FuNGI

C1HCG9

Protein Details

Accession

C1HCG9

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
17-41	ASRSPGSQRHHPHPQLHRQSSRHFD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 26.5, cyto_nucl 14

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR034186 PIN4-like_RRM IPR034069 R3H_Cip2 IPR001374 R3H_dom IPR036867 R3H_dom_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding
KEGG	pbl:PAAG_08460 -
Pfam	View protein in Pfam PF01424 R3H PF00076 RRM_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS51061 R3H PS50102 RRM
CDD	cd02639 R3H_RRM cd12253 RRM_PIN4_like

Amino Acid Sequences

MSNYHPQSQDMYHDNPASRSPGSQRHHPHPQLHRQSSRHFDVFGPMSAGMYDDPMARYDSVRLDRMNPSLHGNSYTYDLSGSQTWNSSGFGSANTLSVGPGTGTSTGRLKPAARGRTGLPATWLDQQPGLAGPFSLGPTNHLQTNQMRPENLSPEGDDELIPTAIVIKNIPFAVKKEQLVQLMTEMNLPLPYAFNYHFDNGVFRGLAFANFTSAEETATVIEVLNHFELQGRKLRVEYKKMLPLQERERIEREKRERRGQLEEQHRPMPNSQLNSQPSLTSLTSHIPVTSPSPVSQRGTELKVNMNEPETLKYYSQLLLFKQDSSREALIFSAKLSPLQRRTVHTLAHNMGLGHASRGTGDQRQVHVFRATDPNVSPPGPANPATIQTADTSRRGLNRAATIDFSEARGDALGPFNTLRGHHSGFLSVLDSPGGFGNAQNLRAAKSFADLRSYTPSPVPSSASFPAALQSNGTRFQPFDGNTSGASNTPILTPTLSGSTIGGQRDDNLLANTLGGLSLGTGIGGPTSGSPRRLRGMFSWEQQDSQPSTTGPIGSNRSIGLGFDTQLSQERLPLRQPRGPAPERGSGFRRQNGHQTRGSDELRSGSNVEIIVE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.4
2	0.38
3	0.38
4	0.36
5	0.32
6	0.32
7	0.33
8	0.38
9	0.42
10	0.5
11	0.55
12	0.6
13	0.7
14	0.73
15	0.76
16	0.76
17	0.82
18	0.83
19	0.85
20	0.85
21	0.79
22	0.81
23	0.79
24	0.77
25	0.68
26	0.59
27	0.5
28	0.48
29	0.45
30	0.38
31	0.32
32	0.24
33	0.22
34	0.2
35	0.2
36	0.13
37	0.11
38	0.11
39	0.1
40	0.1
41	0.11
42	0.14
43	0.13
44	0.14
45	0.16
46	0.23
47	0.25
48	0.29
49	0.29
50	0.32
51	0.36
52	0.39
53	0.39
54	0.33
55	0.35
56	0.34
57	0.34
58	0.33
59	0.29
60	0.26
61	0.26
62	0.25
63	0.19
64	0.16
65	0.15
66	0.15
67	0.16
68	0.17
69	0.14
70	0.15
71	0.16
72	0.16
73	0.17
74	0.15
75	0.14
76	0.13
77	0.12
78	0.14
79	0.13
80	0.13
81	0.12
82	0.12
83	0.1
84	0.1
85	0.09
86	0.06
87	0.06
88	0.07
89	0.09
90	0.1
91	0.12
92	0.16
93	0.17
94	0.18
95	0.21
96	0.21
97	0.27
98	0.35
99	0.4
100	0.39
101	0.4
102	0.4
103	0.46
104	0.47
105	0.39
106	0.33
107	0.28
108	0.28
109	0.33
110	0.32
111	0.24
112	0.23
113	0.22
114	0.2
115	0.19
116	0.17
117	0.1
118	0.09
119	0.08
120	0.09
121	0.1
122	0.11
123	0.09
124	0.12
125	0.17
126	0.19
127	0.2
128	0.19
129	0.22
130	0.25
131	0.34
132	0.39
133	0.37
134	0.36
135	0.36
136	0.4
137	0.4
138	0.38
139	0.3
140	0.23
141	0.23
142	0.23
143	0.21
144	0.17
145	0.13
146	0.12
147	0.11
148	0.1
149	0.07
150	0.09
151	0.09
152	0.09
153	0.09
154	0.08
155	0.1
156	0.11
157	0.13
158	0.11
159	0.14
160	0.21
161	0.25
162	0.25
163	0.28
164	0.32
165	0.33
166	0.32
167	0.3
168	0.24
169	0.21
170	0.2
171	0.16
172	0.12
173	0.1
174	0.09
175	0.09
176	0.07
177	0.07
178	0.07
179	0.09
180	0.1
181	0.12
182	0.14
183	0.15
184	0.16
185	0.15
186	0.17
187	0.15
188	0.15
189	0.12
190	0.1
191	0.1
192	0.1
193	0.1
194	0.09
195	0.08
196	0.08
197	0.09
198	0.09
199	0.09
200	0.09
201	0.09
202	0.07
203	0.08
204	0.07
205	0.07
206	0.07
207	0.05
208	0.06
209	0.06
210	0.07
211	0.07
212	0.07
213	0.07
214	0.1
215	0.11
216	0.12
217	0.19
218	0.18
219	0.18
220	0.21
221	0.29
222	0.31
223	0.37
224	0.41
225	0.4
226	0.47
227	0.49
228	0.52
229	0.48
230	0.49
231	0.48
232	0.5
233	0.47
234	0.42
235	0.45
