Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P0CM96

Protein Details
Accession P0CM96    Localization Confidence High Confidence Score 22.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
35-77PDDIPAYKRKRSPSPNPRDRPASPPTRRRRSQSPYRNSNRAEIHydrophilic
694-764DSDASSYSRRSRRRRYSSDSRSPPPRRRRYSSDSRSPSPPPRRRQYSDEPRSPSPPPRRRRYSDDSRSPSPHydrophilic
786-827ADDSRSPSPPPHRRRYSDDSRSPSPPPRRRRYSDNSRSPSPPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
41-65YKRKRSPSPNPRDRPASPPTRRRRS
702-831RRSRRRRYSSDSRSPPPRRRRYSSDSRSPSPPPRRRQYSDEPRSPSPPPRRRRYSDDSRSPSPPPRRRYSGDSRSPSPPPRRRYADDSRSPSPPPHRRRYSDDSRSPSPPPRRRRYSDNSRSPSPPPRRR
Subcellular Location(s) nucl 20, mito 2, plas 2, cyto 1, golg 1, vacu 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR003891  Initiation_fac_eIF4g_MI  
IPR003890  MIF4G-like_typ-3  
Gene Ontology GO:0071013  C:catalytic step 2 spliceosome  
GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG cne:CNF00260  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02847  MA3  
PF02854  MIF4G  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51366  MI  
Amino Acid Sequences MPRSLSRSVSPRPRSPSLSPPRPDSRSSRGRSLTPDDIPAYKRKRSPSPNPRDRPASPPTRRRRSQSPYRNSNRAEIDRPNVKDIDPNRRRARENALLEKQINMALADDGDADGTVATTKKSADEIARAEFAKLLGSRSGGAYIPPAKLRAMQAEAAKDKTSAEYQRISWDALKKSINGLINKVNISNIKHIVPELFGENLIRGRGLFARSVMRAQASSLPFTPVFAALVAIINTKLPQVGELVLIRLISQFRRAYKRNDKTVCHATSTFIAHLCNQYVAHEIVALQILLLCLDRPTDDSIEVAVGFMREVGQFLSENSPKANNTVFERFRAVLHEGQISKRCQYMIEVLFQVRKDKYKDNPAVPEGLDLVEEEEQITHRVTLDDELQVQESLNLFKADPNFVQNEERYNAIKREILGDSDDESGTESGSEYSESEDDEDEDVAPEKAGIQDMTETNLINLRRTIYLTIMNSLNFEEAVHKLMKVNIPEGREIELCNMVIECCSQERTYSNFYGLIGERFCKLHRIWTDAFQEAFQKYYDTIHRYETNKLRNIGRFFGHLLASDGISWAVLHVVHMNEEETTSSSRIFVKIVLQEMVEEMGINRVAERFRIPDLKPAFAGMFPMDNPKNARFSINYFTSIGMGKVTEDMREYLQNAPKLLAAQQAALAAAESSDSDTDSSSDISSSSDSDSDTDSDASSYSRRSRRRRYSSDSRSPPPRRRRYSSDSRSPSPPPRRRQYSDEPRSPSPPPRRRRYSDDSRSPSPPPRRRYSGDSRSPSPPPRRRYADDSRSPSPPPHRRRYSDDSRSPSPPPRRRRYSDNSRSPSPPPRRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.71
2 0.69
3 0.71
4 0.71
5 0.73
6 0.7
7 0.7
8 0.73
9 0.7
10 0.7
11 0.67
12 0.65
13 0.66
14 0.67
15 0.68
16 0.64
17 0.63
18 0.65
19 0.65
20 0.62
21 0.55
22 0.54
23 0.47
24 0.47
25 0.46
26 0.49
27 0.47
28 0.48
29 0.51
30 0.54
31 0.61
32 0.67
33 0.75
34 0.77
35 0.81
36 0.85
37 0.87
