Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A075ASQ6

Protein Details
Accession A0A075ASQ6    Localization Confidence Low Confidence Score 9.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
254-273NDQNSSKRRRMDESRFRNDEHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto 9, mito_nucl 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027437  30s_Rbsml_prot_S13_C  
IPR027157  NCBP2  
IPR034148  NCBP2_RRM  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR001892  Ribosomal_S13  
IPR010979  Ribosomal_S13-like_H2TH  
IPR018269  Ribosomal_S13_CS  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005846  C:nuclear cap binding complex  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0005840  C:ribosome  
GO:0000339  F:RNA cap binding  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0045292  P:mRNA cis splicing, via spliceosome  
GO:0006412  P:translation  
Pfam View protein in Pfam  
PF00416  Ribosomal_S13  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00646  RIBOSOMAL_S13_1  
PS50159  RIBOSOMAL_S13_2  
PS50102  RRM  
CDD cd12240  RRM_NCBP2  
Amino Acid Sequences MNHFQHILRVLNTNIDGKNNVMYALTSIKGIGRRFANLACKKAEVNLKKRAGELTSEELERLVTVVQNPQDYKIPEWFLNRQKDIKDGSYSQKIRVHRGLRHFWGLRVRGQHTKTTGRRGRTVGGTIEEQEQKYQTSTTIYVGNLSFYTTEEQIFELFSIVGPIKRIIIGLDKYKKTPCGFCFVEYYKREDAMDCMKYINGTKLDDRYVRTDVDPGFLEGRQYGRGRSGGQVRDEYRTDFDQGRGGYGAREYYNDQNSSKRRRMDESRFRNDESD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.27
3 0.26
4 0.23
5 0.25
6 0.21
7 0.2
8 0.15
9 0.14
10 0.13
11 0.15
12 0.14
13 0.11
14 0.11
15 0.14
16 0.19
17 0.2
18 0.23
19 0.22
20 0.24
21 0.27
22 0.31
23 0.38
24 0.39
25 0.42
26 0.39
27 0.39
28 0.37
29 0.4
30 0.45
31 0.44
32 0.46
33 0.52
34 0.55
35 0.55
36 0.56
37 0.53
38 0.45
39 0.39
40 0.36
41 0.32
42 0.29
43 0.28
44 0.26
45 0.23
46 0.22
47 0.18
48 0.13
49 0.08
50 0.06
51 0.07
52 0.12
53 0.14
54 0.17
55 0.18
56 0.19
57 0.24
58 0.24
59 0.25
60 0.26
61 0.27
62 0.27
63 0.31
64 0.37
65 0.4
66 0.46
67 0.47
68 0.46
69 0.43
70 0.45
71 0.44
72 0.4
73 0.36
74 0.32
75 0.35
76 0.41
77 0.41
78 0.42
79 0.43
80 0.42
81 0.44
82 0.48
83 0.48
84 0.44
85 0.51
86 0.52
87 0.51
88 0.56
89 0.51
90 0.46
91 0.47
92 0.43
93 0.39
94 0.37
95 0.37
96 0.37
97 0.38
98 0.39
99 0.36
100 0.43
101 0.44
102 0.49
103 0.51
104 0.47
105 0.49
106 0.47
107 0.46
108 0.39
109 0.37
110 0.28
111 0.25
112 0.22
113 0.19
114 0.2
115 0.19
116 0.17
117 0.15
118 0.14
119 0.13
120 0.13
121 0.12
122 0.09
123 0.09
124 0.09
125 0.1
126 0.11
127 0.11
128 0.12
129 0.12
130 0.12
131 0.1
132 0.09
133 0.08
134 0.07
135 0.09
136 0.07
137 0.08
138 0.07
139 0.08
140 0.08
141 0.07
142 0.07
143 0.06
144 0.05
145 0.05
146 0.05
147 0.06
148 0.06
149 0.07
150 0.07
151 0.07
152 0.07
153 0.07
154 0.07
155 0.12
156 0.14
157 0.21
158 0.28
159 0.29
160 0.31
161 0.33
162 0.38
163 0.35
164 0.39
165 0.33
166 0.34
167 0.34
168 0.33
169 0.37
170 0.35
171 0.42
172 0.37
173 0.4
174 0.34
175 0.33
176 0.32
177 0.26
178 0.27
179 0.25
180 0.25
181 0.2
182 0.2
183 0.19
184 0.19
185 0.2
186 0.22
187 0.17
188 0.18
189 0.2
190 0.22
191 0.26
192 0.28
193 0.29
194 0.29
195 0.29
196 0.28
197 0.26
198 0.28
199 0.24
200 0.24
201 0.22
202 0.2
203 0.19
204 0.18
205 0.18
206 0.14
207 0.15
208 0.18
209 0.18
210 0.18
211 0.19
212 0.21
213 0.22
214 0.27
215 0.33
216 0.33
217 0.36
218 0.42
219 0.4
220 0.43
221 0.43
222 0.4
223 0.36
224 0.33
225 0.33
226 0.28
227 0.27
228 0.28
229 0.26
230 0.26
231 0.23
232 0.21
233 0.18
234 0.17
235 0.19
236 0.15
237 0.17
238 0.19
239 0.26
240 0.32
241 0.34
242 0.34
243 0.41
244 0.49
245 0.56
246 0.59
247 0.59
248 0.58
249 0.64
250 0.72
251 0.74
252 0.77
253 0.78
254 0.81
255 0.78