FuNGI

A0A075B1V6

Protein Details

Accession

A0A075B1V6

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
478-500	WMLALKKPSKSLKSNKRKTISTL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
484-495	KPSKSLKSNKRK
507-518	KLNKKRAAIAHS

Subcellular Location(s)

mito 13, nucl 10, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR044764 DDX52/Rok1_DEADc IPR011545 DEAD/DEAH_box_helicase_dom IPR014001 Helicase_ATP-bd IPR001650 Helicase_C IPR027417 P-loop_NTPase IPR000629 RNA-helicase_DEAD-box_CS
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus GO:0032040 C:small-subunit processome GO:0005524 F:ATP binding GO:0016787 F:hydrolase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0003724 F:RNA helicase activity GO:0000480 P:endonucleolytic cleavage in 5'-ETS of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) GO:0000447 P:endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) GO:0000472 P:endonucleolytic cleavage to generate mature 5'-end of SSU-rRNA from (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) GO:0048254 P:snoRNA localization
Pfam	View protein in Pfam PF00270 DEAD PF00271 Helicase_C
PROSITE	View protein in PROSITE PS00039 DEAD_ATP_HELICASE PS51192 HELICASE_ATP_BIND_1 PS51194 HELICASE_CTER
CDD	cd17957 DEADc_DDX52 cd18787 SF2_C_DEAD

