FuNGI

Q5KNL5

Protein Details

Accession

Q5KNL5

Localization Confidence

High

Confidence Score

15.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
177-198	VVPPPPKKKSHARKQPEGHIKR	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
180-200	PPPKKKSHARKQPEGHIKRAR
330-339	GSRRRRRETG

Subcellular Location(s)

nucl 22.5, cyto_nucl 13, cyto 2.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR009071 HMG_box_dom IPR036910 HMG_box_dom_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0000981 F:DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific GO:0000978 F:RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding GO:0006357 P:regulation of transcription by RNA polymerase II
KEGG	cne:CNA06070 -
Pfam	View protein in Pfam PF00505 HMG_box
PROSITE	View protein in PROSITE PS50118 HMG_BOX_2
CDD	cd01389 HMG-box_ROX1-like

Amino Acid Sequences

MIQLQAQEKSISTSPEKTDQILLHNYAETLSAEDSIDPLLKHLTDPFNVEQADSPQSRTQDAVQGSAETANDFSWLPDFTNTASQANTVAAHLWPLNTTLPSLPSTQPPSSEAESPASSFTGGPHAGVEWPNNFDNRNIESIHSTGASDHDGIAGVVGISSTSSESELEAGGGKDDVVPPPPKKKSHARKQPEGHIKRARNAFILFRKHITDSNLIPPSVEVKHQNISVVAAKMWKEAPLEVRQKFQEQARIEKEEHQRKYPGYRYQPVFRRTDIIRRRVRKDPAEDEKVDAVAEALIKGKAGNELEKEIKEQLVTRSEASESDGESSRGSRRRRRETGQLSKGAIRAQRAQARAKQMRQNLLGSNLLSMSLYNAANARLASSAAATAAAENDYRYHSGIDAMGTTVGHGHTHPGMQYALDSYIQLGYGLDNRPVQVAGYSGEMYGAPSTASGHGSDIYRLPPINGMMAVENGYEWHAPSMEYWDQTNVDPEAAQRQAGYPFEGEYYATHYDLEGGVPEQTEYHLSSLMETSHVGNGSLPERAPGDIIAGAYVTHEKQEDKELPSMRQWAGEGQQTPSGHVMFNERLFDGALGSAGLPDKAEEPDALAMFDQAMEQAGEIAPW