38 0.87
39 0.85
40 0.78
41 0.74
42 0.72
43 0.71
44 0.7
45 0.73
46 0.76
47 0.79
48 0.82
49 0.83
50 0.84
51 0.83
52 0.84
53 0.84
54 0.84
55 0.85
56 0.87
57 0.88
58 0.8
59 0.78
60 0.75
61 0.7
62 0.66
63 0.61
64 0.6
65 0.6
66 0.6
67 0.57
68 0.49
69 0.43
70 0.45
71 0.45
72 0.48
73 0.47
74 0.54
75 0.59
76 0.65
77 0.68
78 0.66
79 0.69
80 0.67
81 0.69
82 0.69
83 0.66
84 0.65
85 0.62
86 0.58
87 0.49
88 0.4
89 0.32
90 0.21
91 0.16
92 0.11
93 0.1
94 0.09
95 0.08
96 0.07
97 0.06
98 0.06
99 0.05
100 0.04
101 0.04
102 0.05
103 0.06
104 0.06
105 0.07
106 0.08
107 0.09
108 0.11
109 0.14
110 0.16
111 0.21
112 0.24
113 0.26
114 0.29
115 0.29
116 0.28
117 0.25
118 0.22
119 0.2
120 0.18
121 0.16
122 0.14
123 0.15
124 0.15
125 0.15
126 0.17
127 0.13
128 0.12
129 0.16
130 0.18
131 0.19
132 0.2
133 0.21
134 0.2
135 0.23
136 0.25
137 0.25
138 0.25
139 0.26
140 0.28
141 0.33
142 0.35
143 0.34
144 0.32
145 0.27
146 0.25
147 0.24
148 0.26
149 0.24
150 0.25
151 0.26
152 0.26
153 0.31
154 0.32
155 0.32
156 0.31
157 0.34
158 0.33
159 0.35
160 0.36
161 0.31
162 0.32
163 0.35
164 0.36
165 0.3
166 0.31
167 0.32
168 0.33
169 0.33
170 0.31
171 0.28
172 0.27
173 0.28
174 0.29
175 0.26
176 0.24
177 0.24
178 0.24
179 0.22
180 0.19
181 0.17
182 0.14
183 0.12
184 0.11
185 0.11
186 0.11
187 0.12
188 0.11
189 0.1
190 0.08
191 0.09
192 0.12
193 0.13
194 0.13
195 0.14
196 0.18
197 0.19
198 0.2
199 0.19
200 0.18
201 0.16
202 0.17
203 0.21
204 0.19
205 0.2
206 0.2
207 0.22
208 0.2
209 0.21
210 0.2
211 0.14
212 0.12
213 0.1
214 0.09
215 0.06
216 0.07
217 0.07
218 0.07
219 0.07
220 0.06
221 0.07
222 0.07
223 0.07
224 0.06
225 0.06
226 0.07
227 0.07
228 0.09
229 0.09
230 0.1
231 0.1
232 0.1
233 0.09
234 0.1
235 0.1
236 0.09
237 0.15
238 0.17
239 0.23
240 0.31
241 0.35
242 0.43
243 0.53
244 0.61
245 0.65
246 0.69
247 0.66
248 0.66
249 0.72
250 0.63
251 0.56
252 0.48
253 0.39
254 0.35
255 0.34
256 0.28
257 0.19
258 0.18
259 0.15
260 0.16
261 0.15
262 0.14
263 0.12
264 0.11
265 0.13
266 0.13
267 0.11
268 0.1
269 0.09
270 0.08
271 0.09
272 0.08
273 0.05
274 0.05
275 0.05
276 0.05
277 0.05
278 0.04
279 0.04
280 0.04
281 0.05
282 0.06
283 0.09
284 0.1
285 0.1
286 0.1
287 0.1
288 0.1
289 0.1
290 0.08
291 0.06
292 0.05
293 0.04
294 0.04
295 0.05
296 0.04
297 0.05
298 0.05
299 0.06
300 0.06
