Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1H661

Protein Details
Accession C1H661    Localization Confidence Medium Confidence Score 14
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
60-84IVGFGERWRKKKKEEEKKKKSGAGABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
66-101RWRKKKKEEEKKKKSGAGAGEGGNGGGAGKMRKPPP
Subcellular Location(s) nucl 15, mito 10
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039128  TRIP4-like  
IPR009349  Znf_C2HC5  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
KEGG pbl:PAAG_06171  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06221  zf-C2HC5  
Amino Acid Sequences MSTLDPALKSWALPRLSALLQLDHDSLTQLLEYTCSLDHDQGAEHLRNILGDSAKALEFIVGFGERWRKKKKEEEKKKKSGAGAGEGGNGGGAGKMRKPPPSAAGPLISEFMPNVRSKPAKASSAAKRQQQQHLATSSPSRNRSRKSLSGSGSATSTSTDNIADLSAAIAQLELTTNPTLSSSSNSIPSKPRKCNCLATLHPLFTPAPNCLNCGKIICSLEGLQPCSFCQQPLLTPEQVQGMIRELRAERGSEKMRAHNRGYQRHGGGNEELLLPSSADGNGNADGVVSDLDAAKAHRDKLLQFQAQNARRTKVVDEVAEFETPDVHGQSALWMTPGQRALALKRQQKVLREMEEKGKEEWERQGGRIVVSLSLEGKGSGMGLIRRVERWEEAEKEVEGQGVGDIEGDADEEMEVGGAGEEMKGAFGNNPLLAGGGLVRPIWKPKGKGTADGNGDGNADEGGVGRRGREQRQMWRRVQDDEGDNERWILDGNMYGYGNGSRDGSMEVEGDGTDCG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.27
3 0.27
4 0.3
5 0.28
6 0.23
7 0.24
8 0.26
9 0.25
10 0.2
11 0.2
12 0.16
13 0.15
14 0.12
15 0.11
16 0.09
17 0.08
18 0.09
19 0.09
20 0.1
21 0.1
22 0.13
23 0.14
24 0.15
25 0.16
26 0.16
27 0.16
28 0.18
29 0.23
30 0.22
31 0.21
32 0.21
33 0.2
34 0.19
35 0.19
36 0.19
37 0.14
38 0.13
39 0.14
40 0.15
41 0.14
42 0.14
43 0.13
44 0.1
45 0.09
46 0.09
47 0.1
48 0.08
49 0.09
50 0.12
51 0.22
52 0.27
53 0.35
54 0.44
55 0.48
56 0.56
57 0.67
58 0.75
59 0.76
60 0.83
61 0.86
62 0.88
63 0.93
64 0.92
65 0.87
66 0.8
67 0.75
68 0.68
69 0.63
70 0.56
71 0.46
72 0.39
73 0.33
74 0.29
75 0.22
76 0.16
77 0.1
78 0.06
79 0.07
80 0.07
81 0.1
82 0.17
83 0.2
84 0.26
85 0.29
86 0.32
87 0.36
88 0.41
89 0.43
90 0.4
91 0.39
92 0.35
93 0.33
94 0.31
95 0.25
96 0.18
97 0.14
98 0.12
99 0.13
100 0.12
101 0.13
102 0.18
103 0.21
104 0.22
105 0.3
106 0.34
107 0.34
108 0.37
109 0.44
110 0.47
111 0.55
112 0.6
113 0.58
114 0.6
115 0.63
116 0.68
117 0.68
118 0.62
119 0.57
120 0.54
121 0.49
122 0.44
123 0.43
124 0.41
125 0.4
126 0.43
127 0.46
128 0.5
129 0.53
130 0.6
131 0.61
132 0.62
133 0.63
134 0.64
135 0.59
136 0.58
137 0.55
138 0.47
139 0.4
140 0.33
141 0.25
142 0.18
143 0.15
144 0.09
145 0.09
146 0.08
147 0.07
148 0.07
149 0.07
150 0.06
151 0.05
152 0.05
153 0.04
154 0.04
155 0.04
156 0.04
157 0.03
158 0.04
159 0.04
160 0.04
161 0.06
162 0.06
163 0.07
164 0.07
165 0.07
166 0.08
167 0.08
168 0.11
169 0.11
170 0.13
171 0.19
172 0.2
173 0.22
174 0.3
175 0.39
176 0.45
177 0.51
178 0.54
179 0.53
180 0.58
181 0.63
182 0.59
183 0.58
184 0.52
185 0.5
186 0.5
187 0.45
