FuNGI

P0CQ84

Protein Details

Accession

P0CQ84

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
64-86	MSSTKPPTTTNKRKRTSNAHDEA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 13, mito 9, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR044773 DDX18/Has1_DEADc IPR011545 DEAD/DEAH_box_helicase_dom IPR025313 DUF4217 IPR014001 Helicase_ATP-bd IPR001650 Helicase_C IPR027417 P-loop_NTPase IPR000629 RNA-helicase_DEAD-box_CS IPR014014 RNA_helicase_DEAD_Q_motif
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus GO:0005524 F:ATP binding GO:0016887 F:ATP hydrolysis activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0003724 F:RNA helicase activity GO:0000463 P:maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)
KEGG	cne:CNB01060 -
Pfam	View protein in Pfam PF00270 DEAD PF13959 DUF4217 PF00271 Helicase_C
PROSITE	View protein in PROSITE PS00039 DEAD_ATP_HELICASE PS51192 HELICASE_ATP_BIND_1 PS51194 HELICASE_CTER PS51195 Q_MOTIF
CDD	cd17942 DEADc_DDX18 cd18787 SF2_C_DEAD

Amino Acid Sequences

MERRDRMRISTAQKFGWGSQAQTGRRFVLRIFMVILSLEKLRQGSLLCMTPSHGNAHSSAHRAMSSTKPPTTTNKRKRTSNAHDEAPAKRVPEASSSKVTLDDSQPAPATSSDAVLGARSAPGTDYERVPFSTLNLSPPTTAAIERMGFETMTEVQARTIPPLLAGKDVLGAARTGSGKTMAFLIPSVELLSTLRFKPVNGTGVIIISPTRELALQIFGVAKELMQGHSQTFGVLMGGANRKAEADKLVKGVNLIVATPGRLLDHLQNTKGFVFKNLKALVIDEADRILEIGFEEEMKQIIKLLPSENRQSMLFSATQTTKVTDLARISLRPGPLYINVDETKEASTADMLEQGYVVCESDQRFMLLFTFLKKNLKKKVIVFFSSCNSVKYHAELLNYIDVPVLDLHGKQKQQKRTNTFFEFINAPAGILLCTDVAARGLDIPKVDWIIQFDPPDDPRDYIHRVGRTARAGKSGKSLLFLLPSELGFLRFLKVAKVPLNEYQFPQKKVADVQKQLESLISKNHYLNTSARDGYRSYLQAYASYSLKKIFDVNKLDLAKVGKAFGFAVPPKVNISVGSVKAKKSRDEDESSDDDGQPKKAYYRNRGRK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.51
2	0.45
3	0.46
4	0.39
5	0.31
6	0.34
7	0.41
8	0.41
9	0.44
10	0.46
11	0.4
12	0.41
13	0.4
14	0.33
15	0.33
16	0.31
17	0.27
18	0.26
19	0.23
20	0.21
21	0.2
22	0.21
23	0.14
24	0.14
25	0.13
26	0.12
27	0.13
28	0.13
29	0.14
30	0.15
31	0.16
32	0.19
33	0.23
34	0.21
35	0.21
36	0.23
37	0.24
38	0.25
39	0.26
40	0.24
41	0.21
42	0.22
43	0.27
44	0.29
45	0.29
46	0.29
47	0.27
48	0.25
49	0.25
50	0.28
51	0.3
52	0.35
53	0.37
54	0.38
55	0.39
56	0.42
57	0.51
58	0.58
59	0.62
60	0.64
61	0.68
62	0.72
63	0.78
64	0.84
65	0.85
66	0.84
67	0.83
68	0.79
69	0.73
70	0.72
71	0.68
72	0.61
73	0.55
74	0.46
75	0.36
76	0.31
77	0.29
78	0.24
79	0.28
80	0.32
81	0.32
82	0.35
83	0.36
84	0.35
85	0.34
86	0.34
87	0.3
88	0.26
89	0.27
90	0.23
91	0.25
92	0.25
93	0.23
94	0.23
95	0.2
96	0.2
97	0.14
98	0.14
99	0.11
100	0.11
101	0.11
102	0.1
103	0.1
104	0.07
105	0.07
106	0.06
107	0.06
108	0.06
109	0.09
110	0.13
111	0.15
112	0.17
113	0.19
114	0.21
115	0.21
116	0.23
117	0.2
118	0.17
119	0.22
120	0.2
121	0.22
122	0.23
123	0.23
124	0.21
125	0.21
126	0.22
127	0.16
128	0.16
129	0.13
130	0.13
131	0.13
132	0.14
133	0.15
134	0.13
135	0.12
136	0.11
137	0.13
138	0.11
139	0.12
140	0.12
141	0.11
142	0.1
143	0.13
144	0.14
145	0.13
146	0.14
147	0.12
148	0.13
149	0.16
150	0.16
151	0.15
152	0.15
153	0.13
154	0.12
155	0.13
156	0.11
157	0.08
158	0.07
159	0.06
160	0.09
161	0.09
162	0.08
163	0.09
164	0.1
165	0.1
166	0.1
167	0.12
168	0.1
169	0.1
170	0.1
171	0.1
172	0.08
173	0.09
174	0.09
175	0.06
176	0.06
177	0.06
178	0.08
179	0.1
180	0.1
181	0.13
182	0.13
183	0.13
184	0.17
185	0.21
186	0.22
187	0.2
188	0.21
189	0.18
190	0.18
191	0.18
192	0.14
193	0.1
194	0.07
195	0.07
196	0.05
197	0.05
198	0.05
199	0.06
200	0.06
201	0.08
202	0.07
203	0.07
204	0.08
205	0.08
206	0.09
207	0.08
208	0.07
