08
23 0.08
24 0.09
25 0.09
26 0.09
27 0.09
28 0.08
29 0.09
30 0.09
31 0.11
32 0.12
33 0.12
34 0.17
35 0.18
36 0.22
37 0.25
38 0.27
39 0.26
40 0.28
41 0.27
42 0.25
43 0.3
44 0.28
45 0.32
46 0.35
47 0.43
48 0.47
49 0.56
50 0.62
51 0.67
52 0.74
53 0.77
54 0.79
55 0.83
56 0.77
57 0.74
58 0.68
59 0.65
60 0.57
61 0.55
62 0.54
63 0.46
64 0.46
65 0.41
66 0.4
67 0.33
68 0.31
69 0.24
70 0.17
71 0.17
72 0.15
73 0.16
74 0.13
75 0.13
76 0.15
77 0.15
78 0.14
79 0.12
80 0.13
81 0.16
82 0.22
83 0.23
84 0.28
85 0.33
86 0.36
87 0.39
88 0.43
89 0.41
90 0.36
91 0.39
92 0.37
93 0.35
94 0.37
95 0.36
96 0.34
97 0.35
98 0.38
99 0.38
100 0.35
101 0.37
102 0.31
103 0.29
104 0.27
105 0.32
106 0.31
107 0.3
108 0.31
109 0.28
110 0.3
111 0.35
112 0.36
113 0.28
114 0.27
115 0.27
116 0.3
117 0.29
118 0.28
119 0.27
120 0.27
121 0.26
122 0.25
123 0.21
124 0.16
125 0.15
126 0.14
127 0.09
128 0.1
129 0.1
130 0.1
131 0.09
132 0.09
133 0.08
134 0.09
135 0.11
136 0.1
137 0.09
138 0.08
139 0.09
140 0.09
141 0.13
142 0.14
143 0.12
144 0.17
145 0.19
146 0.2
147 0.19
148 0.2
149 0.19
150 0.19
151 0.21
152 0.24
153 0.28
154 0.29
155 0.3
156 0.3
157 0.28
158 0.25
159 0.23
160 0.15
161 0.11
162 0.11
163 0.11
164 0.13
165 0.13
166 0.13
167 0.13
168 0.14
169 0.17
170 0.17
171 0.17
172 0.15
173 0.15
174 0.17
175 0.22
176 0.22
177 0.19
178 0.22
179 0.22
180 0.25
181 0.25
182 0.23
183 0.17
184 0.15
185 0.14
186 0.1
187 0.09
188 0.05
189 0.05
190 0.06
191 0.06
192 0.06
193 0.07
194 0.06
195 0.06
196 0.06
197 0.07
198 0.07
199 0.06
200 0.09
201 0.09
202 0.12
203 0.17
204 0.17
205 0.16
206 0.18
207 0.2
208 0.21
209 0.29
210 0.29
211 0.27
212 0.27
213 0.26
214 0.3
215 0.36
216 0.39
217 0.36
218 0.4
219 0.45
220 0.52
221 0.58
222 0.56
223 0.56
224 0.58
225 0.6
226 0.66
227 0.66
228 0.61
229 0.59
230 0.61
231 0.57
232 0.53
233 0.51
234 0.48
235 0.43
236 0.44
237 0.42
238 0.38
239 0.41
240 0.42
241 0.43
242 0.4
243 0.39
244 0.38
245 0.43
246 0.43
247 0.45
248 0.42
249 0.41
250 0.43
251 0.43
252 0.39
253 0.33
254 0.35
255 0.34
256 0.33
257 0.29
258 0.23
259 0.22
260 0.23
261 0.25