Amino Acid Sequences

MKNPDALSCLLVGTSIQNKIKNKKIGNDRSAVNVDFFKTGIKDSFMTFKQQQHGTTKNDNFLDKYSINENNENSDFDLDAKALRNKYKIRLYDGDETLPNPISSFDDFIEKYDLDNNFKTVLKSQNFDKPTPIQMQAMPMIMEKVELISLAPTGSGKTLAFLLPILSHLKGPRKEGFRALIITPTKELAEQIQREMNKLYGKFKFNSVVLTKSNLIAEKYANQDDLACDILISTPQKLVNGVENNLISLKNVQYLVLDEADRLLDDGFLEQVDSLIGACSHQERYTCLFSATISSGVESIAKSFMKNPVRIVIGSKNSATETIEQKLVFVGREEGKLLALRQMISTGFNPPMIIFVQSIERAKELFHELVYENVNVEVIHSERSDLERKNIIQSFRSGKIWVLIATELMARGIDFKGVQCVINYDFPQTSASYIHRIGRTGRAGRPGKAITYFTKEDAPFLKIVVNVMRESGCEVPEWMLALKKPSKSLKSNKRKTISTLPSYDKQKLNKKRAAIAHSKALKQSKSE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.16
2	0.22
3	0.26
4	0.32
5	0.4
6	0.48
7	0.57
8	0.62
9	0.63
10	0.66
11	0.73
12	0.77
13	0.77
14	0.74
15	0.66
16	0.64
17	0.63
18	0.54
19	0.45
20	0.37
21	0.32
22	0.26
23	0.25
24	0.2
25	0.17
26	0.19
27	0.18
28	0.19
29	0.18
30	0.19
31	0.27
32	0.26
33	0.32
34	0.35
35	0.39
36	0.43
37	0.46
38	0.49
39	0.5
40	0.56
41	0.55
42	0.6
43	0.59
44	0.58
45	0.57
46	0.54
47	0.49
48	0.45
49	0.44
50	0.34
51	0.32
52	0.31
53	0.35
54	0.37
55	0.39
56	0.37
57	0.37
58	0.38
59	0.37
60	0.32
61	0.27
62	0.23
63	0.19
64	0.19
65	0.12
66	0.13
67	0.17
68	0.21
69	0.24
70	0.28
71	0.34
72	0.38
73	0.47
74	0.53
75	0.53
76	0.55
77	0.57
78	0.58
79	0.6
80	0.57
81	0.52
82	0.45
83	0.41
84	0.35
85	0.31
86	0.24
87	0.16
88	0.14
89	0.14
90	0.14
91	0.16
92	0.14
93	0.17
94	0.18
95	0.19
96	0.22
97	0.19
98	0.18
99	0.22
100	0.24
101	0.24
102	0.25
103	0.24
104	0.23
105	0.25
106	0.25
107	0.24
108	0.31
109	0.29
110	0.3
111	0.33
112	0.39
113	0.42
114	0.41
115	0.42
116	0.36
117	0.38
118	0.4
119	0.38
120	0.32
121	0.29
122	0.31
123	0.28
124	0.25
125	0.2
126	0.15
127	0.14
128	0.11
129	0.1
130	0.07
131	0.06
132	0.05
133	0.05
134	0.05
135	0.04
136	0.05
137	0.05
138	0.05
139	0.05
140	0.05
141	0.06
142	0.07
143	0.06
144	0.07
145	0.08
146	0.08
147	0.08
148	0.08
149	0.08
150	0.07
151	0.08
152	0.1
153	0.09
154	0.11
155	0.15
156	0.23
157	0.24
158	0.29
159	0.34
160	0.37
161	0.39
162	0.42
163	0.41
164	0.36
165	0.36
166	0.32
167	0.32
168	0.28
169	0.27
170	0.23
171	0.2
172	0.18
173	0.15
174	0.15
175	0.12
176	0.18
177	0.18
178	0.2
179	0.23
180	0.23
181	0.24
182	0.25
183	0.24
184	0.21
185	0.22
186	0.26
187	0.27
188	0.31
189	0.31
190	0.32
191	0.33
192	0.29
193	0.32
194	0.28
195	0.27
196	0.24
197	0.26
198	0.24
199	0.21
200	0.22
201	0.18
202	0.16
203	0.13
204	0.13
205	0.14
206	0.17
207	0.17
208	0.16
209	0.14
210	0.14
211	0.13
212	0.14
213	0.11
214	0.08
215	0.06
216	0.06
217	0.06
218	0.08
219	0.08
220	0.07
221	0.08
222	0.09
223	0.09
224	0.1
225	0.1
226	0.14
227	0.16
228	0.16
229	0.17
230	0.16
231	0.16
232	0.16
233	0.15
234	0.1
235	0.09
236	0.08
237	0.08
238	0.08
239	0.08
240	0.08
241	0.09
242	0.1
243	0.09
244	0.09
245	0.07
246	0.07
247	0.07
248	0.07
249	0.06
250	0.04
251	0.03
252	0.03
253	0.04
254	0.03
255	0.03
256	0.04
257	0.03
258	0.03
259	0.03
260	0.03
261	0.03
262	0.03
263	0.03
264	0.03
265	0.03
266	0.05
267	0.06
268	0.07
269	0.08
270	0.1
271	0.14
272	0.17
273	0.17
274	0.16
275	0.15
276	0.14
277	0.16
278	0.14
279	0.11
280	0.08
281	0.08
282	0.08
283	0.08
284	0.08
285	0.06
286	0.06
287	0.08
288	0.08
289	0.08
290	0.1
291	0.18
292	0.22
293	0.24
294	0.24
295	0.25
296	0.26
297	0.26
298	0.28
299	0.26
300	0.24
301	0.25
302	0.24
303	0.21
304	0.2
305	0.2
306	0.18
307	0.16
308	0.16
309	0.16
310	0.18
311	0.17
312	0.17
313	0.17
314	0.16
315	0.13
316	0.1
317	0.13
318	0.12
319	0.13
320	0.13
321	0.13
322	0.13
323	0.13
324	0.13
325	0.13
326	0.12
327	0.12
328	0.11
329	0.12
330	0.12
331	0.13
332	0.13
333	0.12
334	0.12
335	0.12
336	0.12
337	0.11
338	0.12
339	0.11
340	0.11
341	0.08
342	0.08
343	0.11
344	0.13
345	0.14
346	0.13
347	0.13
348	0.12
349	0.12
350	0.14
351	0.16
352	0.14
353	0.13
354	0.15
355	0.14
356	0.17
357	0.19
358	0.16
359	0.12
360	0.11
361	0.11
362	0.09
363	0.09
364	0.08
365	0.07
366	0.08
367	0.08
368	0.09
369	0.1
370	0.14
371	0.2
372	0.2
373	0.24
374	0.28
375	0.29
376	0.36
377	0.39
378	0.37
379	0.33
380	0.37
381	0.39
382	0.36
383	0.37
384	0.3
385	0.26
386	0.26
387	0.26
388	0.21
389	0.17
390	0.13
391	0.12
392	0.12
393	0.11
394	0.09
395	0.07
396	0.07
397	0.05
398	0.07
399	0.07
400	0.07
401	0.08
402	0.08
403	0.13
404	0.14
405	0.14
406	0.13
407	0.16
408	0.17
409	0.22
410	0.22
411	0.21
412	0.2
413	0.2
414	0.22
415	0.19
416	0.18
417	0.16
418	0.17
419	0.19
420	0.21
421	0.26
422	0.26
423	0.27
424	0.29
425	0.34
426	0.39
427	0.41
428	0.42
429	0.46
430	0.49
431	0.49
432	0.53
433	0.48
434	0.43
435	0.4
436	0.4
437	0.35
438	0.38
439	0.38
440	0.33
441	0.38
442	0.35
443	0.35
444	0.34
445	0.32
446	0.25
447	0.24
448	0.24
449	0.18
450	0.2
451	0.21
452	0.21
453	0.18
454	0.2
455	0.19
456	0.17
457	0.2
458	0.2
459	0.16
460	0.14
461	0.15
462	0.15
463	0.15
464	0.16
465	0.14
466	0.15
467	0.16
468	0.23
469	0.28
470	0.29
471	0.36
472	0.43
473	0.5
474	0.57
475	0.66
476	0.7
477	0.76
478	0.83
479	0.86
480	0.85
481	0.81
482	0.79
483	0.79
484	0.78
485	0.75
486	0.72
487	0.69
488	0.69
489	0.71
490	0.71
491	0.66
492	0.66
493	0.69
494	0.72
495	0.75
496	0.74
497	0.73
498	0.75
499	0.76
500	0.76
501	0.75
502	0.7
503	0.7
504	0.7
505	0.67
506	0.66
507	0.66

A0A075B1V6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer