Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1HBD1

Protein Details
Accession C1HBD1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
9-28VPPDPEKKKYFKVQANHTAPHydrophilic
35-60KDDIKNRKETSLKRKRWEEHDQRVSTBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 13, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
KEGG pbl:PAAG_08072  -  
Amino Acid Sequences MANSADENVPPDPEKKKYFKVQANHTAPLGSKYTKDDIKNRKETSLKRKRWEEHDQRVSTEKIKRSNILHHTISGTLLQQESGTLLTSRSLVFEQREATCARLFSRNCLVDVASSDVKYPVSRFARDPWSGNLLVAINTASCFNLLVSSSGQTGESVHVSISRLFNPSDPRPVTQYVVDAATTFCYPGSIVWCSAACPSSTESIFAAGKSNDLLLVTGIESSWNIRAFKMSPCADVMAVEWLAPQVVMTGLKNSLVRLYDLRSRDTASRLQHPHGVYKIRKVDDCRIVVAGAQKNLHMYDLRFTPNIISEYPQPNKPTHTWTKPYLSFPDYANDLISHDELDISPELGLLACGSQSNRIQLFSLSTGKLVMPPPLFPSSLSSIPTPQQAPTSSSLPNHSQGVIESGNSTCRDVPITHIQYADRIRCLRFENLDAFPTVNGGISAGTPSLLVSAGSTVEEWRM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.45
3 0.53
4 0.6
5 0.68
6 0.72
7 0.75
8 0.78
9 0.81
10 0.8
11 0.74
12 0.64
13 0.56
14 0.49
15 0.44
16 0.38
17 0.28
18 0.24
19 0.27
20 0.33
21 0.37
22 0.43
23 0.49
24 0.55
25 0.64
26 0.71
27 0.69
28 0.71
29 0.73
30 0.76
31 0.77
32 0.78
33 0.77
34 0.77
35 0.84
36 0.83
37 0.83
38 0.85
39 0.84
40 0.84
41 0.85
42 0.78
43 0.71
44 0.68
45 0.63
46 0.58
47 0.55
48 0.51
49 0.49
50 0.51
51 0.53
52 0.53
53 0.6
54 0.6
55 0.6
56 0.55
57 0.48
58 0.46
59 0.41
60 0.37
61 0.29
62 0.22
63 0.16
64 0.15
65 0.13
66 0.1
67 0.1
68 0.1
69 0.09
70 0.09
71 0.07
72 0.07
73 0.08
74 0.09
75 0.09
76 0.1
77 0.11
78 0.13
79 0.15
80 0.18
81 0.2
82 0.2
83 0.23
84 0.22
85 0.23
86 0.21
87 0.21
88 0.2
89 0.25
90 0.25
91 0.27
92 0.36
93 0.35
94 0.33
95 0.33
96 0.31
97 0.24
98 0.25
99 0.25
100 0.18
101 0.17
102 0.17
103 0.16
104 0.17
105 0.16
106 0.16
107 0.19
108 0.22
109 0.24
110 0.26
111 0.31
112 0.38
113 0.39
114 0.41
115 0.35
116 0.36
117 0.34
118 0.32
119 0.28
120 0.2
121 0.18
122 0.15
123 0.12
124 0.07
125 0.07
126 0.07
127 0.06
128 0.05
129 0.05
130 0.05
131 0.06
132 0.06
133 0.07
134 0.08
135 0.09
136 0.09
137 0.09
138 0.09
139 0.08
140 0.09
141 0.09
142 0.09
143 0.08
144 0.07
145 0.08
146 0.09
147 0.12
148 0.13
149 0.13
150 0.14
151 0.14
152 0.17
153 0.22
154 0.24
155 0.3
156 0.3
157 0.3
158 0.32
159 0.34
160 0.32
161 0.27
162 0.25
163 0.18
164 0.17
165 0.15
166 0.12
167 0.1
168 0.09
169 0.08
170 0.07
171 0.06
172 0.05
173 0.05
174 0.06
175 0.09
176 0.09
177 0.09
178 0.1