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.34
2	0.4
3	0.42
4	0.39
5	0.42
6	0.39
7	0.41
8	0.41
9	0.39
10	0.33
11	0.32
12	0.3
13	0.24
14	0.24
15	0.18
16	0.14
17	0.12
18	0.11
19	0.11
20	0.11
21	0.11
22	0.11
23	0.13
24	0.11
25	0.11
26	0.13
27	0.13
28	0.14
29	0.19
30	0.22
31	0.22
32	0.28
33	0.29
34	0.31
35	0.31
36	0.31
37	0.27
38	0.26
39	0.31
40	0.26
41	0.29
42	0.27
43	0.29
44	0.29
45	0.29
46	0.28
47	0.28
48	0.28
49	0.27
50	0.24
51	0.23
52	0.23
53	0.22
54	0.2
55	0.13
56	0.13
57	0.1
58	0.1
59	0.09
60	0.09
61	0.1
62	0.1
63	0.11
64	0.11
65	0.13
66	0.13
67	0.19
68	0.2
69	0.2
70	0.19
71	0.18
72	0.18
73	0.18
74	0.17
75	0.11
76	0.1
77	0.09
78	0.11
79	0.11
80	0.11
81	0.1
82	0.12
83	0.13
84	0.12
85	0.14
86	0.13
87	0.15
88	0.16
89	0.19
90	0.19
91	0.23
92	0.29
93	0.29
94	0.29
95	0.29
96	0.32
97	0.32
98	0.33
99	0.29
100	0.26
101	0.26
102	0.25
103	0.24
104	0.19
105	0.17
106	0.14
107	0.13
108	0.14
109	0.14
110	0.13
111	0.12
112	0.12
113	0.14
114	0.16
115	0.18
116	0.14
117	0.18
118	0.19
119	0.2
120	0.2
121	0.2
122	0.23
123	0.23
124	0.24
125	0.21
126	0.21
127	0.22
128	0.22
129	0.21
130	0.17
131	0.14
132	0.12
133	0.13
134	0.13
135	0.11
136	0.1
137	0.09
138	0.09
139	0.08
140	0.08
141	0.06
142	0.04
143	0.04
144	0.03
145	0.03
146	0.03
147	0.03
148	0.04
149	0.04
150	0.05
151	0.05
152	0.06
153	0.07
154	0.07
155	0.07
156	0.07
157	0.07
158	0.07
159	0.06
160	0.06
161	0.06
162	0.08
163	0.08
164	0.12
165	0.17
166	0.21
167	0.3
168	0.36
169	0.39
170	0.44
171	0.54
172	0.61
173	0.66
174	0.74
175	0.74
176	0.78
177	0.81
178	0.85
179	0.86
180	0.79
181	0.77
182	0.76
183	0.7
184	0.67
185	0.66
186	0.57
187	0.49
188	0.47
189	0.45
190	0.43
191	0.46
192	0.41
193	0.38
194	0.38
195	0.36
196	0.37
197	0.33
198	0.3
199	0.26
200	0.32
201	0.32
202	0.3
203	0.28
204	0.25
205	0.25
206	0.22
207	0.21
208	0.16
209	0.17
210	0.2
211	0.2
212	0.21
213	0.17
214	0.19
215	0.19
216	0.16
217	0.14
218	0.14
219	0.14
220	0.15
221	0.15
222	0.14
223	0.12
224	0.13
225	0.16
226	0.22
227	0.3
228	0.3
229	0.33
230	0.33
231	0.34
232	0.36
233	0.34
234	0.34
235	0.28
236	0.35
237	0.36
238	0.38
239	0.37
240	0.43
241	0.5
242	0.51
243	0.51
244	0.47
245	0.46
246	0.44
247	0.51
248	0.49
249	0.48
250	0.46
251	0.51
252	0.52
253	0.56
254	0.62
255	0.6
256	0.55
257	0.47
258	0.45
259	0.39
260	0.45
261	0.44
262	0.46
263	0.5
264	0.54
265	0.59
266	0.62
267	0.67
268	0.63
269	0.63
270	0.62
271	0.62
272	0.61
273	0.57
274	0.51
275	0.44
276	0.38
277	0.3
278	0.21
279	0.13
280	0.07
281	0.06
282	0.05
283	0.05
284	0.05
285	0.05
286	0.05
287	0.05
288	0.07
289	0.08
290	0.09
291	0.09
292	0.12
293	0.14
294	0.15
295	0.16
296	0.14
297	0.13
298	0.12
299	0.13
300	0.12
301	0.14
302	0.15
303	0.14
304	0.14
305	0.14
306	0.14
307	0.15
308	0.13
309	0.09
310	0.11
311	0.11
312	0.11
313	0.1
314	0.12
315	0.15
316	0.21
317	0.27
318	0.32
319	0.41
320	0.51
321	0.57
322	0.61
323	0.66
324	0.7
325	0.75
326	0.74
327	0.69
328	0.61
329	0.56
330	0.52
331	0.44
332	0.36
333	0.27
334	0.25
335	0.26
336	0.29
337	0.31
338	0.34
339	0.35
340	0.43
341	0.47
342	0.48
343	0.49
344	0.48
345	0.51
346	0.49
347	0.47
348	0.39
349	0.35
350	0.31
351	0.25
352	0.21
353	0.15
354	0.12
355	0.09
356	0.08
357	0.06
358	0.07
359	0.07
360	0.07
361	0.08
362	0.08
363	0.09
364	0.09
365	0.09
366	0.06
367	0.07
368	0.06
369	0.06
370	0.06
371	0.05
372	0.05
373	0.04
374	0.04
375	0.04
376	0.05
377	0.05
378	0.05
379	0.06
380	0.07
381	0.08
382	0.09
383	0.09
384	0.08
385	0.09
386	0.1
387	0.09
388	0.08
389	0.07
390	0.07
391	0.06
392	0.06
393	0.06
394	0.06
395	0.06
396	0.05
397	0.07
398	0.07
399	0.09
400	0.09
401	0.09
402	0.09
403	0.09
404	0.09
405	0.09
406	0.09
407	0.09
408	0.08
409	0.07
410	0.07
411	0.07
412	0.07
413	0.06
414	0.05
415	0.09
416	0.1
417	0.12
418	0.12
419	0.13
420	0.13
421	0.13
422	0.13
423	0.09
424	0.09
425	0.07
426	0.09
427	0.09
428	0.08
429	0.08
430	0.08
431	0.08
432	0.08
433	0.07
434	0.05
435	0.05
436	0.06
437	0.07
438	0.08
439	0.08
440	0.08
441	0.1
442	0.11
443	0.12
444	0.12
445	0.12
446	0.14
447	0.13
448	0.13
449	0.13
450	0.13
451	0.13
452	0.12
453	0.12
454	0.1
455	0.11
456	0.11
457	0.08
458	0.08
459	0.07
460	0.08
461	0.07
462	0.07
463	0.07
464	0.07
465	0.07
466	0.08
467	0.14
468	0.15
469	0.16
470	0.17
471	0.18
472	0.19
473	0.2
474	0.22
475	0.16
476	0.14
477	0.13
478	0.13
479	0.17
480	0.16
481	0.16
482	0.13
483	0.14
484	0.17
485	0.18
486	0.19
487	0.14
488	0.14
489	0.14
490	0.14
491	0.13
492	0.1
493	0.15
494	0.15
495	0.14
496	0.14
497	0.13
498	0.13
499	0.13
500	0.13
501	0.09
502	0.08
503	0.08
504	0.08
505	0.08
506	0.07
507	0.08
508	0.1
509	0.1
510	0.11
511	0.12
512	0.12
513	0.13
514	0.14
515	0.13
516	0.12
517	0.12
518	0.12
519	0.13
520	0.13
521	0.12
522	0.12
523	0.14
524	0.15
525	0.16
526	0.14
527	0.13
528	0.14
529	0.14
530	0.14
531	0.12
532	0.12
533	0.11
534	0.11
535	0.1
536	0.09
537	0.08
538	0.09
539	0.11
540	0.09
541	0.1
542	0.12
543	0.13
544	0.14
545	0.23
546	0.28
547	0.3
548	0.37
549	0.38
550	0.4
551	0.44
552	0.48
553	0.4
554	0.36
555	0.33
556	0.3
557	0.3
558	0.34
559	0.31
560	0.28
561	0.33
562	0.31
563	0.32
564	0.3
565	0.27
566	0.22
567	0.21
568	0.24
569	0.23
570	0.26
571	0.26
572	0.23
573	0.23
574	0.23
575	0.22
576	0.17
577	0.12
578	0.1
579	0.07
580	0.07
581	0.08
582	0.08
583	0.08
584	0.07
585	0.08
586	0.1
587	0.11
588	0.13
589	0.11
590	0.13
591	0.17
592	0.17
593	0.17
594	0.15
595	0.14
596	0.13
597	0.13
598	0.1
599	0.06
600	0.07
601	0.06
602	0.06
603	0.07

Q5KNL5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer