Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W9IWH6

Protein Details
Accession W9IWH6    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
56-78GWSRSPKRWTSTWRKRELRTELVHydrophilic
444-467AVELHSRNWRWHKKHQIWLTKDEHHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 12, cyto 4.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR038635  CCR4-NOT_su2/3/5_C_sf  
IPR040168  Not2/3/5  
IPR007282  NOT2/3/5_C  
Gene Ontology GO:0030015  C:CCR4-NOT core complex  
GO:0000289  P:nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF04153  NOT2_3_5  
Amino Acid Sequences MSSNRRGSATDTPRDAWWLWRSTATPTTRTSRNESITERKTREQQLWLGVWRGSHGWSRSPKRWTSTWRKRELRTELVGLPTCNITRPIVRIWLRHTSSELQYLSGIELFESKLVTMTRLLMQTSEFPSLSNNAQMSNPNQSSMWSTAGSRNLGGPSPRNQATPQQGGQDDMFSPTSSRGQGGFRFGNQGNIGQQTQSSSVDDFPPLNQTSNGEMGSDRTASLMSSLGFSSQAAGAGPSASNRGNGLLNALSANSRANEARSPPGIGAPGSSRPQDGKPPGLEEPRQKSSKEDAVPDDASNAADYNNADYSATNYVAQTMQKRLDTEDVIDPLEGMPASDKWGLKGLTTLMNNYPDYHAMVVGMDPNSLGLDINSQELFSTQIYSLFDDAPPRPVLSNGRFRLPDCYNVTNVQPIESKIQSFNEETLFWIFYSCTADVKQQMAAVELHSRNWRWHKKHQIWLTKDEHMTPQILSPNHERGYYVVWDTNSWRKERKELTLHYGDLDTTLGQAQVVP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.45
3 0.42
4 0.4
5 0.37
6 0.34
7 0.36
8 0.36
9 0.38
10 0.45
11 0.42
12 0.39
13 0.4
14 0.44
15 0.47
16 0.51
17 0.53
18 0.53
19 0.54
20 0.56
21 0.58
22 0.61
23 0.63
24 0.68
25 0.65
26 0.63
27 0.66
28 0.67
29 0.66
30 0.63
31 0.59
32 0.57
33 0.57
34 0.53
35 0.48
36 0.42
37 0.36
38 0.31
39 0.27
40 0.22
41 0.24
42 0.23
43 0.28
44 0.38
45 0.46
46 0.52
47 0.58
48 0.61
49 0.61
50 0.66
51 0.69
52 0.7
53 0.73
54 0.76
55 0.79
56 0.82
57 0.82
58 0.84
59 0.82
60 0.79
61 0.72
62 0.67
63 0.59
64 0.57
65 0.52
66 0.43
67 0.35
68 0.3
69 0.25
70 0.22
71 0.21
72 0.17
73 0.18
74 0.21
75 0.22
76 0.29
77 0.32
78 0.35
79 0.38
80 0.46
81 0.45
82 0.44
83 0.45
84 0.41
85 0.4
86 0.43
87 0.38
88 0.28
89 0.27
90 0.25
91 0.22
92 0.18
93 0.15
94 0.08
95 0.09
96 0.08
97 0.09
98 0.08
99 0.07
100 0.09
101 0.09
102 0.1
103 0.1
104 0.12
105 0.14
106 0.15
107 0.16
108 0.14
109 0.14
110 0.17
111 0.19
112 0.2
113 0.17
114 0.16
115 0.17
116 0.19
117 0.19
118 0.19
119 0.16
120 0.15
121 0.16
122 0.19
123 0.2
124 0.26
125 0.25
126 0.22
127 0.22
128 0.21
129 0.24
130 0.23
131 0.23
132 0.15
133 0.16
134 0.19
135 0.23
136 0.23
137 0.19
138 0.19
139 0.18
140 0.19
141 0.2
142 0.2
143 0.21
144 0.27
145 0.28
146 0.28
147 0.28
148 0.33
149 0.38
150 0.4
151 0.37
152 0.34
153 0.33
154 0.34
155 0.32
156 0.26
157 0.2
158 0.16
159 0.15
160 0.11
161 0.12
162 0.11
163 0.13
164 0.12
165 0.13
166 0.12
167 0.15
168 0.17
169 0.21
170 0.21
171 0.2
172 0.25
173 0.24
174 0.26
175 0.23
176 0.23
177 0.19
178 0.2
179 0.2
180 0.14
181 0.14
182 0.12
183 0.13
184 0.12
185 0.11
186 0.1
187 0.11
188 0.12
189 0.13
190 0.12
191 0.1
192 0.14
193 0.14
194 0.15
195 0.14
196 0.14
197 0.15
198 0.17
199 0.16
200 0.12
201 0.11
202 0.11
203 0.12
204 0.11
205 0.09
206 0.07
207 0.07
208 0.07
209 0.07
210 0.07
211 0.05
212 0.06
213 0.06
214 0.06
215 0.06
216 0.06
217 0.06
218 0.05
219 0.06
220 0.05
221 0.05
222 0.04
223 0.05
224 0.05
225 0.04
226 0.06
227 0.06
228 0.07
229 0.07
230 0.08
231 0.08
232 0.08
233 0.09
234 0.07
235 0.07
236 0.07
237 0.07
238 0.06
239 0.06
240 0.06
241 0.05
242 0.06
243 0.06
244 0.08
245 0.09
246 0.11
247 0.13
248 0.13
249 0.14
250 0.13
251 0.13
252 0.13
253 0.11
254 0.1
255 0.09
256 0.12
257 0.13
258 0.13
259 0.13
260 0.14
261 0.16
262 0.21
263 0.22
264 0.23
265 0.22
266 0.25
267 0.28
268 0.3
269 0.33
270 0.33
271 0.37
272 0.39
273 0.4
274 0.37
275 0.37
276 0.38
277 0.42
278 0.37
279 0.34
280 0.3
281 0.33
282 0.34
283 0.3
284 0.26
285 0.18
286 0.16
287 0.13
288 0.11
289 0.06
290 0.06
291 0.06
292 0.07
293 0.07
294 0.07
295 0.07
296 0.07
297 0.09
298 0.1
299 0.11
300 0.1
301 0.09
302 0.1
303 0.12
304 0.14
305 0.14
306 0.15
307 0.17
308 0.18
309 0.19
310 0.2
311 0.22
312 0.2
313 0.21
314 0.2
315 0.18
316 0.18
317 0.17
318 0.15
319 0.12
320 0.12
321 0.08
322 0.06
323 0.06
324 0.05
325 0.09
326 0.12
327 0.12
328 0.12
329 0.17
330 0.17
331 0.16
332 0.17
333 0.16
334 0.18
335 0.18
336 0.2
337 0.18
338 0.21
339 0.22
340 0.21
341 0.21
342 0.17
343 0.17
344 0.15
345 0.13
346 0.09
347 0.09
348 0.08
349 0.09
350 0.09
351 0.07
352 0.07
353 0.07
354 0.07
355 0.07
356 0.06
357 0.04
358 0.06
359 0.06
360 0.08
361 0.08
362 0.08
363 0.08
364 0.08
365 0.1
366 0.08
367 0.1
368 0.08
369 0.11
370 0.12
371 0.13
372 0.14
373 0.13
374 0.14
375 0.16
376 0.17
377 0.18
378 0.18
379 0.18
380 0.17
381 0.19
382 0.26
383 0.29
384 0.38
385 0.36
386 0.41
387 0.41
388 0.41
389 0.46
390 0.41
391 0.42
392 0.38
393 0.4
394 0.37
395 0.37
396 0.38
397 0.35
398 0.33
399 0.28
400 0.23
401 0.22
402 0.25
403 0.25
404 0.25
405 0.23
406 0.25
407 0.26
408 0.25
409 0.25
410 0.22
411 0.21
412 0.21
413 0.2
414 0.19
415 0.15
416 0.14
417 0.12
418 0.12
419 0.16
420 0.14
421 0.14
422 0.15
423 0.19
424 0.21
425 0.23
426 0.22
427 0.2
428 0.2
429 0.19
430 0.19
431 0.17
432 0.22
433 0.21
434 0.23
435 0.27
436 0.28
437 0.34
438 0.44
439 0.53
440 0.53
441 0.63
442 0.71
443 0.75
444 0.84
445 0.86
446 0.86
447 0.81
448 0.82
449 0.77
450 0.73
451 0.66
452 0.58
453 0.53
454 0.45
455 0.4
456 0.32
457 0.3
458 0.29
459 0.29
460 0.3
461 0.32
462 0.37
463 0.37
464 0.37
465 0.33
466 0.29
467 0.32
468 0.31
469 0.29
470 0.25
471 0.24
472 0.26
473 0.3
474 0.37
475 0.37
476 0.39
477 0.43
478 0.43
479 0.52
480 0.57
481 0.62
482 0.63
483 0.65
484 0.69
485 0.69
486 0.65
487 0.58
488 0.51
489 0.41
490 0.32
491 0.26
492 0.17
493 0.11
494 0.11
495 0.09