Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A075ATC1

Protein Details
Accession A0A075ATC1    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
132-151KEYFPREKIKCIKWCPNGKIHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 12.5, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001180  CNH_dom  
IPR032914  Vam6/VPS39/TRAP1  
IPR019452  VPS39/TGF_beta_rcpt-assoc_1  
IPR019453  VPS39/TGF_beta_rcpt-assoc_2  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0016192  P:vesicle-mediated transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF00780  CNH  
PF10366  Vps39_1  
PF10367  Vps39_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50219  CNH  
Amino Acid Sequences MHVEGPYFYVCSKTGELQIFQSTQNPENPDNESLILIETRNAFCRKWIKQLSVLKDLRVIVCLSDGIVQLFDMDSYNLITNVTITKTAQRFDIYTSIELVNSLPVLISRLCISSKHHLYFYEWRDDSFVFVKEYFPREKIKCIKWCPNGKICVAAGREYFLYNPMNEDRKNICLIGKKPNIILISNNDLLVFGDNEATCVNFELDTFRNSNLGLQSPPDKVEYIFPYIAVSYAGFINIINIETLQNVQRIDTIGDINFTIYKDIFYAYSEKDIYSFKTKPILSQIDELVELELFEEAISMLENYEKIPKENKDEKLQFIRTKFGFYLFSKERYEEAIHEFTLVLLLYPQLNDLEINEINKTSFEPLIPYLTQIRTQLRRKANECKRNKIKDETLQTRQLIDTSLLKLYFLVNESMIGPLVRIANDCLIEETEKLFKKYKKFDELVLFYKEKKMHQKSIDLLQELSISDSSYLKSLTSYLTSFDINETDLLLPSIEFLLQRGHEDAFKVLLQHSASVDTQRKIQDFLSSKFKDKCLKYLNYLITSGSQVKFIXSGSQDKFIHNSYALSLMDLLKQMYKNGTDSSKVDESRNQFKLFLTSSKYYEPEKKSILLGKMGEYERALKILAFDCKSFDSCTKFCSEYYTKDNQLFLTLYNLYLENQLQSNAFKVLEKFGAYLDPLKVIEKLPDDSSLSLFSSFFTSVFTKSKKDNLIILKNVAESNLLQTKYNHLLAQRCKFHVLEETNCILCHRRIGTSICTFIPKSNVTYLHIHSQI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.31
3 0.32
4 0.33
5 0.37
6 0.34
7 0.32
8 0.35
9 0.33
10 0.32
11 0.36
12 0.38
13 0.36
14 0.37
15 0.41
16 0.37
17 0.35
18 0.31
19 0.26
20 0.21
21 0.2
22 0.18
23 0.14
24 0.15
25 0.16
26 0.17
27 0.23
28 0.25
29 0.24
30 0.3
31 0.4
32 0.42
33 0.49
34 0.54
35 0.54
36 0.61
37 0.69
38 0.69
39 0.7
40 0.67
41 0.57
42 0.54
43 0.51
44 0.42
45 0.36
46 0.29
47 0.19
48 0.18
49 0.17
50 0.13
51 0.13
52 0.13
53 0.11
54 0.11
55 0.1
56 0.09
57 0.09
58 0.09
59 0.07
60 0.07
61 0.07
62 0.08
63 0.09
64 0.09
65 0.09
66 0.09
67 0.09
68 0.11
69 0.12
70 0.12
71 0.12
72 0.2
73 0.23
74 0.24
75 0.25
76 0.26
77 0.25
78 0.28
79 0.33
80 0.28
81 0.26
82 0.28
83 0.26
84 0.23
85 0.22
86 0.19
87 0.13
88 0.1
89 0.09
90 0.06
91 0.06
92 0.08
93 0.08
94 0.09
95 0.09
96 0.11
97 0.12
98 0.14
99 0.19
100 0.27
101 0.35
102 0.37
103 0.38
104 0.37
105 0.43
106 0.5
107 0.5
108 0.5
109 0.42
110 0.39
111 0.41
112 0.39
113 0.36
114 0.3
115 0.27
116 0.19
117 0.19
118 0.22
119 0.23
120 0.28
121 0.29
122 0.29
123 0.36
124 0.36
125 0.45
126 0.51
127 0.55
128 0.6
129 0.65
130 0.73
131 0.73
132 0.81
133 0.8
134 0.79
135 0.74
136 0.65
137 0.61
138 0.51
139 0.48
140 0.4
141 0.36
142 0.28
143 0.25
144 0.25
145 0.2
146 0.2
147 0.17
148 0.17
149 0.14
150 0.18
151 0.21
152 0.26
153 0.26
154 0.3
155 0.3
156 0.31
157 0.33
158 0.29
159 0.28
160 0.3
161 0.34
162 0.39
163 0.42
164 0.41
165 0.39
166 0.43
167 0.41
168 0.34
169 0.34
170 0.28
171 0.29
172 0.27
173 0.27
174 0.22
175 0.2
176 0.19
177 0.18
178 0.13
179 0.07
180 0.09
181 0.09
182 0.1
183 0.1
184 0.1
185 0.08
186 0.09
187 0.09
188 0.06
189 0.07
190 0.1
191 0.12
192 0.14
193 0.15
194 0.15
195 0.15
196 0.15
197 0.18
198 0.15
199 0.16
200 0.14
201 0.15
202 0.18
203 0.19
204 0.2
205 0.18
206 0.17
207 0.16
208 0.21
209 0.21
210 0.23
211 0.21
212 0.2
213 0.19
214 0.19
215 0.18
216 0.13
217 0.1
218 0.06
219 0.06
220 0.06
221 0.05
222 0.05
223 0.06
224 0.06
225 0.06
226 0.05
227 0.05
228 0.06
229 0.06
230 0.07
231 0.08
232 0.1
233 0.1
234 0.1
235 0.11
236 0.11
237 0.12
238 0.12
239 0.11
240 0.09
241 0.1
242 0.1
243 0.09
244 0.1
245 0.09
246 0.09
247 0.08
248 0.08
249 0.07
250 0.08
251 0.08
252 0.08
253 0.11
254 0.11
255 0.14
256 0.14
257 0.14
258 0.15
259 0.15
260 0.17
261 0.21
262 0.21
263 0.19
264 0.26
265 0.26
266 0.27
267 0.33
268 0.35
269 0.3
270 0.31
271 0.3
272 0.24
273 0.24
274 0.23
275 0.15
276 0.1
277 0.08
278 0.06
279 0.05
280 0.04
281 0.03
282 0.03
283 0.03
284 0.03
285 0.03
286 0.03
287 0.03
288 0.04
289 0.04
290 0.05
291 0.1
292 0.1
293 0.12
294 0.18
295 0.2
296 0.29
297 0.37
298 0.4
299 0.45
300 0.47
301 0.51
302 0.53
303 0.56
304 0.52
305 0.45
306 0.47
307 0.38
308 0.38
309 0.33
310 0.27
311 0.26
312 0.22
313 0.29
314 0.25
315 0.29
316 0.27
317 0.28
318 0.26
319 0.25
320 0.25
321 0.19
322 0.22
323 0.19
324 0.18
325 0.18
326 0.17
327 0.13
328 0.13
329 0.1
330 0.05
331 0.04
332 0.04
333 0.04
334 0.04
335 0.05
336 0.04
337 0.04
338 0.04
339 0.05
340 0.08
341 0.08
342 0.09
343 0.09
344 0.09
345 0.09
346 0.09
347 0.09
348 0.07
349 0.07
350 0.07
351 0.08
352 0.09
353 0.12
354 0.11
355 0.12
356 0.13
357 0.14
358 0.15
359 0.16
360 0.21
361 0.26
362 0.31
363 0.38
364 0.42
365 0.47
366 0.5
367 0.58
368 0.63
369 0.65
370 0.66
371 0.69
372 0.72
373 0.74
374 0.74
375 0.69
376 0.65
377 0.62
378 0.65
379 0.61
380 0.57
381 0.54
382 0.5
383 0.44
384 0.38
385 0.31
386 0.23
387 0.17
388 0.14
389 0.1
390 0.11
391 0.1
392 0.1
393 0.1
394 0.1
395 0.09
396 0.08
397 0.07
398 0.06
399 0.07
400 0.07
401 0.07
402 0.07
403 0.06
404 0.05
405 0.05
406 0.06
407 0.06
408 0.06
409 0.06
410 0.08
411 0.08
412 0.08
413 0.08
414 0.08
415 0.08
416 0.08
417 0.09
418 0.13
419 0.14
420 0.16
421 0.21
422 0.25
423 0.31
424 0.4
425 0.46
426 0.49
427 0.49
428 0.52
429 0.54
430 0.55
431 0.51
432 0.47
433 0.41
434 0.33
435 0.37
436 0.34
437 0.31
438 0.37
439 0.39
440 0.42
441 0.44
442 0.49
443 0.47
444 0.53
445 0.52
446 0.42
447 0.36
448 0.29
449 0.26
450 0.21
451 0.19
452 0.11
453 0.07
454 0.07
455 0.07
456 0.07
457 0.07
458 0.07
459 0.06
460 0.07
461 0.07
462 0.07
463 0.09
464 0.09
465 0.1
466 0.11
467 0.11
468 0.11
469 0.11
470 0.1
471 0.09
472 0.08
473 0.08
474 0.07
475 0.07
476 0.07
477 0.06
478 0.06
479 0.05
480 0.06
481 0.05
482 0.04
483 0.05
484 0.07
485 0.08
486 0.09
487 0.1
488 0.11
489 0.11
490 0.12
491 0.12
492 0.11
493 0.11
494 0.11
495 0.1
496 0.12
497 0.12
498 0.12
499 0.12
500 0.13
501 0.13
502 0.17
503 0.21
504 0.19
505 0.23
506 0.25
507 0.26
508 0.25
509 0.25
510 0.28
511 0.28
512 0.31
513 0.37
514 0.36
515 0.41
516 0.43
517 0.46
518 0.47
519 0.44
520 0.49
521 0.47
522 0.49
523 0.49
524 0.53
525 0.53
526 0.47
527 0.46
528 0.38
529 0.3
530 0.29
531 0.28
532 0.2
533 0.17
534 0.15
535 0.14
536 0.15
537 0.13
538 0.19
539 0.19
540 0.2
541 0.22
542 0.26
543 0.26
544 0.28
545 0.29
546 0.24
547 0.2
548 0.19
549 0.17
550 0.16
551 0.16
552 0.14
553 0.13
554 0.12
555 0.12
556 0.12
557 0.12
558 0.12
559 0.12
560 0.13
561 0.15
562 0.15
563 0.16
564 0.19
565 0.2
566 0.2
567 0.21
568 0.26
569 0.3
570 0.3
571 0.3
572 0.33
573 0.36
574 0.43
575 0.46
576 0.41
577 0.36
578 0.35
579 0.38
580 0.35
581 0.33
582 0.3
583 0.28
584 0.3
585 0.32
586 0.34
587 0.34
588 0.4
589 0.41
590 0.41
591 0.41
592 0.4
593 0.4
594 0.44
595 0.42
596 0.37
597 0.33
598 0.29
599 0.33
600 0.32
601 0.29
602 0.24
603 0.25
604 0.2
605 0.2
606 0.19
607 0.12
608 0.15
609 0.17
610 0.23
611 0.21
612 0.21
613 0.22
614 0.24
615 0.26
616 0.26
617 0.26
618 0.27
619 0.26
620 0.28
621 0.3
622 0.3
623 0.28
624 0.34
625 0.34
626 0.33
627 0.4
628 0.45
629 0.45
630 0.46
631 0.47
632 0.39
633 0.38
634 0.32
635 0.25
636 0.23
637 0.19
638 0.16
639 0.16
640 0.16
641 0.14
642 0.15
643 0.15
644 0.12
645 0.13
646 0.14
647 0.13
648 0.14
649 0.15
650 0.14
651 0.14
652 0.15
653 0.15
654 0.18
655 0.19
656 0.19
657 0.18
658 0.17
659 0.18
660 0.17
661 0.2
662 0.17
663 0.17
664 0.16
665 0.17
666 0.18
667 0.17
668 0.2
669 0.2
670 0.22
671 0.22
672 0.24
673 0.25
674 0.24
675 0.25
676 0.22
677 0.2
678 0.18
679 0.16
680 0.14
681 0.15
682 0.14
683 0.13
684 0.14
685 0.15
686 0.18
687 0.25
688 0.27
689 0.28
690 0.32
691 0.4
692 0.42
693 0.44
694 0.48
695 0.51
696 0.57
697 0.57
698 0.56
699 0.5
700 0.46
701 0.43
702 0.35
703 0.27
704 0.19
705 0.21
706 0.24
707 0.23
708 0.23
709 0.24
710 0.3
711 0.34
712 0.37
713 0.32
714 0.3
715 0.38
716 0.46
717 0.55
718 0.55
719 0.52
720 0.53
721 0.51
722 0.49
723 0.5
724 0.47
725 0.42
726 0.42
727 0.43
728 0.4
729 0.4
730 0.39
731 0.34
732 0.29
733 0.31
734 0.27
735 0.26
736 0.3
737 0.34
738 0.41
739 0.42
740 0.44
741 0.39
742 0.41
743 0.39
744 0.38
745 0.4
746 0.34
747 0.32
748 0.36
749 0.37
750 0.36
751 0.41
752 0.41