Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1HDV3

Protein Details
Accession C1HDV3    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-28MLLISFRPRERKRKRRKITRVEVNEGCPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
7-18RPRERKRKRRKI
Subcellular Location(s) nucl 14, mito 7, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007219  Transcription_factor_dom_fun  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
KEGG pbl:PAAG_08946  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04082  Fungal_trans  
CDD cd12148  fungal_TF_MHR  
Amino Acid Sequences MLLISFRPRERKRKRRKITRVEVNEGCPTANEEHNTTHAISPKVTAWDSRMAGWVAGRTGIATGNRPSVAPDVSSGHVAATTPQLSPPTSALRETDRVPLYTSATPNFSLPQRQESRSYDESPGTSSFLGRSEYLSGEVPINEDQAKSYPAVASESLTEEDIRILELQHAFDLPPRAVREGLIDAFMKRCAPWMPIVERSWLAERQGNQPSLLLLQAVFLAGSRVSSAPAIAAYASPNEFYRRAKALFWSGYEKNTITVITAVLVLHWYNPEGPEHISINTSGFWNRIGVGLAYQIGLHKEPPAGRDAALRRRLWWTLFVARDCLISAGHGRPRAINPDDSDVRLLSHEDFYGSTADGSMFISYVELASLLGDLTQCCCRKYLSRQKRQYIEGALYRWTRELPNHLHLFQRTSSHDGSSSKLALAPYSFEARQLHILYFIILAILFRSSPPASTPSAAAVLASSFVAGIFEDFLARDEIRFLGPIFTFYLLASGVGLLSCYRYPHLWVKAEYDLRIIYNSQRELSKRWPSAIGSLNALWAMKEEASKAPRHEDSQPLGSLTSEQMTCFSGFGTDLCRLGEAILSPHIQGLLGPRRADDNQCSRTASDMMTAGILAELKTPISTPAVLDGYLPLATVLEHPSIHIASGGDTADITDDILCAQYEGIGNWLLKDWDWNSDIAW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.93
2 0.94
3 0.96
4 0.97
5 0.96
6 0.97
7 0.94
8 0.92
9 0.86
10 0.79
11 0.73
12 0.62
13 0.51
14 0.4
15 0.35
16 0.29
17 0.29
18 0.27
19 0.24
20 0.26
21 0.28
22 0.3
23 0.29
24 0.28
25 0.29
26 0.29
27 0.26
28 0.26
29 0.27
30 0.3
31 0.29
32 0.27
33 0.25
34 0.31
35 0.31
36 0.3
37 0.3
38 0.26
39 0.26
40 0.25
41 0.23
42 0.16
43 0.16
44 0.14
45 0.11
46 0.11
47 0.13
48 0.14
49 0.16
50 0.18
51 0.21
52 0.22
53 0.22
54 0.23
55 0.23
56 0.23
57 0.19
58 0.19
59 0.19
60 0.19
61 0.21
62 0.18
63 0.15
64 0.14
65 0.13
66 0.12
67 0.13
68 0.13
69 0.13
70 0.14
71 0.17
72 0.17
73 0.19
74 0.21
75 0.23
76 0.23
77 0.24
78 0.25
79 0.29
80 0.31
81 0.31
82 0.36
83 0.32
84 0.31
85 0.32
86 0.32
87 0.3
88 0.32
89 0.33
90 0.27
91 0.27
92 0.27
93 0.25
94 0.27
95 0.25
96 0.27
97 0.27
98 0.34
99 0.38
100 0.4
101 0.46
102 0.47
103 0.52
104 0.5
105 0.52
106 0.45
107 0.42
108 0.4
109 0.36
110 0.33
111 0.27
112 0.22
113 0.18
114 0.16
115 0.15
116 0.17
117 0.14
118 0.14
119 0.14
120 0.15
121 0.16
122 0.16
123 0.15
124 0.14
125 0.14
126 0.15
127 0.13
128 0.14
129 0.13
130 0.12
131 0.12
132 0.13
133 0.14
134 0.12
135 0.13
136 0.12
137 0.12
138 0.14
139 0.13
140 0.12
141 0.12
142 0.14
143 0.14
144 0.13
145 0.13
146 0.1
147 0.11
148 0.1
149 0.09
150 0.08
151 0.07
152 0.1
153 0.11
154 0.11
155 0.11
156 0.12
157 0.11
158 0.14
159 0.17
160 0.13
161 0.17
162 0.18
163 0.19
164 0.19
165 0.19
166 0.19
167 0.2
168 0.2
169 0.17
170 0.17
171 0.16
172 0.17
173 0.17
174 0.14
175 0.11
176 0.13
177 0.12
178 0.13
179 0.17
180 0.22
181 0.25
182 0.3
183 0.32
184 0.32
185 0.31
186 0.31
187 0.3
188 0.26
189 0.24
190 0.21
191 0.23
192 0.27
193 0.33
194 0.32
195 0.28
196 0.27
197 0.25
198 0.22
199 0.2
200 0.13
201 0.07
202 0.06
203 0.06
204 0.05
205 0.05
206 0.04
207 0.04
208 0.04
209 0.04
210 0.05
211 0.05
212 0.06
213 0.06
214 0.06
215 0.06
216 0.06
217 0.06
218 0.05
219 0.05
220 0.05
221 0.06
222 0.07
223 0.07
224 0.08
225 0.11
226 0.13
227 0.14
228 0.18
229 0.21
230 0.22
231 0.22
232 0.25
233 0.28
234 0.28
235 0.29
236 0.31
237 0.28
238 0.28
239 0.29
240 0.26
241 0.2
242 0.19
243 0.16
244 0.1
245 0.1
246 0.08
247 0.07
248 0.07
249 0.06
250 0.05
251 0.06
252 0.05
253 0.05
254 0.06
255 0.06
256 0.06
257 0.07
258 0.07
259 0.08
260 0.09
261 0.11
262 0.12
263 0.12
264 0.12
265 0.12
266 0.12
267 0.11
268 0.11
269 0.09
270 0.08
271 0.08
272 0.08
273 0.08
274 0.08
275 0.08
276 0.07
277 0.07
278 0.07
279 0.07
280 0.06
281 0.06
282 0.06
283 0.06
284 0.07
285 0.07
286 0.07
287 0.09
288 0.1
289 0.11
290 0.13
291 0.12
292 0.12
293 0.18
294 0.22
295 0.28
296 0.34
297 0.33
298 0.32
299 0.35
300 0.36
301 0.31
302 0.29
303 0.25
304 0.24
305 0.26
306 0.25
307 0.23
308 0.22
309 0.21
310 0.18
311 0.15
312 0.09
313 0.07
314 0.09
315 0.1
316 0.13
317 0.14
318 0.14
319 0.16
320 0.17
321 0.22
322 0.22
323 0.21
324 0.2
325 0.24
326 0.24
327 0.23
328 0.23
329 0.17
330 0.15
331 0.13
332 0.13
333 0.08
334 0.08
335 0.08
336 0.07
337 0.07
338 0.08
339 0.08
340 0.07
341 0.06
342 0.06
343 0.06
344 0.05
345 0.06
346 0.05
347 0.04
348 0.04
349 0.04
350 0.04
351 0.04
352 0.03
353 0.03
354 0.03
355 0.03
356 0.03
357 0.03
358 0.03
359 0.03
360 0.03
361 0.05
362 0.11
363 0.11
364 0.12
365 0.13
366 0.14
367 0.2
368 0.3
369 0.4
370 0.46
371 0.56
372 0.65
373 0.72
374 0.76
375 0.73
376 0.67
377 0.58
378 0.51
379 0.44
380 0.35
381 0.32
382 0.28
383 0.25
384 0.21
385 0.2
386 0.17
387 0.15
388 0.21
389 0.22
390 0.28
391 0.3
392 0.31
393 0.33
394 0.32
395 0.33