236	0.46
237	0.47
238	0.5
239	0.54
240	0.56
241	0.61
242	0.66
243	0.67
244	0.65
245	0.68
246	0.66
247	0.64
248	0.65
249	0.65
250	0.59
251	0.59
252	0.55
253	0.48
254	0.43
255	0.41
256	0.34
257	0.3
258	0.28
259	0.31
260	0.31
261	0.32
262	0.32
263	0.24
264	0.22
265	0.22
266	0.2
267	0.14
268	0.13
269	0.12
270	0.13
271	0.13
272	0.12
273	0.09
274	0.1
275	0.11
276	0.12
277	0.11
278	0.11
279	0.14
280	0.16
281	0.17
282	0.17
283	0.18
284	0.19
285	0.22
286	0.22
287	0.21
288	0.23
289	0.23
290	0.23
291	0.21
292	0.19
293	0.17
294	0.16
295	0.16
296	0.15
297	0.15
298	0.14
299	0.14
300	0.14
301	0.14
302	0.16
303	0.15
304	0.13
305	0.17
306	0.18
307	0.18
308	0.18
309	0.18
310	0.17
311	0.19
312	0.19
313	0.14
314	0.14
315	0.13
316	0.13
317	0.12
318	0.11
319	0.09
320	0.08
321	0.11
322	0.12
323	0.17
324	0.2
325	0.27
326	0.29
327	0.31
328	0.38
329	0.38
330	0.39
331	0.36
332	0.37
333	0.32
334	0.3
335	0.27
336	0.2
337	0.17
338	0.16
339	0.13
340	0.08
341	0.07
342	0.06
343	0.06
344	0.07
345	0.09
346	0.11
347	0.14
348	0.17
349	0.19
350	0.23
351	0.24
352	0.25
353	0.26
354	0.23
355	0.23
356	0.27
357	0.26
358	0.24
359	0.23
360	0.23
361	0.23
362	0.23
363	0.21
364	0.15
365	0.17
366	0.17
367	0.18
368	0.17
369	0.15
370	0.17
371	0.18
372	0.17
373	0.15
374	0.14
375	0.16
376	0.16
377	0.16
378	0.17
379	0.17
380	0.19
381	0.21
382	0.22
383	0.22
384	0.24
385	0.25
386	0.24
387	0.23
388	0.22
389	0.22
390	0.2
391	0.17
392	0.13
393	0.11
394	0.1
395	0.09
396	0.08
397	0.07
398	0.1
399	0.09
400	0.1
401	0.1
402	0.1
403	0.11
404	0.12
405	0.13
406	0.15
407	0.17
408	0.18
409	0.18
410	0.18
411	0.17
412	0.17
413	0.16
414	0.11
415	0.09
416	0.08
417	0.07
418	0.07
419	0.06
420	0.07
421	0.06
422	0.06
423	0.12
424	0.14
425	0.15
426	0.16
427	0.16
428	0.17
429	0.18
430	0.19
431	0.13
432	0.14
433	0.18
434	0.17
435	0.22
436	0.21
437	0.23
438	0.29
439	0.3
440	0.28
441	0.26
442	0.27
443	0.25
444	0.26
445	0.27
446	0.21
447	0.25
448	0.25
449	0.25
450	0.23
451	0.2
452	0.2
453	0.18
454	0.17
455	0.13
456	0.14
457	0.15
458	0.17
459	0.18
460	0.17
461	0.16
462	0.18
463	0.22
464	0.21
465	0.22
466	0.23
467	0.23
468	0.23
469	0.24
470	0.22
471	0.17
472	0.17
473	0.13
474	0.11
475	0.11
476	0.11
477	0.1
478	0.1
479	0.1
480	0.1
481	0.11
482	0.11
483	0.11
484	0.11
485	0.13
486	0.16
487	0.16
488	0.16
489	0.14
490	0.15
491	0.17
492	0.18
493	0.16
494	0.14
495	0.15
496	0.13
497	0.13
498	0.12
499	0.09
500	0.08
501	0.06
502	0.05
503	0.03
504	0.04
505	0.04
506	0.04
507	0.04
508	0.04
509	0.04
510	0.04
511	0.04
512	0.05
513	0.11
514	0.14
515	0.19
516	0.22
517	0.27
518	0.33
519	0.34
520	0.37
521	0.35
522	0.41
523	0.42
524	0.44
525	0.48
526	0.43
527	0.43
528	0.4
529	0.42
530	0.36
531	0.32
532	0.29
533	0.21
534	0.24
535	0.24
536	0.24
537	0.21
538	0.24
539	0.27
540	0.27
541	0.28
542	0.25
543	0.25
544	0.23
545	0.21
546	0.19
547	0.15
548	0.14
549	0.15
550	0.15
551	0.14
552	0.19
553	0.22
554	0.18
555	0.22
556	0.25
557	0.26
558	0.34
559	0.42
560	0.44
561	0.45
562	0.5
563	0.53
564	0.6
565	0.61
566	0.61
567	0.58
568	0.6
569	0.59
570	0.6
571	0.56
572	0.55
573	0.59
574	0.57
575	0.57
576	0.53
577	0.6
578	0.63
579	0.66
580	0.62
581	0.57
582	0.56
583	0.58
584	0.56
585	0.47
586	0.4
587	0.36
588	0.33
589	0.32
590	0.29
591	0.21
592	0.22

C1HCG9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer