FuNGI

C1H4L8

Protein Details

Accession

C1H4L8

Localization Confidence

High

Confidence Score

21.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
32-66	GDRSSRGDRSDRRERERRRSRSPHHGSRSGRREQE	Basic
91-117	EREWDRDRSDRRRDHRKDDDDRPSRRE	Basic
139-159	GRDRKRSASPPPKKREPTPDL	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
25-63	REERRDRGDRSSRGDRSDRRERERRRSRSPHHGSRSGRR
89-154	REEREWDRDRSDRRRDHRKDDDDRPSRRERDIPDERSRGGRGRERDAFGGGRDRKRSASPPPKKRE

Subcellular Location(s)

nucl 23.5, cyto_nucl 14

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom IPR006529 U2AF_lg
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0006397 P:mRNA processing GO:0008380 P:RNA splicing
KEGG	pbl:PAAG_05711 -
Pfam	View protein in Pfam PF00076 RRM_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM
CDD	cd12231 RRM2_U2AF65 cd12232 RRM3_U2AF65

Amino Acid Sequences

MNGESHSSRDPGRSKDFYGAGRSDREERRDRGDRSSRGDRSDRRERERRRSRSPHHGSRSGRREQETDLYSSSRDYRAREREDRYSGRREEREWDRDRSDRRRDHRKDDDDRPSRRERDIPDERSRGGRGRERDAFGGGRDRKRSASPPPKKREPTPDLTDVVPILERKRRLTQWDIKPPGYEHVTAEQAKLSGMFPLPGAPRQQAVDPSRLQAFMNQPVPGISTNTVLRPSNSRQAKRLFVHNIPPSATEESLVQFFNLQLNGLNVIKGVDPCVSAQLSKDRSFGLLEFKSSADATVALAFDGITMEDTGDMDTSNGEANGSNQGLSLRRPKDYILPVGGEEEPHREGVVSNVVPDTPNKICVSNIPPFIEEEPVTMLLVSFGELKSFVLVKDSETGESRGIAFCEYLDPMSTDIAVENLNGMELGNKRLKVVRASIGTIQATGLDMGINAMSMYAKTTSQDIEAGRVLQLLNMVTTDELLDNDDYEEICDDVRDECSKYGQVVELKVPRPTGNNKQSAGVGKIYVKFDNSESASKALKALAGRKFQDRTVVTTYFSEENFEVNAW

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.48
2	0.52
3	0.55
4	0.5
5	0.51
6	0.48
7	0.43
8	0.44
9	0.44
10	0.46
11	0.48
12	0.52
13	0.54
14	0.53
15	0.59
16	0.64
17	0.63
18	0.65
19	0.68
20	0.67
21	0.67
22	0.74
23	0.69
24	0.67
25	0.73
26	0.7
27	0.69
28	0.74
29	0.75
30	0.74
31	0.79
32	0.82
33	0.84
34	0.87
35	0.87
36	0.87
37	0.89
38	0.88
39	0.89
40	0.9
41	0.89
42	0.87
43	0.87
44	0.83
45	0.83
46	0.83
47	0.81
48	0.77
49	0.7
50	0.64
51	0.59
52	0.6
53	0.52
54	0.47
55	0.41
56	0.35
57	0.31
58	0.31
59	0.3
60	0.27
61	0.27
62	0.29
63	0.36
64	0.44
65	0.52
66	0.58
67	0.61
68	0.64
69	0.7
70	0.74
71	0.7
72	0.7
73	0.68
74	0.69
75	0.66
76	0.6
77	0.6
78	0.61
79	0.65
80	0.61
81	0.61
82	0.58
83	0.61
84	0.68
85	0.69
86	0.7
87	0.7
88	0.73
89	0.78
90	0.8
91	0.82
92	0.84
93	0.84
94	0.83
95	0.83
96	0.85
97	0.83
98	0.81
99	0.78
100	0.76
101	0.7
102	0.66
103	0.63
104	0.57
105	0.58
106	0.62
107	0.63
108	0.64
109	0.64
110	0.61
111	0.58
112	0.56
113	0.51
114	0.48
115	0.47
116	0.43
117	0.47
118	0.52
119	0.5
120	0.49
121	0.46
122	0.4
123	0.35
124	0.4
125	0.38
126	0.38
127	0.39
128	0.4
129	0.39
130	0.42
131	0.46
132	0.47
133	0.52
134	0.56
135	0.63
136	0.71
137	0.78
138	0.79
139	0.81
140	0.81
141	0.77
142	0.75
143	0.71
144	0.66
145	0.58
146	0.53
147	0.46
148	0.36
149	0.28
150	0.22
151	0.16
152	0.15
153	0.19
154	0.21
155	0.24
156	0.31
157	0.34
158	0.39
159	0.47
160	0.53
161	0.58
162	0.67
163	0.68
164	0.62
165	0.6
166	0.55
167	0.5
168	0.43
169	0.34
170	0.25
171	0.22
172	0.26
173	0.25
174	0.24
175	0.2
176	0.17
177	0.16
178	0.15
179	0.12
180	0.08
181	0.08
182	0.08
183	0.07
184	0.11
185	0.12
186	0.14
187	0.16
188	0.15
189	0.16
190	0.16
191	0.18
192	0.21
193	0.23
194	0.26
195	0.25
196	0.26
197	0.26
198	0.25
199	0.24
200	0.21
201	0.22
202	0.22
203	0.24
204	0.22
205	0.21
206	0.2
207	0.22
208	0.18
209	0.16
210	0.11
211	0.11
212	0.12
213	0.13
214	0.15
215	0.14
216	0.15
217	0.18
218	0.21
219	0.28
220	0.35
221	0.36
222	0.39
223	0.43
224	0.49
225	0.46
226	0.5
227	0.47
228	0.42
229	0.48
230	0.46
231	0.43
232	0.36
233	0.35
234	0.31
235	0.27
236	0.24
237	0.16
238	0.13
239	0.12
240	0.13
241	0.12
242	0.09
243	0.07
244	0.07
245	0.08
246	0.07
247	0.07
248	0.06
249	0.06
250	0.08
251	0.08
252	0.07
253	0.06
254	0.07
255	0.07
256	0.07
257	0.07
258	0.06
259	0.07
260	0.07
261	0.09
262	0.08
263	0.08
264	0.09
265	0.14
266	0.17
267	0.18
268	0.19
269	0.17
270	0.18
271	0.18
272	0.18
273	0.18
274	0.15
275	0.14
276	0.14
277	0.14
278	0.14
279	0.13
280	0.13
281	0.07
282	0.06
283	0.06
284	0.06
285	0.06
286	0.05
287	0.05
288	0.05
289	0.04
290	0.04
291	0.04
292	0.03
293	0.03
294	0.03
295	0.03
296	0.03
297	0.04
298	0.04
299	0.04
300	0.03
301	0.03
302	0.04
303	0.04
304	0.04
305	0.04
306	0.04
307	0.05
308	0.07
309	0.08
310	0.07
311	0.07
312	0.08
313	0.09
314	0.12
315	0.19
316	0.19
317	0.2
318	0.21
319	0.22
320	0.28
321	0.3
322	0.31
323	0.25
324	0.24
325	0.23
326	0.25
327	0.24
328	0.17
329	0.14
330	0.14
331	0.12
332	0.12
333	0.11
334	0.09
335	0.09
336	0.1
337	0.15
338	0.11
339	0.11
340	0.11
341	0.12
342	0.12
343	0.12
344	0.15
345	0.11
346	0.14
347	0.15
348	0.15
349	0.15
350	0.19
351	0.24
352	0.25
353	0.27
354	0.25
355	0.25
356	0.26
357	0.27
358	0.25
359	0.19
360	0.15
361	0.13
362	0.12
363	0.12
364	0.1
365	0.09
366	0.07
367	0.06
368	0.06
369	0.06
370	0.05
371	0.05
372	0.06
373	0.06
374	0.07
375	0.07
376	0.07
377	0.08
378	0.09
379	0.1
380	0.13
381	0.14
382	0.15
383	0.16
384	0.18
385	0.15
386	0.16
387	0.16
388	0.12
389	0.12
390	0.11
391	0.09
392	0.08
393	0.09
394	0.09
395	0.08
396	0.08
397	0.08
398	0.09
399	0.09
400	0.08
401	0.07
402	0.06
403	0.07
404	0.06
405	0.06
406	0.05
407	0.05
408	0.05
409	0.05
410	0.05
411	0.07
412	0.08
413	0.13
414	0.17
415	0.17
416	0.19
417	0.23
418	0.26
419	0.26
420	0.29
421	0.31
422	0.3
423	0.33
424	0.34
425	0.34
426	0.31
427	0.28
428	0.23
429	0.17
430	0.14
431	0.11
432	0.09
433	0.05
434	0.04
435	0.05
436	0.04
437	0.04
438	0.03
439	0.04
440	0.04
441	0.04
442	0.06
443	0.06
444	0.07
445	0.08
446	0.1
447	0.1
448	0.11
449	0.15
450	0.14
451	0.16
452	0.17
453	0.17
454	0.16
455	0.16
456	0.15
457	0.12
458	0.13
459	0.1
460	0.09
461	0.08
462	0.08
463	0.07
464	0.07
465	0.08
466	0.07
467	0.06
468	0.08
469	0.09
470	0.09
471	0.09
472	0.1
473	0.09
474	0.09
475	0.1
476	0.08
477	0.08
478	0.07
479	0.07
480	0.08
481	0.11
482	0.13
483	0.15
484	0.16
485	0.19
486	0.2
487	0.21
488	0.21
489	0.23
490	0.24
491	0.25
492	0.31
493	0.35
494	0.36
495	0.38
496	0.39
497	0.35
498	0.38
499	0.44
500	0.47
501	0.5
502	0.55
503	0.53
504	0.53
505	0.55
506	0.54
507	0.49
508	0.4
509	0.33
510	0.3
511	0.34
512	0.35
513	0.32
514	0.29
515	0.28
516	0.27
517	0.31
518	0.3
519	0.3
520	0.29
521	0.3
522	0.31
523	0.29
524	0.29
525	0.22
526	0.22
527	0.23
528	0.28
529	0.33
530	0.39
531	0.42
532	0.48
533	0.5
534	0.48
535	0.53
536	0.47
537	0.46
538	0.45
539	0.43
540	0.38
541	0.36
542	0.39
543	0.33
544	0.3
545	0.28
546	0.22
547	0.21

C1H4L8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer