Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1GPD6

Protein Details
Accession C1GPD6    Localization Confidence High Confidence Score 18.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
193-212SPSPGRSRERKRKINESFSRHydrophilic
220-251PVEKKRTPSKATDRNKRRRMRSQSPHERGRQYBasic
294-313RDRSHQPRSQERFQERPRSIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
184-247RSPRRKRDLSPSPGRSRERKRKINESFSRASHLSASPVEKKRTPSKATDRNKRRRMRSQSPHER
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 12.5, cyto 2.5
Family & Domain DBs
KEGG pbl:PAAG_00381  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF13917  zf-CCHC_3  
Amino Acid Sequences MPQIRKQRTWQSTQEFNGDSRDAEQVVRAWTMKSLWVAELDVLQWGCLDVEWGAKHPTDMFYNRATNRHKDDSLVLHAQGYECKASAQERPYISRPSRTQQLANPKLVPELMSDVPNDLLRTKGVADEQLALKENERSRKRDSDYDDRDHEGIRGHSRKRARSVSPAYSADSVSTISTNRSWSRSPRRKRDLSPSPGRSRERKRKINESFSRASHLSASPVEKKRTPSKATDRNKRRRMRSQSPHERGRQYDPDRRGSWRNRSQSQSMDRSSIAKQRWSLTPDGMDRNGGYTDRDRSHQPRSQERFQERPRSIRNHEPPYRGARGVLRSPPSPRERSLSPFSKRLALTQAMNMNR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.68
2 0.59
3 0.53
4 0.5
5 0.41
6 0.33
7 0.27
8 0.26
9 0.2
10 0.18
11 0.19
12 0.17
13 0.19
14 0.2
15 0.19
16 0.17
17 0.18
18 0.19
19 0.2
20 0.19
21 0.18
22 0.17
23 0.17
24 0.17
25 0.16
26 0.16
27 0.13
28 0.14
29 0.12
30 0.11
31 0.09
32 0.09
33 0.09
34 0.07
35 0.08
36 0.05
37 0.1
38 0.1
39 0.13
40 0.15
41 0.15
42 0.16
43 0.16
44 0.18
45 0.2
46 0.22
47 0.23
48 0.26
49 0.33
50 0.35
51 0.42
52 0.45
53 0.46
54 0.51
55 0.55
56 0.5
57 0.45
58 0.47
59 0.44
60 0.45
61 0.41
62 0.33
63 0.27
64 0.27
65 0.25
66 0.23
67 0.19
68 0.14
69 0.11
70 0.11
71 0.12
72 0.14
73 0.19
74 0.2
75 0.24
76 0.26
77 0.31
78 0.35
79 0.42
80 0.42
81 0.44
82 0.46
83 0.45
84 0.51
85 0.49
86 0.49
87 0.47
88 0.56
89 0.54
90 0.53
91 0.49
92 0.41
93 0.39
94 0.35
95 0.29
96 0.19
97 0.18
98 0.15
99 0.14
100 0.14
101 0.14
102 0.15
103 0.15
104 0.14
105 0.1
106 0.09
107 0.08
108 0.09
109 0.09
110 0.09
111 0.09
112 0.1
113 0.11
114 0.13
115 0.13
116 0.14
117 0.15
118 0.14
119 0.14
120 0.18
121 0.21
122 0.27
123 0.31
124 0.34
125 0.38
126 0.46
127 0.49
128 0.51
129 0.54
130 0.56
131 0.59
132 0.6
133 0.57
134 0.51
135 0.47
136 0.41
137 0.34
138 0.25
139 0.21
140 0.23
141 0.26
142 0.25
143 0.31
144 0.36
145 0.4
146 0.45
147 0.49
148 0.44
149 0.48
150 0.53
151 0.52
152 0.51
153 0.48
154 0.42
155 0.37
156 0.34
157 0.24
158 0.18
159 0.14
160 0.09
161 0.08
162 0.07
163 0.07
164 0.08
165 0.11
166 0.12
167 0.14
168 0.16
169 0.24
170 0.35
171 0.44
172 0.53
173 0.6
174 0.68
175 0.72
176 0.76
177 0.77
178 0.76
179 0.75
180 0.76
181 0.73
182 0.71
183 0.71
184 0.7
185 0.68
186 0.69
187 0.71
188 0.71
189 0.72
190 0.72
191 0.75
192 0.8
193 0.82
194 0.79
195 0.75
196 0.69
197 0.61
198 0.59
199 0.49
200 0.41
201 0.32
202 0.25
203 0.2
204 0.18
205 0.21
206 0.24
207 0.29
208 0.32
209 0.33
210 0.38
211 0.44
212 0.5
213 0.5
214 0.51
215 0.56
216 0.63
217 0.7
218 0.76
219 0.79
220 0.82
221 0.88
222 0.87
223 0.86
224 0.86
225 0.86
226 0.86
227 0.86
228 0.86
229 0.88
230 0.87
231 0.87
232 0.83
233 0.77
234 0.7
235 0.67
236 0.65
237 0.61
238 0.62
239 0.59
240 0.59
241 0.57
242 0.58
243 0.6
244 0.58
245 0.62
246 0.62
247 0.66
248 0.65
249 0.68
250 0.68
251 0.67
252 0.67
253 0.64
254 0.56
255 0.5
256 0.44
257 0.42
258 0.41
259 0.39
260 0.34
261 0.31
262 0.32
263 0.33
264 0.38
265 0.39
266 0.38
267 0.34
268 0.36
269 0.36
270 0.38
271 0.35
272 0.31
273 0.27
274 0.26
275 0.25
276 0.2
277 0.19
278 0.18
279 0.24
280 0.25
281 0.27
282 0.33
283 0.37
284 0.45
285 0.47
286 0.51
287 0.55
288 0.61
289 0.68
290 0.71
291 0.73
292 0.74
293 0.78
294 0.81
295 0.75
296 0.76
297 0.75
298 0.74
299 0.73
300 0.74
301 0.75
302 0.75
303 0.77
304 0.73
305 0.7
306 0.7
307 0.69
308 0.59
309 0.52
310 0.48
311 0.47
312 0.49
313 0.5
314 0.47
315 0.46
316 0.5
317 0.56
318 0.58
319 0.56
320 0.53
321 0.51
322 0.52
323 0.55
324 0.59
325 0.59
326 0.57
327 0.59
328 0.58
329 0.59
330 0.54
331 0.51
332 0.48
333 0.43
334 0.4
335 0.4