Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1HAD5

Protein Details
Accession C1HAD5    Localization Confidence Low Confidence Score 8.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
232-254DSELRTASRYQKKARNKACCLLLHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 12, cyto_nucl 10.5, cyto 7, mito 4, plas 1, pero 1, cysk 1, vacu 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010989  SNARE  
IPR045242  Syntaxin  
IPR006012  Syntaxin/epimorphin_CS  
IPR006011  Syntaxin_N  
IPR000727  T_SNARE_dom  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0005484  F:SNAP receptor activity  
GO:0006886  P:intracellular protein transport  
GO:0016192  P:vesicle-mediated transport  
KEGG pbl:PAAG_07589  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05739  SNARE  
PF14523  Syntaxin_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00914  SYNTAXIN  
PS50192  T_SNARE  
CDD cd15840  SNARE_Qa  
Amino Acid Sequences MSFDRLSALEAQPTRRQDESHYQDDPDFQRLTESLSNRLFTLTSNISRLSNQISLLGTKRDTERVRERVHDLLEETREGFREVGEGIKQVQMWDDVNPSQKWTQQKLSSEFKSTLEEFQSVQRRALEKQRASATAARTALEEDGGVPHSPTEGQSLQQLQERQPRLASQAEVDFQESLIIEREAEIRNIEQSVGELNELFRDVAHIVHEQGGQLDLISENVERTRDDTRGADSELRTASRYQKKARNKACCLLLILAVVLVIIVLAATLA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.38
3 0.38
4 0.38
5 0.47
6 0.49
7 0.48
8 0.47
9 0.44
10 0.44
11 0.49
12 0.44
13 0.38
14 0.32
15 0.25
16 0.25
17 0.24
18 0.28
19 0.28
20 0.27
21 0.29
22 0.31
23 0.32
24 0.3
25 0.31
26 0.25
27 0.2
28 0.24
29 0.22
30 0.21
31 0.23
32 0.24
33 0.24
34 0.24
35 0.25
36 0.24
37 0.2
38 0.18
39 0.18
40 0.18
41 0.19
42 0.21
43 0.22
44 0.18
45 0.19
46 0.2
47 0.26
48 0.27
49 0.33
50 0.4
51 0.45
52 0.49
53 0.51
54 0.52
55 0.49
56 0.48
57 0.42
58 0.35
59 0.31
60 0.28
61 0.25
62 0.22
63 0.18
64 0.18
65 0.17
66 0.15
67 0.1
68 0.1
69 0.09
70 0.1
71 0.1
72 0.1
73 0.1
74 0.11
75 0.11
76 0.1
77 0.11
78 0.1
79 0.11
80 0.11
81 0.12
82 0.13
83 0.18
84 0.18
85 0.2
86 0.19
87 0.22
88 0.27
89 0.3
90 0.35
91 0.35
92 0.41
93 0.44
94 0.5
95 0.49
96 0.46
97 0.43
98 0.37
99 0.35
100 0.3
101 0.26
102 0.2
103 0.19
104 0.16
105 0.21
106 0.28
107 0.25
108 0.25
109 0.26
110 0.26
111 0.27
112 0.35
113 0.38
114 0.31
115 0.35
116 0.36
117 0.34
118 0.35
119 0.37
120 0.3
121 0.26
122 0.25
123 0.2
124 0.18
125 0.18
126 0.15
127 0.11
128 0.09
129 0.05
130 0.05
131 0.06
132 0.06
133 0.05
134 0.05
135 0.05
136 0.06
137 0.06
138 0.09
139 0.09
140 0.09
141 0.12
142 0.13
143 0.14
144 0.18
145 0.19
146 0.19
147 0.26
148 0.28
149 0.26
150 0.26
151 0.25
152 0.25
153 0.25
154 0.22
155 0.16
156 0.16
157 0.16
158 0.16
159 0.16
160 0.13
161 0.1
162 0.1
163 0.09
164 0.07
165 0.08
166 0.07
167 0.06
168 0.07
169 0.1
170 0.1
171 0.11
172 0.11
173 0.1
174 0.11
175 0.12
176 0.11
177 0.08
178 0.08
179 0.09
180 0.08
181 0.08
182 0.07
183 0.07
184 0.07
185 0.08
186 0.08
187 0.06
188 0.07
189 0.07
190 0.08
191 0.1
192 0.1
193 0.1
194 0.13
195 0.13
196 0.11
197 0.11
198 0.12
199 0.09
200 0.08
201 0.08
202 0.06
203 0.06
204 0.07
205 0.06
206 0.07
207 0.08
208 0.1
209 0.09
210 0.12
211 0.15
212 0.16
213 0.18
214 0.19
215 0.22
216 0.24
217 0.27
218 0.29
219 0.26
220 0.29
221 0.29
222 0.28
223 0.25
224 0.25
225 0.32
226 0.37
227 0.45
228 0.49
229 0.56
230 0.66
231 0.75
232 0.83
233 0.83
234 0.81
235 0.81
236 0.78
237 0.71
238 0.64
239 0.55
240 0.46
241 0.35
242 0.28
243 0.2
244 0.14
245 0.11
246 0.07
247 0.05
248 0.03
249 0.02
250 0.02