Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1GXZ5

Protein Details
Accession C1GXZ5    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
223-247DQTSNFSAKKKRRRTTERKFNFEWNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
231-236KKKRRR
Subcellular Location(s) cyto_nucl 13, nucl 12.5, cyto 12.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR000629  RNA-helicase_DEAD-box_CS  
IPR014014  RNA_helicase_DEAD_Q_motif  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0003724  F:RNA helicase activity  
KEGG pbl:PAAG_03278  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF00271  Helicase_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00039  DEAD_ATP_HELICASE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
PS51195  Q_MOTIF  
CDD cd17945  DEADc_DDX23  
cd18787  SF2_C_DEAD  
Amino Acid Sequences MDKIIANGYTDLSLPGPPSGPPPEPFERPPTPPPPPPESLVPPPHPDSIAPPPPPEEAPPPAPPVAKKTKVGWGSKPSATPLSVEELLRKKREADEAASKPTFLSKAQREKLALEKRAKEVENERRLKANGTTSTSSRGSEANGYAFSTSRYDATDVPSRPSIPTGPRSLRQAEIPTAPAAMRSKHNDMPPPSGPKTEQKGGKRPSPEEAQAALIRQRYMGVDQTSNFSAKKKRRRTTERKFNFEWNADEDTSPDYNPLYQNRSTTNFFGRGRLAGFGDEAADAVARNYARALEDRDPEAGSARAREILEMERRRKEEGGRHALDAHWSEKKLEHMRERDWRIFKEDFNISTKGGSVPNPMRSWAESGLPKRLLSIIDKVGYTDPSPIQRAAIPIALQNRDLIGVAVTGSGKTAAFLLPLLVYIGELPRLDEFEWRRNDGPYAIILAPTRELAQQIEIEAKKFSTPLGFNVVSIVGGHSLEEQAYSLRNGAEIIIATPGRLVDCIERRMIVLSQCCYVIMDEADRMIDLGFEEPVNKILDALPVANEKPDTEDAENPQAMSQHIGGKDRYRQTMMYTATMPSAVERIARKYLRRPAIVTIGNVGEAVDTVEQRVEFVSGEDKRKKRLAEILASREFRPPIIVFVNIKRNCDAVARDIKNMGYSSVTLHGSKTQEQREAALASVRNGNTDVLVATDLAGRGIDVPDVSLVVNFNMATNIESYTHRIGRTGRAGKSGVAITFLGNEDSDVLYDLKQMLMKSSISRVPEELRKHEAAQSKPVRGAASQKKIEESSGFSGKGGGAGW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.13
3 0.13
4 0.13
5 0.18
6 0.23
7 0.26
8 0.27
9 0.33
10 0.38
11 0.43
12 0.47
13 0.5
14 0.5
15 0.52
16 0.58
17 0.59
18 0.61
19 0.62
20 0.65
21 0.64
22 0.62
23 0.6
24 0.59
25 0.57
26 0.58
27 0.6
28 0.57
29 0.56
30 0.56
31 0.54
32 0.48
33 0.42
34 0.39
35 0.41
36 0.44
37 0.41
38 0.39
39 0.39
40 0.41
41 0.42
42 0.4
43 0.36
44 0.33
45 0.36
46 0.38
47 0.39
48 0.4
49 0.41
50 0.39
51 0.42
52 0.46
53 0.46
54 0.46
55 0.46
56 0.52
57 0.57
58 0.61
59 0.61
60 0.59
61 0.6
62 0.6
63 0.58
64 0.53
65 0.48
66 0.43
67 0.36
68 0.29
69 0.29
70 0.28
71 0.26
72 0.29
73 0.34
74 0.4
75 0.42
76 0.41
77 0.38
78 0.4
79 0.48
80 0.46
81 0.45
82 0.48
83 0.5
84 0.56
85 0.54
86 0.49
87 0.4
88 0.39
89 0.33
90 0.26
91 0.31
92 0.32
93 0.43
94 0.47
95 0.52
96 0.51
97 0.52
98 0.59
99 0.6
100 0.58
101 0.56
102 0.57
103 0.56
104 0.61
105 0.59
106 0.54
107 0.55
108 0.57
109 0.6
110 0.6
111 0.57
112 0.55
113 0.56
114 0.53
115 0.48
116 0.45
117 0.41
118 0.42
119 0.43
120 0.39
121 0.44
122 0.42
123 0.37
124 0.3
125 0.25
126 0.21
127 0.22
128 0.22
129 0.18
130 0.18
131 0.18
132 0.17
133 0.16
134 0.16
135 0.14
136 0.13
137 0.12
138 0.13
139 0.14
140 0.15
141 0.2
142 0.27
143 0.26
144 0.29
145 0.31
146 0.3
147 0.29
148 0.3
149 0.3
150 0.28
151 0.32
152 0.36
153 0.39
154 0.42
155 0.46
156 0.46
157 0.43
158 0.41
159 0.4
160 0.35
161 0.32
162 0.31
163 0.26
164 0.24
165 0.22
166 0.21
167 0.19
168 0.18
169 0.21
170 0.25
171 0.31
172 0.35
173 0.39
174 0.43
175 0.45
176 0.5
177 0.5
178 0.52
179 0.48
180 0.47
181 0.45
182 0.46
183 0.48
184 0.49
185 0.5
186 0.5
187 0.58
188 0.61
189 0.64
190 0.62
191 0.58
192 0.56
193 0.55
194 0.5
195 0.44
196 0.39
197 0.37
198 0.31
199 0.31
200 0.28
201 0.24
202 0.21
203 0.17
204 0.17
205 0.14
206 0.15
207 0.18
208 0.18
209 0.18
210 0.18
211 0.22
212 0.22
213 0.23
214 0.21
215 0.21
216 0.27
217 0.34
218 0.44
219 0.52
220 0.59
221 0.68
222 0.79
223 0.86
224 0.88
225 0.9
226 0.89
227 0.86
228 0.82
229 0.79
230 0.74
231 0.65
232 0.56
233 0.49
234 0.44
235 0.37
236 0.33
237 0.26
238 0.23
239 0.21
240 0.18
241 0.15
242 0.11
243 0.12
244 0.15
245 0.18
246 0.2
247 0.21
248 0.23
249 0.26
250 0.3
251 0.31
252 0.31
253 0.31
254 0.34
255 0.33
256 0.33
257 0.3
258 0.27
259 0.25
260 0.23
261 0.19
262 0.13
263 0.12
264 0.1
265 0.09
266 0.08
267 0.07
268 0.05
269 0.05
270 0.04
271 0.04
272 0.06
273 0.06
274 0.06
275 0.06
276 0.07
277 0.08
278 0.1
279 0.15
280 0.17
281 0.19
282 0.21
283 0.22
284 0.21
285 0.2
286 0.2
287 0.16
288 0.13
289 0.11
290 0.11
291 0.13
292 0.12
293 0.12
294 0.13
295 0.16
296 0.24
297 0.3
298 0.35
299 0.37
300 0.39
301 0.41
302 0.41
303 0.41
304 0.41
305 0.43
306 0.48
307 0.44
308 0.43
309 0.42
310 0.4
311 0.37
312 0.31
313 0.24
314 0.18
315 0.16
316 0.17
317 0.17
318 0.24
319 0.28
320 0.32
321 0.37
322 0.38
323 0.44
324 0.52
325 0.56
326 0.57
327 0.54
328 0.5
329 0.48
330 0.45
331 0.4
332 0.37
333 0.33
334 0.28
335 0.28
336 0.28
337 0.22
338 0.2
339 0.2
340 0.16
341 0.15
342 0.13
343 0.15
344 0.18
345 0.22
346 0.22
347 0.23
348 0.22
349 0.22
350 0.24
351 0.19
352 0.19
353 0.19
354 0.21
355 0.25
356 0.25
357 0.24
358 0.22
359 0.22
360 0.19
361 0.17
362 0.19
363 0.16
364 0.16
365 0.16
366 0.16
367 0.16
368 0.15
369 0.14
370 0.12
371 0.11
372 0.12
373 0.14
374 0.13
375 0.13
376 0.13
377 0.14
378 0.13
379 0.12
380 0.1
381 0.11
382 0.14
383 0.14
384 0.13
385 0.12
386 0.11
387 0.11
388 0.1
389 0.08
390 0.05
391 0.04
392 0.04
393 0.04
394 0.04
395 0.04
396 0.04
397 0.04
398 0.04
399 0.04
400 0.04
401 0.04
402 0.04
403 0.04
404 0.04
405 0.04
406 0.04
407 0.04
408 0.03
409 0.03
410 0.03
411 0.04
412 0.04
413 0.04
414 0.05
415 0.05
416 0.06
417 0.07
418 0.12
419 0.14
420 0.21
421 0.24
422 0.26
423 0.27
424 0.26
425 0.27
426 0.23
427 0.2
428 0.13
429 0.14
430 0.12
431 0.12
432 0.11
433 0.11
434 0.1
435 0.1
436 0.1
437 0.07
438 0.08
439 0.07
440 0.08
441 0.08
442 0.08
443 0.13
444 0.13
445 0.13
446 0.13
447 0.13
448 0.12
449 0.11
450 0.11
451 0.1
452 0.1
453 0.11
454 0.18
455 0.17
456 0.17
457 0.18
458 0.17
459 0.13
460 0.12
461 0.11
462 0.05
463 0.05
464 0.05
465 0.05
466 0.05
467 0.05
468 0.05
469 0.05
470 0.05
471 0.06
472 0.06
473 0.06
474 0.06
475 0.06
476 0.06
477 0.06
478 0.06
479 0.05
480 0.06
481 0.07
482 0.07
483 0.06
484 0.07
485 0.06
486 0.06
487 0.06
488 0.07
489 0.1
490 0.14
491 0.16
492 0.16
493 0.17
494 0.17
495 0.18
496 0.19
497 0.17
498 0.17
499 0.16
500 0.16
501 0.16
502 0.16
503 0.15
504 0.13
505 0.11
506 0.08
507 0.08
508 0.07
509 0.07
510 0.07
511 0.06
512 0.06
513 0.05
514 0.05
515 0.04
516 0.05
517 0.05
518 0.05
519 0.06
520 0.06
521 0.08
522 0.09
523 0.08
524 0.08
525 0.08
526 0.1
527 0.1
528 0.1
529 0.09
530 0.1
531 0.11
532 0.11
533 0.11
534 0.09
535 0.13
536 0.14
537 0.16
538 0.17
539 0.2
540 0.22
541 0.27
542 0.27
543 0.23
544 0.22
545 0.2
546 0.18
547 0.16
548 0.14
549 0.14
550 0.15
551 0.18
552 0.19
553 0.22
554 0.3
555 0.32
556 0.34
557 0.32
558 0.31
559 0.31
560 0.37
561 0.35
562 0.29
563 0.26
564 0.24
565 0.22
566 0.21
567 0.18
568 0.11
569 0.1
570 0.08
571 0.1
572 0.12
573 0.15
574 0.23
575 0.26
576 0.3
577 0.37
578 0.46
579 0.5
580 0.51
581 0.5
582 0.46
583 0.51
584 0.5
585 0.42
586 0.35
587 0.28
588 0.25
589 0.22
590 0.18
591 0.09
592 0.07
593 0.07
594 0.06
595 0.05
596 0.06
597 0.07
598 0.07
599 0.07
600 0.08
601 0.07
602 0.06
603 0.07
604 0.14
605 0.18
606 0.26
607 0.35
608 0.37
609 0.42
610 0.47
611 0.48
612 0.45
613 0.5
614 0.49
615 0.5
616 0.56
617 0.58
618 0.61
619 0.61
620 0.57
621 0.53
622 0.46
623 0.36
624 0.32
625 0.24
626 0.22
627 0.22
628 0.24
629 0.23
630 0.29
631 0.39
632 0.37
633 0.39
634 0.35
635 0.34
636 0.31
637 0.32
638 0.28
639 0.26
640 0.34
641 0.34
642 0.35
643 0.36
644 0.35
645 0.34
646 0.32
647 0.25
648 0.16
649 0.14
650 0.14
651 0.17
652 0.18
653 0.16
654 0.17
655 0.21
656 0.23
657 0.29
658 0.34
659 0.35
660 0.39
661 0.39
662 0.4
663 0.39
664 0.37
665 0.31
666 0.28
667 0.24
668 0.21
669 0.26
670 0.24
671 0.21
672 0.21
673 0.21
674 0.16
675 0.16
676 0.14
677 0.08
678 0.09
679 0.08
680 0.07
681 0.09
682 0.08
683 0.08
684 0.07
685 0.07
686 0.07
687 0.08
688 0.08
689 0.06
690 0.07
691 0.07
692 0.08
693 0.08
694 0.07
695 0.07
696 0.07
697 0.08
698 0.08
699 0.08
700 0.08
701 0.08
702 0.09
703 0.09
704 0.1
705 0.11
706 0.12
707 0.17
708 0.22
709 0.25
710 0.25
711 0.27
712 0.28
713 0.34
714 0.43
715 0.47
716 0.43
717 0.44
718 0.45
719 0.43
720 0.44
721 0.39
722 0.29
723 0.24
724 0.21
725 0.17
726 0.18
727 0.17
728 0.14
729 0.11
730 0.11
731 0.1
732 0.1
733 0.1
734 0.1
735 0.1
736 0.09
737 0.11
738 0.12
739 0.12
740 0.14
741 0.14
742 0.15
743 0.17
744 0.18
745 0.19
746 0.24
747 0.27
748 0.27
749 0.29
750 0.3
751 0.34
752 0.4
753 0.44
754 0.45
755 0.48
756 0.49
757 0.49
758 0.52
759 0.53
760 0.49
761 0.53
762 0.55
763 0.53
764 0.52
765 0.53
766 0.48
767 0.42
768 0.48
769 0.48
770 0.5
771 0.52
772 0.51
773 0.53
774 0.52
775 0.53
776 0.46
777 0.41
778 0.38
779 0.38
780 0.36
781 0.31
782 0.31
783 0.28