179 0.1
180 0.1
181 0.11
182 0.11
183 0.08
184 0.09
185 0.1
186 0.12
187 0.12
188 0.12
189 0.11
190 0.13
191 0.13
192 0.12
193 0.13
194 0.1
195 0.1
196 0.09
197 0.09
198 0.07
199 0.06
200 0.06
201 0.04
202 0.04
203 0.04
204 0.04
205 0.04
206 0.04
207 0.04
208 0.05
209 0.07
210 0.09
211 0.09
212 0.09
213 0.11
214 0.12
215 0.14
216 0.2
217 0.19
218 0.18
219 0.18
220 0.18
221 0.17
222 0.15
223 0.14
224 0.09
225 0.08
226 0.07
227 0.06
228 0.05
229 0.05
230 0.05
231 0.04
232 0.02
233 0.03
234 0.04
235 0.04
236 0.05
237 0.06
238 0.07
239 0.08
240 0.08
241 0.09
242 0.09
243 0.1
244 0.1
245 0.13
246 0.17
247 0.19
248 0.2
249 0.2
250 0.21
251 0.22
252 0.24
253 0.26
254 0.24
255 0.31
256 0.32
257 0.33
258 0.36
259 0.35
260 0.36
261 0.35
262 0.39
263 0.32
264 0.37
265 0.41
266 0.38
267 0.41
268 0.42
269 0.46
270 0.45
271 0.45
272 0.39
273 0.33
274 0.31
275 0.29
276 0.31
277 0.25
278 0.2
279 0.19
280 0.18
281 0.19
282 0.19
283 0.18
284 0.13
285 0.11
286 0.12
287 0.15
288 0.17
289 0.16
290 0.16
291 0.16
292 0.18
293 0.19
294 0.16
295 0.15
296 0.19
297 0.26
298 0.29
299 0.32
300 0.31
301 0.31
302 0.35
303 0.36
304 0.38
305 0.4
306 0.45
307 0.46
308 0.49
309 0.56
310 0.55
311 0.56
312 0.53
313 0.46
314 0.4
315 0.36
316 0.34
317 0.28
318 0.24
319 0.21
320 0.16
321 0.14
322 0.14
323 0.13
324 0.1
325 0.08
326 0.09
327 0.08
328 0.1
329 0.09
330 0.08
331 0.08
332 0.07
333 0.07
334 0.07
335 0.07
336 0.04
337 0.04
338 0.04
339 0.05
340 0.06
341 0.1
342 0.12
343 0.17
344 0.18
345 0.19
346 0.19
347 0.19
348 0.21
349 0.2
350 0.23
351 0.18
352 0.18
353 0.18
354 0.17
355 0.2
356 0.18
357 0.21
358 0.18
359 0.18
360 0.23
361 0.24
362 0.25
363 0.22
364 0.25
365 0.24
366 0.26
367 0.27
368 0.23
369 0.24
370 0.25
371 0.29
372 0.26
373 0.22
374 0.24
375 0.24
376 0.26
377 0.27
378 0.28
379 0.27
380 0.28
381 0.31
382 0.31
383 0.32
384 0.3
385 0.27
386 0.24
387 0.22
388 0.24
389 0.2
390 0.16
391 0.15
392 0.14
393 0.18
394 0.18
395 0.2
396 0.16
397 0.16
398 0.19
399 0.18
400 0.24
401 0.3
402 0.34
403 0.34
404 0.35
405 0.35
406 0.38
407 0.45
408 0.42
409 0.38
410 0.37
411 0.36
412 0.38
413 0.42
414 0.43
415 0.4
416 0.41
417 0.4
418 0.39
419 0.4
420 0.36
421 0.33
422 0.26
423 0.23
424 0.18
425 0.13
426 0.1
427 0.08
428 0.07
429 0.07
430 0.08
431 0.07
432 0.07
433 0.07
434 0.07
435 0.07
436 0.07
437 0.07
438 0.06
439 0.07
440 0.07
441 0.08
442 0.08