301 0.07
302 0.13
303 0.13
304 0.14
305 0.14
306 0.16
307 0.15
308 0.17
309 0.18
310 0.14
311 0.18
312 0.25
313 0.26
314 0.25
315 0.28
316 0.27
317 0.25
318 0.26
319 0.25
320 0.19
321 0.19
322 0.22
323 0.2
324 0.23
325 0.27
326 0.26
327 0.24
328 0.23
329 0.21
330 0.17
331 0.18
332 0.22
333 0.19
334 0.2
335 0.2
336 0.2
337 0.22
338 0.22
339 0.24
340 0.18
341 0.21
342 0.22
343 0.26
344 0.31
345 0.4
346 0.46
347 0.46
348 0.49
349 0.47
350 0.45
351 0.39
352 0.34
353 0.24
354 0.17
355 0.13
356 0.08
357 0.08
358 0.06
359 0.06
360 0.05
361 0.05
362 0.05
363 0.06
364 0.07
365 0.05
366 0.06
367 0.06
368 0.06
369 0.07
370 0.08
371 0.08
372 0.09
373 0.09
374 0.09
375 0.09
376 0.08
377 0.08
378 0.07
379 0.07
380 0.07
381 0.07
382 0.07
383 0.08
384 0.1
385 0.11
386 0.11
387 0.12
388 0.12
389 0.13
390 0.16
391 0.14
392 0.16
393 0.15
394 0.16
395 0.16
396 0.17
397 0.16
398 0.15
399 0.16
400 0.13
401 0.16
402 0.15
403 0.14
404 0.13
405 0.12
406 0.13
407 0.13
408 0.12
409 0.09
410 0.09
411 0.08
412 0.07
413 0.07
414 0.05
415 0.04
416 0.05
417 0.05
418 0.04
419 0.05
420 0.06
421 0.06
422 0.06
423 0.06
424 0.07
425 0.07
426 0.07
427 0.06
428 0.06
429 0.07
430 0.06
431 0.06
432 0.05
433 0.05
434 0.05
435 0.05
436 0.05
437 0.04
438 0.06
439 0.06
440 0.09
441 0.09
442 0.08
443 0.08
444 0.12
445 0.12
446 0.11
447 0.11
448 0.11
449 0.11
450 0.12
451 0.13
452 0.11
453 0.14
454 0.14
455 0.16
456 0.15
457 0.15
458 0.14
459 0.14
460 0.12
461 0.08
462 0.08
463 0.07
464 0.07
465 0.09
466 0.09
467 0.09
468 0.09
469 0.12
470 0.15
471 0.14
472 0.17
473 0.18
474 0.19
475 0.2
476 0.2
477 0.2
478 0.18
479 0.17
480 0.15
481 0.14
482 0.12
483 0.11
484 0.1
485 0.08
486 0.07
487 0.07
488 0.06
489 0.06
490 0.08
491 0.08
492 0.09
493 0.11
494 0.15
495 0.2
496 0.2
497 0.2
498 0.19
499 0.19
500 0.21
501 0.19
502 0.17
503 0.13
504 0.13
505 0.13
506 0.13
507 0.14
508 0.15
509 0.15
510 0.21
511 0.22
512 0.28
513 0.29
514 0.35
515 0.38
516 0.36
517 0.36
518 0.28
519 0.29
520 0.23
521 0.22
522 0.15
523 0.13
524 0.11
525 0.14
526 0.18
527 0.18
528 0.19
529 0.23
530 0.28
531 0.3
532 0.37
533 0.42
534 0.45
535 0.46
536 0.49
537 0.49
538 0.5
539 0.51
540 0.46
541 0.4
542 0.34
543 0.3
544 0.29
545 0.24
546 0.18
547 0.17
548 0.15
549 0.14
550 0.11
551 0.1
552 0.08
553 0.07
554 0.06
555 0.04