209	0.07
210	0.08
211	0.09
212	0.09
213	0.1
214	0.09
215	0.11
216	0.11
217	0.09
218	0.08
219	0.07
220	0.06
221	0.05
222	0.05
223	0.07
224	0.09
225	0.1
226	0.1
227	0.1
228	0.1
229	0.1
230	0.11
231	0.12
232	0.13
233	0.14
234	0.16
235	0.17
236	0.17
237	0.17
238	0.16
239	0.13
240	0.1
241	0.08
242	0.08
243	0.07
244	0.07
245	0.07
246	0.07
247	0.05
248	0.06
249	0.07
250	0.1
251	0.17
252	0.19
253	0.2
254	0.2
255	0.21
256	0.21
257	0.22
258	0.18
259	0.16
260	0.2
261	0.2
262	0.26
263	0.26
264	0.26
265	0.24
266	0.25
267	0.21
268	0.16
269	0.15
270	0.09
271	0.08
272	0.07
273	0.07
274	0.06
275	0.05
276	0.04
277	0.03
278	0.04
279	0.03
280	0.04
281	0.05
282	0.05
283	0.05
284	0.05
285	0.05
286	0.05
287	0.06
288	0.07
289	0.08
290	0.1
291	0.14
292	0.17
293	0.21
294	0.21
295	0.21
296	0.2
297	0.2
298	0.18
299	0.16
300	0.13
301	0.1
302	0.12
303	0.11
304	0.13
305	0.13
306	0.13
307	0.11
308	0.12
309	0.13
310	0.12
311	0.12
312	0.13
313	0.14
314	0.14
315	0.16
316	0.17
317	0.16
318	0.14
319	0.14
320	0.13
321	0.14
322	0.17
323	0.15
324	0.17
325	0.17
326	0.17
327	0.17
328	0.16
329	0.14
330	0.12
331	0.11
332	0.07
333	0.06
334	0.06
335	0.06
336	0.08
337	0.07
338	0.07
339	0.07
340	0.07
341	0.07
342	0.06
343	0.06
344	0.04
345	0.06
346	0.07
347	0.09
348	0.09
349	0.09
350	0.09
351	0.09
352	0.1
353	0.1
354	0.1
355	0.11
356	0.14
357	0.15
358	0.23
359	0.26
360	0.33
361	0.4
362	0.46
363	0.48
364	0.51
365	0.58
366	0.57
367	0.57
368	0.52
369	0.46
370	0.41
371	0.43
372	0.37
373	0.29
374	0.24
375	0.23
376	0.21
377	0.21
378	0.24
379	0.2
380	0.2
381	0.2
382	0.21
383	0.21
384	0.2
385	0.18
386	0.13
387	0.11
388	0.11
389	0.1
390	0.09
391	0.06
392	0.07
393	0.1
394	0.15
395	0.19
396	0.25
397	0.33
398	0.42
399	0.51
400	0.59
401	0.65
402	0.68
403	0.74
404	0.71
405	0.66
406	0.56
407	0.49
408	0.42
409	0.33
410	0.28
411	0.19
412	0.14
413	0.12
414	0.12
415	0.09
416	0.08
417	0.07
418	0.04
419	0.05
420	0.05
421	0.04
422	0.05
423	0.05
424	0.05
425	0.07
426	0.08
427	0.09
428	0.1
429	0.1
430	0.11
431	0.12
432	0.13
433	0.11
434	0.15
435	0.16
436	0.19
437	0.19
438	0.19
439	0.21
440	0.22
441	0.25
442	0.22
443	0.21
444	0.2
445	0.25
446	0.28
447	0.3
448	0.35
449	0.33
450	0.35
451	0.37
452	0.41
453	0.43
454	0.44
455	0.4
456	0.43
457	0.42
458	0.41
459	0.44
460	0.43
461	0.36
462	0.33
463	0.32
464	0.25
465	0.26
466	0.25
467	0.2
468	0.16
469	0.16
470	0.15
471	0.14
472	0.14
473	0.12
474	0.12
475	0.12
476	0.13
477	0.13
478	0.14
479	0.16
480	0.2
481	0.24
482	0.27
483	0.29
484	0.34
485	0.4
486	0.4
487	0.4
488	0.45
489	0.47
490	0.46
491	0.48
492	0.42
493	0.38
494	0.44
495	0.52
496	0.5
497	0.51
498	0.53
499	0.53
500	0.53
501	0.5
502	0.45
503	0.37
504	0.29
505	0.29
506	0.27
507	0.25
508	0.26
509	0.3
510	0.28
511	0.3
512	0.32
513	0.29
514	0.32
515	0.31
516	0.31
517	0.29
518	0.29
519	0.29
520	0.31
521	0.28
522	0.25
523	0.25
524	0.25
525	0.25
526	0.27
527	0.27
528	0.24
529	0.24
530	0.23
531	0.23
532	0.23
533	0.22
534	0.26
535	0.28
536	0.34
537	0.39
538	0.41
539	0.46
540	0.47
541	0.46
542	0.43
543	0.39
544	0.34
545	0.29
546	0.27
547	0.19
548	0.19
549	0.2
550	0.18
551	0.22
552	0.21
553	0.27
554	0.27
555	0.28
556	0.29
557	0.3
558	0.29
559	0.23
560	0.27
561	0.26
562	0.29
563	0.37
564	0.38
565	0.4
566	0.47
567	0.5
568	0.51
569	0.5
570	0.53
571	0.52
572	0.56
573	0.57
574	0.57
575	0.58
576	0.56
577	0.52
578	0.46
579	0.43
580	0.39
581	0.36
582	0.32
583	0.29
584	0.31
585	0.34
586	0.42
587	0.48

P0CQ84

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer