Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A075B2G1

Protein Details
Accession A0A075B2G1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
233-259LMKRATRQPKETMKRKKKNIEFNALGEHydrophilic
271-292LSKLQTRKVKALKKYLSKKEDGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
236-250RATRQPKETMKRKKK
Subcellular Location(s) mito 11.5, mito_nucl 11.333, nucl 10, cyto_nucl 8.333, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007109  Brix  
IPR039770  Rpf2  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0008097  F:5S rRNA binding  
GO:0008312  F:7S RNA binding  
GO:1902626  P:assembly of large subunit precursor of preribosome  
GO:0000466  P:maturation of 5.8S rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000463  P:maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000027  P:ribosomal large subunit assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF04427  Brix  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50833  BRIX  
Amino Acid Sequences MSLVKVAKTALGKRILESREPKVVENPKSVLVMKGHRTSQIVIQALNNIQYALKKPFGIHFSRKNDIKPFESETPLEFLCEKNDTSLFAIGYHTKKHPNTITMGRLFDHHILDMVELSIEQFKTLEDFKVEKCAVGAKPSIIFVGELFEMNETYRHLKNFFLDYFRGKEVKVIDLTGLEHVIVFTATEANIFMRTYRPLLLKSGNKLPRVELEEMGPRFDFKVGRTKFAHEELMKRATRQPKETMKRKKKNIEFNALGEKYGRVYVDHQDLSKLQTRKVKALKKYLSKKEDGEEKQAKKQKMDVDSE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.45
3 0.48
4 0.49
5 0.48
6 0.48
7 0.49
8 0.49
9 0.5
10 0.56
11 0.53
12 0.53
13 0.5
14 0.43
15 0.45
16 0.44
17 0.38
18 0.34
19 0.36
20 0.37
21 0.4
22 0.39
23 0.39
24 0.41
25 0.38
26 0.38
27 0.38
28 0.33
29 0.28
30 0.27
31 0.28
32 0.27
33 0.27
34 0.22
35 0.15
36 0.14
37 0.15
38 0.19
39 0.19
40 0.21
41 0.2
42 0.21
43 0.26
44 0.31
45 0.36
46 0.4
47 0.45
48 0.5
49 0.57
50 0.59
51 0.59
52 0.61
53 0.59
54 0.54
55 0.49
56 0.49
57 0.45
58 0.45
59 0.41
60 0.34
61 0.33
62 0.29
63 0.26
64 0.19
65 0.16
66 0.15
67 0.16
68 0.15
69 0.14
70 0.14
71 0.15
72 0.16
73 0.17
74 0.14
75 0.13
76 0.14
77 0.17
78 0.18
79 0.2
80 0.21
81 0.26
82 0.27
83 0.33
84 0.35
85 0.33
86 0.37
87 0.4
88 0.43
89 0.39
90 0.39
91 0.33
92 0.3
93 0.3
94 0.27
95 0.22
96 0.15
97 0.13
98 0.12
99 0.12
100 0.11
101 0.08
102 0.05
103 0.04
104 0.05
105 0.06
106 0.06
107 0.06
108 0.05
109 0.05
110 0.07
111 0.08
112 0.09
113 0.09
114 0.11
115 0.12
116 0.18
117 0.18
118 0.17
119 0.16
120 0.2
121 0.18
122 0.18
123 0.19
124 0.13
125 0.13
126 0.13
127 0.13
128 0.09
129 0.09
130 0.06
131 0.07
132 0.06
133 0.06
134 0.06
135 0.06
136 0.06
137 0.06
138 0.06
139 0.06
140 0.09
141 0.1
142 0.11
143 0.12
144 0.13
145 0.14
146 0.18
147 0.18
148 0.17
149 0.18
150 0.19
151 0.21
152 0.22
153 0.21
154 0.17
155 0.19
156 0.17
157 0.18
158 0.17
159 0.14
160 0.12
161 0.12
162 0.13
163 0.1
164 0.09
165 0.06
166 0.05
167 0.05
168 0.05
169 0.04
170 0.03
171 0.03
172 0.03
173 0.03
174 0.04
175 0.04
176 0.04
177 0.05
178 0.05
179 0.06
180 0.07
181 0.09
182 0.1
183 0.13
184 0.15
185 0.15
186 0.19
187 0.25
188 0.27
189 0.3
190 0.38
191 0.41
192 0.42
193 0.41
194 0.4
195 0.38
196 0.39
197 0.37
198 0.29
199 0.26
200 0.3
201 0.3
202 0.3
203 0.24
204 0.2
205 0.18
206 0.19
207 0.18
208 0.13
209 0.23
210 0.22
211 0.29
212 0.3
213 0.33
214 0.35
215 0.37
216 0.43
217 0.35
218 0.38
219 0.37
220 0.44
221 0.4
222 0.38
223 0.42
224 0.44
225 0.48
226 0.49
227 0.52
228 0.55
229 0.65
230 0.73
231 0.78
232 0.8
233 0.84
234 0.89
235 0.91
236 0.89
237 0.9
238 0.89
239 0.87
240 0.8
241 0.74
242 0.75
243 0.64
244 0.55
245 0.45
246 0.36
247 0.27
248 0.25
249 0.21
250 0.12
251 0.15
252 0.2
253 0.27
254 0.28
255 0.27
256 0.28
257 0.29
258 0.32
259 0.37
260 0.34
261 0.32
262 0.37
263 0.4
264 0.47
265 0.56
266 0.6
267 0.61
268 0.69
269 0.74
270 0.77
271 0.84
272 0.84
273 0.82
274 0.79
275 0.74
276 0.71
277 0.72
278 0.66
279 0.66
280 0.65
281 0.63
282 0.68
283 0.72
284 0.68
285 0.62
286 0.63
287 0.61