556 0.04
557 0.04
558 0.04
559 0.06
560 0.06
561 0.07
562 0.08
563 0.08
564 0.07
565 0.08
566 0.08
567 0.08
568 0.1
569 0.1
570 0.1
571 0.11
572 0.12
573 0.12
574 0.12
575 0.12
576 0.14
577 0.16
578 0.18
579 0.17
580 0.16
581 0.15
582 0.15
583 0.15
584 0.1
585 0.07
586 0.05
587 0.06
588 0.07
589 0.07
590 0.07
591 0.08
592 0.09
593 0.1
594 0.12
595 0.12
596 0.16
597 0.23
598 0.23
599 0.3
600 0.33
601 0.34
602 0.32
603 0.31
604 0.28
605 0.21
606 0.22
607 0.14
608 0.12
609 0.1
610 0.18
611 0.17
612 0.19
613 0.23
614 0.23
615 0.26
616 0.26
617 0.28
618 0.23
619 0.27
620 0.32
621 0.3
622 0.31
623 0.28
624 0.27
625 0.26
626 0.24
627 0.2
628 0.13
629 0.1
630 0.08
631 0.11
632 0.11
633 0.1
634 0.11
635 0.12
636 0.14
637 0.16
638 0.17
639 0.21
640 0.26
641 0.28
642 0.27
643 0.26
644 0.25
645 0.24
646 0.24
647 0.21
648 0.16
649 0.14
650 0.15
651 0.14
652 0.13
653 0.12
654 0.11
655 0.06
656 0.05
657 0.05
658 0.04
659 0.05
660 0.05
661 0.06
662 0.06
663 0.07
664 0.07
665 0.08
666 0.09
667 0.08
668 0.08
669 0.08
670 0.09
671 0.09
672 0.09
673 0.1
674 0.1
675 0.1
676 0.11
677 0.13
678 0.13
679 0.13
680 0.13
681 0.12
682 0.11
683 0.11
684 0.12
685 0.12
686 0.15
687 0.22
688 0.3
689 0.4
690 0.5
691 0.61
692 0.7
693 0.8
694 0.84
695 0.85
696 0.88
697 0.89
698 0.9
699 0.88
700 0.84
701 0.85
702 0.85
703 0.86
704 0.86
705 0.86
706 0.84
707 0.84
708 0.85
709 0.83
710 0.85
711 0.85
712 0.85
713 0.82
714 0.77
715 0.75
716 0.73
717 0.74
718 0.74
719 0.73
720 0.72
721 0.75
722 0.8
723 0.8
724 0.82
725 0.82
726 0.83
727 0.84
728 0.83
729 0.79
730 0.73
731 0.72
732 0.69
733 0.67
734 0.67
735 0.66
736 0.68
737 0.72
738 0.77
739 0.8
740 0.84
741 0.83
742 0.83
743 0.84
744 0.85
745 0.82
746 0.78
747 0.75
748 0.72
749 0.72
750 0.72
751 0.7
752 0.67
753 0.69
754 0.71
755 0.73
756 0.76
757 0.77
758 0.77
759 0.78
760 0.77
761 0.73
762 0.71
763 0.73
764 0.73
765 0.73
766 0.72
767 0.69
768 0.71
769 0.75
770 0.76
771 0.77
772 0.78
773 0.78
774 0.79
775 0.79
776 0.74
777 0.7
778 0.65
779 0.64
780 0.64
781 0.64
782 0.64
783 0.67
784 0.72
785 0.75
786 0.81
787 0.83
788 0.83
789 0.83
790 0.83
791 0.8
792 0.76
793 0.74
794 0.7
795 0.71
796 0.71
797 0.69
798 0.7
799 0.73
800 0.78
801 0.8
802 0.85
803 0.85
804 0.86
805 0.87
806 0.88
807 0.84
808 0.81
809 0.79
810 0.76
811 0.76