Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A075AWH3

Protein Details
Accession A0A075AWH3    Localization Confidence High Confidence Score 17.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
78-105TINYKLRLLKKLRMKKERKREPIISEETHydrophilic
148-169QSTERSQGKKKRKTPSGTNEIKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
86-97LKKLRMKKERKR
155-187GKKKRKTPSGTNEIKSKPKLKQPNEKEILPTKR
Subcellular Location(s) nucl 15, mito 7, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034101  Lsm4  
IPR010920  LSM_dom_sf  
IPR007823  RRP8  
IPR042036  RRP8_N  
IPR029063  SAM-dependent_MTases_sf  
IPR047575  Sm  
IPR001163  Sm_dom_euk/arc  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0008168  F:methyltransferase activity  
GO:0032259  P:methylation  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
GO:0000956  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF01423  LSM  
PF05148  Methyltransf_8  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS52002  SM  
CDD cd01723  LSm4  
Amino Acid Sequences MLPLSLLNTALGSPMLVELKNGETYNGHLVTCDTWMNLNLREVICTSPDGDRFWRMPECFIRGNMIKYLRVPDEVSVTINYKLRLLKKLRMKKERKREPIISEETLFEVEEQDLACNVAEGEAVGLSGWSYMSFFSVPDWDFQAPTVQSTERSQGKKKRKTPSGTNEIKSKPKLKQPNEKEILPTKRLKTQKQKIINLNTSETKINNSQETPALSKSAKKPVSKLSKLEKNLNAGRFRWINEKLYTTKSGSAFDLFQESPSLFDIYHEGFSTQVKKWPLNPLDAIIAHFKRFKNLKIADMGCGEAKFAQTLHTIHEIHSFDLVAANEFITACDISKTPLKDESVDAVIFSLSLMGVNYASFIKEAMRILHSKGELVIAEVTSRFENEEKFLVWLKSLGFLLVQREENKMFKLFFFRKEENVPYRDPPFTLLKPCIYKKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.1
3 0.1
4 0.1
5 0.11
6 0.14
7 0.18
8 0.18
9 0.17
10 0.16
11 0.19
12 0.26
13 0.25
14 0.22
15 0.19
16 0.2
17 0.2
18 0.21
19 0.19
20 0.12
21 0.13
22 0.16
23 0.19
24 0.2
25 0.21
26 0.24
27 0.23
28 0.24
29 0.23
30 0.22
31 0.2
32 0.19
33 0.19
34 0.19
35 0.21
36 0.23
37 0.25
38 0.28
39 0.28
40 0.32
41 0.37
42 0.33
43 0.38
44 0.39
45 0.42
46 0.4
47 0.4
48 0.42
49 0.38
50 0.4
51 0.39
52 0.37
53 0.33
54 0.32
55 0.37
56 0.32
57 0.31
58 0.29
59 0.25
60 0.26
61 0.25
62 0.24
63 0.21
64 0.21
65 0.22
66 0.23
67 0.22
68 0.21
69 0.25
70 0.28
71 0.35
72 0.39
73 0.44
74 0.52
75 0.62
76 0.69
77 0.75
78 0.81
79 0.83
80 0.88
81 0.91
82 0.9
83 0.89
84 0.87
85 0.82
86 0.8
87 0.77
88 0.69
89 0.59
90 0.5
91 0.41
92 0.34
93 0.28
94 0.18
95 0.12
96 0.09
97 0.09
98 0.08
99 0.07
100 0.07
101 0.07
102 0.07
103 0.06
104 0.05
105 0.05
106 0.04
107 0.04
108 0.04
109 0.03
110 0.03
111 0.03
112 0.03
113 0.03
114 0.03
115 0.03
116 0.03
117 0.03
118 0.04
119 0.05
120 0.05
121 0.05
122 0.06
123 0.1
124 0.1
125 0.11
126 0.14
127 0.14
128 0.14
129 0.14
130 0.18
131 0.14
132 0.15
133 0.16
134 0.13
135 0.14
136 0.16
137 0.22
138 0.25
139 0.29
140 0.36
141 0.44
142 0.54
143 0.62
144 0.69
145 0.73
146 0.75
147 0.79
148 0.82
149 0.82
150 0.82
151 0.8
152 0.74
153 0.71
154 0.66
155 0.64
156 0.59
157 0.55
158 0.49
159 0.5
160 0.58
161 0.58
162 0.65
163 0.67
164 0.73
165 0.71
166 0.67
167 0.63
168 0.61
169 0.58
170 0.52
171 0.5
172 0.41
173 0.45
174 0.5
175 0.54
176 0.57
177 0.61
178 0.65
179 0.69
180 0.74
181 0.75
182 0.77
183 0.73
184 0.65
185 0.58
186 0.51
187 0.43
188 0.36
189 0.28
190 0.23
191 0.21
192 0.2
193 0.18
194 0.17
195 0.17
196 0.17
197 0.19
198 0.18
199 0.15
200 0.15
201 0.14
202 0.18
203 0.2
204 0.28
205 0.32
206 0.31
207 0.34
208 0.41
209 0.5
210 0.49
211 0.51
212 0.51
213 0.53
214 0.56
215 0.6
216 0.53
217 0.5
218 0.51
219 0.5
220 0.44
221 0.37
222 0.38
223 0.32
224 0.31
225 0.31
226 0.29
227 0.28
228 0.27
229 0.3
230 0.29
231 0.3
232 0.32
233 0.27
234 0.28
235 0.25
236 0.25
237 0.22
238 0.21
239 0.17
240 0.15
241 0.18
242 0.13
243 0.13
244 0.12
245 0.11
246 0.11
247 0.11
248 0.11
249 0.07
250 0.08
251 0.1
252 0.1
253 0.11
254 0.1
255 0.09
256 0.09
257 0.11
258 0.15
259 0.13
260 0.17
261 0.19
262 0.21
263 0.24
264 0.33
265 0.34
266 0.34
267 0.33
268 0.3
269 0.3
270 0.29
271 0.27
272 0.23
273 0.22
274 0.2
275 0.24
276 0.22
277 0.27
278 0.3
279 0.31
280 0.35
281 0.36
282 0.38
283 0.41
284 0.42
285 0.37
286 0.35
287 0.33
288 0.24
289 0.22
290 0.19
291 0.12
292 0.11
293 0.09
294 0.08
295 0.09
296 0.1
297 0.11
298 0.14
299 0.18
300 0.19
301 0.19
302 0.26
303 0.25
304 0.22
305 0.22
306 0.19
307 0.14
308 0.16
309 0.16
310 0.1
311 0.09
312 0.09
313 0.09
314 0.08
315 0.08
316 0.07
317 0.07
318 0.06
319 0.08
320 0.08
321 0.1
322 0.15
323 0.16
324 0.17
325 0.22
326 0.23
327 0.24
328 0.26
329 0.27
330 0.25
331 0.24
332 0.21
333 0.17
334 0.15
335 0.12
336 0.1
337 0.07
338 0.04
339 0.04
340 0.04
341 0.04
342 0.04
343 0.04
344 0.06
345 0.06
346 0.06
347 0.06
348 0.06
349 0.07
350 0.1
351 0.12
352 0.13
353 0.17
354 0.18
355 0.2
356 0.26
357 0.25
358 0.23
359 0.22
360 0.21
361 0.17
362 0.18
363 0.17
364 0.11
365 0.12
366 0.12
367 0.13
368 0.11
369 0.12
370 0.12
371 0.12
372 0.14
373 0.16
374 0.18
375 0.17
376 0.2
377 0.23
378 0.22
379 0.21
380 0.21
381 0.18
382 0.19
383 0.18
384 0.16
385 0.13
386 0.14
387 0.18
388 0.21
389 0.24
390 0.23
391 0.28
392 0.31
393 0.32
394 0.34
395 0.33
396 0.3
397 0.28
398 0.37
399 0.37
400 0.42
401 0.47
402 0.48
403 0.5
404 0.55
405 0.62
406 0.6
407 0.6
408 0.57
409 0.54
410 0.55
411 0.52
412 0.46
413 0.41
414 0.4
415 0.41
416 0.44
417 0.43
418 0.45
419 0.52