396 0.28
397 0.27
398 0.22
399 0.24
400 0.24
401 0.21
402 0.23
403 0.22
404 0.22
405 0.21
406 0.19
407 0.14
408 0.16
409 0.15
410 0.13
411 0.12
412 0.11
413 0.11
414 0.14
415 0.13
416 0.14
417 0.15
418 0.16
419 0.2
420 0.19
421 0.18
422 0.15
423 0.15
424 0.13
425 0.12
426 0.11
427 0.06
428 0.05
429 0.05
430 0.04
431 0.04
432 0.04
433 0.04
434 0.07
435 0.07
436 0.08
437 0.1
438 0.13
439 0.14
440 0.15
441 0.15
442 0.13
443 0.14
444 0.14
445 0.12
446 0.09
447 0.07
448 0.07
449 0.06
450 0.05
451 0.03
452 0.03
453 0.04
454 0.03
455 0.04
456 0.04
457 0.04
458 0.04
459 0.04
460 0.06
461 0.08
462 0.08
463 0.08
464 0.08
465 0.09
466 0.09
467 0.1
468 0.1
469 0.1
470 0.11
471 0.12
472 0.12
473 0.12
474 0.12
475 0.11
476 0.12
477 0.08
478 0.08
479 0.07
480 0.05
481 0.05
482 0.04
483 0.04
484 0.04
485 0.05
486 0.06
487 0.07
488 0.09
489 0.09
490 0.14
491 0.22
492 0.28
493 0.32
494 0.33
495 0.36
496 0.41
497 0.43
498 0.39
499 0.34
500 0.28
501 0.24
502 0.23
503 0.2
504 0.18
505 0.21
506 0.22
507 0.22
508 0.25
509 0.27
510 0.31
511 0.39
512 0.44
513 0.4
514 0.41
515 0.42
516 0.4
517 0.44
518 0.45
519 0.38
520 0.31
521 0.29
522 0.27
523 0.24
524 0.22
525 0.16
526 0.11
527 0.1
528 0.08
529 0.09
530 0.11
531 0.16
532 0.2
533 0.23
534 0.25
535 0.3
536 0.32
537 0.35
538 0.38
539 0.39
540 0.41
541 0.42
542 0.4
543 0.35
544 0.32
545 0.28
546 0.25
547 0.19
548 0.17
549 0.12
550 0.12
551 0.12
552 0.14
553 0.14
554 0.12
555 0.11
556 0.09
557 0.09
558 0.09
559 0.12
560 0.12
561 0.12
562 0.12
563 0.12
564 0.12
565 0.12
566 0.13
567 0.1
568 0.1
569 0.12
570 0.13
571 0.13
572 0.13
573 0.13
574 0.11
575 0.11
576 0.17
577 0.23
578 0.27
579 0.27
580 0.27
581 0.32
582 0.35
583 0.4
584 0.4
585 0.41
586 0.41
587 0.44
588 0.46
589 0.41
590 0.42
591 0.38
592 0.3
593 0.23
594 0.19
595 0.17
596 0.15
597 0.14
598 0.11
599 0.1
600 0.09
601 0.07
602 0.07
603 0.07
604 0.07
605 0.08
606 0.08
607 0.1
608 0.12
609 0.12
610 0.11
611 0.16
612 0.17
613 0.16
614 0.16
615 0.15
616 0.15
617 0.14
618 0.13
619 0.08
620 0.07
621 0.07
622 0.09
623 0.11
624 0.12
625 0.12
626 0.12
627 0.15
628 0.15
629 0.15
630 0.14
631 0.12
632 0.11
633 0.13
634 0.13
635 0.1
636 0.1
637 0.1
638 0.1
639 0.09
640 0.08
641 0.06
642 0.06
643 0.06
644 0.08
645 0.07
646 0.06
647 0.06
648 0.08
649 0.09
650 0.09
651 0.11
652 0.13
653 0.14
654 0.14
655 0.16
656 0.15
657 0.14
658 0.2
659 0.19
660 0.22
661 0.23