Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P0CQ60

Protein Details
Accession P0CQ60    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-32MEEHRKRHGRRLDYEEKKRKRTAREAHKASADBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
5-58RKRHGRRLDYEEKKRKRTAREAHKASADAQKIFGHKAKLHHARRHAEKVQMKKT
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 11.5, cyto 6.5, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039411  NSA2_fam  
IPR022309  Ribosomal_S8e/biogenesis_NSA2  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030687  C:preribosome, large subunit precursor  
GO:0000460  P:maturation of 5.8S rRNA  
GO:0000466  P:maturation of 5.8S rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000470  P:maturation of LSU-rRNA  
GO:0000463  P:maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
Pfam View protein in Pfam  
PF01201  Ribosomal_S8e  
CDD cd11381  NSA2  
Amino Acid Sequences MEEHRKRHGRRLDYEEKKRKRTAREAHKASADAQKIFGHKAKLHHARRHAEKVQMKKTLKAHDERNVKQKDDGAVKEGALPAYLLDRDGQKDAKALSSAVKDRRKDRAAKYSVPLPKVRGIAEEEMFKVIKTGKSKSKSWKRMVNKATFVGEGFTRKPVKLERFIRPMGLRMTKANVTHPELKTTFQLPILGVKKNPQSPLYTSLGVLTKGTILEVNVSELGMVTTGGKVVWSKYAQITNNPENDGCINSVLLV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.86
2 0.87
3 0.87
4 0.86
5 0.86
6 0.84
7 0.82
8 0.83
9 0.82
10 0.83
11 0.84
12 0.83
13 0.8
14 0.77
15 0.68
16 0.61
17 0.59
18 0.51
19 0.4
20 0.35
21 0.33
22 0.3
23 0.33
24 0.33
25 0.3
26 0.3
27 0.34
28 0.42
29 0.5
30 0.57
31 0.6
32 0.65
33 0.69
34 0.73
35 0.78
36 0.72
37 0.71
38 0.69
39 0.71
40 0.7
41 0.71
42 0.64
43 0.62
44 0.63
45 0.63
46 0.62
47 0.59
48 0.57
49 0.57
50 0.65
51 0.63
52 0.67
53 0.62
54 0.57
55 0.53
56 0.5
57 0.46
58 0.43
59 0.39
60 0.33
61 0.29
62 0.28
63 0.28
64 0.25
65 0.19
66 0.12
67 0.11
68 0.08
69 0.08
70 0.08
71 0.07
72 0.07
73 0.08
74 0.1
75 0.12
76 0.13
77 0.12
78 0.14
79 0.14
80 0.14
81 0.13
82 0.12
83 0.13
84 0.16
85 0.21
86 0.27
87 0.33
88 0.35
89 0.39
90 0.47
91 0.49
92 0.53
93 0.54
94 0.56
95 0.55
96 0.55
97 0.54
98 0.53
99 0.52
100 0.48
101 0.43
102 0.35
103 0.33
104 0.31
105 0.29
106 0.23
107 0.21
108 0.21
109 0.2
110 0.19
111 0.15
112 0.15
113 0.14
114 0.12
115 0.1
116 0.09
117 0.12
118 0.14
119 0.18
120 0.24
121 0.29
122 0.34
123 0.44
124 0.54
125 0.6
126 0.64
127 0.69
128 0.68
129 0.73
130 0.76
131 0.72
132 0.64
133 0.57
134 0.52
135 0.42
136 0.36
137 0.27
138 0.2
139 0.16
140 0.13
141 0.16
142 0.17
143 0.16
144 0.19
145 0.25
146 0.29
147 0.36
148 0.42
149 0.45
150 0.49
151 0.5
152 0.52
153 0.46
154 0.43
155 0.39
156 0.37
157 0.3
158 0.26
159 0.29
160 0.28
161 0.28
162 0.29
163 0.28
164 0.3
165 0.37
166 0.36
167 0.38
168 0.36
169 0.36
170 0.34
171 0.31
172 0.27
173 0.2
174 0.2
175 0.15
176 0.22
177 0.24
178 0.23
179 0.23
180 0.27
181 0.32
182 0.35
183 0.38
184 0.32
185 0.34
186 0.35
187 0.4
188 0.39
189 0.33
190 0.29
191 0.29
192 0.28
193 0.25
194 0.21
195 0.15
196 0.12
197 0.11
198 0.11
199 0.09
200 0.07
201 0.09
202 0.09
203 0.11
204 0.1
205 0.1
206 0.1
207 0.09
208 0.09
209 0.06
210 0.06
211 0.05
212 0.05
213 0.05
214 0.05
215 0.06
216 0.07
217 0.08
218 0.14
219 0.15
220 0.18
221 0.23
222 0.3
223 0.32
224 0.39
225 0.47
226 0.47
227 0.5
228 0.5
229 0.45
230 0.4
231 0.39
232 0.34
233 0.26
234 0.21