Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1H4U6

Protein Details
Accession C1H4U6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
22-45DDLGYPRSTPKKWRHRMETSGGVSHydrophilic
127-149AKTETNTSSRKRQRQLKEYGELSHydrophilic
941-963HGGKRVRFKYHPPEDVKRRQFCSBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 14, cyto_nucl 11, cyto 6, pero 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR029256  Heliccase-ass-bd  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR038718  SNF2-like_sf  
IPR000330  SNF2_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0140658  F:ATP-dependent chromatin remodeler activity  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
KEGG pbl:PAAG_05786  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00271  Helicase_C  
PF00176  SNF2-rel_dom  
PF14773  VIGSSK  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
CDD cd18005  DEXHc_ERCC6L2  
cd18793  SF2_C_SNF  
Amino Acid Sequences MVSKWELEDSDATTQSGDASDDDLGYPRSTPKKWRHRMETSGGVSSSEQPGLGRKACSAKNPIAVSVNQEIISLSDDEFSDIKDFDDGAAAYEKFKNRKSLQRKQAAAITRRAKGVTQNPIVGKRPAKTETNTSSRKRQRQLKEYGELSSDDDMMGHILPNYIQNRRSAFDKKTVLLKEAGLKLPPNFDDVEFSDDEHLEDLKEKPDFQKATPSRNYEDIQLPYSLGLIPAPIAQWLRDYQVRGVEFLHELFVYQKGGILGDDMGLGKSVQVIAFLTAAYGKTGDERDAKRMRKMRRTGDGVWYPRTLIVCPGTLLQNWKSELDRWGWWHVEVYHGAGKEAALQSAASGRVEIMLTTYKTYVLNKGALNMVEWDCVVADECHIIKERKSETAQSMNEINALCRIGLTGTAIQNKYEELWTLLNWTNPGKFGPVSTWKSTICDPLKLGQSHDATMYQLSKARKTAKKLANNLLPPFFLRRMKTLIADQLPKKSDRVVFCPLTPTQADAYERVLDSDIIKYIKMSSDPCSCGSRKKSGWCCRMYLPQGGKWQSYVFPAISNLQKLSNHLAILIPQSQDPSEKQDKDLEMLQIAVPDQWRQLYATRDSILNYANHEFCGKWKVLKKLLKWWHGNGDKVLVFSHSVRLLKMLQMLFKHTSYNVSYLDGSMTYDNRAKAVDNFNADPREFVFLISTRAGGIGLNITSANKVVVVDPNWNPAFDLQAQDRAYRIGQSRDVEVFRLISAGTIEEIVYARQIYKQQQANIGYTASTERRYFKGIQEKKGRRGEIFGLSNMFQYQGDNIVLRDIVNKTNVAESKVGVKIVELELDDTNDGLNKEPFPSPNDEENDDAMSQLAAMIRGEEVGDRNENKMNVIQAKHDPIQAILAGAGVEYTHENSEVIGSSKIEERLSRRAEMAADGASFGEEQVFQGSQDDVSSGFDVTHGGKRVRFKYHPPEDVKRRQFCSMAKRFGFDSLTEFALVVEGMTQAQRRGYLTKWYRECQSILMSGTNTPVMEEDVSLLNSIPKQQTPG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.17
3 0.16
4 0.13
5 0.09
6 0.1
7 0.1
8 0.11
9 0.11
10 0.13
11 0.14
12 0.14
13 0.14
14 0.2
15 0.27
16 0.31
17 0.4
18 0.49
19 0.58
20 0.68
21 0.77
22 0.8
23 0.82
24 0.86
25 0.85
26 0.84
27 0.77
28 0.71
29 0.61
30 0.52
31 0.44
32 0.39
33 0.34
34 0.24
35 0.2
36 0.16
37 0.21
38 0.25
39 0.27
40 0.25
41 0.27
42 0.34
43 0.37
44 0.44
45 0.46
46 0.46
47 0.5
48 0.5
49 0.49
50 0.45
51 0.43
52 0.41
53 0.38
54 0.34
55 0.26
56 0.25
57 0.22
58 0.18
59 0.2
60 0.15
61 0.12
62 0.11
63 0.11
64 0.13
65 0.13
66 0.14
67 0.13
68 0.13
69 0.13
70 0.12
71 0.12
72 0.1
73 0.13
74 0.11
75 0.11
76 0.16
77 0.15
78 0.17
79 0.22
80 0.28
81 0.31
82 0.35
83 0.43
84 0.46
85 0.56
86 0.64
87 0.7
88 0.75
89 0.79
90 0.79
91 0.74
92 0.74
93 0.72
94 0.67
95 0.66
96 0.62
97 0.55
98 0.53
99 0.5
100 0.44
101 0.44
102 0.47
103 0.47
104 0.45
105 0.48
106 0.49
107 0.54
108 0.56
109 0.54
110 0.5
111 0.43
112 0.45
113 0.43
114 0.45
115 0.43
116 0.49
117 0.51
118 0.55
119 0.61
120 0.6
121 0.66
122 0.71
123 0.76
124 0.77
125 0.79
126 0.8
127 0.81
128 0.86
129 0.84
130 0.82
131 0.74
132 0.67
133 0.59
134 0.49
135 0.42
136 0.33
137 0.24
138 0.16
139 0.14
140 0.12
141 0.11
142 0.1
143 0.07
144 0.06
145 0.07
146 0.07
147 0.14
148 0.18
149 0.21
150 0.23
151 0.27
152 0.3
153 0.32
154 0.37
155 0.38
156 0.38
157 0.43
158 0.46
159 0.44
160 0.49
161 0.49
162 0.46
163 0.41
164 0.38
165 0.36
166 0.36
167 0.36
168 0.29
169 0.3
170 0.29
171 0.31
172 0.3
173 0.25
174 0.21
175 0.2
176 0.22
177 0.21
178 0.24
179 0.2
180 0.2
181 0.2
182 0.19
183 0.18
184 0.15
185 0.14
186 0.09
187 0.12
188 0.12
189 0.14
190 0.15
191 0.17
192 0.18
193 0.27
194 0.29
195 0.28
196 0.37
197 0.38
198 0.46
199 0.52
200 0.54
201 0.49
202 0.52
203 0.52
204 0.45
205 0.46
206 0.4
207 0.35
208 0.3
209 0.27
210 0.21
211 0.21
212 0.16
213 0.11
214 0.08
215 0.06
216 0.06
217 0.06
218 0.06
219 0.08
220 0.08
221 0.08
222 0.1
223 0.11
224 0.15
225 0.17
226 0.19
227 0.19
228 0.25
229 0.25
230 0.24
231 0.23
232 0.21
233 0.2
234 0.18
235 0.17
236 0.1
237 0.1
238 0.1
239 0.11
240 0.1
241 0.09
242 0.1
243 0.09
244 0.09
245 0.09
246 0.09
247 0.08
248 0.07
249 0.08
250 0.06
251 0.06
252 0.06
253 0.06
254 0.05
255 0.05
256 0.06
257 0.05
258 0.05
259 0.06
260 0.06
261 0.06
262 0.06
263 0.06
264 0.06
265 0.06
266 0.06
267 0.06
268 0.05
269 0.08
270 0.09
271 0.12
272 0.18
273 0.2
274 0.29
275 0.37
276 0.4
277 0.46
278 0.53
279 0.59
280 0.62
281 0.69
282 0.69
283 0.69
284 0.73
285 0.68
286 0.7
287 0.69
288 0.63
289 0.57
290 0.49
291 0.41
292 0.36
293 0.33
294 0.24
295 0.19
296 0.17
297 0.14
298 0.14
299 0.15
300 0.15
301 0.15
302 0.19
303 0.18
304 0.2
305 0.21
306 0.21
307 0.21
308 0.22
309 0.24
310 0.23
311 0.23
312 0.23
313 0.25
314 0.25
315 0.24
316 0.24
317 0.21
318 0.21
319 0.18
320 0.18
321 0.17
322 0.16
323 0.16
324 0.14
325 0.13
326 0.15
327 0.15
328 0.12
329 0.09
330 0.09
331 0.09
332 0.11
333 0.12
334 0.07
335 0.07
336 0.06
337 0.07
338 0.07
339 0.07
340 0.06
341 0.09
342 0.09
343 0.1
344 0.11
345 0.11
346 0.12
347 0.14
348 0.16
349 0.16
350 0.19
351 0.18
352 0.2
353 0.2
354 0.19
355 0.18
356 0.17
357 0.15
358 0.12
359 0.11
360 0.1
361 0.08
362 0.08
363 0.08
364 0.05
365 0.05
366 0.07
367 0.07
368 0.08
369 0.11
370 0.12
371 0.12
372 0.19
373 0.21
374 0.24
375 0.26
376 0.29
377 0.3
378 0.37
379 0.37
380 0.32
381 0.32
382 0.26
383 0.27
384 0.23
385 0.19
386 0.12
387 0.12
388 0.09
389 0.08
390 0.08
391 0.05
392 0.06
393 0.07
394 0.08
395 0.11
396 0.16
397 0.16
398 0.16
399 0.16
400 0.16
401 0.16
402 0.13
403 0.11
404 0.08
405 0.09
406 0.09
407 0.13
408 0.14
409 0.13
410 0.14
411 0.15
412 0.13
413 0.13
414 0.14
415 0.11
416 0.1
417 0.1
418 0.13
419 0.2
420 0.24
421 0.25
422 0.28
423 0.26
424 0.28
425 0.29
426 0.33
427 0.26
428 0.24
429 0.23
430 0.25
431 0.3
432 0.29
433 0.29
434 0.27
435 0.26
436 0.24
437 0.24
438 0.2
439 0.15
440 0.15
441 0.15
442 0.09
443 0.13
444 0.13
445 0.15
446 0.19
447 0.27
448 0.3
449 0.36
450 0.45
451 0.49
452 0.56
453 0.61
454 0.64
455 0.62
456 0.62
457 0.58
458 0.49
459 0.4
460 0.33
461 0.3
462 0.26
463 0.23
464 0.2
465 0.21
466 0.23
467 0.24
468 0.25
469 0.23
470 0.25
471 0.25
472 0.29
473 0.28
474 0.29
475 0.3
476 0.29
477 0.28
478 0.26
479 0.27
480 0.24
481 0.28
482 0.3
483 0.29
484 0.28
485 0.31
486 0.28
487 0.26
488 0.23
489 0.19
490 0.14
491 0.15
492 0.15
493 0.13
494 0.14
495 0.13
496 0.13
497 0.12
498 0.11
499 0.09
500 0.09
501 0.09
502 0.09
503 0.08
504 0.08
505 0.07
506 0.08
507 0.08
508 0.09
509 0.1
510 0.12
511 0.17
512 0.19
513 0.2
514 0.24
515 0.24
516 0.29
517 0.31
518 0.35
519 0.33
520 0.41
521 0.49
522 0.55
523 0.62
524 0.58
525 0.57
526 0.53
527 0.56
528 0.5
529 0.47
530 0.4
531 0.36
532 0.41
533 0.4
534 0.37
535 0.31
536 0.29
537 0.23
538 0.21
539 0.18
540 0.12
541 0.1
542 0.11
543 0.13
544 0.14
545 0.14
546 0.13
547 0.13
548 0.13
549 0.15
550 0.18
551 0.16
552 0.15
553 0.14
554 0.13
555 0.12
556 0.14
557 0.14
558 0.11
559 0.09
560 0.1
561 0.1
562 0.12
563 0.11
564 0.17
565 0.22
566 0.22
567 0.24
568 0.28
569 0.28
570 0.28
571 0.3
572 0.23
573 0.16
574 0.16
575 0.14
576 0.1
577 0.1
578 0.09
579 0.07
580 0.07
581 0.07
582 0.07
583 0.07
584 0.08
585 0.11
586 0.14
587 0.17
588 0.19
589 0.19
590 0.19
591 0.2
592 0.2
593 0.19
594 0.16
595 0.16
596 0.16
597 0.15
598 0.15
599 0.15
600 0.13
601 0.13
602 0.16
603 0.14
604 0.17
605 0.22
606 0.28
607 0.37
608 0.43
609 0.44
610 0.51
611 0.59
612 0.62
613 0.6
614 0.56
615 0.57
616 0.55
617 0.54
618 0.44
619 0.4
620 0.32
621 0.28
622 0.25
623 0.16
624 0.14
625 0.13
626 0.15
627 0.14
628 0.14
629 0.13
630 0.15
631 0.15
632 0.15
633 0.19
634 0.17
635 0.17
636 0.17
637 0.21
638 0.22
639 0.21
640 0.21
641 0.17
642 0.19
643 0.18
644 0.2
645 0.17
646 0.16
647 0.15
648 0.15
649 0.15
650 0.11
651 0.11
652 0.09
653 0.09
654 0.1
655 0.13
656 0.13
657 0.13
658 0.13
659 0.13
660 0.17
661 0.22
662 0.23
663 0.23
664 0.25
665 0.28
666 0.3
667 0.29
668 0.25
669 0.2
670 0.21
671 0.17
672 0.16
673 0.14
674 0.13
675 0.16
676 0.15
677 0.15
678 0.1
679 0.1
680 0.1
681 0.08
682 0.07
683 0.06
684 0.05
685 0.06
686 0.06
687 0.06
688 0.06
689 0.07
690 0.06
691 0.05
692 0.06
693 0.06
694 0.1
695 0.11
696 0.16
697 0.17
698 0.24
699 0.24
700 0.23
701 0.22
702 0.19
703 0.21
704 0.17
705 0.19
706 0.14
707 0.2
708 0.21
709 0.21
710 0.21
711 0.2
712 0.19
713 0.2
714 0.22
715 0.19
716 0.23
717 0.24
718 0.26
719 0.28
720 0.29
721 0.25
722 0.23
723 0.2
724 0.15
725 0.14
726 0.11
727 0.08
728 0.07
729 0.06
730 0.06
731 0.05
732 0.05
733 0.06
734 0.06
735 0.06
736 0.06
737 0.06
738 0.07
739 0.09
740 0.13
741 0.17
742 0.25
743 0.3
744 0.32
745 0.38
746 0.41
747 0.4
748 0.37
749 0.33
750 0.25
751 0.21
752 0.22
753 0.17
754 0.17
755 0.17
756 0.19
757 0.21
758 0.25
759 0.27
760 0.31
761 0.4
762 0.44
763 0.52
764 0.6
765 0.66
766 0.71
767 0.76
768 0.72
769 0.61
770 0.59
771 0.54
772 0.51
773 0.46
774 0.38
775 0.32
776 0.3
777 0.29
778 0.25
779 0.21
780 0.13
781 0.11
782 0.1
783 0.1
784 0.11
785 0.11
786 0.1
787 0.11
788 0.11
789 0.1
790 0.13
791 0.13
792 0.14
793 0.15
794 0.16
795 0.16
796 0.21
797 0.23
798 0.22
799 0.21
800 0.19
801 0.23
802 0.24
803 0.23
804 0.17
805 0.16
806 0.16
807 0.16
808 0.17
809 0.12
810 0.12
811 0.12
812 0.13
813 0.13
814 0.1
815 0.1
816 0.1
817 0.1
818 0.1
819 0.12
820 0.12
821 0.14
822 0.17
823 0.19
824 0.21
825 0.28
826 0.31
827 0.36
828 0.39
829 0.39
830 0.38
831 0.38
832 0.36
833 0.29
834 0.24
835 0.16
836 0.12
837 0.1
838 0.09
839 0.08
840 0.06
841 0.06
842 0.06
843 0.06
844 0.06
845 0.07
846 0.07
847 0.08
848 0.11
849 0.16
850 0.17
851 0.19
852 0.23
853 0.23
854 0.24
855 0.25
856 0.27
857 0.28
858 0.28
859 0.3
860 0.31
861 0.38
862 0.38
863 0.37
864 0.32
865 0.27
866 0.28
867 0.23
868 0.18
869 0.12
870 0.1
871 0.08
872 0.07
873 0.06
874 0.04
875 0.05
876 0.05
877 0.07
878 0.07
879 0.08
880 0.08
881 0.09
882 0.1
883 0.1
884 0.11
885 0.11
886 0.1
887 0.12
888 0.16
889 0.18
890 0.19
891 0.22
892 0.25
893 0.33
894 0.37
895 0.37
896 0.35
897 0.34
898 0.34
899 0.31
900 0.28
901 0.2
902 0.16
903 0.15
904 0.13
905 0.12
906 0.1
907 0.09
908 0.08
909 0.06
910 0.06
911 0.09
912 0.09
913 0.09
914 0.1
915 0.11
916 0.1
917 0.1
918 0.1
919 0.08
920 0.1
921 0.11
922 0.09
923 0.09
924 0.08
925 0.1
926 0.13
927 0.18
928 0.2
929 0.22
930 0.26
931 0.35
932 0.41
933 0.49
934 0.51
935 0.55
936 0.62
937 0.69
938 0.75
939 0.75
940 0.79
941 0.8
942 0.86
943 0.86
944 0.83
945 0.78
946 0.73
947 0.71
948 0.68
949 0.68
950 0.67
951 0.67
952 0.61
953 0.59
954 0.55
955 0.53
956 0.48
957 0.38
958 0.33
959 0.25
960 0.25
961 0.22
962 0.21
963 0.16
964 0.14
965 0.13
966 0.08
967 0.06
968 0.05
969 0.06
970 0.08
971 0.1
972 0.11
973 0.13
974 0.15
975 0.17
976 0.2
977 0.22
978 0.31
979 0.38
980 0.46
981 0.52
982 0.54
983 0.57
984 0.58
985 0.57
986 0.51
987 0.47
988 0.41
989 0.36
990 0.35
991 0.31
992 0.27
993 0.28
994 0.25
995 0.2
996 0.16
997 0.15
998 0.14
999 0.14
1000 0.13
1001 0.13
1002 0.13
1003 0.14
1004 0.14
1005 0.13
1006 0.14
1007 0.15
1008 0.2
1009 0.22