Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1HBX7

Protein Details
Accession C1HBX7    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
466-485LEKEKEREVKRGLKRTTRKGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
424-485RKLRRAYEEEKAEERKLLAEKTKKEERDRLLRGMSAEEQRKYLEKEKEREVKRGLKRTTRKG
Subcellular Location(s) cyto 10.5, cyto_nucl 9, mito 7, nucl 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012879  CCDC47  
Gene Ontology GO:0005783  C:endoplasmic reticulum  
GO:0016020  C:membrane  
GO:0005509  F:calcium ion binding  
GO:0032469  P:endoplasmic reticulum calcium ion homeostasis  
KEGG pbl:PAAG_08268  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF07946  CCDC47  
Amino Acid Sequences MSGLLQNLFKGKAQPPPASGDDVDFADFASNIPEPPPAAAHGPPTTTATTFAAGTPLTSTLQPPTAARPVLYTAWYRVWERVEPSDFIQEAFVIPFIILLLCVHVWGMGKNRRKAKQWAQAHLPTLESEFAVVGYDGRPRARKAPSADAVQAEGLRKVAADADDDDTAAAAAAGVDRVDVPESMLKEKTGTEFTMYATGRQNVAFLDVSIRLLRWYNPLYMLGDQVVSLFFDSWAAPVEQVECVAYAFDGKEKDLVPAPSAVESEMIEQRSKGGSNSSAYDGFVFAIVHKNCMRRLREDRYDISLTFTKDISKLPDWATVMSESAEITEMMLTAELVEAVARAGDDFEYLIITDQPLDKPTKIDETTPRKRINLSLRLPKSSNYTHTLPLFTQFLRLTDRLVSVAHFRAEVSRKLRNTREEEIRKLRRAYEEEKAEERKLLAEKTKKEERDRLLRGMSAEEQRKYLEKEKEREVKRGLKRTTRKG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.42
3 0.47
4 0.48
5 0.46
6 0.43
7 0.36
8 0.31
9 0.28
10 0.26
11 0.19
12 0.17
13 0.13
14 0.12
15 0.1
16 0.11
17 0.1
18 0.1
19 0.11
20 0.12
21 0.12
22 0.13
23 0.14
24 0.14
25 0.16
26 0.17
27 0.22
28 0.23
29 0.23
30 0.23
31 0.25
32 0.25
33 0.22
34 0.23
35 0.2
36 0.19
37 0.18
38 0.17
39 0.15
40 0.13
41 0.13
42 0.12
43 0.12
44 0.12
45 0.12
46 0.13
47 0.14
48 0.16
49 0.17
50 0.17
51 0.21
52 0.26
53 0.26
54 0.25
55 0.24
56 0.26
57 0.26
58 0.28
59 0.24
60 0.22
61 0.25
62 0.28
63 0.27
64 0.27
65 0.29
66 0.3
67 0.32
68 0.35
69 0.35
70 0.34
71 0.34
72 0.37
73 0.33
74 0.3
75 0.27
76 0.2
77 0.17
78 0.15
79 0.13
80 0.07
81 0.06
82 0.06
83 0.06
84 0.05
85 0.05
86 0.04
87 0.05
88 0.05
89 0.05
90 0.05
91 0.06
92 0.07
93 0.09
94 0.17
95 0.24
96 0.33
97 0.4
98 0.49
99 0.54
100 0.59
101 0.67
102 0.69
103 0.72
104 0.72
105 0.73
106 0.72
107 0.71
108 0.68
109 0.59
110 0.49
111 0.39
112 0.32
113 0.24
114 0.16
115 0.11
116 0.08
117 0.07
118 0.07
119 0.06
120 0.05
121 0.06
122 0.09
123 0.1
124 0.14
125 0.17
126 0.18
127 0.25
128 0.3
129 0.35
130 0.38
131 0.45
132 0.47
133 0.48
134 0.48
135 0.42
136 0.38
137 0.32
138 0.28
139 0.2
140 0.16
141 0.12
142 0.09
143 0.08
144 0.08
145 0.08
146 0.07
147 0.08
148 0.09
149 0.11
150 0.11
151 0.11
152 0.11
153 0.09
154 0.09
155 0.07
156 0.05
157 0.02
158 0.02
159 0.02
160 0.03
161 0.03
162 0.03
163 0.03
164 0.03
165 0.04
166 0.04
167 0.05
168 0.08
169 0.09
170 0.12
171 0.12
172 0.12
173 0.12
174 0.13
175 0.14
176 0.14
177 0.13
178 0.13
179 0.13
180 0.13
181 0.19
182 0.18
183 0.19
184 0.19
185 0.2
186 0.18
187 0.18
188 0.18
189 0.11
190 0.13
191 0.11
192 0.08
193 0.09
194 0.09
195 0.09
196 0.09
197 0.09
198 0.08
199 0.08
200 0.09
201 0.12
202 0.13
203 0.13
204 0.14
205 0.15
206 0.16
207 0.16
208 0.15
209 0.11
210 0.09
211 0.08
212 0.07
213 0.06
214 0.05
215 0.04
216 0.04
217 0.04
218 0.04
219 0.04
220 0.04
221 0.05
222 0.05
223 0.05
224 0.05
225 0.06
226 0.05
227 0.06
228 0.05
229 0.04
230 0.04
231 0.04
232 0.04
233 0.04
234 0.04
235 0.06
236 0.06
237 0.06
238 0.08
239 0.09
240 0.1
241 0.12
242 0.13
243 0.12
244 0.13
245 0.13
246 0.11
247 0.11
248 0.1
249 0.08
250 0.08
251 0.09
252 0.1
253 0.11
254 0.1
255 0.1
256 0.11
257 0.12
258 0.12
259 0.1
260 0.1
261 0.11
262 0.12
263 0.14
264 0.15
265 0.15
266 0.15
267 0.14
268 0.12
269 0.1
270 0.09
271 0.07
272 0.06
273 0.13
274 0.13
275 0.16
276 0.18
277 0.21
278 0.24
279 0.32
280 0.34
281 0.34
282 0.43
283 0.48
284 0.53
285 0.56
286 0.55
287 0.54
288 0.54
289 0.45
290 0.42
291 0.36
292 0.3
293 0.26
294 0.23
295 0.18
296 0.17
297 0.19
298 0.19
299 0.18
300 0.2
301 0.2
302 0.24
303 0.23
304 0.23
305 0.23
306 0.18
307 0.16
308 0.14
309 0.12
310 0.08
311 0.07
312 0.08
313 0.06
314 0.05
315 0.05
316 0.05
317 0.04
318 0.04
319 0.04
320 0.03
321 0.03
322 0.03
323 0.03
324 0.03
325 0.03
326 0.03
327 0.03
328 0.03
329 0.03
330 0.03
331 0.03
332 0.04
333 0.04
334 0.04
335 0.04
336 0.05
337 0.05
338 0.05
339 0.05
340 0.06
341 0.08
342 0.09
343 0.11
344 0.14
345 0.14
346 0.16
347 0.18
348 0.24
349 0.24
350 0.28
351 0.36
352 0.43
353 0.52
354 0.59
355 0.6
356 0.55
357 0.56
358 0.58
359 0.58
360 0.58
361 0.57
362 0.59
363 0.59
364 0.63
365 0.62
366 0.56
367 0.52
368 0.47
369 0.44
370 0.39
371 0.38
372 0.38
373 0.39
374 0.39
375 0.33
376 0.31
377 0.29
378 0.23
379 0.25
380 0.21
381 0.21
382 0.24
383 0.24
384 0.23
385 0.22
386 0.23
387 0.19
388 0.19
389 0.19
390 0.17
391 0.2
392 0.18
393 0.16
394 0.16
395 0.22
396 0.26
397 0.31
398 0.32
399 0.38
400 0.42
401 0.5
402 0.57
403 0.59
404 0.62
405 0.63
406 0.69
407 0.68
408 0.72
409 0.75
410 0.77
411 0.75
412 0.71
413 0.67
414 0.65
415 0.64
416 0.6
417 0.59
418 0.58
419 0.56
420 0.6
421 0.6
422 0.53
423 0.49
424 0.44
425 0.39
426 0.36
427 0.36
428 0.38
429 0.42
430 0.47
431 0.53
432 0.62
433 0.65
434 0.69
435 0.72
436 0.72
437 0.74
438 0.74
439 0.72
440 0.66
441 0.61
442 0.54
443 0.5
444 0.47
445 0.45
446 0.46
447 0.4
448 0.38
449 0.38
450 0.42
451 0.43
452 0.46
453 0.48
454 0.5
455 0.56
456 0.64
457 0.72
458 0.71
459 0.73
460 0.73
461 0.73
462 0.74
463 0.77
464 0.76
465 0.77