188 0.4
189 0.34
190 0.3
191 0.23
192 0.22
193 0.16
194 0.18
195 0.17
196 0.19
197 0.18
198 0.19
199 0.18
200 0.18
201 0.18
202 0.16
203 0.17
204 0.15
205 0.15
206 0.15
207 0.18
208 0.18
209 0.19
210 0.16
211 0.15
212 0.15
213 0.16
214 0.15
215 0.12
216 0.12
217 0.1
218 0.12
219 0.15
220 0.19
221 0.17
222 0.17
223 0.18
224 0.17
225 0.17
226 0.15
227 0.12
228 0.11
229 0.11
230 0.11
231 0.12
232 0.11
233 0.13
234 0.13
235 0.14
236 0.12
237 0.16
238 0.19
239 0.22
240 0.23
241 0.28
242 0.33
243 0.38
244 0.4
245 0.4
246 0.45
247 0.48
248 0.51
249 0.48
250 0.44
251 0.42
252 0.4
253 0.36
254 0.29
255 0.22
256 0.18
257 0.14
258 0.12
259 0.09
260 0.08
261 0.06
262 0.06
263 0.06
264 0.05
265 0.05
266 0.05
267 0.06
268 0.06
269 0.06
270 0.06
271 0.05
272 0.05
273 0.05
274 0.05
275 0.03
276 0.03
277 0.03
278 0.04
279 0.04
280 0.04
281 0.08
282 0.09
283 0.1
284 0.12
285 0.13
286 0.14
287 0.22
288 0.3
289 0.3
290 0.29
291 0.34
292 0.41
293 0.46
294 0.51
295 0.46
296 0.39
297 0.37
298 0.38
299 0.33
300 0.3
301 0.28
302 0.22
303 0.21
304 0.23
305 0.24
306 0.23
307 0.21
308 0.15
309 0.12
310 0.11
311 0.1
312 0.07
313 0.05
314 0.05
315 0.05
316 0.07
317 0.07
318 0.07
319 0.07
320 0.07
321 0.08
322 0.11
323 0.12
324 0.11
325 0.12
326 0.13
327 0.16
328 0.24
329 0.31
330 0.34
331 0.36
332 0.43
333 0.45
334 0.49
335 0.53
336 0.51
337 0.51
338 0.49
339 0.49
340 0.5
341 0.52
342 0.49
343 0.42
344 0.4
345 0.34
346 0.33
347 0.35
348 0.34
349 0.31
350 0.29
351 0.33
352 0.29
353 0.29
354 0.28
355 0.24
356 0.17
357 0.15
358 0.15
359 0.11
360 0.1
361 0.1
362 0.08
363 0.07
364 0.06
365 0.06
366 0.06
367 0.07
368 0.07
369 0.1
370 0.13
371 0.14
372 0.15
373 0.17
374 0.19
375 0.19
376 0.23
377 0.26
378 0.27
379 0.28
380 0.3
381 0.28
382 0.27
383 0.26
384 0.21
385 0.15
386 0.11
387 0.09
388 0.07
389 0.07
390 0.05
391 0.05
392 0.04
393 0.04
394 0.04
395 0.04
396 0.04
397 0.04
398 0.04
399 0.03
400 0.03
401 0.03
402 0.03
403 0.03
404 0.03
405 0.03
406 0.03
407 0.03
408 0.03
409 0.04
410 0.04
411 0.05
412 0.06
413 0.08
414 0.1
415 0.1
416 0.1
417 0.1
418 0.1
419 0.1
420 0.09
421 0.08
422 0.06
423 0.07
424 0.07
425 0.08
426 0.09
427 0.15
428 0.22
429 0.27
430 0.3
431 0.37
432 0.48
433 0.48
434 0.55
435 0.55
436 0.56
437 0.54
438 0.54
439 0.47
440 0.37
441 0.35
442 0.28
443 0.22
444 0.14
445 0.09
446 0.06
447 0.06
448 0.08
449 0.11
450 0.11
451 0.11
452 0.19
453 0.26
454 0.31
455 0.4
456 0.45
457 0.53
458 0.63
459 0.72
460 0.72
461 0.74
462 0.72
463 0.68
464 0.64
465 0.6
466 0.55
467 0.52
468 0.51
469 0.44
470 0.42
471 0.37
472 0.33
473 0.26
474 0.22
475 0.15
476 0.11
477 0.11
478 0.11
479 0.14
480 0.15
481 0.14
482 0.15
483 0.16
484 0.15
485 0.14
486 0.14
487 0.11
488 0.12
489 0.14
490 0.13
491 0.13
492 0.13
493 0.12
494 0.11
495 0.11