Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

Q5KPN5

Protein Details
Accession Q5KPN5    Localization Confidence High Confidence Score 20.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
314-342ESESSSSRQAKRRPKKRSRSPPSQFSEPSHydrophilic
402-425EKEEREHKLRKEALKKQKLKGGKABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
42-57ERRKRLEEASKEARRR
288-302AREKRPISNPPSEKR
322-333QAKRRPKKRSRS
403-425KEEREHKLRKEALKKQKLKGGKA
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013256  Chromatin_SPT2  
KEGG cne:CNA02130  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08243  SPT2  
Amino Acid Sequences MSEYQALKARALEMQREKEEAMKMELAAKQEREKQLAREQEERRKRLEEASKEARRRELMRAHEELNRKTGGAGNRVSQAEYDPFAEDVKPIATANIPKPSARSGPSKISKTSLNKPASSSSTKASTSNKSGNSKNGGPSKGSSPPVTAVLGRKEKAARLFAQKAKKSAADSLFSVRSLVESREPAQVRVTPRAGPSQVPPTSMKTEMRGKANGGGRNAAVRSRLMMNGKEELRKLCPDRDVRDRRSIDEISRDLKAKRLLTDESSPQKNSRPLTASMSKLSIPSSKAREKRPISNPPSEKRRRYSLDDSTDSESESSSSRQAKRRPKKRSRSPPSQFSEPSAAFISAEIQALFRRPGRSGPKYADDFSDASSDDMEAGLSDVEIEERRAAKIARLEDEAAEKEEREHKLRKEALKKQKLKGGKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.44
2 0.45
3 0.46
4 0.45
5 0.45
6 0.46
7 0.4
8 0.35
9 0.29
10 0.27
11 0.3
12 0.31
13 0.31
14 0.31
15 0.32
16 0.33
17 0.4
18 0.44
19 0.46
20 0.47
21 0.49
22 0.53
23 0.59
24 0.58
25 0.59
26 0.63
27 0.67
28 0.74
29 0.71
30 0.68
31 0.63
32 0.59
33 0.6
34 0.61
35 0.58
36 0.57
37 0.63
38 0.68
39 0.69
40 0.7
41 0.67
42 0.63
43 0.59
44 0.58
45 0.55
46 0.55
47 0.56
48 0.57
49 0.54
50 0.55
51 0.58
52 0.52
53 0.48
54 0.4
55 0.33
56 0.3
57 0.32
58 0.31
59 0.3
60 0.3
61 0.28
62 0.33
63 0.33
64 0.33
65 0.28
66 0.25
67 0.22
68 0.21
69 0.19
70 0.15
71 0.15
72 0.15
73 0.15
74 0.13
75 0.11
76 0.1
77 0.1
78 0.09
79 0.09
80 0.11
81 0.16
82 0.2
83 0.26
84 0.27
85 0.26
86 0.29
87 0.32
88 0.33
89 0.32
90 0.35
91 0.32
92 0.41
93 0.48
94 0.5
95 0.48
96 0.46
97 0.5
98 0.5
99 0.54
100 0.54
101 0.51
102 0.48
103 0.49
104 0.5
105 0.48
106 0.46
107 0.39
108 0.32
109 0.31
110 0.31
111 0.32
112 0.33
113 0.32
114 0.34
115 0.39
116 0.42
117 0.43
118 0.45
119 0.47
120 0.48
121 0.46
122 0.46
123 0.46
124 0.42
125 0.38
126 0.37
127 0.36
128 0.36
129 0.36
130 0.3
131 0.25
132 0.25
133 0.25
134 0.24
135 0.21
136 0.18
137 0.23
138 0.27
139 0.25
140 0.27
141 0.27
142 0.29
143 0.31
144 0.32
145 0.29
146 0.32
147 0.39
148 0.42
149 0.5
150 0.5
151 0.48
152 0.47
153 0.45
154 0.39
155 0.38
156 0.35
157 0.27
158 0.26
159 0.27
160 0.26
161 0.23
162 0.22
163 0.15
164 0.13
165 0.12
166 0.12
167 0.11
168 0.12
169 0.14
170 0.21
171 0.21
172 0.21
173 0.22
174 0.24
175 0.25
176 0.28
177 0.28
178 0.23
179 0.24
180 0.27
181 0.26
182 0.23
183 0.22
184 0.26
185 0.25
186 0.26
187 0.26
188 0.26
189 0.27
190 0.29
191 0.27
192 0.22
193 0.29
194 0.3
195 0.31
196 0.29
197 0.27
198 0.3
199 0.34
200 0.33
201 0.27
202 0.24
203 0.21
204 0.22
205 0.22
206 0.16
207 0.13
208 0.1
209 0.1
210 0.11
211 0.13
212 0.14
213 0.15
214 0.16
215 0.2
216 0.22
217 0.23
218 0.22
219 0.21
220 0.22
221 0.25
222 0.26
223 0.24
224 0.29
225 0.32
226 0.36
227 0.45
228 0.51
229 0.51
230 0.58
231 0.56
232 0.52
233 0.53
234 0.5
235 0.41
236 0.38
237 0.35
238 0.28
239 0.29
240 0.28
241 0.23
242 0.26
243 0.29
244 0.25
245 0.25
246 0.26
247 0.27
248 0.28
249 0.32
250 0.34
251 0.35
252 0.37
253 0.36
254 0.34
255 0.37
256 0.38
257 0.36
258 0.34
259 0.32
260 0.31
261 0.36
262 0.39
263 0.37
264 0.33
265 0.33
266 0.29
267 0.25
268 0.25
269 0.21
270 0.18
271 0.21
272 0.27
273 0.33
274 0.39
275 0.45
276 0.53
277 0.55
278 0.62
279 0.66
280 0.7
281 0.68
282 0.72
283 0.74
284 0.72
285 0.78
286 0.78
287 0.75
288 0.7
289 0.72
290 0.68
291 0.68
292 0.69
293 0.67
294 0.66
295 0.63
296 0.61
297 0.56
298 0.5
299 0.43
300 0.34
301 0.25
302 0.17
303 0.15
304 0.13
305 0.15
306 0.22
307 0.28
308 0.36
309 0.44
310 0.55
311 0.64
312 0.73
313 0.79
314 0.83
315 0.88
316 0.92
317 0.94
318 0.93
319 0.93
320 0.92
321 0.91
322 0.87
323 0.84
324 0.74
325 0.67
326 0.64
327 0.53
328 0.47
329 0.38
330 0.31
331 0.22
332 0.21
333 0.18
334 0.12
335 0.13
336 0.1
337 0.09
338 0.1
339 0.12
340 0.15
341 0.17
342 0.18
343 0.19
344 0.27
345 0.36
346 0.42
347 0.47
348 0.5
349 0.54
350 0.56
351 0.57
352 0.51
353 0.45
354 0.39
355 0.34
356 0.3
357 0.23
358 0.19
359 0.17
360 0.15
361 0.11
362 0.1
363 0.08
364 0.06
365 0.06
366 0.05
367 0.04
368 0.04
369 0.04
370 0.06
371 0.07
372 0.09
373 0.12
374 0.13
375 0.14
376 0.18
377 0.18
378 0.21
379 0.27
380 0.31
381 0.31
382 0.33
383 0.34
384 0.32
385 0.36
386 0.34
387 0.3
388 0.27
389 0.23
390 0.24
391 0.3
392 0.33
393 0.35
394 0.41
395 0.43
396 0.52
397 0.6
398 0.66
399 0.69
400 0.75
401 0.79
402 0.82
403 0.86
404 0.83
405 0.84